MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/SotonG1 complete genome

Total Repeats: 339

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020941	TC	3	6	2270	2275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020941	GA	3	6	7598	7603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020941	TA	3	6	11848	11853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020941	TA	3	6	13939	13944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020941	TA	4	8	14163	14170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020941	AG	3	6	18115	18120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020941	GA	3	6	18128	18133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020941	CT	3	6	19050	19055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020941	AG	3	6	21116	21121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020941	GA	3	6	21274	21279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020941	AG	3	6	21791	21796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020941	CT	3	6	21860	21865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_020941	GA	3	6	27112	27117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020941	CT	3	6	27119	27124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020941	TC	3	6	28487	28492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020941	AG	3	6	28570	28575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020941	GA	3	6	36984	36989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020941	AT	3	6	37086	37091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020941	CT	3	6	39353	39358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_020941	CT	3	6	40724	40729	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020941	CT	3	6	42916	42921	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020941	GA	5	10	43192	43201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020941	TC	3	6	44408	44413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_020941	TA	3	6	44561	44566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020941	AG	3	6	48643	48648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020941	TG	4	8	51991	51998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020941	GA	3	6	56093	56098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020941	GA	3	6	61171	61176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020941	AG	4	8	65196	65203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020941	TA	3	6	69527	69532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020941	CT	3	6	72263	72268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_020941	TA	3	6	85624	85629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020941	TC	3	6	90845	90850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_020941	GA	3	6	90977	90982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020941	CT	3	6	93327	93332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_020941	TA	3	6	93493	93498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020941	AG	3	6	93536	93541	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020941	AG	3	6	93633	93638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020941	GA	3	6	93855	93860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020941	TA	3	6	94472	94477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020941	TC	3	6	100353	100358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_020941	AT	3	6	100404	100409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020941	TA	3	6	107080	107085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020941	TG	3	6	116322	116327	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020941	AG	4	8	118908	118915	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020941	GA	3	6	120730	120735	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020941	TA	3	6	122965	122970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020941	GT	3	6	123954	123959	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020941	CT	3	6	128487	128492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_020941	TC	3	6	130809	130814	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_020941	AG	3	6	130886	130891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020941	AG	3	6	130911	130916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020941	GA	3	6	138635	138640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020941	AT	3	6	142867	142872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020941	GA	3	6	152105	152110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020941	AG	3	6	157673	157678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020941	TC	3	6	172137	172142	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_020941	AG	3	6	172269	172274	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020941	CT	3	6	172287	172292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_020941	TG	3	6	178778	178783	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020941	GA	3	6	184264	184269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020941	TC	3	6	192381	192386	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_020941	AT	3	6	192723	192728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020941	AG	3	6	197196	197201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020941	TC	3	6	200187	200192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_020941	CT	3	6	203945	203950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_020941	GA	4	8	207004	207011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020941	CT	4	8	207052	207059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_020941	AG	4	8	218325	218332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020941	TA	3	6	219879	219884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020941	CT	3	6	221519	221524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_020941	TC	3	6	224520	224525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_020941	AG	3	6	224551	224556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020941	TC	3	6	238751	238756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020941	AG	3	6	238777	238782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020941	CA	3	6	243701	243706	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_020941	GT	3	6	243918	243923	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020941	GA	3	6	250786	250791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020941	TG	3	6	250896	250901	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020941	AG	3	6	251698	251703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020941	AG	3	6	252707	252712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020941	TA	3	6	254513	254518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020941	AG	3	6	256794	256799	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020941	TC	3	6	256820	256825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_020941	AG	3	6	258298	258303	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020941	TA	3	6	264661	264666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020941	CA	3	6	266468	266473	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_020941	TC	3	6	268368	268373	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_020941	CA	3	6	273719	273724	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_020941	CT	3	6	273782	273787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_020941	TA	3	6	273921	273926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020941	AT	4	8	284481	284488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020941	CT	3	6	285333	285338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_020941	TC	4	8	285424	285431	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_020941	TC	3	6	287115	287120	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_020941	TC	3	6	287172	287177	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_020941	CT	3	6	287645	287650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_020941	AT	3	6	299660	299665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020941	CA	3	6	301989	301994	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_020941	GA	3	6	306720	306725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020941	AG	3	6	315926	315931	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020941	CT	3	6	347878	347883	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020941	CT	3	6	350949	350954	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_020941	TC	3	6	355175	355180	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_020941	TC	3	6	359005	359010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020941	CT	3	6	359091	359096	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_020941	AC	3	6	362424	362429	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_020941	GA	3	6	364334	364339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020941	TC	3	6	364412	364417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_020941	TA	3	6	364613	364618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020941	CT	4	8	381642	381649	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_020941	CG	3	6	391480	391485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_020941	CA	3	6	392530	392535	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_020941	TC	3	6	395077	395082	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_020941	CT	3	6	395567	395572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_020941	GA	3	6	395697	395702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020941	GA	3	6	395828	395833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020941	CT	3	6	409924	409929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_020941	CT	3	6	410911	410916	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_020941	CT	3	6	429641	429646	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_020941	CT	3	6	430664	430669	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_020941	AG	3	6	431011	431016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020941	GA	3	6	432706	432711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020941	AC	3	6	436704	436709	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_020941	CT	3	6	440975	440980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_020941	AC	3	6	441013	441018	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_020941	CA	3	6	443482	443487	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_020941	CT	3	6	444886	444891	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_020941	CT	3	6	454168	454173	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_020941	AG	3	6	460309	460314	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020941	TC	3	6	466847	466852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_020941	AT	3	6	466916	466921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020941	GA	4	8	468290	468297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020941	TA	3	6	468333	468338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020941	GA	3	6	468431	468436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020941	TC	3	6	480163	480168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_020941	AC	3	6	485694	485699	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_020941	GA	4	8	485739	485746	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020941	CA	3	6	485776	485781	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_020941	TC	3	6	485817	485822	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_020941	AC	3	6	490252	490257	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_020941	AG	3	6	490414	490419	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020941	CT	3	6	490433	490438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_020941	AG	3	6	490726	490731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020941	CT	3	6	493712	493717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_020941	CT	3	6	494230	494235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_020941	TG	3	6	494263	494268	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020941	TA	3	6	494376	494381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020941	CT	4	8	500033	500040	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_020941	CA	3	6	508103	508108	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_020941	CT	3	6	509041	509046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_020941	TA	3	6	514844	514849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020941	AG	3	6	516742	516747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_020941	TC	3	6	517588	517593	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.