MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams1 complete genome

Total Repeats: 648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020933	TGTGA	2	10	3878	3887	20 %	40 %	40 %	0 %	478466664
2	NC_020933	TTGAA	2	10	4234	4243	40 %	40 %	20 %	0 %	478466665
3	NC_020933	GAGAA	2	10	4528	4537	60 %	0 %	40 %	0 %	478466665
4	NC_020933	GAAAA	2	10	4965	4974	80 %	0 %	20 %	0 %	478466665
5	NC_020933	TTACA	2	10	5120	5129	40 %	40 %	0 %	20 %	478466665
6	NC_020933	GTCTT	2	10	5816	5825	0 %	60 %	20 %	20 %	478466666
7	NC_020933	TGGTA	2	10	8289	8298	20 %	40 %	40 %	0 %	478466668
8	NC_020933	CGAAA	2	10	9697	9706	60 %	0 %	20 %	20 %	478466669
9	NC_020933	GGCTG	2	10	10333	10342	0 %	20 %	60 %	20 %	478466670
10	NC_020933	CCTCT	2	10	11125	11134	0 %	40 %	0 %	60 %	478466671
11	NC_020933	AAAGG	2	10	11284	11293	60 %	0 %	40 %	0 %	478466671
12	NC_020933	AAGAA	2	10	12404	12413	80 %	0 %	20 %	0 %	478466672
13	NC_020933	AAAGA	2	10	13802	13811	80 %	0 %	20 %	0 %	478466673
14	NC_020933	GATTT	2	10	15649	15658	20 %	60 %	20 %	0 %	478466675
15	NC_020933	CGTTC	2	10	16760	16769	0 %	40 %	20 %	40 %	478466676
16	NC_020933	GCTTC	2	10	17133	17142	0 %	40 %	20 %	40 %	478466676
17	NC_020933	GAAGG	2	10	17504	17513	40 %	0 %	60 %	0 %	478466676
18	NC_020933	GTTGT	2	10	20930	20939	0 %	60 %	40 %	0 %	478466679
19	NC_020933	AAGAT	2	10	22042	22051	60 %	20 %	20 %	0 %	478466680
20	NC_020933	TTTGC	2	10	22653	22662	0 %	60 %	20 %	20 %	478466680
21	NC_020933	GGAAA	2	10	24407	24416	60 %	0 %	40 %	0 %	478466680
22	NC_020933	AGAGG	2	10	26132	26141	40 %	0 %	60 %	0 %	478466681
23	NC_020933	GGAGA	2	10	27911	27920	40 %	0 %	60 %	0 %	478466682
24	NC_020933	GGATA	2	10	27937	27946	40 %	20 %	40 %	0 %	478466682
25	NC_020933	ATCCG	2	10	28662	28671	20 %	20 %	20 %	40 %	478466684
26	NC_020933	AGGGT	2	10	29180	29189	20 %	20 %	60 %	0 %	478466684
27	NC_020933	CCTAT	2	10	30220	30229	20 %	40 %	0 %	40 %	478466685
28	NC_020933	GAAGG	2	10	31019	31028	40 %	0 %	60 %	0 %	478466686
29	NC_020933	GAGCT	2	10	32059	32068	20 %	20 %	40 %	20 %	478466687
30	NC_020933	CTATT	2	10	36733	36742	20 %	60 %	0 %	20 %	478466693
31	NC_020933	TCCTA	2	10	36780	36789	20 %	40 %	0 %	40 %	478466693
32	NC_020933	ACGAT	2	10	38695	38704	40 %	20 %	20 %	20 %	478466694
33	NC_020933	AATTT	2	10	39586	39595	40 %	60 %	0 %	0 %	478466695
34	NC_020933	AGCAA	2	10	42710	42719	60 %	0 %	20 %	20 %	478466697
35	NC_020933	CGATG	2	10	42767	42776	20 %	20 %	40 %	20 %	478466697
36	NC_020933	TTTAT	2	10	44770	44779	20 %	80 %	0 %	0 %	478466700
37	NC_020933	CTTTC	2	10	46866	46875	0 %	60 %	0 %	40 %	478466702
38	NC_020933	AGTTT	2	10	47405	47414	20 %	60 %	20 %	0 %	478466702
39	NC_020933	CTTTT	2	10	50570	50579	0 %	80 %	0 %	20 %	478466705
40	NC_020933	CCGTA	2	10	54404	54413	20 %	20 %	20 %	40 %	478466708
41	NC_020933	TTATC	2	10	55807	55816	20 %	60 %	0 %	20 %	478466709
42	NC_020933	GTTGT	2	10	56872	56881	0 %	60 %	40 %	0 %	478466710
43	NC_020933	GAGCA	2	10	60379	60388	40 %	0 %	40 %	20 %	478466712
44	NC_020933	TGTGA	2	10	62828	62837	20 %	40 %	40 %	0 %	478466714
45	NC_020933	AGTGA	2	10	64349	64358	40 %	20 %	40 %	0 %	478466715
