MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/795 complete genome

Total Repeats: 2505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020938	GGAT	2	8	57	64	25 %	25 %	50 %	0 %	478469370
2	NC_020938	GGGA	2	8	394	401	25 %	0 %	75 %	0 %	478469370
3	NC_020938	AGTG	2	8	544	551	25 %	25 %	50 %	0 %	478469370
4	NC_020938	TGGC	2	8	578	585	0 %	25 %	50 %	25 %	478469370
5	NC_020938	AATG	2	8	1063	1070	50 %	25 %	25 %	0 %	478469370
6	NC_020938	CTAT	2	8	1397	1404	25 %	50 %	0 %	25 %	478469370
7	NC_020938	AGTA	2	8	2086	2093	50 %	25 %	25 %	0 %	478469371
8	NC_020938	ATGA	2	8	2490	2497	50 %	25 %	25 %	0 %	478469372
9	NC_020938	GATA	2	8	2528	2535	50 %	25 %	25 %	0 %	478469372
10	NC_020938	CATG	2	8	3706	3713	25 %	25 %	25 %	25 %	478469373
11	NC_020938	TTCC	2	8	4011	4018	0 %	50 %	0 %	50 %	478469373
12	NC_020938	TTTA	2	8	4409	4416	25 %	75 %	0 %	0 %	478469374
13	NC_020938	ATCC	2	8	4709	4716	25 %	25 %	0 %	50 %	478469374
14	NC_020938	GACG	2	8	5456	5463	25 %	0 %	50 %	25 %	478469374
15	NC_020938	TTGG	2	8	5559	5566	0 %	50 %	50 %	0 %	478469374
16	NC_020938	TGGA	2	8	5920	5927	25 %	25 %	50 %	0 %	478469375
17	NC_020938	CTTT	2	8	6297	6304	0 %	75 %	0 %	25 %	478469375
18	NC_020938	GGGA	2	8	6812	6819	25 %	0 %	75 %	0 %	478469375
19	NC_020938	GGTG	2	8	7115	7122	0 %	25 %	75 %	0 %	478469376
20	NC_020938	AAAT	2	8	7181	7188	75 %	25 %	0 %	0 %	478469376
21	NC_020938	AAGC	2	8	8419	8426	50 %	0 %	25 %	25 %	478469377
22	NC_020938	ATTG	2	8	8817	8824	25 %	50 %	25 %	0 %	478469378
23	NC_020938	AGCG	2	8	9284	9291	25 %	0 %	50 %	25 %	478469378
24	NC_020938	AAAG	2	8	9305	9312	75 %	0 %	25 %	0 %	478469378
25	NC_020938	CTTT	2	8	9645	9652	0 %	75 %	0 %	25 %	478469378
26	NC_020938	TTCG	2	8	10019	10026	0 %	50 %	25 %	25 %	478469379
27	NC_020938	AATT	2	8	10124	10131	50 %	50 %	0 %	0 %	478469379
28	NC_020938	ATGG	2	8	10183	10190	25 %	25 %	50 %	0 %	478469379
29	NC_020938	CTTT	2	8	10808	10815	0 %	75 %	0 %	25 %	478469380
30	NC_020938	GCAA	2	8	11025	11032	50 %	0 %	25 %	25 %	478469380
31	NC_020938	AGCC	2	8	11255	11262	25 %	0 %	25 %	50 %	478469380
32	NC_020938	GAAA	2	8	11398	11405	75 %	0 %	25 %	0 %	478469380
33	NC_020938	GTTT	2	8	13173	13180	0 %	75 %	25 %	0 %	478469382
34	NC_020938	ATGC	2	8	13603	13610	25 %	25 %	25 %	25 %	478469382
35	NC_020938	TTGT	2	8	14639	14646	0 %	75 %	25 %	0 %	478469383
36	NC_020938	TTCT	2	8	14810	14817	0 %	75 %	0 %	25 %	478469383
37	NC_020938	ATTT	2	8	15016	15023	25 %	75 %	0 %	0 %	478469383
38	NC_020938	TTTC	2	8	15678	15685	0 %	75 %	0 %	25 %	478469384
39	NC_020938	AAAT	2	8	16160	16167	75 %	25 %	0 %	0 %	478469384
40	NC_020938	CTAT	2	8	16859	16866	25 %	50 %	0 %	25 %	478469385
41	NC_020938	GTAA	2	8	17002	17009	50 %	25 %	25 %	0 %	478469385
42	NC_020938	CTAA	2	8	17195	17202	50 %	25 %	0 %	25 %	478469385
43	NC_020938	AGAA	2	8	17458	17465	75 %	0 %	25 %	0 %	478469385
44	NC_020938	ATTT	2	8	17604	17611	25 %	75 %	0 %	0 %	478469385
45	NC_020938	TGCG	2	8	19126	19133	0 %	25 %	50 %	25 %	478469387
