MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada1 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 2843

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020935	GGAT	2	8	57	64	25 %	25 %	50 %	0 %	478452225
2	NC_020935	GGGA	2	8	394	401	25 %	0 %	75 %	0 %	478452225
3	NC_020935	AGTG	2	8	544	551	25 %	25 %	50 %	0 %	478452225
4	NC_020935	TGGC	2	8	578	585	0 %	25 %	50 %	25 %	478452225
5	NC_020935	AATG	2	8	1063	1070	50 %	25 %	25 %	0 %	478452225
6	NC_020935	CTAT	2	8	1397	1404	25 %	50 %	0 %	25 %	478452225
7	NC_020935	AAGG	2	8	1906	1913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020935	AGTA	2	8	2086	2093	50 %	25 %	25 %	0 %	478452226
9	NC_020935	ATGA	2	8	2490	2497	50 %	25 %	25 %	0 %	478452227
10	NC_020935	GATA	2	8	2528	2535	50 %	25 %	25 %	0 %	478452227
11	NC_020935	CATG	2	8	3706	3713	25 %	25 %	25 %	25 %	478452228
12	NC_020935	TTCC	2	8	4011	4018	0 %	50 %	0 %	50 %	478452228
13	NC_020935	TTTA	2	8	4409	4416	25 %	75 %	0 %	0 %	478452229
14	NC_020935	ATCC	2	8	4709	4716	25 %	25 %	0 %	50 %	478452229
15	NC_020935	GACG	2	8	5456	5463	25 %	0 %	50 %	25 %	478452229
16	NC_020935	TTGG	2	8	5559	5566	0 %	50 %	50 %	0 %	478452229
17	NC_020935	TGGA	2	8	5920	5927	25 %	25 %	50 %	0 %	478452230
18	NC_020935	CTTT	2	8	6297	6304	0 %	75 %	0 %	25 %	478452230
19	NC_020935	GGGA	2	8	6812	6819	25 %	0 %	75 %	0 %	478452230
20	NC_020935	GGAG	2	8	6903	6910	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020935	GGTG	2	8	7115	7122	0 %	25 %	75 %	0 %	478452231
22	NC_020935	AAAT	2	8	7181	7188	75 %	25 %	0 %	0 %	478452231
23	NC_020935	TATG	2	8	7552	7559	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020935	ATTT	2	8	7693	7700	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020935	TTTG	2	8	7785	7792	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020935	AAGC	2	8	8419	8426	50 %	0 %	25 %	25 %	478452232
27	NC_020935	ATTG	2	8	8817	8824	25 %	50 %	25 %	0 %	478452233
28	NC_020935	AGCG	2	8	9284	9291	25 %	0 %	50 %	25 %	478452233
29	NC_020935	AAAG	2	8	9305	9312	75 %	0 %	25 %	0 %	478452233
30	NC_020935	CTTT	2	8	9645	9652	0 %	75 %	0 %	25 %	478452233
31	NC_020935	TATT	2	8	9908	9915	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020935	TTCG	2	8	10019	10026	0 %	50 %	25 %	25 %	478452234
33	NC_020935	AATT	2	8	10124	10131	50 %	50 %	0 %	0 %	478452234
34	NC_020935	ATGG	2	8	10183	10190	25 %	25 %	50 %	0 %	478452234
35	NC_020935	CTTT	2	8	10808	10815	0 %	75 %	0 %	25 %	478452235
36	NC_020935	GCAA	2	8	11025	11032	50 %	0 %	25 %	25 %	478452235
37	NC_020935	AGCC	2	8	11255	11262	25 %	0 %	25 %	50 %	478452235
38	NC_020935	GAAA	2	8	11398	11405	75 %	0 %	25 %	0 %	478452235
39	NC_020935	AGAA	2	8	11802	11809	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020935	GTTT	2	8	13173	13180	0 %	75 %	25 %	0 %	478452237
41	NC_020935	ATGC	2	8	13603	13610	25 %	25 %	25 %	25 %	478452237
42	NC_020935	AAGG	2	8	14038	14045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020935	TTGT	2	8	14639	14646	0 %	75 %	25 %	0 %	478452238
44	NC_020935	TTCT	2	8	14810	14817	0 %	75 %	0 %	25 %	478452238
45	NC_020935	ATTT	2	8	15016	15023	25 %	75 %	0 %	0 %	478452238
46	NC_020935	TTTC	2	8	15678	15685	0 %	75 %	0 %	25 %	478452239
47	NC_020935	AAAT	2	8	16160	16167	75 %	25 %	0 %	0 %	478452239
