MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis G/SotonG1 complete genome

Total Repeats: 752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020941	TGTGA	2	10	3881	3890	20 %	40 %	40 %	0 %	478456743
2	NC_020941	TTGAA	2	10	4237	4246	40 %	40 %	20 %	0 %	478456744
3	NC_020941	GAGAA	2	10	4531	4540	60 %	0 %	40 %	0 %	478456744
4	NC_020941	GAAAA	2	10	4968	4977	80 %	0 %	20 %	0 %	478456744
5	NC_020941	TTACA	2	10	5123	5132	40 %	40 %	0 %	20 %	478456744
6	NC_020941	GTCTT	2	10	5819	5828	0 %	60 %	20 %	20 %	478456745
7	NC_020941	TATTT	2	10	7634	7643	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020941	TGGTA	2	10	8291	8300	20 %	40 %	40 %	0 %	478456747
9	NC_020941	CGAAA	2	10	9699	9708	60 %	0 %	20 %	20 %	478456748
10	NC_020941	GGCTG	2	10	10333	10342	0 %	20 %	60 %	20 %	478456749
11	NC_020941	CCTCT	2	10	11125	11134	0 %	40 %	0 %	60 %	478456750
12	NC_020941	AAAGG	2	10	11284	11293	60 %	0 %	40 %	0 %	478456750
13	NC_020941	AAGAA	2	10	12404	12413	80 %	0 %	20 %	0 %	478456751
14	NC_020941	AAAGA	2	10	13802	13811	80 %	0 %	20 %	0 %	478456752
15	NC_020941	GGTGT	2	10	13906	13915	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020941	GATTT	2	10	15649	15658	20 %	60 %	20 %	0 %	478456754
17	NC_020941	CGTTC	2	10	16760	16769	0 %	40 %	20 %	40 %	478456755
18	NC_020941	GCTTC	2	10	17133	17142	0 %	40 %	20 %	40 %	478456755
19	NC_020941	GAAGG	2	10	17504	17513	40 %	0 %	60 %	0 %	478456755
20	NC_020941	GTTGT	2	10	20930	20939	0 %	60 %	40 %	0 %	478456758
21	NC_020941	AAGAT	2	10	22042	22051	60 %	20 %	20 %	0 %	478456759
22	NC_020941	TTTGC	2	10	22653	22662	0 %	60 %	20 %	20 %	478456759
23	NC_020941	GGAAA	2	10	24407	24416	60 %	0 %	40 %	0 %	478456759
24	NC_020941	AGAGG	2	10	26132	26141	40 %	0 %	60 %	0 %	478456760
25	NC_020941	GGAGA	2	10	27911	27920	40 %	0 %	60 %	0 %	478456761
26	NC_020941	GGATA	2	10	27937	27946	40 %	20 %	40 %	0 %	478456761
27	NC_020941	ATCCG	2	10	28662	28671	20 %	20 %	20 %	40 %	478456763
28	NC_020941	AGGGT	2	10	29180	29189	20 %	20 %	60 %	0 %	478456763
29	NC_020941	CCTAT	2	10	30220	30229	20 %	40 %	0 %	40 %	478456764
30	NC_020941	GAAGG	2	10	31019	31028	40 %	0 %	60 %	0 %	478456765
31	NC_020941	GAGCT	2	10	32059	32068	20 %	20 %	40 %	20 %	478456766
32	NC_020941	AAAGA	2	10	33692	33701	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020941	CTATT	2	10	36733	36742	20 %	60 %	0 %	20 %	478456772
34	NC_020941	TCCTA	2	10	36780	36789	20 %	40 %	0 %	40 %	478456772
35	NC_020941	ACGAT	2	10	38696	38705	40 %	20 %	20 %	20 %	478456773
36	NC_020941	TTTGA	2	10	39061	39070	20 %	60 %	20 %	0 %	478456773
37	NC_020941	AGCAA	2	10	42712	42721	60 %	0 %	20 %	20 %	478456776
38	NC_020941	CGATG	2	10	42769	42778	20 %	20 %	40 %	20 %	478456776
39	NC_020941	TGCAA	2	10	42927	42936	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_020941	CAAAA	2	10	43246	43255	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_020941	TTTAT	2	10	44843	44852	20 %	80 %	0 %	0 %	478456779
42	NC_020941	CTTTC	2	10	46939	46948	0 %	60 %	0 %	40 %	478456781
43	NC_020941	AGTTT	2	10	47478	47487	20 %	60 %	20 %	0 %	478456781
44	NC_020941	GAAGA	2	10	48611	48620	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020941	CTATT	2	10	50190	50199	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_020941	CTTTT	2	10	50641	50650	0 %	80 %	0 %	20 %	478456784
47	NC_020941	CCGTA	2	10	54308	54317	20 %	20 %	20 %	40 %	478456787
