MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 14070

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020934	AGG	2	6	18	23	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478449526
2	NC_020934	TAA	3	9	93	101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478449526
3	NC_020934	AGT	2	6	168	173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449526
4	NC_020934	AAG	2	6	324	329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449526
5	NC_020934	CAA	2	6	338	343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478449526
6	NC_020934	AGT	2	6	364	369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449526
7	NC_020934	GTG	2	6	380	385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478449526
8	NC_020934	CAG	2	6	413	418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449526
9	NC_020934	GCT	2	6	532	537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449526
10	NC_020934	ATT	2	6	557	562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449526
11	NC_020934	GCC	2	6	601	606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478449526
12	NC_020934	TGC	2	6	660	665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449526
13	NC_020934	ATT	2	6	672	677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449526
14	NC_020934	CGA	2	6	694	699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449526
15	NC_020934	TAT	2	6	836	841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449526
16	NC_020934	GAA	2	6	883	888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449526
17	NC_020934	AGA	2	6	912	917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449526
18	NC_020934	AGA	2	6	966	971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449526
19	NC_020934	CAA	2	6	1039	1044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478449526
20	NC_020934	TTG	2	6	1182	1187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449526
21	NC_020934	CTC	2	6	1211	1216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478449526
22	NC_020934	GAT	2	6	1273	1278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449526
23	NC_020934	GAT	2	6	1327	1332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449526
24	NC_020934	ATG	2	6	1390	1395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449526
25	NC_020934	CTT	2	6	1610	1615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449526
26	NC_020934	CAG	2	6	1675	1680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449526
27	NC_020934	AAG	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020934	TGG	2	6	1833	1838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020934	CTT	2	6	1840	1845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020934	ATG	2	6	1933	1938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449527
31	NC_020934	GTG	2	6	1939	1944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478449527
32	NC_020934	TCC	2	6	1948	1953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478449527
33	NC_020934	AGC	2	6	1962	1967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449527
34	NC_020934	AGC	2	6	1989	1994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449527
35	NC_020934	AAG	2	6	2000	2005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449527
36	NC_020934	TAC	2	6	2038	2043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478449527
37	NC_020934	GCT	2	6	2048	2053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449527
38	NC_020934	AAC	2	6	2146	2151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478449527
39	NC_020934	AGA	2	6	2158	2163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449527
40	NC_020934	TAA	2	6	2248	2253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020934	AGA	2	6	2414	2419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449528
42	NC_020934	ATC	2	6	2421	2426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478449528
43	NC_020934	TGC	2	6	2441	2446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449528
44	NC_020934	CAT	2	6	2565	2570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478449528
45	NC_020934	AGA	2	6	2594	2599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449528
46	NC_020934	AAG	2	6	2623	2628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449528
47	NC_020934	GGA	2	6	2658	2663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478449528
48	NC_020934	ATC	2	6	2787	2792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478449529
49	NC_020934	ATA	2	6	2937	2942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478449529
50	NC_020934	AAC	2	6	2962	2967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478449529
51	NC_020934	GGT	2	6	3016	3021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478449529
52	NC_020934	AAT	2	6	3122	3127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478449529
53	NC_020934	TTC	2	6	3157	3162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449529
54	NC_020934	GCA	2	6	3176	3181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449529
55	NC_020934	GGA	2	6	3224	3229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478449529
56	NC_020934	CAG	2	6	3243	3248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449529
57	NC_020934	GTT	2	6	3260	3265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449529
58	NC_020934	GGT	2	6	3352	3357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478449529
59	NC_020934	AAG	2	6	3510	3515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449529
60	NC_020934	ATT	2	6	3572	3577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449529
61	NC_020934	TTG	2	6	3624	3629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449529
62	NC_020934	AAG	2	6	3735	3740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449529
63	NC_020934	AAG	2	6	3750	3755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449529
64	NC_020934	CAG	2	6	3792	3797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449529
65	NC_020934	GCT	2	6	3863	3868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449529
66	NC_020934	AAG	2	6	4029	4034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449529
67	NC_020934	CAG	2	6	4079	4084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449529
68	NC_020934	GGA	2	6	4166	4171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478449529
69	NC_020934	AAT	2	6	4176	4181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478449529
70	NC_020934	ATT	2	6	4256	4261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449530
71	NC_020934	TGA	2	6	4286	4291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449530
72	NC_020934	GTA	2	6	4518	4523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449530
73	NC_020934	AGA	2	6	4565	4570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449530
74	NC_020934	GAA	2	6	4749	4754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449530
75	NC_020934	CGT	2	6	4881	4886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449530
76	NC_020934	GTT	2	6	4932	4937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449530
77	NC_020934	TGA	2	6	5069	5074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449530
78	NC_020934	TTG	2	6	5164	5169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449530
79	NC_020934	TTC	2	6	5305	5310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449530
80	NC_020934	TCT	2	6	5397	5402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449530
81	NC_020934	AGA	2	6	5417	5422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449530
82	NC_020934	GTT	2	6	5444	5449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449530
83	NC_020934	GGT	2	6	5492	5497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478449530
84	NC_020934	CTC	2	6	5596	5601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478449530
85	NC_020934	AGC	2	6	5627	5632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449530
86	NC_020934	GCA	2	6	5652	5657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020934	AGA	2	6	5679	5684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020934	ATT	2	6	5746	5751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449531
89	NC_020934	TCT	2	6	5764	5769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449531
90	NC_020934	GCT	2	6	5810	5815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449531
91	NC_020934	GAT	2	6	5845	5850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449531
92	NC_020934	ACG	2	6	5883	5888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449531
93	NC_020934	GAA	2	6	5907	5912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449531