46	NC_020938	GAAG	2	8	20110	20117	50 %	0 %	50 %	0 %	478469387
47	NC_020938	GATG	2	8	22244	22251	25 %	25 %	50 %	0 %	478469389
48	NC_020938	CATT	2	8	23303	23310	25 %	50 %	0 %	25 %	478469389
49	NC_020938	GCTT	2	8	23646	23653	0 %	50 %	25 %	25 %	478469389
50	NC_020938	GGTT	2	8	23694	23701	0 %	50 %	50 %	0 %	478469389
51	NC_020938	TTCT	2	8	24064	24071	0 %	75 %	0 %	25 %	478469389
52	NC_020938	TAAC	2	8	24166	24173	50 %	25 %	0 %	25 %	478469389
53	NC_020938	CATT	2	8	24289	24296	25 %	50 %	0 %	25 %	478469389
54	NC_020938	GGTA	2	8	24659	24666	25 %	25 %	50 %	0 %	478469389
55	NC_020938	TTGA	2	8	25654	25661	25 %	50 %	25 %	0 %	478469390
56	NC_020938	TAGG	2	8	25878	25885	25 %	25 %	50 %	0 %	478469390
57	NC_020938	TTCC	2	8	26002	26009	0 %	50 %	0 %	50 %	478469390
58	NC_020938	TAGG	2	8	26116	26123	25 %	25 %	50 %	0 %	478469390
59	NC_020938	GCTT	2	8	26888	26895	0 %	50 %	25 %	25 %	478469390
60	NC_020938	GGAA	2	8	27471	27478	50 %	0 %	50 %	0 %	478469391
61	NC_020938	TTAA	2	8	27544	27551	50 %	50 %	0 %	0 %	478469391
62	NC_020938	AAAG	2	8	27594	27601	75 %	0 %	25 %	0 %	478469391
63	NC_020938	GTTT	2	8	28157	28164	0 %	75 %	25 %	0 %	478469392
64	NC_020938	CAGA	2	8	28179	28186	50 %	0 %	25 %	25 %	478469392
65	NC_020938	CTTT	2	8	30151	30158	0 %	75 %	0 %	25 %	478469394
66	NC_020938	TTTG	2	8	30166	30173	0 %	75 %	25 %	0 %	478469394
67	NC_020938	TTGT	2	8	30201	30208	0 %	75 %	25 %	0 %	478469394
68	NC_020938	TGGC	2	8	30364	30371	0 %	25 %	50 %	25 %	478469394
69	NC_020938	AAAG	2	8	30924	30931	75 %	0 %	25 %	0 %	478469395
70	NC_020938	AAAC	2	8	30994	31001	75 %	0 %	0 %	25 %	478469395
71	NC_020938	GATG	2	8	31137	31144	25 %	25 %	50 %	0 %	478469395
72	NC_020938	GATA	2	8	32246	32253	50 %	25 %	25 %	0 %	478469397
73	NC_020938	TGAT	2	8	34741	34748	25 %	50 %	25 %	0 %	478469400
74	NC_020938	AAGA	3	12	34869	34880	75 %	0 %	25 %	0 %	478469400
75	NC_020938	AAGC	2	8	35089	35096	50 %	0 %	25 %	25 %	478469401
76	NC_020938	GTTC	2	8	35122	35129	0 %	50 %	25 %	25 %	478469401
77	NC_020938	GGCA	2	8	35501	35508	25 %	0 %	50 %	25 %	478469402
78	NC_020938	TGCT	2	8	35911	35918	0 %	50 %	25 %	25 %	478469402
79	NC_020938	TTGG	2	8	36143	36150	0 %	50 %	50 %	0 %	478469402
80	NC_020938	AGAT	2	8	36863	36870	50 %	25 %	25 %	0 %	478469402
81	NC_020938	CTTT	2	8	37235	37242	0 %	75 %	0 %	25 %	478469403
82	NC_020938	ATGA	2	8	37725	37732	50 %	25 %	25 %	0 %	478469403
83	NC_020938	TAGG	2	8	37884	37891	25 %	25 %	50 %	0 %	478469403
84	NC_020938	CAAT	2	8	38068	38075	50 %	25 %	0 %	25 %	478469403
85	NC_020938	AATG	2	8	38855	38862	50 %	25 %	25 %	0 %	478469403
86	NC_020938	AGAA	2	8	39692	39699	75 %	0 %	25 %	0 %	478469404
87	NC_020938	AAGA	2	8	39744	39751	75 %	0 %	25 %	0 %	478469404
88	NC_020938	ATCC	2	8	39752	39759	25 %	25 %	0 %	50 %	478469404
89	NC_020938	TAAT	2	8	39963	39970	50 %	50 %	0 %	0 %	478469404
90	NC_020938	GTGC	2	8	42051	42058	0 %	25 %	50 %	25 %	478469406
91	NC_020938	AGAA	2	8	42470	42477	75 %	0 %	25 %	0 %	478469406
92	NC_020938	GGAT	2	8	42622	42629	25 %	25 %	50 %	0 %	478469406
