MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/795 complete genome

Total Repeats: 648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020938	TGTGA	2	10	3878	3887	20 %	40 %	40 %	0 %	478469373
2	NC_020938	TTGAA	2	10	4234	4243	40 %	40 %	20 %	0 %	478469374
3	NC_020938	GAGAA	2	10	4528	4537	60 %	0 %	40 %	0 %	478469374
4	NC_020938	GAAAA	2	10	4965	4974	80 %	0 %	20 %	0 %	478469374
5	NC_020938	TTACA	2	10	5120	5129	40 %	40 %	0 %	20 %	478469374
6	NC_020938	GTCTT	2	10	5816	5825	0 %	60 %	20 %	20 %	478469375
7	NC_020938	TGGTA	2	10	8289	8298	20 %	40 %	40 %	0 %	478469377
8	NC_020938	CGAAA	2	10	9697	9706	60 %	0 %	20 %	20 %	478469378
9	NC_020938	GGCTG	2	10	10333	10342	0 %	20 %	60 %	20 %	478469379
10	NC_020938	CCTCT	2	10	11125	11134	0 %	40 %	0 %	60 %	478469380
11	NC_020938	AAAGG	2	10	11284	11293	60 %	0 %	40 %	0 %	478469380
12	NC_020938	AAGAA	2	10	12404	12413	80 %	0 %	20 %	0 %	478469381
13	NC_020938	AAAGA	2	10	13802	13811	80 %	0 %	20 %	0 %	478469382
14	NC_020938	GATTT	2	10	15649	15658	20 %	60 %	20 %	0 %	478469384
15	NC_020938	CGTTC	2	10	16760	16769	0 %	40 %	20 %	40 %	478469385
16	NC_020938	GCTTC	2	10	17133	17142	0 %	40 %	20 %	40 %	478469385
17	NC_020938	GAAGG	2	10	17504	17513	40 %	0 %	60 %	0 %	478469385
18	NC_020938	GTTGT	2	10	20930	20939	0 %	60 %	40 %	0 %	478469388
19	NC_020938	AAGAT	2	10	22042	22051	60 %	20 %	20 %	0 %	478469389
20	NC_020938	TTTGC	2	10	22653	22662	0 %	60 %	20 %	20 %	478469389
21	NC_020938	GGAAA	2	10	24407	24416	60 %	0 %	40 %	0 %	478469389
22	NC_020938	AGAGG	2	10	26132	26141	40 %	0 %	60 %	0 %	478469390
23	NC_020938	GGAGA	2	10	27911	27920	40 %	0 %	60 %	0 %	478469391
24	NC_020938	GGATA	2	10	27937	27946	40 %	20 %	40 %	0 %	478469391
25	NC_020938	ATCCG	2	10	28662	28671	20 %	20 %	20 %	40 %	478469393
26	NC_020938	AGGGT	2	10	29180	29189	20 %	20 %	60 %	0 %	478469393
27	NC_020938	CCTAT	2	10	30220	30229	20 %	40 %	0 %	40 %	478469394
28	NC_020938	GAAGG	2	10	31019	31028	40 %	0 %	60 %	0 %	478469395
29	NC_020938	GAGCT	2	10	32059	32068	20 %	20 %	40 %	20 %	478469396
30	NC_020938	CTATT	2	10	36733	36742	20 %	60 %	0 %	20 %	478469402
31	NC_020938	TCCTA	2	10	36780	36789	20 %	40 %	0 %	40 %	478469402
32	NC_020938	ACGAT	2	10	38695	38704	40 %	20 %	20 %	20 %	478469403
33	NC_020938	AATTT	2	10	39586	39595	40 %	60 %	0 %	0 %	478469404
34	NC_020938	AGCAA	2	10	42710	42719	60 %	0 %	20 %	20 %	478469406
35	NC_020938	CGATG	2	10	42767	42776	20 %	20 %	40 %	20 %	478469406
36	NC_020938	TTTAT	2	10	44770	44779	20 %	80 %	0 %	0 %	478469409
37	NC_020938	CTTTC	2	10	46866	46875	0 %	60 %	0 %	40 %	478469411
38	NC_020938	AGTTT	2	10	47405	47414	20 %	60 %	20 %	0 %	478469411
39	NC_020938	CTTTT	2	10	50570	50579	0 %	80 %	0 %	20 %	478469414
40	NC_020938	CCGTA	2	10	54404	54413	20 %	20 %	20 %	40 %	478469417
41	NC_020938	TTATC	2	10	55807	55816	20 %	60 %	0 %	20 %	478469418
42	NC_020938	GTTGT	2	10	56872	56881	0 %	60 %	40 %	0 %	478469419
43	NC_020938	GAGCA	2	10	60235	60244	40 %	0 %	40 %	20 %	478469421
44	NC_020938	TGTGA	2	10	62684	62693	20 %	40 %	40 %	0 %	478469423
45	NC_020938	AGTGA	2	10	64205	64214	40 %	20 %	40 %	0 %	478469424