48	NC_020935	CAAA	2	8	16672	16679	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_020935	CTAT	2	8	16859	16866	25 %	50 %	0 %	25 %	478452240
50	NC_020935	GTAA	2	8	17002	17009	50 %	25 %	25 %	0 %	478452240
51	NC_020935	CTAA	2	8	17195	17202	50 %	25 %	0 %	25 %	478452240
52	NC_020935	AGAA	2	8	17458	17465	75 %	0 %	25 %	0 %	478452240
53	NC_020935	ATTT	2	8	17604	17611	25 %	75 %	0 %	0 %	478452240
54	NC_020935	TGCG	2	8	19126	19133	0 %	25 %	50 %	25 %	478452242
55	NC_020935	GAAG	2	8	20110	20117	50 %	0 %	50 %	0 %	478452242
56	NC_020935	GCCA	2	8	21620	21627	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_020935	CGCT	2	8	21868	21875	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_020935	TTAA	2	8	21889	21896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020935	GTTA	2	8	21926	21933	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020935	GATC	2	8	21981	21988	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_020935	GATG	2	8	22244	22251	25 %	25 %	50 %	0 %	478452244
62	NC_020935	CATT	2	8	23303	23310	25 %	50 %	0 %	25 %	478452244
63	NC_020935	GCTT	2	8	23646	23653	0 %	50 %	25 %	25 %	478452244
64	NC_020935	GGTT	2	8	23694	23701	0 %	50 %	50 %	0 %	478452244
65	NC_020935	TTCT	2	8	24064	24071	0 %	75 %	0 %	25 %	478452244
66	NC_020935	TAAC	2	8	24166	24173	50 %	25 %	0 %	25 %	478452244
67	NC_020935	CATT	2	8	24289	24296	25 %	50 %	0 %	25 %	478452244
68	NC_020935	GGTA	2	8	24659	24666	25 %	25 %	50 %	0 %	478452244
69	NC_020935	TTGA	2	8	25655	25662	25 %	50 %	25 %	0 %	478452245
70	NC_020935	TAGG	2	8	25879	25886	25 %	25 %	50 %	0 %	478452245
71	NC_020935	TTCC	2	8	26003	26010	0 %	50 %	0 %	50 %	478452245
72	NC_020935	TAGG	2	8	26117	26124	25 %	25 %	50 %	0 %	478452245
73	NC_020935	GCTT	2	8	26889	26896	0 %	50 %	25 %	25 %	478452245
74	NC_020935	GGAA	2	8	27472	27479	50 %	0 %	50 %	0 %	478452246
75	NC_020935	TTAA	2	8	27545	27552	50 %	50 %	0 %	0 %	478452246
76	NC_020935	AAAG	2	8	27595	27602	75 %	0 %	25 %	0 %	478452246
77	NC_020935	GTTT	2	8	28158	28165	0 %	75 %	25 %	0 %	478452247
78	NC_020935	CAGA	2	8	28180	28187	50 %	0 %	25 %	25 %	478452247
79	NC_020935	ATTG	2	8	28539	28546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020935	CTTT	2	8	30152	30159	0 %	75 %	0 %	25 %	478452249
81	NC_020935	TTTG	2	8	30167	30174	0 %	75 %	25 %	0 %	478452249
82	NC_020935	TTGT	2	8	30202	30209	0 %	75 %	25 %	0 %	478452249
83	NC_020935	TGGC	2	8	30365	30372	0 %	25 %	50 %	25 %	478452249
84	NC_020935	AAAG	2	8	30925	30932	75 %	0 %	25 %	0 %	478452250
85	NC_020935	AAAC	2	8	30995	31002	75 %	0 %	0 %	25 %	478452250
86	NC_020935	GATG	2	8	31138	31145	25 %	25 %	50 %	0 %	478452250
87	NC_020935	GATA	2	8	32247	32254	50 %	25 %	25 %	0 %	478452252
88	NC_020935	TGAT	2	8	34742	34749	25 %	50 %	25 %	0 %	478452255
89	NC_020935	AAGA	3	12	34870	34881	75 %	0 %	25 %	0 %	478452255
90	NC_020935	AAGC	2	8	35090	35097	50 %	0 %	25 %	25 %	478452256
91	NC_020935	GTTC	2	8	35123	35130	0 %	50 %	25 %	25 %	478452256
92	NC_020935	GGCA	2	8	35502	35509	25 %	0 %	50 %	25 %	478452257
93	NC_020935	TGCT	2	8	35912	35919	0 %	50 %	25 %	25 %	478452257
94	NC_020935	TTGG	2	8	36144	36151	0 %	50 %	50 %	0 %	478452257
95	NC_020935	AGAT	2	8	36864	36871	50 %	25 %	25 %	0 %	478452257
