MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams1 complete genome

Total Repeats: 2505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020933	GGAT	2	8	57	64	25 %	25 %	50 %	0 %	478466661
2	NC_020933	GGGA	2	8	394	401	25 %	0 %	75 %	0 %	478466661
3	NC_020933	AGTG	2	8	544	551	25 %	25 %	50 %	0 %	478466661
4	NC_020933	TGGC	2	8	578	585	0 %	25 %	50 %	25 %	478466661
5	NC_020933	AATG	2	8	1063	1070	50 %	25 %	25 %	0 %	478466661
6	NC_020933	CTAT	2	8	1397	1404	25 %	50 %	0 %	25 %	478466661
7	NC_020933	AGTA	2	8	2086	2093	50 %	25 %	25 %	0 %	478466662
8	NC_020933	ATGA	2	8	2490	2497	50 %	25 %	25 %	0 %	478466663
9	NC_020933	GATA	2	8	2528	2535	50 %	25 %	25 %	0 %	478466663
10	NC_020933	CATG	2	8	3706	3713	25 %	25 %	25 %	25 %	478466664
11	NC_020933	TTCC	2	8	4011	4018	0 %	50 %	0 %	50 %	478466664
12	NC_020933	TTTA	2	8	4409	4416	25 %	75 %	0 %	0 %	478466665
13	NC_020933	ATCC	2	8	4709	4716	25 %	25 %	0 %	50 %	478466665
14	NC_020933	GACG	2	8	5456	5463	25 %	0 %	50 %	25 %	478466665
15	NC_020933	TTGG	2	8	5559	5566	0 %	50 %	50 %	0 %	478466665
16	NC_020933	TGGA	2	8	5920	5927	25 %	25 %	50 %	0 %	478466666
17	NC_020933	CTTT	2	8	6297	6304	0 %	75 %	0 %	25 %	478466666
18	NC_020933	GGGA	2	8	6812	6819	25 %	0 %	75 %	0 %	478466666
19	NC_020933	GGTG	2	8	7115	7122	0 %	25 %	75 %	0 %	478466667
20	NC_020933	AAAT	2	8	7181	7188	75 %	25 %	0 %	0 %	478466667
21	NC_020933	AAGC	2	8	8419	8426	50 %	0 %	25 %	25 %	478466668
22	NC_020933	ATTG	2	8	8817	8824	25 %	50 %	25 %	0 %	478466669
23	NC_020933	AGCG	2	8	9284	9291	25 %	0 %	50 %	25 %	478466669
24	NC_020933	AAAG	2	8	9305	9312	75 %	0 %	25 %	0 %	478466669
25	NC_020933	CTTT	2	8	9645	9652	0 %	75 %	0 %	25 %	478466669
26	NC_020933	TTCG	2	8	10019	10026	0 %	50 %	25 %	25 %	478466670
27	NC_020933	AATT	2	8	10124	10131	50 %	50 %	0 %	0 %	478466670
28	NC_020933	ATGG	2	8	10183	10190	25 %	25 %	50 %	0 %	478466670
29	NC_020933	CTTT	2	8	10808	10815	0 %	75 %	0 %	25 %	478466671
30	NC_020933	GCAA	2	8	11025	11032	50 %	0 %	25 %	25 %	478466671
31	NC_020933	AGCC	2	8	11255	11262	25 %	0 %	25 %	50 %	478466671
32	NC_020933	GAAA	2	8	11398	11405	75 %	0 %	25 %	0 %	478466671
33	NC_020933	GTTT	2	8	13173	13180	0 %	75 %	25 %	0 %	478466673
34	NC_020933	ATGC	2	8	13603	13610	25 %	25 %	25 %	25 %	478466673
35	NC_020933	TTGT	2	8	14639	14646	0 %	75 %	25 %	0 %	478466674
36	NC_020933	TTCT	2	8	14810	14817	0 %	75 %	0 %	25 %	478466674
37	NC_020933	ATTT	2	8	15016	15023	25 %	75 %	0 %	0 %	478466674
38	NC_020933	TTTC	2	8	15678	15685	0 %	75 %	0 %	25 %	478466675
39	NC_020933	AAAT	2	8	16160	16167	75 %	25 %	0 %	0 %	478466675
40	NC_020933	CTAT	2	8	16859	16866	25 %	50 %	0 %	25 %	478466676
41	NC_020933	GTAA	2	8	17002	17009	50 %	25 %	25 %	0 %	478466676
42	NC_020933	CTAA	2	8	17195	17202	50 %	25 %	0 %	25 %	478466676
43	NC_020933	AGAA	2	8	17458	17465	75 %	0 %	25 %	0 %	478466676
44	NC_020933	ATTT	2	8	17604	17611	25 %	75 %	0 %	0 %	478466676
45	NC_020933	TGCG	2	8	19126	19133	0 %	25 %	50 %	25 %	478466678
