MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams5 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020936	TGTGA	2	10	3878	3887	20 %	40 %	40 %	0 %	478450429
2	NC_020936	TTGAA	2	10	4234	4243	40 %	40 %	20 %	0 %	478450430
3	NC_020936	GAGAA	2	10	4528	4537	60 %	0 %	40 %	0 %	478450430
4	NC_020936	GAAAA	2	10	4965	4974	80 %	0 %	20 %	0 %	478450430
5	NC_020936	TTACA	2	10	5120	5129	40 %	40 %	0 %	20 %	478450430
6	NC_020936	GTCTT	2	10	5816	5825	0 %	60 %	20 %	20 %	478450431
7	NC_020936	TATTT	2	10	7631	7640	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020936	TGGTA	2	10	8289	8298	20 %	40 %	40 %	0 %	478450433
9	NC_020936	CGAAA	2	10	9697	9706	60 %	0 %	20 %	20 %	478450434
10	NC_020936	GGCTG	2	10	10333	10342	0 %	20 %	60 %	20 %	478450435
11	NC_020936	CCTCT	2	10	11125	11134	0 %	40 %	0 %	60 %	478450436
12	NC_020936	AAAGG	2	10	11284	11293	60 %	0 %	40 %	0 %	478450436
13	NC_020936	AAAGA	2	10	13787	13796	80 %	0 %	20 %	0 %	478450438
14	NC_020936	GGTGT	2	10	13891	13900	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020936	GATTT	2	10	15634	15643	20 %	60 %	20 %	0 %	478450440
16	NC_020936	CGTTC	2	10	16745	16754	0 %	40 %	20 %	40 %	478450441
17	NC_020936	GCTTC	2	10	17118	17127	0 %	40 %	20 %	40 %	478450441
18	NC_020936	GAAGG	2	10	17489	17498	40 %	0 %	60 %	0 %	478450441
19	NC_020936	GTTGT	2	10	20915	20924	0 %	60 %	40 %	0 %	478450444
20	NC_020936	AAGAT	2	10	22027	22036	60 %	20 %	20 %	0 %	478450445
21	NC_020936	TTTGC	2	10	22638	22647	0 %	60 %	20 %	20 %	478450445
22	NC_020936	GGAAA	2	10	24392	24401	60 %	0 %	40 %	0 %	478450445
23	NC_020936	AGAGG	2	10	26117	26126	40 %	0 %	60 %	0 %	478450446
24	NC_020936	GGAGA	2	10	27896	27905	40 %	0 %	60 %	0 %	478450447
25	NC_020936	GGATA	2	10	27922	27931	40 %	20 %	40 %	0 %	478450447
26	NC_020936	ATCCG	2	10	28647	28656	20 %	20 %	20 %	40 %	478450449
27	NC_020936	AGGGT	2	10	29165	29174	20 %	20 %	60 %	0 %	478450449
28	NC_020936	CCTAT	2	10	30205	30214	20 %	40 %	0 %	40 %	478450450
29	NC_020936	GAAGG	2	10	31004	31013	40 %	0 %	60 %	0 %	478450451
30	NC_020936	GAGCT	2	10	32044	32053	20 %	20 %	40 %	20 %	478450452
31	NC_020936	AAAGA	2	10	33677	33686	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020936	CTATT	2	10	36718	36727	20 %	60 %	0 %	20 %	478450458
33	NC_020936	TCCTA	2	10	36765	36774	20 %	40 %	0 %	40 %	478450458
34	NC_020936	ACGAT	2	10	38680	38689	40 %	20 %	20 %	20 %	478450459
35	NC_020936	AATTT	2	10	39571	39580	40 %	60 %	0 %	0 %	478450460
36	NC_020936	AGCAA	2	10	42695	42704	60 %	0 %	20 %	20 %	478450462
37	NC_020936	CGATG	2	10	42752	42761	20 %	20 %	40 %	20 %	478450462
38	NC_020936	TGCAA	2	10	42910	42919	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_020936	TTTAT	2	10	44755	44764	20 %	80 %	0 %	0 %	478450465
40	NC_020936	CTTTC	2	10	46851	46860	0 %	60 %	0 %	40 %	478450467
41	NC_020936	AGTTT	2	10	47390	47399	20 %	60 %	20 %	0 %	478450467
42	NC_020936	GAAGA	2	10	48523	48532	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020936	CTATT	2	10	50104	50113	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_020936	CTTTT	2	10	50555	50564	0 %	80 %	0 %	20 %	478450470
45	NC_020936	CCGTA	2	10	54389	54398	20 %	20 %	20 %	40 %	478450473
46	NC_020936	AATTT	2	10	54629	54638	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020936	TTATC	2	10	55792	55801	20 %	60 %	0 %	20 %	478450474
48	NC_020936	GTTGT	2	10	56857	56866	0 %	60 %	40 %	0 %	478450475