46	NC_020933	CCTTC	2	10	64623	64632	0 %	40 %	0 %	60 %	478466715
47	NC_020933	AGGAG	2	10	66851	66860	40 %	0 %	60 %	0 %	478466717
48	NC_020933	GTTAA	2	10	66981	66990	40 %	40 %	20 %	0 %	478466717
49	NC_020933	CAAGC	2	10	69347	69356	40 %	0 %	20 %	40 %	478466719
50	NC_020933	GGAGC	2	10	70217	70226	20 %	0 %	60 %	20 %	478466720
51	NC_020933	GCGAT	2	10	70407	70416	20 %	20 %	40 %	20 %	478466720
52	NC_020933	CTCTT	2	10	70761	70770	0 %	60 %	0 %	40 %	478466720
53	NC_020933	AGGGG	2	10	71407	71416	20 %	0 %	80 %	0 %	478466720
54	NC_020933	AAGAA	2	10	71449	71458	80 %	0 %	20 %	0 %	478466720
55	NC_020933	ATTGG	2	10	72739	72748	20 %	40 %	40 %	0 %	478466722
56	NC_020933	GAAAA	2	10	73811	73820	80 %	0 %	20 %	0 %	478466722
57	NC_020933	TGGGA	2	10	74228	74237	20 %	20 %	60 %	0 %	478466723
58	NC_020933	TATTT	2	10	76755	76764	20 %	80 %	0 %	0 %	478466724
59	NC_020933	TGTCT	2	10	80550	80559	0 %	60 %	20 %	20 %	478466727
60	NC_020933	TTACT	2	10	81057	81066	20 %	60 %	0 %	20 %	478466727
61	NC_020933	AGAAA	2	10	82447	82456	80 %	0 %	20 %	0 %	478466729
62	NC_020933	GGAAG	2	10	82960	82969	40 %	0 %	60 %	0 %	478466729
63	NC_020933	AGCGA	2	10	85426	85435	40 %	0 %	40 %	20 %	478466731
64	NC_020933	GATCC	2	10	86511	86520	20 %	20 %	20 %	40 %	478466732
65	NC_020933	AGAGC	2	10	87846	87855	40 %	0 %	40 %	20 %	478466733
66	NC_020933	TTTTC	2	10	91578	91587	0 %	80 %	0 %	20 %	478466736
67	NC_020933	GGATG	2	10	91838	91847	20 %	20 %	60 %	0 %	478466737
68	NC_020933	CAACA	2	10	93377	93386	60 %	0 %	0 %	40 %	478466738
69	NC_020933	ACAGC	2	10	94422	94431	40 %	0 %	20 %	40 %	478466739
70	NC_020933	GGAAC	2	10	95134	95143	40 %	0 %	40 %	20 %	478466740
71	NC_020933	GGATT	2	10	96034	96043	20 %	40 %	40 %	0 %	478466740
72	NC_020933	CAATC	2	10	97136	97145	40 %	20 %	0 %	40 %	478466742
73	NC_020933	TTTGC	2	10	97270	97279	0 %	60 %	20 %	20 %	478466742
74	NC_020933	ATTCA	2	10	97534	97543	40 %	40 %	0 %	20 %	478466742
75	NC_020933	GATCC	2	10	97793	97802	20 %	20 %	20 %	40 %	478466742
76	NC_020933	GTTTT	2	10	98214	98223	0 %	80 %	20 %	0 %	478466742
77	NC_020933	AAGCT	2	10	99419	99428	40 %	20 %	20 %	20 %	478466743
78	NC_020933	AGGGG	2	10	99778	99787	20 %	0 %	80 %	0 %	478466743
79	NC_020933	ATAGC	2	10	100471	100480	40 %	20 %	20 %	20 %	478466744
80	NC_020933	TTCCC	2	10	101075	101084	0 %	40 %	0 %	60 %	478466745
81	NC_020933	AGCGA	2	10	103399	103408	40 %	0 %	40 %	20 %	478466747
82	NC_020933	TTTCT	2	10	103757	103766	0 %	80 %	0 %	20 %	478466747
83	NC_020933	CTTCT	2	10	103811	103820	0 %	60 %	0 %	40 %	478466747
84	NC_020933	ATCAT	2	10	104963	104972	40 %	40 %	0 %	20 %	478466748
85	NC_020933	GGCAT	2	10	105671	105680	20 %	20 %	40 %	20 %	478466748
86	NC_020933	AAAGC	2	10	109397	109406	60 %	0 %	20 %	20 %	478466751
87	NC_020933	GCATT	2	10	110557	110566	20 %	40 %	20 %	20 %	478466753
88	NC_020933	TGTTT	2	10	115246	115255	0 %	80 %	20 %	0 %	478466756
89	NC_020933	CATGT	2	10	115624	115633	20 %	40 %	20 %	20 %	478466756
90	NC_020933	TATCG	2	10	116328	116337	20 %	40 %	20 %	20 %	478466756
91	NC_020933	TTTCT	2	10	116844	116853	0 %	80 %	0 %	20 %	478466757
92	NC_020933	GGAGA	2	10	117040	117049	40 %	0 %	60 %	0 %	478466757
