MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE8 high quality draft genome

Total Repeats: 347

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020942	TC	3	6	2270	2275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020942	GA	3	6	7598	7603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020942	TA	3	6	11848	11853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020942	AG	3	6	11909	11914	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020942	TA	3	6	13929	13934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020942	TA	4	8	14153	14160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020942	AG	3	6	18105	18110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020942	GA	3	6	18118	18123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020942	CT	3	6	19040	19045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020942	AG	3	6	21106	21111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020942	GA	3	6	21264	21269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020942	AG	3	6	21781	21786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020942	CT	3	6	21850	21855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_020942	GA	3	6	27102	27107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020942	CT	3	6	27109	27114	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020942	TC	3	6	28477	28482	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020942	AG	3	6	28560	28565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020942	GA	3	6	36974	36979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020942	AT	3	6	37076	37081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020942	CT	3	6	39343	39348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020942	CT	3	6	40713	40718	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020942	CT	3	6	42905	42910	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020942	GA	5	10	43180	43189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020942	AG	3	6	43304	43309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020942	TC	3	6	44396	44401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_020942	TA	3	6	44549	44554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020942	AG	3	6	48632	48637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020942	TG	4	8	51979	51986	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020942	GA	3	6	56195	56200	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020942	GA	3	6	61343	61348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020942	AG	4	8	65362	65369	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020942	TA	3	6	85791	85796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020942	TC	3	6	91012	91017	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_020942	GA	3	6	91144	91149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020942	CT	3	6	93494	93499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_020942	TA	3	6	93660	93665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020942	AG	3	6	93703	93708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020942	AG	3	6	93800	93805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020942	GA	3	6	94022	94027	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020942	TA	3	6	94638	94643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020942	TC	3	6	100514	100519	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_020942	AT	3	6	100565	100570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020942	GC	3	6	102671	102676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_020942	TA	3	6	107241	107246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020942	TG	3	6	116483	116488	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020942	AG	4	8	119069	119076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020942	GA	3	6	120891	120896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020942	TA	3	6	123126	123131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020942	GT	3	6	124115	124120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020942	CT	3	6	128652	128657	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_020942	TC	3	6	130974	130979	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_020942	AG	3	6	131051	131056	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020942	AG	3	6	131076	131081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020942	AG	3	6	138738	138743	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020942	GA	3	6	138801	138806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020942	AT	3	6	143033	143038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020942	AG	3	6	157838	157843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020942	TC	3	6	172302	172307	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_020942	AG	3	6	172434	172439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020942	CT	3	6	172452	172457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_020942	TG	3	6	178943	178948	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020942	GA	3	6	184379	184384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020942	CT	3	6	191611	191616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020942	AT	3	6	198751	198756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020942	AG	3	6	203528	203533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020942	TC	3	6	206520	206525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_020942	CT	3	6	210278	210283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_020942	GA	4	8	213339	213346	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020942	CT	4	8	213387	213394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_020942	AG	4	8	224623	224630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020942	CA	3	6	224682	224687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_020942	TA	3	6	226177	226182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020942	CT	3	6	227819	227824	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020942	TC	3	6	230820	230825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020942	AG	3	6	230851	230856	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020942	TC	3	6	245047	245052	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_020942	AG	3	6	245073	245078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020942	CA	3	6	249997	250002	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_020942	GT	3	6	250214	250219	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020942	GA	3	6	257081	257086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020942	TG	3	6	257191	257196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020942	AG	3	6	257993	257998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020942	AG	3	6	258018	258023	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020942	AG	3	6	259001	259006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020942	TA	3	6	260807	260812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020942	TC	3	6	263123	263128	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020942	AG	3	6	264601	264606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020942	TA	3	6	270961	270966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020942	CA	3	6	272768	272773	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_020942	TC	3	6	274668	274673	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_020942	CT	3	6	280082	280087	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_020942	TA	3	6	280221	280226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020942	AT	4	8	290781	290788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020942	CT	3	6	291633	291638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_020942	TC	4	8	291724	291731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_020942	TC	3	6	293415	293420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_020942	TC	3	6	293472	293477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_020942	CT	3	6	293945	293950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_020942	AT	3	6	305961	305966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020942	CA	3	6	308290	308295	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_020942	AC	3	6	308331	308336	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020942	GA	3	6	313021	313026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020942	AG	3	6	322241	322246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020942	CT	3	6	354208	354213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_020942	CT	3	6	357280	357285	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020942	TC	3	6	361506	361511	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_020942	CT	3	6	365422	365427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_020942	AC	3	6	368755	368760	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_020942	GA	3	6	370667	370672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020942	TC	3	6	370745	370750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_020942	TA	3	6	370947	370952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020942	CT	4	8	388063	388070	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_020942	CG	3	6	397902	397907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_020942	TC	3	6	401499	401504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_020942	CT	3	6	401989	401994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_020942	GA	3	6	402119	402124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020942	GA	3	6	402250	402255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020942	CT	3	6	416355	416360	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_020942	CT	3	6	417342	417347	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_020942	CT	3	6	436070	436075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_020942	CT	3	6	437093	437098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_020942	AG	3	6	437440	437445	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020942	GA	3	6	439135	439140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020942	AC	3	6	443134	443139	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_020942	CT	3	6	447413	447418	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_020942	AC	3	6	447451	447456	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_020942	CA	3	6	449920	449925	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_020942	CT	3	6	451320	451325	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_020942	CT	3	6	460602	460607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_020942	CT	3	6	463055	463060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_020942	AG	3	6	466743	466748	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020942	TC	3	6	473281	473286	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_020942	AT	3	6	473350	473355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020942	GA	4	8	474724	474731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020942	TA	3	6	474767	474772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020942	GA	3	6	474865	474870	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020942	AC	3	6	492174	492179	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_020942	GA	4	8	492219	492226	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020942	CA	3	6	492256	492261	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_020942	TC	3	6	492297	492302	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_020942	AC	3	6	496732	496737	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_020942	AG	3	6	496893	496898	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020942	CT	3	6	496912	496917	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_020942	AG	3	6	497205	497210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020942	CT	3	6	500191	500196	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_020942	CT	3	6	500709	500714	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_020942	TG	3	6	500742	500747	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020942	TA	3	6	500855	500860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020942	CT	4	8	506512	506519	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_020942	CT	4	8	509479	509486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_020942	CA	3	6	514585	514590	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_020942	CT	3	6	515523	515528	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_020942	TA	3	6	521329	521334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_020942	AG	3	6	523227	523232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.