MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020934	TGTGA	2	10	3878	3887	20 %	40 %	40 %	0 %	478449529
2	NC_020934	TTGAA	2	10	4234	4243	40 %	40 %	20 %	0 %	478449530
3	NC_020934	GAGAA	2	10	4528	4537	60 %	0 %	40 %	0 %	478449530
4	NC_020934	GAAAA	2	10	4965	4974	80 %	0 %	20 %	0 %	478449530
5	NC_020934	TTACA	2	10	5120	5129	40 %	40 %	0 %	20 %	478449530
6	NC_020934	GTCTT	2	10	5816	5825	0 %	60 %	20 %	20 %	478449531
7	NC_020934	TATTT	2	10	7631	7640	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020934	TGGTA	2	10	8289	8298	20 %	40 %	40 %	0 %	478449533
9	NC_020934	CGAAA	2	10	9697	9706	60 %	0 %	20 %	20 %	478449534
10	NC_020934	GGCTG	2	10	10333	10342	0 %	20 %	60 %	20 %	478449535
11	NC_020934	CCTCT	2	10	11125	11134	0 %	40 %	0 %	60 %	478449536
12	NC_020934	AAAGG	2	10	11284	11293	60 %	0 %	40 %	0 %	478449536
13	NC_020934	AAGAA	2	10	12404	12413	80 %	0 %	20 %	0 %	478449537
14	NC_020934	AAAGA	2	10	13802	13811	80 %	0 %	20 %	0 %	478449538
15	NC_020934	GGTGT	2	10	13906	13915	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020934	GATTT	2	10	15649	15658	20 %	60 %	20 %	0 %	478449540
17	NC_020934	CGTTC	2	10	16760	16769	0 %	40 %	20 %	40 %	478449541
18	NC_020934	GCTTC	2	10	17133	17142	0 %	40 %	20 %	40 %	478449541
19	NC_020934	GAAGG	2	10	17504	17513	40 %	0 %	60 %	0 %	478449541
20	NC_020934	GTTGT	2	10	20930	20939	0 %	60 %	40 %	0 %	478449544
21	NC_020934	AAGAT	2	10	22042	22051	60 %	20 %	20 %	0 %	478449545
22	NC_020934	TTTGC	2	10	22653	22662	0 %	60 %	20 %	20 %	478449545
23	NC_020934	GGAAA	2	10	24407	24416	60 %	0 %	40 %	0 %	478449545
24	NC_020934	AGAGG	2	10	26132	26141	40 %	0 %	60 %	0 %	478449546
25	NC_020934	GGAGA	2	10	27911	27920	40 %	0 %	60 %	0 %	478449547
26	NC_020934	GGATA	2	10	27937	27946	40 %	20 %	40 %	0 %	478449547
27	NC_020934	ATCCG	2	10	28662	28671	20 %	20 %	20 %	40 %	478449549
28	NC_020934	AGGGT	2	10	29180	29189	20 %	20 %	60 %	0 %	478449549
29	NC_020934	CCTAT	2	10	30220	30229	20 %	40 %	0 %	40 %	478449550
30	NC_020934	GAAGG	2	10	31019	31028	40 %	0 %	60 %	0 %	478449551
31	NC_020934	GAGCT	2	10	32059	32068	20 %	20 %	40 %	20 %	478449552
32	NC_020934	AAAGA	2	10	33692	33701	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020934	CTATT	2	10	36733	36742	20 %	60 %	0 %	20 %	478449558
34	NC_020934	TCCTA	2	10	36780	36789	20 %	40 %	0 %	40 %	478449558
35	NC_020934	ACGAT	2	10	38695	38704	40 %	20 %	20 %	20 %	478449559
36	NC_020934	AATTT	2	10	39586	39595	40 %	60 %	0 %	0 %	478449560
37	NC_020934	AGCAA	2	10	42710	42719	60 %	0 %	20 %	20 %	478449562
38	NC_020934	CGATG	2	10	42767	42776	20 %	20 %	40 %	20 %	478449562
39	NC_020934	TGCAA	2	10	42925	42934	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_020934	TTTAT	2	10	44770	44779	20 %	80 %	0 %	0 %	478449565
41	NC_020934	CTTTC	2	10	46866	46875	0 %	60 %	0 %	40 %	478449567
42	NC_020934	AGTTT	2	10	47405	47414	20 %	60 %	20 %	0 %	478449567
43	NC_020934	GAAGA	2	10	48538	48547	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020934	CTATT	2	10	50119	50128	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_020934	CTTTT	2	10	50570	50579	0 %	80 %	0 %	20 %	478449570
46	NC_020934	CCGTA	2	10	54404	54413	20 %	20 %	20 %	40 %	478449573
47	NC_020934	AATTT	2	10	54644	54653	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020934	TTATC	2	10	55807	55816	20 %	60 %	0 %	20 %	478449574
49	NC_020934	GTTGT	2	10	56872	56881	0 %	60 %	40 %	0 %	478449575
50	NC_020934	GAGCA	2	10	60379	60388	40 %	0 %	40 %	20 %	478449577
51	NC_020934	TGTGA	2	10	62828	62837	20 %	40 %	40 %	0 %	478449579
