MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada1 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020935	TGTGA	2	10	3878	3887	20 %	40 %	40 %	0 %	478452228
2	NC_020935	TTGAA	2	10	4234	4243	40 %	40 %	20 %	0 %	478452229
3	NC_020935	GAGAA	2	10	4528	4537	60 %	0 %	40 %	0 %	478452229
4	NC_020935	GAAAA	2	10	4965	4974	80 %	0 %	20 %	0 %	478452229
5	NC_020935	TTACA	2	10	5120	5129	40 %	40 %	0 %	20 %	478452229
6	NC_020935	GTCTT	2	10	5816	5825	0 %	60 %	20 %	20 %	478452230
7	NC_020935	TGGTA	2	10	8289	8298	20 %	40 %	40 %	0 %	478452232
8	NC_020935	CGAAA	2	10	9697	9706	60 %	0 %	20 %	20 %	478452233
9	NC_020935	GGCTG	2	10	10333	10342	0 %	20 %	60 %	20 %	478452234
10	NC_020935	CCTCT	2	10	11125	11134	0 %	40 %	0 %	60 %	478452235
11	NC_020935	AAAGG	2	10	11284	11293	60 %	0 %	40 %	0 %	478452235
12	NC_020935	AAGAA	2	10	12404	12413	80 %	0 %	20 %	0 %	478452236
13	NC_020935	AAAGA	2	10	13802	13811	80 %	0 %	20 %	0 %	478452237
14	NC_020935	GATTT	2	10	15649	15658	20 %	60 %	20 %	0 %	478452239
15	NC_020935	CGTTC	2	10	16760	16769	0 %	40 %	20 %	40 %	478452240
16	NC_020935	GCTTC	2	10	17133	17142	0 %	40 %	20 %	40 %	478452240
17	NC_020935	GAAGG	2	10	17504	17513	40 %	0 %	60 %	0 %	478452240
18	NC_020935	GTTGT	2	10	20930	20939	0 %	60 %	40 %	0 %	478452243
19	NC_020935	AAGAT	2	10	22042	22051	60 %	20 %	20 %	0 %	478452244
20	NC_020935	TTTGC	2	10	22653	22662	0 %	60 %	20 %	20 %	478452244
21	NC_020935	GGAAA	2	10	24407	24416	60 %	0 %	40 %	0 %	478452244
22	NC_020935	AGAGG	2	10	26133	26142	40 %	0 %	60 %	0 %	478452245
23	NC_020935	GGAGA	2	10	27912	27921	40 %	0 %	60 %	0 %	478452246
24	NC_020935	GGATA	2	10	27938	27947	40 %	20 %	40 %	0 %	478452246
25	NC_020935	ATCCG	2	10	28663	28672	20 %	20 %	20 %	40 %	478452248
26	NC_020935	AGGGT	2	10	29181	29190	20 %	20 %	60 %	0 %	478452248
27	NC_020935	CCTAT	2	10	30221	30230	20 %	40 %	0 %	40 %	478452249
28	NC_020935	GAAGG	2	10	31020	31029	40 %	0 %	60 %	0 %	478452250
29	NC_020935	GAGCT	2	10	32060	32069	20 %	20 %	40 %	20 %	478452251
30	NC_020935	CTATT	2	10	36734	36743	20 %	60 %	0 %	20 %	478452257
31	NC_020935	TCCTA	2	10	36781	36790	20 %	40 %	0 %	40 %	478452257
32	NC_020935	ACGAT	2	10	38696	38705	40 %	20 %	20 %	20 %	478452258
33	NC_020935	AATTT	2	10	39587	39596	40 %	60 %	0 %	0 %	478452259
34	NC_020935	AGCAA	2	10	42711	42720	60 %	0 %	20 %	20 %	478452261
35	NC_020935	CGATG	2	10	42768	42777	20 %	20 %	40 %	20 %	478452261
36	NC_020935	TTTAT	2	10	44771	44780	20 %	80 %	0 %	0 %	478452264
37	NC_020935	CTTTC	2	10	46867	46876	0 %	60 %	0 %	40 %	478452266
38	NC_020935	AGTTT	2	10	47406	47415	20 %	60 %	20 %	0 %	478452266
39	NC_020935	CTTTT	2	10	50571	50580	0 %	80 %	0 %	20 %	478452269
40	NC_020935	CCGTA	2	10	54406	54415	20 %	20 %	20 %	40 %	478452272
41	NC_020935	TTATC	2	10	55809	55818	20 %	60 %	0 %	20 %	478452273
42	NC_020935	GTTGT	2	10	56874	56883	0 %	60 %	40 %	0 %	478452274
43	NC_020935	GAGCA	2	10	60380	60389	40 %	0 %	40 %	20 %	478452276
44	NC_020935	TGTGA	2	10	62829	62838	20 %	40 %	40 %	0 %	478452278
45	NC_020935	AGTGA	2	10	64350	64359	40 %	20 %	40 %	0 %	478452279