94	NC_020934	AGA	3	9	5984	5992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449531
95	NC_020934	GCT	2	6	5993	5998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449531
96	NC_020934	AGA	2	6	6002	6007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449531
97	NC_020934	TGG	2	6	6038	6043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478449531
98	NC_020934	AGA	3	9	6056	6064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449531
99	NC_020934	GGA	2	6	6065	6070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478449531
100	NC_020934	TCA	2	6	6250	6255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478449531
101	NC_020934	GGA	2	6	6287	6292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478449531
102	NC_020934	CTT	2	6	6347	6352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449531
103	NC_020934	CTG	2	6	6353	6358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449531
104	NC_020934	CAG	2	6	6508	6513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449531
105	NC_020934	CTT	2	6	6959	6964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_020934	AGG	2	6	7037	7042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478449532
107	NC_020934	GAA	2	6	7081	7086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449532
108	NC_020934	GCA	2	6	7345	7350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449532
109	NC_020934	AAG	2	6	7386	7391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449532
110	NC_020934	TGC	2	6	7419	7424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449532
111	NC_020934	GAA	2	6	7674	7679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020934	TTA	2	6	7751	7756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020934	GAA	2	6	7800	7805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020934	ATG	2	6	7836	7841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020934	TCG	2	6	7913	7918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449533
116	NC_020934	TCC	2	6	7956	7961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478449533
117	NC_020934	GTT	2	6	8064	8069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449533
118	NC_020934	TTA	2	6	8434	8439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449533
119	NC_020934	TTC	2	6	8757	8762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449533
120	NC_020934	GAA	2	6	8901	8906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449534
121	NC_020934	ACC	2	6	9029	9034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478449534
122	NC_020934	CTT	2	6	9082	9087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449534
123	NC_020934	GAG	2	6	9162	9167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478449534
124	NC_020934	ATA	2	6	9179	9184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478449534
125	NC_020934	AGG	2	6	9203	9208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478449534
126	NC_020934	GAA	2	6	9383	9388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449534
127	NC_020934	CAG	2	6	9399	9404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449534
128	NC_020934	TGT	2	6	9470	9475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449534
129	NC_020934	GAG	2	6	9485	9490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478449534
130	NC_020934	TAC	2	6	9553	9558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478449534
131	NC_020934	GTT	2	6	9657	9662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449534
132	NC_020934	AAG	2	6	9681	9686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449534
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135	NC_020934	ATC	2	6	9790	9795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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253	NC_020934	AAT	3	9	19038	19046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_020934	TCT	2	6	19066	19071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_020934	TGC	2	6	19194	19199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449543
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258	NC_020934	GCT	2	6	19390	19395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449543
259	NC_020934	TGT	2	6	19524	19529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449543
260	NC_020934	GAA	2	6	19602	19607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449543
261	NC_020934	GAA	2	6	19614	19619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449543
262	NC_020934	AAG	2	6	19649	19654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449543
263	NC_020934	GAA	2	6	19780	19785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449543
264	NC_020934	AAG	2	6	19841	19846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449543
265	NC_020934	AGA	2	6	19968	19973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449543
266	NC_020934	TGT	2	6	20010	20015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449543
267	NC_020934	TAT	2	6	20057	20062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449543
268	NC_020934	AGA	3	9	20216	20224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449543
269	NC_020934	AAT	2	6	20272	20277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478449543
270	NC_020934	CTA	2	6	20330	20335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478449543
271	NC_020934	AAT	2	6	20395	20400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478449543
272	NC_020934	AAG	2	6	20438	20443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449543
273	NC_020934	CTT	3	9	20492	20500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_020934	GAG	2	6	20563	20568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478449544
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276	NC_020934	TCC	2	6	20804	20809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478449544
277	NC_020934	TCG	2	6	20813	20818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449544
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280	NC_020934	GAA	2	6	21017	21022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_020934	GGA	2	6	21211	21216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
282	NC_020934	AGA	3	9	21251	21259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
283	NC_020934	TGG	2	6	21470	21475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
284	NC_020934	AAC	2	6	21509	21514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_020934	AGC	2	6	21526	21531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_020934	TGA	2	6	21727	21732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_020934	TCC	2	6	21844	21849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
288	NC_020934	AAT	2	6	22020	22025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_020934	TGT	2	6	22223	22228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449545
290	NC_020934	GAA	2	6	22377	22382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449545
291	NC_020934	GGA	2	6	22468	22473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478449545
292	NC_020934	TGG	2	6	22503	22508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478449545
293	NC_020934	GAC	2	6	22629	22634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449545
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295	NC_020934	TTG	2	6	22873	22878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449545
296	NC_020934	TTC	2	6	22942	22947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449545
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298	NC_020934	TCG	2	6	23141	23146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449545
299	NC_020934	GAA	2	6	23150	23155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449545
300	NC_020934	TTG	2	6	23204	23209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449545
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320	NC_020934	AAG	2	6	25075	25080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449545
321	NC_020934	TTA	2	6	25173	25178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
322	NC_020934	AGA	2	6	25347	25352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449546
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333	NC_020934	TAG	2	6	26736	26741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449546
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354	NC_020934	TAA	2	6	28480	28485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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374	NC_020934	ATC	2	6	30315	30320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478449550
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