96	NC_020935	CTTT	2	8	37236	37243	0 %	75 %	0 %	25 %	478452258
97	NC_020935	ATGA	2	8	37726	37733	50 %	25 %	25 %	0 %	478452258
98	NC_020935	TAGG	2	8	37885	37892	25 %	25 %	50 %	0 %	478452258
99	NC_020935	CAAT	2	8	38069	38076	50 %	25 %	0 %	25 %	478452258
100	NC_020935	AATG	2	8	38856	38863	50 %	25 %	25 %	0 %	478452258
101	NC_020935	AGAA	2	8	39693	39700	75 %	0 %	25 %	0 %	478452259
102	NC_020935	AAGA	2	8	39745	39752	75 %	0 %	25 %	0 %	478452259
103	NC_020935	ATCC	2	8	39753	39760	25 %	25 %	0 %	50 %	478452259
104	NC_020935	TAAT	2	8	39964	39971	50 %	50 %	0 %	0 %	478452259
105	NC_020935	GTGC	2	8	42052	42059	0 %	25 %	50 %	25 %	478452261
106	NC_020935	AGAA	2	8	42471	42478	75 %	0 %	25 %	0 %	478452261
107	NC_020935	GGAT	2	8	42623	42630	25 %	25 %	50 %	0 %	478452261
108	NC_020935	AAAC	2	8	43762	43769	75 %	0 %	0 %	25 %	478452263
109	NC_020935	CAAT	2	8	43966	43973	50 %	25 %	0 %	25 %	478452263
110	NC_020935	TGTT	2	8	44346	44353	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020935	AATA	2	8	44584	44591	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020935	ATTT	2	8	44722	44729	25 %	75 %	0 %	0 %	478452264
113	NC_020935	GCTC	2	8	45030	45037	0 %	25 %	25 %	50 %	478452264
114	NC_020935	TTCT	2	8	45172	45179	0 %	75 %	0 %	25 %	478452264
115	NC_020935	TTGA	2	8	45772	45779	25 %	50 %	25 %	0 %	478452265
116	NC_020935	TGTT	2	8	45944	45951	0 %	75 %	25 %	0 %	478452265
117	NC_020935	CTAT	2	8	45974	45981	25 %	50 %	0 %	25 %	478452265
118	NC_020935	TGTT	2	8	46003	46010	0 %	75 %	25 %	0 %	478452265
119	NC_020935	CTAT	2	8	46299	46306	25 %	50 %	0 %	25 %	478452265
120	NC_020935	AAGA	2	8	46794	46801	75 %	0 %	25 %	0 %	478452266
121	NC_020935	AAGA	2	8	46851	46858	75 %	0 %	25 %	0 %	478452266
122	NC_020935	AAAG	2	8	46891	46898	75 %	0 %	25 %	0 %	478452266
123	NC_020935	AAGA	2	8	47006	47013	75 %	0 %	25 %	0 %	478452266
124	NC_020935	ACTT	2	8	47267	47274	25 %	50 %	0 %	25 %	478452266
125	NC_020935	ATGG	2	8	47893	47900	25 %	25 %	50 %	0 %	478452266
126	NC_020935	AGGA	2	8	47924	47931	50 %	0 %	50 %	0 %	478452266
127	NC_020935	GAAC	2	8	48471	48478	50 %	0 %	25 %	25 %	478452266
128	NC_020935	AAGT	2	8	48506	48513	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020935	AACA	2	8	48715	48722	75 %	0 %	0 %	25 %	478452267
130	NC_020935	CTTT	2	8	48911	48918	0 %	75 %	0 %	25 %	478452267
131	NC_020935	CTTT	2	8	49796	49803	0 %	75 %	0 %	25 %	478452268
132	NC_020935	GTAG	2	8	49814	49821	25 %	25 %	50 %	0 %	478452268
133	NC_020935	GAAG	2	8	51244	51251	50 %	0 %	50 %	0 %	478452269
134	NC_020935	TTCA	2	8	51666	51673	25 %	50 %	0 %	25 %	478452269
135	NC_020935	TCTA	2	8	51883	51890	25 %	50 %	0 %	25 %	478452269
136	NC_020935	TATT	2	8	52770	52777	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020935	GGAA	2	8	53001	53008	50 %	0 %	50 %	0 %	478452271
138	NC_020935	TTAA	2	8	53742	53749	50 %	50 %	0 %	0 %	478452271
139	NC_020935	CCTT	2	8	53949	53956	0 %	50 %	0 %	50 %	478452272
140	NC_020935	TTTA	2	8	54116	54123	25 %	75 %	0 %	0 %	478452272
141	NC_020935	AAAG	2	8	54340	54347	75 %	0 %	25 %	0 %	478452272
142	NC_020935	GATT	2	8	54477	54484	25 %	50 %	25 %	0 %	478452272
143	NC_020935	AATC	2	8	54532	54539	50 %	25 %	0 %	25 %	478452272
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