46	NC_020935	CCTTC	2	10	64624	64633	0 %	40 %	0 %	60 %	478452279
47	NC_020935	AGGAG	2	10	66852	66861	40 %	0 %	60 %	0 %	478452281
48	NC_020935	GTTAA	2	10	66982	66991	40 %	40 %	20 %	0 %	478452281
49	NC_020935	CAAGC	2	10	69348	69357	40 %	0 %	20 %	40 %	478452283
50	NC_020935	GGAGC	2	10	70218	70227	20 %	0 %	60 %	20 %	478452284
51	NC_020935	GCGAT	2	10	70408	70417	20 %	20 %	40 %	20 %	478452284
52	NC_020935	CTCTT	2	10	70762	70771	0 %	60 %	0 %	40 %	478452284
53	NC_020935	AGGGG	2	10	71408	71417	20 %	0 %	80 %	0 %	478452284
54	NC_020935	AAGAA	2	10	71450	71459	80 %	0 %	20 %	0 %	478452284
55	NC_020935	ATTGG	2	10	72740	72749	20 %	40 %	40 %	0 %	478452286
56	NC_020935	GAAAA	2	10	73812	73821	80 %	0 %	20 %	0 %	478452286
57	NC_020935	TGGGA	2	10	74229	74238	20 %	20 %	60 %	0 %	478452287
58	NC_020935	TATTT	2	10	76756	76765	20 %	80 %	0 %	0 %	478452288
59	NC_020935	TGTCT	2	10	80551	80560	0 %	60 %	20 %	20 %	478452291
60	NC_020935	TTACT	2	10	81058	81067	20 %	60 %	0 %	20 %	478452291
61	NC_020935	AGAAA	2	10	82448	82457	80 %	0 %	20 %	0 %	478452293
62	NC_020935	GGAAG	2	10	82961	82970	40 %	0 %	60 %	0 %	478452293
63	NC_020935	AGCGA	2	10	85432	85441	40 %	0 %	40 %	20 %	478452296
64	NC_020935	GATCC	2	10	86517	86526	20 %	20 %	20 %	40 %	478452297
65	NC_020935	AGAGC	2	10	87852	87861	40 %	0 %	40 %	20 %	478452298
66	NC_020935	TTTTC	2	10	91584	91593	0 %	80 %	0 %	20 %	478452301
67	NC_020935	GGATG	2	10	91844	91853	20 %	20 %	60 %	0 %	478452302
68	NC_020935	CAACA	2	10	93383	93392	60 %	0 %	0 %	40 %	478452303
69	NC_020935	ACAGC	2	10	94428	94437	40 %	0 %	20 %	40 %	478452304
70	NC_020935	GGAAC	2	10	95140	95149	40 %	0 %	40 %	20 %	478452305
71	NC_020935	GGATT	2	10	96040	96049	20 %	40 %	40 %	0 %	478452305
72	NC_020935	CAATC	2	10	97137	97146	40 %	20 %	0 %	40 %	478452308
73	NC_020935	TTTGC	2	10	97271	97280	0 %	60 %	20 %	20 %	478452308
74	NC_020935	ATTCA	2	10	97535	97544	40 %	40 %	0 %	20 %	478452308
75	NC_020935	GATCC	2	10	97794	97803	20 %	20 %	20 %	40 %	478452308
76	NC_020935	GTTTT	2	10	98215	98224	0 %	80 %	20 %	0 %	478452308
77	NC_020935	AAGCT	2	10	99420	99429	40 %	20 %	20 %	20 %	478452309
78	NC_020935	AGGGG	2	10	99779	99788	20 %	0 %	80 %	0 %	478452309
79	NC_020935	ATAGC	2	10	100472	100481	40 %	20 %	20 %	20 %	478452310
80	NC_020935	TTCCC	2	10	101076	101085	0 %	40 %	0 %	60 %	478452311
81	NC_020935	AGCGA	2	10	103400	103409	40 %	0 %	40 %	20 %	478452313
82	NC_020935	TTTCT	2	10	103758	103767	0 %	80 %	0 %	20 %	478452313
83	NC_020935	CTTCT	2	10	103812	103821	0 %	60 %	0 %	40 %	478452313
84	NC_020935	ATCAT	2	10	104964	104973	40 %	40 %	0 %	20 %	478452314
85	NC_020935	GGCAT	2	10	105672	105681	20 %	20 %	40 %	20 %	478452314
86	NC_020935	AAAGC	2	10	109398	109407	60 %	0 %	20 %	20 %	478452317
87	NC_020935	GCATT	2	10	110558	110567	20 %	40 %	20 %	20 %	478452319
88	NC_020935	TGTTT	2	10	115247	115256	0 %	80 %	20 %	0 %	478452322
89	NC_020935	CATGT	2	10	115625	115634	20 %	40 %	20 %	20 %	478452322
90	NC_020935	TATCG	2	10	116329	116338	20 %	40 %	20 %	20 %	478452322
91	NC_020935	TTTCT	2	10	116845	116854	0 %	80 %	0 %	20 %	478452323
