MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis A/5291 complete genome

Total Repeats: 14131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020939	AGG	2	6	18	23	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478448617
2	NC_020939	GAA	2	6	87	92	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448617
3	NC_020939	GTA	2	6	131	136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478448617
4	NC_020939	AGT	2	6	162	167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478448617
5	NC_020939	AAG	2	6	318	323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448617
6	NC_020939	CAA	2	6	332	337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478448617
7	NC_020939	AGT	2	6	358	363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478448617
8	NC_020939	GTG	2	6	374	379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478448617
9	NC_020939	CAG	2	6	410	415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478448617
10	NC_020939	GCC	2	6	598	603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478448617
11	NC_020939	TGC	2	6	657	662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478448617
12	NC_020939	ATT	2	6	669	674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478448617
13	NC_020939	CGA	2	6	691	696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478448617
14	NC_020939	TAT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478448617
15	NC_020939	GAA	2	6	880	885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448617
16	NC_020939	AGA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448617
17	NC_020939	AGA	2	6	963	968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448617
18	NC_020939	CAA	2	6	1036	1041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478448617
19	NC_020939	TTG	2	6	1179	1184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478448617
20	NC_020939	CTC	2	6	1208	1213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478448617
21	NC_020939	GAT	2	6	1270	1275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478448617
22	NC_020939	GAT	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478448617
23	NC_020939	ATG	2	6	1387	1392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478448617
24	NC_020939	CCT	2	6	1546	1551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478448617
25	NC_020939	CTT	2	6	1607	1612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448617
26	NC_020939	CAG	2	6	1672	1677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478448617
27	NC_020939	TGA	2	6	1733	1738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478448617
28	NC_020939	AAG	2	6	1814	1819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020939	TGG	2	6	1830	1835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020939	CTT	2	6	1837	1842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020939	ATG	2	6	1930	1935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478448618
32	NC_020939	GTG	2	6	1936	1941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478448618
33	NC_020939	TCC	2	6	1945	1950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478448618
34	NC_020939	AGC	2	6	1959	1964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478448618
35	NC_020939	AGC	2	6	1986	1991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478448618
36	NC_020939	AAG	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448618
37	NC_020939	TAC	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478448618
38	NC_020939	GCT	2	6	2045	2050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478448618
39	NC_020939	AAC	2	6	2143	2148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478448618
40	NC_020939	AGA	2	6	2155	2160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448618
41	NC_020939	TAA	2	6	2245	2250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020939	AGA	2	6	2411	2416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448619
43	NC_020939	ATC	2	6	2418	2423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478448619
44	NC_020939	TGC	2	6	2438	2443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478448619
45	NC_020939	CAT	2	6	2562	2567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478448619
46	NC_020939	AGA	2	6	2591	2596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448619
47	NC_020939	AAG	2	6	2620	2625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448619
48	NC_020939	GGA	2	6	2655	2660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478448619
49	NC_020939	ATC	2	6	2784	2789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478448620
50	NC_020939	ATA	2	6	2934	2939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478448620
51	NC_020939	AAC	2	6	2959	2964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478448620
52	NC_020939	GGT	2	6	3013	3018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478448620
53	NC_020939	AAT	2	6	3119	3124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478448620
54	NC_020939	TTC	2	6	3154	3159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448620
55	NC_020939	GCA	2	6	3173	3178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478448620
56	NC_020939	GGA	2	6	3221	3226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478448620
57	NC_020939	CAG	2	6	3240	3245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478448620
58	NC_020939	GTT	2	6	3257	3262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478448620
59	NC_020939	GGT	2	6	3349	3354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478448620
60	NC_020939	AAG	2	6	3507	3512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448620
61	NC_020939	ATT	2	6	3569	3574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478448620
62	NC_020939	TTG	2	6	3621	3626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478448620
63	NC_020939	AAG	2	6	3732	3737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448620
64	NC_020939	AAG	2	6	3747	3752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448620
65	NC_020939	CAG	2	6	3789	3794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478448620
66	NC_020939	GCT	2	6	3860	3865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478448620
67	NC_020939	AAG	2	6	4026	4031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448620
68	NC_020939	CAG	2	6	4076	4081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478448620
69	NC_020939	GGA	2	6	4163	4168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478448620
