MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L1/440/LN complete genome

Total Repeats: 2384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020937	GA	3	6	212	217	50 %	0 %	50 %	0 %	478447724
2	NC_020937	AG	3	6	844	849	50 %	0 %	50 %	0 %	478447724
3	NC_020937	TC	3	6	2195	2200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020937	TC	3	6	2267	2272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020937	AG	3	6	2750	2755	50 %	0 %	50 %	0 %	478447727
6	NC_020937	TC	3	6	2831	2836	0 %	50 %	0 %	50 %	478447727
7	NC_020937	GA	3	6	3418	3423	50 %	0 %	50 %	0 %	478447727
8	NC_020937	AT	3	6	5111	5116	50 %	50 %	0 %	0 %	478447728
9	NC_020937	TC	3	6	5861	5866	0 %	50 %	0 %	50 %	478447729
10	NC_020937	GA	3	6	5872	5877	50 %	0 %	50 %	0 %	478447729
11	NC_020937	AT	3	6	5976	5981	50 %	50 %	0 %	0 %	478447729
12	NC_020937	TG	3	6	6129	6134	0 %	50 %	50 %	0 %	478447729
13	NC_020937	TA	3	6	6200	6205	50 %	50 %	0 %	0 %	478447729
14	NC_020937	AG	3	6	6537	6542	50 %	0 %	50 %	0 %	478447729
15	NC_020937	GA	3	6	7595	7600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020937	AC	3	6	8246	8251	50 %	0 %	0 %	50 %	478447731
17	NC_020937	AG	3	6	8989	8994	50 %	0 %	50 %	0 %	478447732
18	NC_020937	CT	4	8	9108	9115	0 %	50 %	0 %	50 %	478447732
19	NC_020937	GT	3	6	9190	9195	0 %	50 %	50 %	0 %	478447732
20	NC_020937	AG	3	6	9950	9955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020937	GA	3	6	10466	10471	50 %	0 %	50 %	0 %	478447734
22	NC_020937	AG	3	6	10683	10688	50 %	0 %	50 %	0 %	478447734
23	NC_020937	TA	3	6	11848	11853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020937	AG	3	6	11909	11914	50 %	0 %	50 %	0 %	478447735
25	NC_020937	TA	3	6	12469	12474	50 %	50 %	0 %	0 %	478447735
26	NC_020937	TG	3	6	13372	13377	0 %	50 %	50 %	0 %	478447736
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28	NC_020937	AG	4	8	13677	13684	50 %	0 %	50 %	0 %	478447736
29	NC_020937	TA	3	6	13939	13944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020937	TA	4	8	14163	14170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020937	AC	3	6	15006	15011	50 %	0 %	0 %	50 %	478447737
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34	NC_020937	TC	3	6	16385	16390	0 %	50 %	0 %	50 %	478447738
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39	NC_020937	GA	3	6	18128	18133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020937	GA	3	6	18372	18377	50 %	0 %	50 %	0 %	478447740
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44	NC_020937	GA	3	6	19265	19270	50 %	0 %	50 %	0 %	478447741
45	NC_020937	GA	3	6	19364	19369	50 %	0 %	50 %	0 %	478447741
46	NC_020937	AG	3	6	19830	19835	50 %	0 %	50 %	0 %	478447741
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71	NC_020937	TG	3	6	28992	28997	0 %	50 %	50 %	0 %	478447747
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