92	NC_020935	GGAGA	2	10	117041	117050	40 %	0 %	60 %	0 %	478452323
93	NC_020935	AAAGA	2	10	119092	119101	80 %	0 %	20 %	0 %	478452326
94	NC_020935	CCAAT	2	10	122055	122064	40 %	20 %	0 %	40 %	478452329
95	NC_020935	GCTTC	2	10	123156	123165	0 %	40 %	20 %	40 %	478452329
96	NC_020935	TACAA	2	10	126945	126954	60 %	20 %	0 %	20 %	478452333
97	NC_020935	GAAGA	2	10	130903	130912	60 %	0 %	40 %	0 %	478452336
98	NC_020935	AAAAG	2	10	132815	132824	80 %	0 %	20 %	0 %	478452337
99	NC_020935	GATTC	2	10	133146	133155	20 %	40 %	20 %	20 %	478452337
100	NC_020935	GGATA	2	10	135764	135773	40 %	20 %	40 %	0 %	478452339
101	NC_020935	ATTGT	2	10	136461	136470	20 %	60 %	20 %	0 %	478452340
102	NC_020935	TCCAG	2	10	140633	140642	20 %	20 %	20 %	40 %	478452347
103	NC_020935	GTACA	2	10	141364	141373	40 %	20 %	20 %	20 %	478452348
104	NC_020935	TAGAT	2	10	141737	141746	40 %	40 %	20 %	0 %	478452348
105	NC_020935	AAAAC	2	10	142629	142638	80 %	0 %	0 %	20 %	478452349
106	NC_020935	TGCTA	2	10	143715	143724	20 %	40 %	20 %	20 %	478452351
107	NC_020935	GGAGC	2	10	143762	143771	20 %	0 %	60 %	20 %	478452351
108	NC_020935	CTGGG	2	10	145131	145140	0 %	20 %	60 %	20 %	478452353
109	NC_020935	GTTTT	2	10	145878	145887	0 %	80 %	20 %	0 %	478452354
110	NC_020935	GAACC	2	10	149612	149621	40 %	0 %	20 %	40 %	478452355
111	NC_020935	ATTCT	2	10	153096	153105	20 %	60 %	0 %	20 %	478452359
112	NC_020935	CTGTG	2	10	153300	153309	0 %	40 %	40 %	20 %	478452359
113	NC_020935	TTCTT	2	10	155773	155782	0 %	80 %	0 %	20 %	478452362
114	NC_020935	AGGAA	2	10	160332	160341	60 %	0 %	40 %	0 %	478452366
115	NC_020935	AGAGA	2	10	163572	163581	60 %	0 %	40 %	0 %	478452369
116	NC_020935	AGCAA	2	10	164007	164016	60 %	0 %	20 %	20 %	478452369
117	NC_020935	TATGA	2	10	164431	164440	40 %	40 %	20 %	0 %	478452370
118	NC_020935	CAAAA	2	10	167510	167519	80 %	0 %	0 %	20 %	478452371
119	NC_020935	AAGAG	2	10	168343	168352	60 %	0 %	40 %	0 %	478452371
120	NC_020935	GATTG	2	10	168688	168697	20 %	40 %	40 %	0 %	478452371
121	NC_020935	GTTTT	2	10	175167	175176	0 %	80 %	20 %	0 %	478452375
122	NC_020935	TATTG	2	10	175190	175199	20 %	60 %	20 %	0 %	478452375
123	NC_020935	CAGCA	2	10	175549	175558	40 %	0 %	20 %	40 %	478452375
124	NC_020935	TAGGA	2	10	175854	175863	40 %	20 %	40 %	0 %	478452376
125	NC_020935	TGATT	2	10	177781	177790	20 %	60 %	20 %	0 %	478452377
126	NC_020935	TCAAT	2	10	178422	178431	40 %	40 %	0 %	20 %	478452377
127	NC_020935	TTTTC	2	10	178461	178470	0 %	80 %	0 %	20 %	478452377
128	NC_020935	GGAAT	2	10	180020	180029	40 %	20 %	40 %	0 %	478452379
129	NC_020935	AGAGT	2	10	181407	181416	40 %	20 %	40 %	0 %	478452380
130	NC_020935	TTGAA	2	10	182097	182106	40 %	40 %	20 %	0 %	478452381
131	NC_020935	TGAGT	2	10	182911	182920	20 %	40 %	40 %	0 %	478452381
132	NC_020935	AGGGG	2	10	183108	183117	20 %	0 %	80 %	0 %	478452381
133	NC_020935	TTGAG	2	10	183658	183667	20 %	40 %	40 %	0 %	478452382
134	NC_020935	ATAGA	2	10	183680	183689	60 %	20 %	20 %	0 %	478452382
135	NC_020935	AGAGA	2	10	185763	185772	60 %	0 %	40 %	0 %	478452385
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