49	NC_020936	GAGCA	2	10	60364	60373	40 %	0 %	40 %	20 %	478450477
50	NC_020936	TGTGA	2	10	62813	62822	20 %	40 %	40 %	0 %	478450479
51	NC_020936	AGTGA	2	10	64334	64343	40 %	20 %	40 %	0 %	478450480
52	NC_020936	CCTTC	2	10	64608	64617	0 %	40 %	0 %	60 %	478450480
53	NC_020936	AGGAG	2	10	66836	66845	40 %	0 %	60 %	0 %	478450482
54	NC_020936	GTTAA	2	10	66966	66975	40 %	40 %	20 %	0 %	478450482
55	NC_020936	CAAGC	2	10	69332	69341	40 %	0 %	20 %	40 %	478450484
56	NC_020936	AAAAG	2	10	69580	69589	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020936	GGAGC	2	10	70202	70211	20 %	0 %	60 %	20 %	478450485
58	NC_020936	GCGAT	2	10	70392	70401	20 %	20 %	40 %	20 %	478450485
59	NC_020936	CTCTT	2	10	70746	70755	0 %	60 %	0 %	40 %	478450485
60	NC_020936	AGGGG	2	10	71392	71401	20 %	0 %	80 %	0 %	478450485
61	NC_020936	AAGAA	2	10	71434	71443	80 %	0 %	20 %	0 %	478450485
62	NC_020936	CTTGC	2	10	72523	72532	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_020936	ATTGG	2	10	72724	72733	20 %	40 %	40 %	0 %	478450487
64	NC_020936	GAAAA	2	10	73796	73805	80 %	0 %	20 %	0 %	478450487
65	NC_020936	TGGGA	2	10	74213	74222	20 %	20 %	60 %	0 %	478450488
66	NC_020936	TATTT	2	10	76740	76749	20 %	80 %	0 %	0 %	478450489
67	NC_020936	AAAAG	2	10	77273	77282	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020936	ATCAA	2	10	78971	78980	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_020936	TGTCT	2	10	80535	80544	0 %	60 %	20 %	20 %	478450492
70	NC_020936	TTACT	2	10	81042	81051	20 %	60 %	0 %	20 %	478450492
71	NC_020936	AGAAA	2	10	82432	82441	80 %	0 %	20 %	0 %	478450494
72	NC_020936	GGAAG	2	10	82945	82954	40 %	0 %	60 %	0 %	478450494
73	NC_020936	AGCGA	2	10	85411	85420	40 %	0 %	40 %	20 %	478450496
74	NC_020936	TTTGT	2	10	85710	85719	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020936	GATCC	2	10	86496	86505	20 %	20 %	20 %	40 %	478450497
76	NC_020936	AGAGC	2	10	87831	87840	40 %	0 %	40 %	20 %	478450498
77	NC_020936	AATAA	2	10	88709	88718	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020936	TTTTC	2	10	91563	91572	0 %	80 %	0 %	20 %	478450501
79	NC_020936	GGATG	2	10	91823	91832	20 %	20 %	60 %	0 %	478450502
80	NC_020936	CAACA	2	10	93362	93371	60 %	0 %	0 %	40 %	478450503
81	NC_020936	ACAGC	2	10	94407	94416	40 %	0 %	20 %	40 %	478450504
82	NC_020936	CTTTT	2	10	94781	94790	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_020936	GGAAC	2	10	95119	95128	40 %	0 %	40 %	20 %	478450505
84	NC_020936	GGATT	2	10	96019	96028	20 %	40 %	40 %	0 %	478450505
85	NC_020936	CAATC	2	10	97121	97130	40 %	20 %	0 %	40 %	478450507
86	NC_020936	TTTGC	2	10	97255	97264	0 %	60 %	20 %	20 %	478450507
87	NC_020936	ATTCA	2	10	97519	97528	40 %	40 %	0 %	20 %	478450507
88	NC_020936	GATCC	2	10	97778	97787	20 %	20 %	20 %	40 %	478450507
89	NC_020936	GTTTT	2	10	98199	98208	0 %	80 %	20 %	0 %	478450507
90	NC_020936	ACAAA	2	10	98327	98336	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_020936	AAGCT	2	10	99404	99413	40 %	20 %	20 %	20 %	478450508
92	NC_020936	AGGGG	2	10	99763	99772	20 %	0 %	80 %	0 %	478450508
93	NC_020936	ATAGC	2	10	100456	100465	40 %	20 %	20 %	20 %	478450509
94	NC_020936	TTCCC	2	10	101060	101069	0 %	40 %	0 %	60 %	478450510
95	NC_020936	AGCGA	2	10	103384	103393	40 %	0 %	40 %	20 %	478450512
96	NC_020936	TTTCT	2	10	103742	103751	0 %	80 %	0 %	20 %	478450512
97	NC_020936	CTTCT	2	10	103796	103805	0 %	60 %	0 %	40 %	478450512
