MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis A/5291 complete genome

Total Repeats: 2886

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020939	GGAT	2	8	57	64	25 %	25 %	50 %	0 %	478448617
2	NC_020939	GTTC	2	8	109	116	0 %	50 %	25 %	25 %	478448617
3	NC_020939	GCGT	2	8	294	301	0 %	25 %	50 %	25 %	478448617
4	NC_020939	AGTG	2	8	541	548	25 %	25 %	50 %	0 %	478448617
5	NC_020939	TGGC	2	8	575	582	0 %	25 %	50 %	25 %	478448617
6	NC_020939	AATG	2	8	1060	1067	50 %	25 %	25 %	0 %	478448617
7	NC_020939	CTAT	2	8	1394	1401	25 %	50 %	0 %	25 %	478448617
8	NC_020939	AAGG	2	8	1903	1910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020939	AGTA	2	8	2083	2090	50 %	25 %	25 %	0 %	478448618
10	NC_020939	ATGA	2	8	2487	2494	50 %	25 %	25 %	0 %	478448619
11	NC_020939	GATA	2	8	2525	2532	50 %	25 %	25 %	0 %	478448619
12	NC_020939	TTTC	2	8	2822	2829	0 %	75 %	0 %	25 %	478448620
13	NC_020939	CATG	2	8	3703	3710	25 %	25 %	25 %	25 %	478448620
14	NC_020939	TTCC	2	8	4008	4015	0 %	50 %	0 %	50 %	478448620
15	NC_020939	TTTA	2	8	4406	4413	25 %	75 %	0 %	0 %	478448621
16	NC_020939	ATCC	2	8	4706	4713	25 %	25 %	0 %	50 %	478448621
17	NC_020939	GACG	2	8	5453	5460	25 %	0 %	50 %	25 %	478448621
18	NC_020939	TTGG	2	8	5556	5563	0 %	50 %	50 %	0 %	478448621
19	NC_020939	TGGA	2	8	5917	5924	25 %	25 %	50 %	0 %	478448622
20	NC_020939	CTTT	2	8	6294	6301	0 %	75 %	0 %	25 %	478448622
21	NC_020939	GGGA	2	8	6809	6816	25 %	0 %	75 %	0 %	478448622
22	NC_020939	GGAG	2	8	6900	6907	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020939	GGTG	2	8	7112	7119	0 %	25 %	75 %	0 %	478448623
24	NC_020939	AAAT	2	8	7178	7185	75 %	25 %	0 %	0 %	478448623
25	NC_020939	TATG	2	8	7549	7556	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020939	ATTT	2	8	7690	7697	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020939	TTTG	2	8	7782	7789	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020939	AAGC	2	8	8416	8423	50 %	0 %	25 %	25 %	478448624
29	NC_020939	ATTG	2	8	8814	8821	25 %	50 %	25 %	0 %	478448625
30	NC_020939	AGCG	2	8	9281	9288	25 %	0 %	50 %	25 %	478448625
31	NC_020939	AAAG	2	8	9302	9309	75 %	0 %	25 %	0 %	478448625
32	NC_020939	CTTT	2	8	9642	9649	0 %	75 %	0 %	25 %	478448625
33	NC_020939	TATT	2	8	9904	9911	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020939	TTCG	2	8	10013	10020	0 %	50 %	25 %	25 %	478448626
35	NC_020939	AATT	2	8	10118	10125	50 %	50 %	0 %	0 %	478448626
36	NC_020939	ATGG	2	8	10177	10184	25 %	25 %	50 %	0 %	478448626
37	NC_020939	CTTT	2	8	10802	10809	0 %	75 %	0 %	25 %	478448627
38	NC_020939	GCAA	2	8	11019	11026	50 %	0 %	25 %	25 %	478448627
39	NC_020939	AGCC	2	8	11249	11256	25 %	0 %	25 %	50 %	478448627
40	NC_020939	GAAA	2	8	11392	11399	75 %	0 %	25 %	0 %	478448627
41	NC_020939	AGAA	2	8	11796	11803	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020939	AATG	2	8	12134	12141	50 %	25 %	25 %	0 %	478448628
43	NC_020939	GTTT	2	8	13166	13173	0 %	75 %	25 %	0 %	478448629
44	NC_020939	ATGC	2	8	13596	13603	25 %	25 %	25 %	25 %	478448629
45	NC_020939	AAGG	2	8	14031	14038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020939	TTGT	2	8	14632	14639	0 %	75 %	25 %	0 %	478448630