52	NC_020934	AGTGA	2	10	64349	64358	40 %	20 %	40 %	0 %	478449580
53	NC_020934	CCTTC	2	10	64623	64632	0 %	40 %	0 %	60 %	478449580
54	NC_020934	AGGAG	2	10	66851	66860	40 %	0 %	60 %	0 %	478449582
55	NC_020934	GTTAA	2	10	66981	66990	40 %	40 %	20 %	0 %	478449582
56	NC_020934	CAAGC	2	10	69347	69356	40 %	0 %	20 %	40 %	478449584
57	NC_020934	AAAAG	2	10	69595	69604	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020934	GGAGC	2	10	70217	70226	20 %	0 %	60 %	20 %	478449585
59	NC_020934	GCGAT	2	10	70407	70416	20 %	20 %	40 %	20 %	478449585
60	NC_020934	CTCTT	2	10	70761	70770	0 %	60 %	0 %	40 %	478449585
61	NC_020934	AGGGG	2	10	71407	71416	20 %	0 %	80 %	0 %	478449585
62	NC_020934	AAGAA	2	10	71449	71458	80 %	0 %	20 %	0 %	478449585
63	NC_020934	CTTGC	2	10	72538	72547	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_020934	ATTGG	2	10	72739	72748	20 %	40 %	40 %	0 %	478449587
65	NC_020934	GAAAA	2	10	73811	73820	80 %	0 %	20 %	0 %	478449587
66	NC_020934	TGGGA	2	10	74228	74237	20 %	20 %	60 %	0 %	478449588
67	NC_020934	TATTT	2	10	76755	76764	20 %	80 %	0 %	0 %	478449589
68	NC_020934	AAAAG	2	10	77288	77297	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020934	ATCAA	2	10	78986	78995	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_020934	TGTCT	2	10	80550	80559	0 %	60 %	20 %	20 %	478449592
71	NC_020934	TTACT	2	10	81057	81066	20 %	60 %	0 %	20 %	478449592
72	NC_020934	AGAAA	2	10	82447	82456	80 %	0 %	20 %	0 %	478449594
73	NC_020934	GGAAG	2	10	82960	82969	40 %	0 %	60 %	0 %	478449594
74	NC_020934	AGCGA	2	10	85426	85435	40 %	0 %	40 %	20 %	478449596
75	NC_020934	TTTGT	2	10	85725	85734	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020934	GATCC	2	10	86511	86520	20 %	20 %	20 %	40 %	478449597
77	NC_020934	AGAGC	2	10	87846	87855	40 %	0 %	40 %	20 %	478449598
78	NC_020934	AATAA	2	10	88724	88733	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020934	TTTTC	2	10	91578	91587	0 %	80 %	0 %	20 %	478449601
80	NC_020934	GGATG	2	10	91838	91847	20 %	20 %	60 %	0 %	478449602
81	NC_020934	CAACA	2	10	93377	93386	60 %	0 %	0 %	40 %	478449603
82	NC_020934	ACAGC	2	10	94422	94431	40 %	0 %	20 %	40 %	478449604
83	NC_020934	CTTTT	2	10	94796	94805	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_020934	GGAAC	2	10	95134	95143	40 %	0 %	40 %	20 %	478449605
85	NC_020934	GGATT	2	10	96034	96043	20 %	40 %	40 %	0 %	478449605
86	NC_020934	CAATC	2	10	97136	97145	40 %	20 %	0 %	40 %	478449607
87	NC_020934	TTTGC	2	10	97270	97279	0 %	60 %	20 %	20 %	478449607
88	NC_020934	ATTCA	2	10	97534	97543	40 %	40 %	0 %	20 %	478449607
89	NC_020934	GATCC	2	10	97793	97802	20 %	20 %	20 %	40 %	478449607
90	NC_020934	GTTTT	2	10	98214	98223	0 %	80 %	20 %	0 %	478449607
91	NC_020934	ACAAA	2	10	98342	98351	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_020934	AAGCT	2	10	99419	99428	40 %	20 %	20 %	20 %	478449608
93	NC_020934	AGGGG	2	10	99778	99787	20 %	0 %	80 %	0 %	478449608
94	NC_020934	ATAGC	2	10	100471	100480	40 %	20 %	20 %	20 %	478449609
95	NC_020934	TTCCC	2	10	101075	101084	0 %	40 %	0 %	60 %	478449610
96	NC_020934	AGCGA	2	10	103399	103408	40 %	0 %	40 %	20 %	478449612
97	NC_020934	TTTCT	2	10	103757	103766	0 %	80 %	0 %	20 %	478449612
98	NC_020934	CTTCT	2	10	103811	103820	0 %	60 %	0 %	40 %	478449612
99	NC_020934	ATCAT	2	10	104963	104972	40 %	40 %	0 %	20 %	478449613
100	NC_020934	GGCAT	2	10	105671	105680	20 %	20 %	40 %	20 %	478449613
101	NC_020934	AAAGC	2	10	109397	109406	60 %	0 %	20 %	20 %	478449616