93	NC_020938	AAAC	2	8	43761	43768	75 %	0 %	0 %	25 %	478469408
94	NC_020938	CAAT	2	8	43965	43972	50 %	25 %	0 %	25 %	478469408
95	NC_020938	ATTT	2	8	44721	44728	25 %	75 %	0 %	0 %	478469409
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99	NC_020938	TGTT	2	8	45943	45950	0 %	75 %	25 %	0 %	478469410
100	NC_020938	CTAT	2	8	45973	45980	25 %	50 %	0 %	25 %	478469410
101	NC_020938	TGTT	2	8	46002	46009	0 %	75 %	25 %	0 %	478469410
102	NC_020938	CTAT	2	8	46298	46305	25 %	50 %	0 %	25 %	478469410
103	NC_020938	AAGA	2	8	46793	46800	75 %	0 %	25 %	0 %	478469411
104	NC_020938	AAGA	2	8	46850	46857	75 %	0 %	25 %	0 %	478469411
105	NC_020938	AAAG	2	8	46890	46897	75 %	0 %	25 %	0 %	478469411
106	NC_020938	AAGA	2	8	47005	47012	75 %	0 %	25 %	0 %	478469411
107	NC_020938	ACTT	2	8	47266	47273	25 %	50 %	0 %	25 %	478469411
108	NC_020938	ATGG	2	8	47892	47899	25 %	25 %	50 %	0 %	478469411
109	NC_020938	AGGA	2	8	47923	47930	50 %	0 %	50 %	0 %	478469411
110	NC_020938	GAAC	2	8	48470	48477	50 %	0 %	25 %	25 %	478469411
111	NC_020938	AACA	2	8	48714	48721	75 %	0 %	0 %	25 %	478469412
112	NC_020938	CTTT	2	8	48910	48917	0 %	75 %	0 %	25 %	478469412
113	NC_020938	CTTT	2	8	49795	49802	0 %	75 %	0 %	25 %	478469413
114	NC_020938	GTAG	2	8	49813	49820	25 %	25 %	50 %	0 %	478469413
115	NC_020938	GAAG	2	8	51243	51250	50 %	0 %	50 %	0 %	478469414
116	NC_020938	TTCA	2	8	51665	51672	25 %	50 %	0 %	25 %	478469414
117	NC_020938	TCTA	2	8	51882	51889	25 %	50 %	0 %	25 %	478469414
118	NC_020938	GGAA	2	8	52999	53006	50 %	0 %	50 %	0 %	478469416
119	NC_020938	TTAA	2	8	53740	53747	50 %	50 %	0 %	0 %	478469416
120	NC_020938	CCTT	2	8	53947	53954	0 %	50 %	0 %	50 %	478469417
121	NC_020938	TTTA	2	8	54114	54121	25 %	75 %	0 %	0 %	478469417
122	NC_020938	AAAG	2	8	54338	54345	75 %	0 %	25 %	0 %	478469417
123	NC_020938	GATT	2	8	54475	54482	25 %	50 %	25 %	0 %	478469417
124	NC_020938	AATC	2	8	54530	54537	50 %	25 %	0 %	25 %	478469417
125	NC_020938	TATT	2	8	54591	54598	25 %	75 %	0 %	0 %	478469417
126	NC_020938	TCGA	2	8	54979	54986	25 %	25 %	25 %	25 %	478469418
127	NC_020938	CTTC	2	8	55073	55080	0 %	50 %	0 %	50 %	478469418
128	NC_020938	GAAT	2	8	55108	55115	50 %	25 %	25 %	0 %	478469418
129	NC_020938	TTGA	2	8	55178	55185	25 %	50 %	25 %	0 %	478469418
130	NC_020938	GGAA	2	8	55534	55541	50 %	0 %	50 %	0 %	478469418
131	NC_020938	AGAA	2	8	55880	55887	75 %	0 %	25 %	0 %	478469418
132	NC_020938	CTGG	3	12	56445	56456	0 %	25 %	50 %	25 %	478469419
133	NC_020938	TTGC	2	8	56579	56586	0 %	50 %	25 %	25 %	478469419
134	NC_020938	AGCG	2	8	56619	56626	25 %	0 %	50 %	25 %	478469419
135	NC_020938	AGCT	2	8	57078	57085	25 %	25 %	25 %	25 %	478469419
136	NC_020938	TTTG	2	8	57312	57319	0 %	75 %	25 %	0 %	478469419
137	NC_020938	GGTT	2	8	57772	57779	0 %	50 %	50 %	0 %	478469419
138	NC_020938	GAAA	2	8	58566	58573	75 %	0 %	25 %	0 %	478469420
139	NC_020938	AGGT	2	8	58605	58612	25 %	25 %	50 %	0 %	478469420
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