47	NC_020939	TTCT	2	8	14803	14810	0 %	75 %	0 %	25 %	478448630
48	NC_020939	ATTT	2	8	15009	15016	25 %	75 %	0 %	0 %	478448630
49	NC_020939	TTTC	2	8	15671	15678	0 %	75 %	0 %	25 %	478448631
50	NC_020939	AAAT	2	8	16153	16160	75 %	25 %	0 %	0 %	478448631
51	NC_020939	CAAA	2	8	16665	16672	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_020939	GTAA	2	8	16995	17002	50 %	25 %	25 %	0 %	478448632
53	NC_020939	CTAA	2	8	17188	17195	50 %	25 %	0 %	25 %	478448632
54	NC_020939	AGAA	2	8	17451	17458	75 %	0 %	25 %	0 %	478448632
55	NC_020939	ATTT	2	8	17597	17604	25 %	75 %	0 %	0 %	478448632
56	NC_020939	TGCG	2	8	19119	19126	0 %	25 %	50 %	25 %	478448634
57	NC_020939	GAAG	2	8	20103	20110	50 %	0 %	50 %	0 %	478448634
58	NC_020939	TTTG	2	8	20129	20136	0 %	75 %	25 %	0 %	478448634
59	NC_020939	TGTA	2	8	20821	20828	25 %	50 %	25 %	0 %	478448635
60	NC_020939	CGCT	2	8	21861	21868	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_020939	TTAA	2	8	21882	21889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020939	GTTA	2	8	21919	21926	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020939	GATC	2	8	21974	21981	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_020939	GATG	2	8	22237	22244	25 %	25 %	50 %	0 %	478448636
65	NC_020939	TTCT	2	8	22935	22942	0 %	75 %	0 %	25 %	478448636
66	NC_020939	CATT	2	8	23296	23303	25 %	50 %	0 %	25 %	478448636
67	NC_020939	GCTT	2	8	23639	23646	0 %	50 %	25 %	25 %	478448636
68	NC_020939	GGTT	2	8	23687	23694	0 %	50 %	50 %	0 %	478448636
69	NC_020939	TTCT	2	8	24057	24064	0 %	75 %	0 %	25 %	478448636
70	NC_020939	TAAC	2	8	24159	24166	50 %	25 %	0 %	25 %	478448636
71	NC_020939	CATT	2	8	24282	24289	25 %	50 %	0 %	25 %	478448636
72	NC_020939	GGTA	2	8	24652	24659	25 %	25 %	50 %	0 %	478448636
73	NC_020939	TTCG	2	8	25792	25799	0 %	50 %	25 %	25 %	478448637
74	NC_020939	TAGG	2	8	25871	25878	25 %	25 %	50 %	0 %	478448637
75	NC_020939	TTCC	2	8	25995	26002	0 %	50 %	0 %	50 %	478448637
76	NC_020939	TAGG	2	8	26109	26116	25 %	25 %	50 %	0 %	478448637
77	NC_020939	GCTT	2	8	26881	26888	0 %	50 %	25 %	25 %	478448637
78	NC_020939	GGAA	2	8	27464	27471	50 %	0 %	50 %	0 %	478448638
79	NC_020939	TTAA	2	8	27537	27544	50 %	50 %	0 %	0 %	478448638
80	NC_020939	AAAG	2	8	27587	27594	75 %	0 %	25 %	0 %	478448638
81	NC_020939	GGGC	2	8	27867	27874	0 %	0 %	75 %	25 %	478448638
82	NC_020939	CAGA	2	8	28172	28179	50 %	0 %	25 %	25 %	478448639
83	NC_020939	ATTG	2	8	28531	28538	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020939	CTTT	2	8	30144	30151	0 %	75 %	0 %	25 %	478448641
85	NC_020939	TTTG	2	8	30159	30166	0 %	75 %	25 %	0 %	478448641
86	NC_020939	TTGT	2	8	30194	30201	0 %	75 %	25 %	0 %	478448641
87	NC_020939	TGGC	2	8	30357	30364	0 %	25 %	50 %	25 %	478448641
88	NC_020939	AAAG	2	8	30917	30924	75 %	0 %	25 %	0 %	478448642
89	NC_020939	AAAC	2	8	30987	30994	75 %	0 %	0 %	25 %	478448642
90	NC_020939	GATG	2	8	31130	31137	25 %	25 %	50 %	0 %	478448642
91	NC_020939	GATA	2	8	32239	32246	50 %	25 %	25 %	0 %	478448644
92	NC_020939	TGAT	2	8	34733	34740	25 %	50 %	25 %	0 %	478448647
93	NC_020939	AAGA	3	12	34861	34872	75 %	0 %	25 %	0 %	478448647
94	NC_020939	AAGC	2	8	35081	35088	50 %	0 %	25 %	25 %	478448648