46	NC_020938	CCTTC	2	10	64479	64488	0 %	40 %	0 %	60 %	478469424
47	NC_020938	AGGAG	2	10	66707	66716	40 %	0 %	60 %	0 %	478469426
48	NC_020938	GTTAA	2	10	66837	66846	40 %	40 %	20 %	0 %	478469426
49	NC_020938	CAAGC	2	10	69203	69212	40 %	0 %	20 %	40 %	478469428
50	NC_020938	GGAGC	2	10	70073	70082	20 %	0 %	60 %	20 %	478469429
51	NC_020938	GCGAT	2	10	70263	70272	20 %	20 %	40 %	20 %	478469429
52	NC_020938	CTCTT	2	10	70617	70626	0 %	60 %	0 %	40 %	478469429
53	NC_020938	AGGGG	2	10	71263	71272	20 %	0 %	80 %	0 %	478469429
54	NC_020938	AAGAA	2	10	71305	71314	80 %	0 %	20 %	0 %	478469429
55	NC_020938	ATTGG	2	10	72595	72604	20 %	40 %	40 %	0 %	478469431
56	NC_020938	GAAAA	2	10	73667	73676	80 %	0 %	20 %	0 %	478469431
57	NC_020938	TGGGA	2	10	74084	74093	20 %	20 %	60 %	0 %	478469432
58	NC_020938	TATTT	2	10	76611	76620	20 %	80 %	0 %	0 %	478469433
59	NC_020938	TGTCT	2	10	80406	80415	0 %	60 %	20 %	20 %	478469436
60	NC_020938	TTACT	2	10	80913	80922	20 %	60 %	0 %	20 %	478469436
61	NC_020938	AGAAA	2	10	82303	82312	80 %	0 %	20 %	0 %	478469438
62	NC_020938	GGAAG	2	10	82816	82825	40 %	0 %	60 %	0 %	478469438
63	NC_020938	AGCGA	2	10	85282	85291	40 %	0 %	40 %	20 %	478469440
64	NC_020938	GATCC	2	10	86367	86376	20 %	20 %	20 %	40 %	478469441
65	NC_020938	AGAGC	2	10	87702	87711	40 %	0 %	40 %	20 %	478469442
66	NC_020938	TTTTC	2	10	91434	91443	0 %	80 %	0 %	20 %	478469445
67	NC_020938	GGATG	2	10	91694	91703	20 %	20 %	60 %	0 %	478469446
68	NC_020938	CAACA	2	10	93233	93242	60 %	0 %	0 %	40 %	478469447
69	NC_020938	ACAGC	2	10	94278	94287	40 %	0 %	20 %	40 %	478469448
70	NC_020938	GGAAC	2	10	94990	94999	40 %	0 %	40 %	20 %	478469449
71	NC_020938	GGATT	2	10	95890	95899	20 %	40 %	40 %	0 %	478469449
72	NC_020938	CAATC	2	10	96992	97001	40 %	20 %	0 %	40 %	478469451
73	NC_020938	TTTGC	2	10	97126	97135	0 %	60 %	20 %	20 %	478469451
74	NC_020938	ATTCA	2	10	97390	97399	40 %	40 %	0 %	20 %	478469451
75	NC_020938	GATCC	2	10	97649	97658	20 %	20 %	20 %	40 %	478469451
76	NC_020938	GTTTT	2	10	98070	98079	0 %	80 %	20 %	0 %	478469451
77	NC_020938	AAGCT	2	10	99275	99284	40 %	20 %	20 %	20 %	478469452
78	NC_020938	AGGGG	2	10	99634	99643	20 %	0 %	80 %	0 %	478469452
79	NC_020938	ATAGC	2	10	100327	100336	40 %	20 %	20 %	20 %	478469453
80	NC_020938	TTCCC	2	10	100931	100940	0 %	40 %	0 %	60 %	478469454
81	NC_020938	AGCGA	2	10	103255	103264	40 %	0 %	40 %	20 %	478469456
82	NC_020938	TTTCT	2	10	103613	103622	0 %	80 %	0 %	20 %	478469456
83	NC_020938	CTTCT	2	10	103667	103676	0 %	60 %	0 %	40 %	478469456
84	NC_020938	ATCAT	2	10	104819	104828	40 %	40 %	0 %	20 %	478469457
85	NC_020938	GGCAT	2	10	105527	105536	20 %	20 %	40 %	20 %	478469457
86	NC_020938	AAAGC	2	10	109253	109262	60 %	0 %	20 %	20 %	478469460
87	NC_020938	GCATT	2	10	110413	110422	20 %	40 %	20 %	20 %	478469462
88	NC_020938	TGTTT	2	10	115102	115111	0 %	80 %	20 %	0 %	478469465
89	NC_020938	CATGT	2	10	115480	115489	20 %	40 %	20 %	20 %	478469465
90	NC_020938	TATCG	2	10	116184	116193	20 %	40 %	20 %	20 %	478469465
91	NC_020938	TTTCT	2	10	116700	116709	0 %	80 %	0 %	20 %	478469466
