MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis Ia/SotonIa3 complete genome

Total Repeats: 2364

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020940	GA	3	6	212	217	50 %	0 %	50 %	0 %	478474770
2	NC_020940	TC	3	6	825	830	0 %	50 %	0 %	50 %	478474770
3	NC_020940	AG	3	6	847	852	50 %	0 %	50 %	0 %	478474770
4	NC_020940	TC	3	6	2270	2275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020940	AG	3	6	2753	2758	50 %	0 %	50 %	0 %	478474773
6	NC_020940	GA	3	6	3421	3426	50 %	0 %	50 %	0 %	478474773
7	NC_020940	AT	3	6	5114	5119	50 %	50 %	0 %	0 %	478474774
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9	NC_020940	GA	3	6	5875	5880	50 %	0 %	50 %	0 %	478474775
10	NC_020940	AT	3	6	5979	5984	50 %	50 %	0 %	0 %	478474775
11	NC_020940	TG	3	6	6132	6137	0 %	50 %	50 %	0 %	478474775
12	NC_020940	AG	3	6	6540	6545	50 %	0 %	50 %	0 %	478474775
13	NC_020940	GA	3	6	7598	7603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020940	AC	3	6	8248	8253	50 %	0 %	0 %	50 %	478474777
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18	NC_020940	GA	3	6	10466	10471	50 %	0 %	50 %	0 %	478474780
19	NC_020940	AG	3	6	10683	10688	50 %	0 %	50 %	0 %	478474780
20	NC_020940	TA	3	6	11848	11853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020940	AG	3	6	11909	11914	50 %	0 %	50 %	0 %	478474781
22	NC_020940	TA	3	6	12469	12474	50 %	50 %	0 %	0 %	478474781
23	NC_020940	TG	3	6	13372	13377	0 %	50 %	50 %	0 %	478474782
24	NC_020940	AG	3	6	13521	13526	50 %	0 %	50 %	0 %	478474782
25	NC_020940	AG	4	8	13677	13684	50 %	0 %	50 %	0 %	478474782
26	NC_020940	TA	3	6	13939	13944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020940	TA	4	8	14162	14169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020940	AC	3	6	15005	15010	50 %	0 %	0 %	50 %	478474783
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33	NC_020940	GA	3	6	17768	17773	50 %	0 %	50 %	0 %	478474785
34	NC_020940	AG	3	6	18114	18119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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40	NC_020940	GA	3	6	19264	19269	50 %	0 %	50 %	0 %	478474787
41	NC_020940	GA	3	6	19363	19368	50 %	0 %	50 %	0 %	478474787
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