70	NC_020939	AAT	2	6	4173	4178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478448620
71	NC_020939	ATT	2	6	4253	4258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478448621
72	NC_020939	TGA	2	6	4283	4288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478448621
73	NC_020939	GTA	2	6	4515	4520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478448621
74	NC_020939	AGA	2	6	4562	4567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448621
75	NC_020939	GAA	2	6	4746	4751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448621
76	NC_020939	CGT	2	6	4878	4883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478448621
77	NC_020939	GTT	2	6	4929	4934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478448621
78	NC_020939	TGA	2	6	5066	5071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478448621
79	NC_020939	TTG	2	6	5161	5166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478448621
80	NC_020939	TTC	2	6	5302	5307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448621
81	NC_020939	TCT	2	6	5394	5399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448621
82	NC_020939	AGA	2	6	5414	5419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448621
83	NC_020939	GTT	2	6	5441	5446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478448621
84	NC_020939	GGT	2	6	5489	5494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478448621
85	NC_020939	CTC	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478448621
86	NC_020939	AGC	2	6	5624	5629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478448621
87	NC_020939	GCA	2	6	5649	5654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_020939	AGA	2	6	5676	5681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020939	ATT	2	6	5743	5748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478448622
90	NC_020939	TCT	2	6	5761	5766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448622
91	NC_020939	GCT	2	6	5807	5812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478448622
92	NC_020939	GAT	2	6	5842	5847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478448622
93	NC_020939	ACG	2	6	5880	5885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478448622
94	NC_020939	GAA	2	6	5904	5909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448622
95	NC_020939	AGA	3	9	5981	5989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448622
96	NC_020939	GCT	2	6	5990	5995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478448622
97	NC_020939	AGA	2	6	5999	6004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448622
98	NC_020939	TGG	2	6	6035	6040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478448622
99	NC_020939	AGA	3	9	6053	6061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448622
100	NC_020939	GGA	2	6	6062	6067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478448622
101	NC_020939	TCA	2	6	6247	6252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478448622
102	NC_020939	GGA	2	6	6284	6289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478448622
103	NC_020939	CTT	2	6	6344	6349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448622
104	NC_020939	CTG	2	6	6350	6355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478448622
105	NC_020939	CAG	2	6	6505	6510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478448622
106	NC_020939	CTT	2	6	6956	6961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_020939	AGG	2	6	7034	7039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478448623
108	NC_020939	GAA	2	6	7078	7083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448623
109	NC_020939	GCA	2	6	7342	7347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478448623
110	NC_020939	AAG	2	6	7383	7388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448623
111	NC_020939	TGC	2	6	7416	7421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478448623
112	NC_020939	TTA	2	6	7748	7753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020939	GAA	2	6	7797	7802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020939	ATG	2	6	7833	7838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020939	TCC	2	6	7953	7958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478448624
116	NC_020939	GTT	2	6	8061	8066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478448624
117	NC_020939	TTA	2	6	8431	8436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478448624
118	NC_020939	TTC	2	6	8754	8759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448624
119	NC_020939	GAA	2	6	8898	8903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448625
120	NC_020939	ACC	2	6	9026	9031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478448625
121	NC_020939	CTT	2	6	9079	9084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448625
122	NC_020939	GAG	2	6	9159	9164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478448625
123	NC_020939	ATA	2	6	9176	9181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478448625
124	NC_020939	AGG	2	6	9200	9205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478448625
125	NC_020939	GAA	2	6	9380	9385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448625
126	NC_020939	CAG	2	6	9396	9401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478448625
127	NC_020939	TGT	2	6	9467	9472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478448625
128	NC_020939	GAG	2	6	9482	9487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478448625
129	NC_020939	TAC	2	6	9550	9555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478448625
130	NC_020939	GTT	2	6	9654	9659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478448625
131	NC_020939	AAG	2	6	9678	9683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448625
132	NC_020939	GAG	2	6	9704	9709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478448625
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134	NC_020939	ATC	2	6	9787	9792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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250	NC_020939	AAT	3	9	19031	19039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_020939	TCT	2	6	19059	19064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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258	NC_020939	GAA	2	6	19607	19612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448634
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