92	NC_020938	GGAGA	2	10	116896	116905	40 %	0 %	60 %	0 %	478469466
93	NC_020938	AAAGA	2	10	118947	118956	80 %	0 %	20 %	0 %	478469469
94	NC_020938	CCAAT	2	10	121910	121919	40 %	20 %	0 %	40 %	478469472
95	NC_020938	GCTTC	2	10	123011	123020	0 %	40 %	20 %	40 %	478469472
96	NC_020938	TACAA	2	10	126800	126809	60 %	20 %	0 %	20 %	478469476
97	NC_020938	ATCCA	2	10	129207	129216	40 %	20 %	0 %	40 %	478469480
98	NC_020938	GAAGA	2	10	130757	130766	60 %	0 %	40 %	0 %	478469480
99	NC_020938	AAAAG	2	10	132669	132678	80 %	0 %	20 %	0 %	478469481
100	NC_020938	GATTC	2	10	133000	133009	20 %	40 %	20 %	20 %	478469481
101	NC_020938	GGATA	2	10	135618	135627	40 %	20 %	40 %	0 %	478469483
102	NC_020938	ATTGT	2	10	136315	136324	20 %	60 %	20 %	0 %	478469484
103	NC_020938	TCCAG	2	10	140487	140496	20 %	20 %	20 %	40 %	478469491
104	NC_020938	GTACA	2	10	141218	141227	40 %	20 %	20 %	20 %	478469492
105	NC_020938	TAGAT	2	10	141591	141600	40 %	40 %	20 %	0 %	478469492
106	NC_020938	AAAAC	2	10	142483	142492	80 %	0 %	0 %	20 %	478469493
107	NC_020938	TGCTA	2	10	143569	143578	20 %	40 %	20 %	20 %	478469495
108	NC_020938	GGAGC	2	10	143616	143625	20 %	0 %	60 %	20 %	478469495
109	NC_020938	CTGGG	2	10	145031	145040	0 %	20 %	60 %	20 %	478469497
110	NC_020938	GTTTT	2	10	145778	145787	0 %	80 %	20 %	0 %	478469498
111	NC_020938	GAACC	2	10	149512	149521	40 %	0 %	20 %	40 %	478469499
112	NC_020938	ATTCT	2	10	153009	153018	20 %	60 %	0 %	20 %	478469503
113	NC_020938	CTGTG	2	10	153213	153222	0 %	40 %	40 %	20 %	478469503
114	NC_020938	TTCTT	2	10	155686	155695	0 %	80 %	0 %	20 %	478469506
115	NC_020938	AGGAA	2	10	160245	160254	60 %	0 %	40 %	0 %	478469510
116	NC_020938	AGAGA	2	10	163485	163494	60 %	0 %	40 %	0 %	478469513
117	NC_020938	AGCAA	2	10	163920	163929	60 %	0 %	20 %	20 %	478469513
118	NC_020938	TATGA	2	10	164344	164353	40 %	40 %	20 %	0 %	478469514
119	NC_020938	CAAAA	2	10	167423	167432	80 %	0 %	0 %	20 %	478469515
120	NC_020938	AAGAG	2	10	168256	168265	60 %	0 %	40 %	0 %	478469515
121	NC_020938	GATTG	2	10	168601	168610	20 %	40 %	40 %	0 %	478469515
122	NC_020938	GTTTT	2	10	175080	175089	0 %	80 %	20 %	0 %	478469519
123	NC_020938	TATTG	2	10	175103	175112	20 %	60 %	20 %	0 %	478469519
124	NC_020938	CAGCA	2	10	175462	175471	40 %	0 %	20 %	40 %	478469519
125	NC_020938	TAGGA	2	10	175767	175776	40 %	20 %	40 %	0 %	478469520
126	NC_020938	TGATT	2	10	177694	177703	20 %	60 %	20 %	0 %	478469521
127	NC_020938	TCAAT	2	10	178335	178344	40 %	40 %	0 %	20 %	478469521
128	NC_020938	TTTTC	2	10	178374	178383	0 %	80 %	0 %	20 %	478469521
129	NC_020938	GGAAT	2	10	179933	179942	40 %	20 %	40 %	0 %	478469523
130	NC_020938	AGAGT	2	10	181320	181329	40 %	20 %	40 %	0 %	478469525
131	NC_020938	TTGAA	2	10	182010	182019	40 %	40 %	20 %	0 %	478469526
132	NC_020938	TGAGT	2	10	182824	182833	20 %	40 %	40 %	0 %	478469526
133	NC_020938	AGGGG	2	10	183021	183030	20 %	0 %	80 %	0 %	478469526
134	NC_020938	TTGAG	2	10	183571	183580	20 %	40 %	40 %	0 %	478469527
135	NC_020938	ATAGA	2	10	183593	183602	60 %	20 %	20 %	0 %	478469527
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