102	NC_020934	GCATT	2	10	110557	110566	20 %	40 %	20 %	20 %	478449618
103	NC_020934	GCTCT	2	10	114622	114631	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_020934	TGTTT	2	10	115246	115255	0 %	80 %	20 %	0 %	478449621
105	NC_020934	CATGT	2	10	115624	115633	20 %	40 %	20 %	20 %	478449621
106	NC_020934	TATCG	2	10	116328	116337	20 %	40 %	20 %	20 %	478449621
107	NC_020934	TTTCT	2	10	116844	116853	0 %	80 %	0 %	20 %	478449622
108	NC_020934	GGAGA	2	10	117040	117049	40 %	0 %	60 %	0 %	478449622
109	NC_020934	AAAGA	2	10	119091	119100	80 %	0 %	20 %	0 %	478449625
110	NC_020934	CCAAT	2	10	122054	122063	40 %	20 %	0 %	40 %	478449628
111	NC_020934	GCTTC	2	10	123155	123164	0 %	40 %	20 %	40 %	478449628
112	NC_020934	TACAA	2	10	126944	126953	60 %	20 %	0 %	20 %	478449632
113	NC_020934	ATCCA	2	10	129351	129360	40 %	20 %	0 %	40 %	478449636
114	NC_020934	GAAGA	2	10	130901	130910	60 %	0 %	40 %	0 %	478449636
115	NC_020934	AAAAG	2	10	132813	132822	80 %	0 %	20 %	0 %	478449637
116	NC_020934	GATTC	2	10	133144	133153	20 %	40 %	20 %	20 %	478449637
117	NC_020934	GGATA	2	10	135762	135771	40 %	20 %	40 %	0 %	478449639
118	NC_020934	ATTGT	2	10	136459	136468	20 %	60 %	20 %	0 %	478449640
119	NC_020934	TTGCA	2	10	137674	137683	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_020934	AAGAG	2	10	138926	138935	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020934	TCCAG	2	10	140631	140640	20 %	20 %	20 %	40 %	478449647
122	NC_020934	GTACA	2	10	141362	141371	40 %	20 %	20 %	20 %	478449648
123	NC_020934	TAGAT	2	10	141735	141744	40 %	40 %	20 %	0 %	478449648
124	NC_020934	AAAAG	2	10	142147	142156	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020934	AAAAC	2	10	142627	142636	80 %	0 %	0 %	20 %	478449649
126	NC_020934	TGCTA	2	10	143713	143722	20 %	40 %	20 %	20 %	478449651
127	NC_020934	GGAGC	2	10	143760	143769	20 %	0 %	60 %	20 %	478449651
128	NC_020934	CTGGG	2	10	145175	145184	0 %	20 %	60 %	20 %	478449653
129	NC_020934	GTTTT	2	10	145922	145931	0 %	80 %	20 %	0 %	478449654
130	NC_020934	GAACC	2	10	149656	149665	40 %	0 %	20 %	40 %	478449655
131	NC_020934	ATTCT	2	10	153153	153162	20 %	60 %	0 %	20 %	478449659
132	NC_020934	CTGTG	2	10	153357	153366	0 %	40 %	40 %	20 %	478449659
133	NC_020934	TTCTT	2	10	155830	155839	0 %	80 %	0 %	20 %	478449662
134	NC_020934	AGGAA	2	10	160389	160398	60 %	0 %	40 %	0 %	478449666
135	NC_020934	CAAAA	2	10	162401	162410	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_020934	AGAGA	2	10	163629	163638	60 %	0 %	40 %	0 %	478449669
137	NC_020934	AGCAA	2	10	164064	164073	60 %	0 %	20 %	20 %	478449669
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176	NC_020934	TTTCT	2	10	212124	212133	0 %	80 %	0 %	20 %	478449709
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249	NC_020934	CTAAA	2	10	328312	328321	60 %	20 %	0 %	20 %	478449817
250	NC_020934	CAAAA	2	10	328792	328801	80 %	0 %	0 %	20 %	478449817
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252	NC_020934	CTTGT	2	10	330552	330561	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
253	NC_020934	CCTTT	2	10	331011	331020	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
254	NC_020934	CTAAA	2	10	334114	334123	60 %	20 %	0 %	20 %	478449821
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262	NC_020934	ATCTC	2	10	347951	347960	20 %	40 %	0 %	40 %	478449833
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266	NC_020934	TAGCA	2	10	354499	354508	40 %	20 %	20 %	20 %	478449834
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