48	NC_020941	AATTT	2	10	54548	54557	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020941	TTATC	2	10	55711	55720	20 %	60 %	0 %	20 %	478456788
50	NC_020941	GAGCA	2	10	60157	60166	40 %	0 %	40 %	20 %	478456791
51	NC_020941	TGTGA	2	10	62606	62615	20 %	40 %	40 %	0 %	478456793
52	NC_020941	AGTGA	2	10	64133	64142	40 %	20 %	40 %	0 %	478456794
53	NC_020941	CCTTC	2	10	64407	64416	0 %	40 %	0 %	60 %	478456794
54	NC_020941	AGGAG	2	10	66635	66644	40 %	0 %	60 %	0 %	478456796
55	NC_020941	GTTAA	2	10	66765	66774	40 %	40 %	20 %	0 %	478456796
56	NC_020941	CAAGC	2	10	69143	69152	40 %	0 %	20 %	40 %	478456798
57	NC_020941	AAAAG	2	10	69391	69400	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020941	GCGAT	2	10	70203	70212	20 %	20 %	40 %	20 %	478456799
59	NC_020941	CTCTT	2	10	70557	70566	0 %	60 %	0 %	40 %	478456799
60	NC_020941	AGGGG	2	10	71203	71212	20 %	0 %	80 %	0 %	478456799
61	NC_020941	AAGAA	2	10	71245	71254	80 %	0 %	20 %	0 %	478456799
62	NC_020941	CTTGC	2	10	72334	72343	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_020941	ATTGG	2	10	72535	72544	20 %	40 %	40 %	0 %	478456801
64	NC_020941	GAAAA	2	10	73607	73616	80 %	0 %	20 %	0 %	478456801
65	NC_020941	TGGGA	2	10	74024	74033	20 %	20 %	60 %	0 %	478456802
66	NC_020941	TATTT	2	10	76551	76560	20 %	80 %	0 %	0 %	478456803
67	NC_020941	AAAAG	2	10	77084	77093	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020941	ATCAA	2	10	78782	78791	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_020941	TGTCT	2	10	80343	80352	0 %	60 %	20 %	20 %	478456806
70	NC_020941	TTACT	2	10	80850	80859	20 %	60 %	0 %	20 %	478456806
71	NC_020941	AGAAA	2	10	82240	82249	80 %	0 %	20 %	0 %	478456808
72	NC_020941	GGAAG	2	10	82753	82762	40 %	0 %	60 %	0 %	478456808
73	NC_020941	TTTGT	2	10	85518	85527	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020941	GATCC	2	10	86304	86313	20 %	20 %	20 %	40 %	478456811
75	NC_020941	AGAGC	2	10	87639	87648	40 %	0 %	40 %	20 %	478456812
76	NC_020941	AATAA	2	10	88517	88526	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020941	TTTTC	2	10	91371	91380	0 %	80 %	0 %	20 %	478456815
78	NC_020941	GGATG	2	10	91631	91640	20 %	20 %	60 %	0 %	478456816
79	NC_020941	CAACA	2	10	93170	93179	60 %	0 %	0 %	40 %	478456817
80	NC_020941	ACAGC	2	10	94215	94224	40 %	0 %	20 %	40 %	478456818
81	NC_020941	CTTTT	2	10	94589	94598	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_020941	GGAAC	2	10	94927	94936	40 %	0 %	40 %	20 %	478456819
83	NC_020941	GGATT	2	10	95827	95836	20 %	40 %	40 %	0 %	478456819
84	NC_020941	AGCAT	2	10	95848	95857	40 %	20 %	20 %	20 %	478456819
85	NC_020941	CAATC	2	10	96929	96938	40 %	20 %	0 %	40 %	478456821
86	NC_020941	TTTGC	2	10	97063	97072	0 %	60 %	20 %	20 %	478456821
87	NC_020941	ATTCA	2	10	97327	97336	40 %	40 %	0 %	20 %	478456821
88	NC_020941	GATCC	2	10	97586	97595	20 %	20 %	20 %	40 %	478456821
89	NC_020941	GTTTT	2	10	98007	98016	0 %	80 %	20 %	0 %	478456821
90	NC_020941	ACAAA	2	10	98134	98143	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_020941	AAGCT	2	10	99210	99219	40 %	20 %	20 %	20 %	478456822
92	NC_020941	AGGGG	2	10	99569	99578	20 %	0 %	80 %	0 %	478456822
93	NC_020941	ATAGC	2	10	100268	100277	40 %	20 %	20 %	20 %	478456823
94	NC_020941	AGCGA	2	10	103196	103205	40 %	0 %	40 %	20 %	478456826
95	NC_020941	TTTCT	2	10	103554	103563	0 %	80 %	0 %	20 %	478456826
