MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis A/7249 complete genome

Total Repeats: 2382

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020944	GA	3	6	206	211	50 %	0 %	50 %	0 %	478465762
2	NC_020944	TC	3	6	819	824	0 %	50 %	0 %	50 %	478465762
3	NC_020944	AG	3	6	841	846	50 %	0 %	50 %	0 %	478465762
4	NC_020944	TC	3	6	2264	2269	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020944	AG	3	6	2747	2752	50 %	0 %	50 %	0 %	478465765
6	NC_020944	GA	3	6	3415	3420	50 %	0 %	50 %	0 %	478465765
7	NC_020944	TC	3	6	5858	5863	0 %	50 %	0 %	50 %	478465767
8	NC_020944	GA	3	6	5869	5874	50 %	0 %	50 %	0 %	478465767
9	NC_020944	AT	3	6	5973	5978	50 %	50 %	0 %	0 %	478465767
10	NC_020944	TG	3	6	6126	6131	0 %	50 %	50 %	0 %	478465767
11	NC_020944	AG	3	6	6534	6539	50 %	0 %	50 %	0 %	478465767
12	NC_020944	GA	3	6	7592	7597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020944	AC	3	6	8243	8248	50 %	0 %	0 %	50 %	478465769
14	NC_020944	AG	3	6	8986	8991	50 %	0 %	50 %	0 %	478465770
15	NC_020944	CT	4	8	9105	9112	0 %	50 %	0 %	50 %	478465770
16	NC_020944	GT	3	6	9187	9192	0 %	50 %	50 %	0 %	478465770
17	NC_020944	GT	3	6	9614	9619	0 %	50 %	50 %	0 %	478465770
18	NC_020944	GA	3	6	10460	10465	50 %	0 %	50 %	0 %	478465772
19	NC_020944	AG	3	6	10677	10682	50 %	0 %	50 %	0 %	478465772
20	NC_020944	TA	3	6	11842	11847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020944	AG	3	6	11902	11907	50 %	0 %	50 %	0 %	478465773
22	NC_020944	TA	3	6	12462	12467	50 %	50 %	0 %	0 %	478465773
23	NC_020944	TG	3	6	13365	13370	0 %	50 %	50 %	0 %	478465774
24	NC_020944	AG	3	6	13514	13519	50 %	0 %	50 %	0 %	478465774
25	NC_020944	TC	3	6	13648	13653	0 %	50 %	0 %	50 %	478465774
26	NC_020944	AG	4	8	13670	13677	50 %	0 %	50 %	0 %	478465774
27	NC_020944	TA	3	6	13932	13937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020944	TA	4	8	14156	14163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020944	AC	3	6	14999	15004	50 %	0 %	0 %	50 %	478465775
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31	NC_020944	TC	3	6	16378	16383	0 %	50 %	0 %	50 %	478465776
32	NC_020944	GA	3	6	16907	16912	50 %	0 %	50 %	0 %	478465777
33	NC_020944	AG	3	6	16978	16983	50 %	0 %	50 %	0 %	478465777
34	NC_020944	GA	3	6	17762	17767	50 %	0 %	50 %	0 %	478465777
35	NC_020944	AG	3	6	18108	18113	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020944	GA	3	6	18121	18126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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41	NC_020944	GA	3	6	19258	19263	50 %	0 %	50 %	0 %	478465779
42	NC_020944	GA	3	6	19357	19362	50 %	0 %	50 %	0 %	478465779
43	NC_020944	AG	3	6	19823	19828	50 %	0 %	50 %	0 %	478465779
44	NC_020944	AG	4	8	20109	20116	50 %	0 %	50 %	0 %	478465779
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48	NC_020944	AG	3	6	21109	21114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020944	GA	3	6	21267	21272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020944	AG	3	6	21784	21789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020944	CT	3	6	21853	21858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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54	NC_020944	AT	3	6	23104	23109	50 %	50 %	0 %	0 %	478465781
55	NC_020944	GA	3	6	24423	24428	50 %	0 %	50 %	0 %	478465781
56	NC_020944	GA	3	6	24515	24520	50 %	0 %	50 %	0 %	478465781
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61	NC_020944	GA	3	6	26981	26986	50 %	0 %	50 %	0 %	478465782
62	NC_020944	GA	3	6	27105	27110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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104	NC_020944	GA	3	6	41620	41625	50 %	0 %	50 %	0 %	478465797
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107	NC_020944	GA	4	8	42606	42613	50 %	0 %	50 %	0 %	478465798
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109	NC_020944	CT	3	6	42908	42913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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112	NC_020944	TC	3	6	44234	44239	0 %	50 %	0 %	50 %	478465800
113	NC_020944	TC	3	6	44399	44404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_020944	TA	3	6	44552	44557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020944	TC	3	6	45464	45469	0 %	50 %	0 %	50 %	478465801
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118	NC_020944	AG	3	6	46176	46181	50 %	0 %	50 %	0 %	478465802
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122	NC_020944	AG	3	6	47062	47067	50 %	0 %	50 %	0 %	478465803
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126	NC_020944	TG	4	8	51981	51988	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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134	NC_020944	AG	3	6	56506	56511	50 %	0 %	50 %	0 %	478465811
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145	NC_020944	GA	3	6	61969	61974	50 %	0 %	50 %	0 %	478465815
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