MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada1 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 341

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020935	TC	3	6	2195	2200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020935	TC	3	6	2267	2272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020935	GA	3	6	7595	7600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020935	AG	3	6	9950	9955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020935	TA	3	6	11848	11853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020935	TA	3	6	13939	13944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020935	TA	4	8	14163	14170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020935	AG	3	6	18115	18120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020935	GA	3	6	18128	18133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020935	CT	3	6	19050	19055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_020935	AG	3	6	21116	21121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020935	GA	3	6	21274	21279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020935	AG	3	6	21791	21796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020935	CT	3	6	21860	21865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020935	GA	3	6	27113	27118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020935	CT	3	6	27120	27125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020935	TC	3	6	28488	28493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020935	AG	3	6	28571	28576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020935	GA	3	6	36985	36990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020935	AT	3	6	37086	37091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020935	CT	3	6	39353	39358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020935	CT	3	6	40723	40728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020935	AG	3	6	42849	42854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020935	CT	3	6	42915	42920	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_020935	AG	3	6	43245	43250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020935	TC	3	6	44337	44342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020935	TA	3	6	44489	44494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020935	AG	3	6	48571	48576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020935	TG	4	8	51920	51927	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020935	GA	3	6	56191	56196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020935	GA	3	6	61394	61399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020935	AG	4	8	65413	65420	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020935	TA	3	6	69732	69737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020935	CT	3	6	72468	72473	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020935	TA	3	6	85837	85842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020935	TC	3	6	91058	91063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020935	GA	3	6	91190	91195	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020935	CT	3	6	93540	93545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020935	TA	3	6	93706	93711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020935	AG	3	6	93749	93754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020935	AG	3	6	93846	93851	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020935	GA	3	6	94068	94073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020935	TA	3	6	94685	94690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020935	TC	3	6	100557	100562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_020935	AT	3	6	100608	100613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020935	GC	3	6	102714	102719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020935	TA	3	6	107284	107289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020935	TG	3	6	116538	116543	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020935	AG	4	8	119126	119133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020935	GA	3	6	120948	120953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020935	TA	3	6	123256	123261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020935	GT	3	6	124246	124251	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020935	CT	3	6	128782	128787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_020935	TC	3	6	131105	131110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020935	AG	3	6	131182	131187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020935	AG	3	6	131207	131212	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020935	TG	3	6	137620	137625	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020935	AG	3	6	138865	138870	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020935	AT	3	6	143160	143165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020935	GA	3	6	152341	152346	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020935	AG	3	6	157908	157913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020935	TC	3	6	172380	172385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_020935	AG	3	6	172512	172517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020935	CT	3	6	172530	172535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020935	TG	3	6	179019	179024	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020935	TA	3	6	184214	184219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020935	GA	3	6	184327	184332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020935	GA	3	6	184430	184435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020935	GA	3	6	185071	185076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020935	GA	3	6	185103	185108	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020935	AG	3	6	189157	189162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020935	AT	3	6	189659	189664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020935	AG	3	6	193436	193441	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020935	TC	3	6	196428	196433	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020935	CT	3	6	200183	200188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_020935	GA	4	8	203242	203249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020935	CT	4	8	203290	203297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_020935	TA	3	6	204871	204876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020935	AG	3	6	214563	214568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020935	TA	3	6	216117	216122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020935	CT	3	6	217759	217764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_020935	TC	3	6	220760	220765	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020935	AG	3	6	220791	220796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020935	TC	3	6	234990	234995	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_020935	AG	3	6	235016	235021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020935	AC	3	6	239939	239944	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020935	GA	3	6	247025	247030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020935	TG	3	6	247135	247140	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020935	AG	3	6	247935	247940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020935	GA	3	6	248814	248819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020935	AG	3	6	248939	248944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020935	TA	3	6	250760	250765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020935	AG	3	6	253051	253056	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020935	TC	3	6	253077	253082	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_020935	TA	3	6	260918	260923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020935	AG	3	6	260998	261003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020935	CA	3	6	262725	262730	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_020935	TC	3	6	264624	264629	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_020935	CA	3	6	269973	269978	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_020935	TA	3	6	270176	270181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020935	AT	4	8	280736	280743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020935	CT	3	6	281588	281593	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020935	TC	4	8	281679	281686	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_020935	TC	3	6	283370	283375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_020935	TC	3	6	283427	283432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020935	CT	3	6	283900	283905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_020935	AT	3	6	295914	295919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020935	CA	3	6	298243	298248	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_020935	GA	3	6	302974	302979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020935	AG	3	6	312193	312198	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020935	CT	3	6	344097	344102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_020935	CT	3	6	347168	347173	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_020935	TC	3	6	351394	351399	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_020935	CT	3	6	355310	355315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_020935	AC	3	6	358643	358648	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_020935	GA	3	6	360552	360557	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020935	TC	3	6	360630	360635	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_020935	TA	3	6	360831	360836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020935	GC	3	6	362360	362365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_020935	TC	3	6	362663	362668	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_020935	CT	4	8	377966	377973	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_020935	CG	3	6	387805	387810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_020935	CA	3	6	388855	388860	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_020935	TC	3	6	391402	391407	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_020935	CT	3	6	391892	391897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_020935	GA	3	6	392022	392027	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020935	GA	3	6	392146	392151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020935	CT	3	6	406254	406259	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_020935	CT	3	6	407239	407244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_020935	CT	3	6	425974	425979	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_020935	CT	3	6	426997	427002	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_020935	AG	3	6	427343	427348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020935	GA	3	6	429038	429043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020935	AC	3	6	433036	433041	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020935	CT	3	6	437307	437312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_020935	AC	3	6	437345	437350	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_020935	CA	3	6	439814	439819	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_020935	CT	3	6	441218	441223	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_020935	CT	3	6	450500	450505	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_020935	AG	3	6	456641	456646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020935	TC	3	6	463179	463184	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_020935	AT	3	6	463248	463253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020935	GA	4	8	464622	464629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020935	TA	3	6	464665	464670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020935	TC	3	6	476489	476494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_020935	AC	3	6	482031	482036	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_020935	GA	4	8	482076	482083	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020935	CA	3	6	482113	482118	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_020935	TC	3	6	482154	482159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_020935	AC	3	6	486589	486594	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_020935	AG	3	6	486751	486756	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020935	CT	3	6	486770	486775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_020935	AG	3	6	487063	487068	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_020935	CT	3	6	490050	490055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.