93	NC_020933	AAAGA	2	10	119091	119100	80 %	0 %	20 %	0 %	478466760
94	NC_020933	CCAAT	2	10	122054	122063	40 %	20 %	0 %	40 %	478466763
95	NC_020933	GCTTC	2	10	123155	123164	0 %	40 %	20 %	40 %	478466763
96	NC_020933	TACAA	2	10	126944	126953	60 %	20 %	0 %	20 %	478466767
97	NC_020933	ATCCA	2	10	129351	129360	40 %	20 %	0 %	40 %	478466771
98	NC_020933	GAAGA	2	10	130901	130910	60 %	0 %	40 %	0 %	478466771
99	NC_020933	AAAAG	2	10	132813	132822	80 %	0 %	20 %	0 %	478466772
100	NC_020933	GATTC	2	10	133144	133153	20 %	40 %	20 %	20 %	478466772
101	NC_020933	GGATA	2	10	135762	135771	40 %	20 %	40 %	0 %	478466774
102	NC_020933	ATTGT	2	10	136459	136468	20 %	60 %	20 %	0 %	478466775
103	NC_020933	TCCAG	2	10	140631	140640	20 %	20 %	20 %	40 %	478466782
104	NC_020933	GTACA	2	10	141362	141371	40 %	20 %	20 %	20 %	478466783
105	NC_020933	TAGAT	2	10	141735	141744	40 %	40 %	20 %	0 %	478466783
106	NC_020933	AAAAC	2	10	142627	142636	80 %	0 %	0 %	20 %	478466784
107	NC_020933	TGCTA	2	10	143713	143722	20 %	40 %	20 %	20 %	478466786
108	NC_020933	GGAGC	2	10	143760	143769	20 %	0 %	60 %	20 %	478466786
109	NC_020933	CTGGG	2	10	145175	145184	0 %	20 %	60 %	20 %	478466788
110	NC_020933	GTTTT	2	10	145922	145931	0 %	80 %	20 %	0 %	478466789
111	NC_020933	GAACC	2	10	149656	149665	40 %	0 %	20 %	40 %	478466790
112	NC_020933	ATTCT	2	10	153153	153162	20 %	60 %	0 %	20 %	478466794
113	NC_020933	CTGTG	2	10	153357	153366	0 %	40 %	40 %	20 %	478466794
114	NC_020933	TTCTT	2	10	155830	155839	0 %	80 %	0 %	20 %	478466797
115	NC_020933	AGGAA	2	10	160389	160398	60 %	0 %	40 %	0 %	478466801
116	NC_020933	AGAGA	2	10	163629	163638	60 %	0 %	40 %	0 %	478466804
117	NC_020933	AGCAA	2	10	164064	164073	60 %	0 %	20 %	20 %	478466804
118	NC_020933	TATGA	2	10	164488	164497	40 %	40 %	20 %	0 %	478466805
119	NC_020933	CAAAA	2	10	167567	167576	80 %	0 %	0 %	20 %	478466806
120	NC_020933	AAGAG	2	10	168400	168409	60 %	0 %	40 %	0 %	478466806
121	NC_020933	GATTG	2	10	168745	168754	20 %	40 %	40 %	0 %	478466806
122	NC_020933	GTTTT	2	10	175224	175233	0 %	80 %	20 %	0 %	478466810
123	NC_020933	TATTG	2	10	175247	175256	20 %	60 %	20 %	0 %	478466810
124	NC_020933	CAGCA	2	10	175606	175615	40 %	0 %	20 %	40 %	478466810
125	NC_020933	TAGGA	2	10	175911	175920	40 %	20 %	40 %	0 %	478466811
126	NC_020933	TGATT	2	10	177838	177847	20 %	60 %	20 %	0 %	478466812
127	NC_020933	TCAAT	2	10	178479	178488	40 %	40 %	0 %	20 %	478466812
128	NC_020933	TTTTC	2	10	178518	178527	0 %	80 %	0 %	20 %	478466812
129	NC_020933	GGAAT	2	10	180077	180086	40 %	20 %	40 %	0 %	478466814
130	NC_020933	AGAGT	2	10	181464	181473	40 %	20 %	40 %	0 %	478466815
131	NC_020933	TTGAA	2	10	182154	182163	40 %	40 %	20 %	0 %	478466816
132	NC_020933	TGAGT	2	10	182968	182977	20 %	40 %	40 %	0 %	478466816
133	NC_020933	AGGGG	2	10	183165	183174	20 %	0 %	80 %	0 %	478466816
134	NC_020933	TTGAG	2	10	183715	183724	20 %	40 %	40 %	0 %	478466817
135	NC_020933	ATAGA	2	10	183737	183746	60 %	20 %	20 %	0 %	478466817
136	NC_020933	AGAGA	2	10	185820	185829	60 %	0 %	40 %	0 %	478466820
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