95	NC_020939	GTTC	2	8	35114	35121	0 %	50 %	25 %	25 %	478448648
96	NC_020939	GGCA	2	8	35493	35500	25 %	0 %	50 %	25 %	478448649
97	NC_020939	TCGA	2	8	35750	35757	25 %	25 %	25 %	25 %	478448649
98	NC_020939	TGCT	2	8	35903	35910	0 %	50 %	25 %	25 %	478448649
99	NC_020939	TATG	2	8	36046	36053	25 %	50 %	25 %	0 %	478448649
100	NC_020939	TTGG	2	8	36135	36142	0 %	50 %	50 %	0 %	478448649
101	NC_020939	AGAT	2	8	36855	36862	50 %	25 %	25 %	0 %	478448649
102	NC_020939	CTTT	2	8	37228	37235	0 %	75 %	0 %	25 %	478448650
103	NC_020939	ATGA	2	8	37718	37725	50 %	25 %	25 %	0 %	478448650
104	NC_020939	TAGG	2	8	37877	37884	25 %	25 %	50 %	0 %	478448650
105	NC_020939	CAAT	2	8	38061	38068	50 %	25 %	0 %	25 %	478448650
106	NC_020939	AATG	2	8	38848	38855	50 %	25 %	25 %	0 %	478448650
107	NC_020939	AGAA	2	8	39685	39692	75 %	0 %	25 %	0 %	478448651
108	NC_020939	AAGA	2	8	39737	39744	75 %	0 %	25 %	0 %	478448651
109	NC_020939	ATCC	2	8	39745	39752	25 %	25 %	0 %	50 %	478448651
110	NC_020939	TAAT	2	8	39956	39963	50 %	50 %	0 %	0 %	478448651
111	NC_020939	GTGC	2	8	42045	42052	0 %	25 %	50 %	25 %	478448653
112	NC_020939	AGAA	2	8	42464	42471	75 %	0 %	25 %	0 %	478448653
113	NC_020939	GGAT	2	8	42616	42623	25 %	25 %	50 %	0 %	478448653
114	NC_020939	AAAC	2	8	43824	43831	75 %	0 %	0 %	25 %	478448655
115	NC_020939	CAAT	2	8	44028	44035	50 %	25 %	0 %	25 %	478448655
116	NC_020939	TGTT	2	8	44408	44415	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020939	AATA	2	8	44647	44654	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020939	ATTT	2	8	44785	44792	25 %	75 %	0 %	0 %	478448656
119	NC_020939	GCTC	2	8	45093	45100	0 %	25 %	25 %	50 %	478448656
120	NC_020939	TTCT	2	8	45235	45242	0 %	75 %	0 %	25 %	478448656
121	NC_020939	TTGA	2	8	45835	45842	25 %	50 %	25 %	0 %	478448657
122	NC_020939	TGTT	2	8	46007	46014	0 %	75 %	25 %	0 %	478448657
123	NC_020939	CTAT	2	8	46037	46044	25 %	50 %	0 %	25 %	478448657
124	NC_020939	TGTT	2	8	46066	46073	0 %	75 %	25 %	0 %	478448657
125	NC_020939	CTAT	2	8	46362	46369	25 %	50 %	0 %	25 %	478448657
126	NC_020939	AAGA	2	8	46857	46864	75 %	0 %	25 %	0 %	478448658
127	NC_020939	AAGA	2	8	46914	46921	75 %	0 %	25 %	0 %	478448658
128	NC_020939	AAAG	2	8	46954	46961	75 %	0 %	25 %	0 %	478448658
129	NC_020939	AAGA	2	8	47069	47076	75 %	0 %	25 %	0 %	478448658
130	NC_020939	ACTT	2	8	47330	47337	25 %	50 %	0 %	25 %	478448658
131	NC_020939	ATGG	2	8	47956	47963	25 %	25 %	50 %	0 %	478448658
132	NC_020939	AGGA	2	8	47987	47994	50 %	0 %	50 %	0 %	478448658
133	NC_020939	GAAC	2	8	48534	48541	50 %	0 %	25 %	25 %	478448658
134	NC_020939	AAGT	2	8	48569	48576	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020939	AACA	2	8	48778	48785	75 %	0 %	0 %	25 %	478448659
136	NC_020939	CTTT	2	8	48974	48981	0 %	75 %	0 %	25 %	478448659
137	NC_020939	CTTT	2	8	49859	49866	0 %	75 %	0 %	25 %	478448660
138	NC_020939	GTAG	2	8	49877	49884	25 %	25 %	50 %	0 %	478448660
139	NC_020939	GAAG	2	8	51305	51312	50 %	0 %	50 %	0 %	478448661
140	NC_020939	TTCA	2	8	51727	51734	25 %	50 %	0 %	25 %	478448661
141	NC_020939	TATT	2	8	52661	52668	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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