98	NC_020936	ATCAT	2	10	104948	104957	40 %	40 %	0 %	20 %	478450513
99	NC_020936	GGCAT	2	10	105656	105665	20 %	20 %	40 %	20 %	478450513
100	NC_020936	AAAGC	2	10	109382	109391	60 %	0 %	20 %	20 %	478450516
101	NC_020936	GCATT	2	10	110542	110551	20 %	40 %	20 %	20 %	478450518
102	NC_020936	GCTCT	2	10	114607	114616	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_020936	TGTTT	2	10	115231	115240	0 %	80 %	20 %	0 %	478450521
104	NC_020936	CATGT	2	10	115609	115618	20 %	40 %	20 %	20 %	478450521
105	NC_020936	TATCG	2	10	116313	116322	20 %	40 %	20 %	20 %	478450521
106	NC_020936	TTTCT	2	10	116829	116838	0 %	80 %	0 %	20 %	478450522
107	NC_020936	GGAGA	2	10	117025	117034	40 %	0 %	60 %	0 %	478450522
108	NC_020936	AAAGA	2	10	119076	119085	80 %	0 %	20 %	0 %	478450525
109	NC_020936	CCAAT	2	10	122039	122048	40 %	20 %	0 %	40 %	478450528
110	NC_020936	GCTTC	2	10	123140	123149	0 %	40 %	20 %	40 %	478450528
111	NC_020936	TACAA	2	10	126929	126938	60 %	20 %	0 %	20 %	478450532
112	NC_020936	ATCCA	2	10	129336	129345	40 %	20 %	0 %	40 %	478450536
113	NC_020936	GAAGA	2	10	130886	130895	60 %	0 %	40 %	0 %	478450536
114	NC_020936	AAAAG	2	10	132798	132807	80 %	0 %	20 %	0 %	478450537
115	NC_020936	GATTC	2	10	133129	133138	20 %	40 %	20 %	20 %	478450537
116	NC_020936	GGATA	2	10	135747	135756	40 %	20 %	40 %	0 %	478450539
117	NC_020936	ATTGT	2	10	136444	136453	20 %	60 %	20 %	0 %	478450540
118	NC_020936	TTGCA	2	10	137659	137668	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_020936	AAGAG	2	10	138911	138920	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020936	TCCAG	2	10	140616	140625	20 %	20 %	20 %	40 %	478450547
121	NC_020936	GTACA	2	10	141347	141356	40 %	20 %	20 %	20 %	478450548
122	NC_020936	TAGAT	2	10	141720	141729	40 %	40 %	20 %	0 %	478450548
123	NC_020936	AAAAG	2	10	142132	142141	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020936	AAAAC	2	10	142612	142621	80 %	0 %	0 %	20 %	478450549
125	NC_020936	TGCTA	2	10	143698	143707	20 %	40 %	20 %	20 %	478450551
126	NC_020936	GGAGC	2	10	143745	143754	20 %	0 %	60 %	20 %	478450551
127	NC_020936	CTGGG	2	10	145160	145169	0 %	20 %	60 %	20 %	478450553
128	NC_020936	GTTTT	2	10	145907	145916	0 %	80 %	20 %	0 %	478450554
129	NC_020936	GAACC	2	10	149641	149650	40 %	0 %	20 %	40 %	478450555
130	NC_020936	ATTCT	2	10	153138	153147	20 %	60 %	0 %	20 %	478450559
131	NC_020936	CTGTG	2	10	153342	153351	0 %	40 %	40 %	20 %	478450559
132	NC_020936	TTCTT	2	10	155815	155824	0 %	80 %	0 %	20 %	478450562
133	NC_020936	AGGAA	2	10	160374	160383	60 %	0 %	40 %	0 %	478450566
134	NC_020936	CAAAA	2	10	162386	162395	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_020936	AGAGA	2	10	163614	163623	60 %	0 %	40 %	0 %	478450569
136	NC_020936	AGCAA	2	10	164049	164058	60 %	0 %	20 %	20 %	478450569
137	NC_020936	TATGA	2	10	164473	164482	40 %	40 %	20 %	0 %	478450570
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252	NC_020936	CCTTT	2	10	330996	331005	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
253	NC_020936	CTAAA	2	10	334099	334108	60 %	20 %	0 %	20 %	478450722
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265	NC_020936	TAGCA	2	10	354484	354493	40 %	20 %	20 %	20 %	478450735
266	NC_020936	AAGGC	2	10	358750	358759	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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