96	NC_020941	ATCAT	2	10	104760	104769	40 %	40 %	0 %	20 %	478456827
97	NC_020941	GGCAT	2	10	105468	105477	20 %	20 %	40 %	20 %	478456827
98	NC_020941	AAAGC	2	10	109194	109203	60 %	0 %	20 %	20 %	478456830
99	NC_020941	GCATT	2	10	110354	110363	20 %	40 %	20 %	20 %	478456832
100	NC_020941	GCTCT	2	10	114407	114416	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_020941	TGTTT	2	10	115031	115040	0 %	80 %	20 %	0 %	478456835
102	NC_020941	CATGT	2	10	115409	115418	20 %	40 %	20 %	20 %	478456835
103	NC_020941	TATCG	2	10	116113	116122	20 %	40 %	20 %	20 %	478456835
104	NC_020941	TTTCT	2	10	116629	116638	0 %	80 %	0 %	20 %	478456836
105	NC_020941	AAAGA	2	10	118874	118883	80 %	0 %	20 %	0 %	478456839
106	NC_020941	GCTTC	2	10	122864	122873	0 %	40 %	20 %	40 %	478456842
107	NC_020941	TACAA	2	10	126652	126661	60 %	20 %	0 %	20 %	478456846
108	NC_020941	ATCCA	2	10	129057	129066	40 %	20 %	0 %	40 %	478456849
109	NC_020941	GAAGA	2	10	130607	130616	60 %	0 %	40 %	0 %	478456849
110	NC_020941	AAAAG	2	10	132520	132529	80 %	0 %	20 %	0 %	478456850
111	NC_020941	GATTC	2	10	132851	132860	20 %	40 %	20 %	20 %	478456850
112	NC_020941	GGATA	2	10	135471	135480	40 %	20 %	40 %	0 %	478456852
113	NC_020941	ATTGG	2	10	136136	136145	20 %	40 %	40 %	0 %	478456853
114	NC_020941	ATTGT	2	10	136169	136178	20 %	60 %	20 %	0 %	478456853
115	NC_020941	TGTTT	2	10	136595	136604	0 %	80 %	20 %	0 %	478456854
116	NC_020941	TTGCA	2	10	137384	137393	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_020941	TCCAG	2	10	140340	140349	20 %	20 %	20 %	40 %	478456860
118	NC_020941	GTACA	2	10	141071	141080	40 %	20 %	20 %	20 %	478456861
119	NC_020941	TAGAT	2	10	141444	141453	40 %	40 %	20 %	0 %	478456861
120	NC_020941	AAAAG	2	10	141856	141865	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020941	AAAAC	2	10	142336	142345	80 %	0 %	0 %	20 %	478456862
122	NC_020941	TGCTA	2	10	143422	143431	20 %	40 %	20 %	20 %	478456864
123	NC_020941	GGAGC	2	10	143469	143478	20 %	0 %	60 %	20 %	478456864
124	NC_020941	CTGGG	2	10	144884	144893	0 %	20 %	60 %	20 %	478456866
125	NC_020941	GTTTT	2	10	145631	145640	0 %	80 %	20 %	0 %	478456867
126	NC_020941	GAACC	2	10	149365	149374	40 %	0 %	20 %	40 %	478456868
127	NC_020941	ATTCT	2	10	152861	152870	20 %	60 %	0 %	20 %	478456872
128	NC_020941	CTGTG	2	10	153065	153074	0 %	40 %	40 %	20 %	478456872
129	NC_020941	TTCTT	2	10	155538	155547	0 %	80 %	0 %	20 %	478456875
130	NC_020941	TTCTA	2	10	157643	157652	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_020941	AGGAA	2	10	160098	160107	60 %	0 %	40 %	0 %	478456879
132	NC_020941	CAAAA	2	10	162101	162110	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_020941	AGAGA	2	10	163329	163338	60 %	0 %	40 %	0 %	478456882
134	NC_020941	AGCAA	2	10	163764	163773	60 %	0 %	20 %	20 %	478456882
135	NC_020941	CAAAA	2	10	167267	167276	80 %	0 %	0 %	20 %	478456884
136	NC_020941	AAGAG	2	10	168100	168109	60 %	0 %	40 %	0 %	478456884
137	NC_020941	GATTG	2	10	168445	168454	20 %	40 %	40 %	0 %	478456884
138	NC_020941	GTTTT	2	10	174924	174933	0 %	80 %	20 %	0 %	478456888
139	NC_020941	TATTG	2	10	174947	174956	20 %	60 %	20 %	0 %	478456888
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266	NC_020941	ATTTA	2	10	357921	357930	40 %	60 %	0 %	0 %	478457052
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