46	NC_020933	GAAG	2	8	20110	20117	50 %	0 %	50 %	0 %	478466678
47	NC_020933	GATG	2	8	22244	22251	25 %	25 %	50 %	0 %	478466680
48	NC_020933	CATT	2	8	23303	23310	25 %	50 %	0 %	25 %	478466680
49	NC_020933	GCTT	2	8	23646	23653	0 %	50 %	25 %	25 %	478466680
50	NC_020933	GGTT	2	8	23694	23701	0 %	50 %	50 %	0 %	478466680
51	NC_020933	TTCT	2	8	24064	24071	0 %	75 %	0 %	25 %	478466680
52	NC_020933	TAAC	2	8	24166	24173	50 %	25 %	0 %	25 %	478466680
53	NC_020933	CATT	2	8	24289	24296	25 %	50 %	0 %	25 %	478466680
54	NC_020933	GGTA	2	8	24659	24666	25 %	25 %	50 %	0 %	478466680
55	NC_020933	TTGA	2	8	25654	25661	25 %	50 %	25 %	0 %	478466681
56	NC_020933	TAGG	2	8	25878	25885	25 %	25 %	50 %	0 %	478466681
57	NC_020933	TTCC	2	8	26002	26009	0 %	50 %	0 %	50 %	478466681
58	NC_020933	TAGG	2	8	26116	26123	25 %	25 %	50 %	0 %	478466681
59	NC_020933	GCTT	2	8	26888	26895	0 %	50 %	25 %	25 %	478466681
60	NC_020933	GGAA	2	8	27471	27478	50 %	0 %	50 %	0 %	478466682
61	NC_020933	TTAA	2	8	27544	27551	50 %	50 %	0 %	0 %	478466682
62	NC_020933	AAAG	2	8	27594	27601	75 %	0 %	25 %	0 %	478466682
63	NC_020933	GTTT	2	8	28157	28164	0 %	75 %	25 %	0 %	478466683
64	NC_020933	CAGA	2	8	28179	28186	50 %	0 %	25 %	25 %	478466683
65	NC_020933	CTTT	2	8	30151	30158	0 %	75 %	0 %	25 %	478466685
66	NC_020933	TTTG	2	8	30166	30173	0 %	75 %	25 %	0 %	478466685
67	NC_020933	TTGT	2	8	30201	30208	0 %	75 %	25 %	0 %	478466685
68	NC_020933	TGGC	2	8	30364	30371	0 %	25 %	50 %	25 %	478466685
69	NC_020933	AAAG	2	8	30924	30931	75 %	0 %	25 %	0 %	478466686
70	NC_020933	AAAC	2	8	30994	31001	75 %	0 %	0 %	25 %	478466686
71	NC_020933	GATG	2	8	31137	31144	25 %	25 %	50 %	0 %	478466686
72	NC_020933	GATA	2	8	32246	32253	50 %	25 %	25 %	0 %	478466688
73	NC_020933	TGAT	2	8	34741	34748	25 %	50 %	25 %	0 %	478466691
74	NC_020933	AAGA	3	12	34869	34880	75 %	0 %	25 %	0 %	478466691
75	NC_020933	AAGC	2	8	35089	35096	50 %	0 %	25 %	25 %	478466692
76	NC_020933	GTTC	2	8	35122	35129	0 %	50 %	25 %	25 %	478466692
77	NC_020933	GGCA	2	8	35501	35508	25 %	0 %	50 %	25 %	478466693
78	NC_020933	TGCT	2	8	35911	35918	0 %	50 %	25 %	25 %	478466693
79	NC_020933	TTGG	2	8	36143	36150	0 %	50 %	50 %	0 %	478466693
80	NC_020933	AGAT	2	8	36863	36870	50 %	25 %	25 %	0 %	478466693
81	NC_020933	CTTT	2	8	37235	37242	0 %	75 %	0 %	25 %	478466694
82	NC_020933	ATGA	2	8	37725	37732	50 %	25 %	25 %	0 %	478466694
83	NC_020933	TAGG	2	8	37884	37891	25 %	25 %	50 %	0 %	478466694
84	NC_020933	CAAT	2	8	38068	38075	50 %	25 %	0 %	25 %	478466694
85	NC_020933	AATG	2	8	38855	38862	50 %	25 %	25 %	0 %	478466694
86	NC_020933	AGAA	2	8	39692	39699	75 %	0 %	25 %	0 %	478466695
87	NC_020933	AAGA	2	8	39744	39751	75 %	0 %	25 %	0 %	478466695
88	NC_020933	ATCC	2	8	39752	39759	25 %	25 %	0 %	50 %	478466695
89	NC_020933	TAAT	2	8	39963	39970	50 %	50 %	0 %	0 %	478466695
90	NC_020933	GTGC	2	8	42051	42058	0 %	25 %	50 %	25 %	478466697
91	NC_020933	AGAA	2	8	42470	42477	75 %	0 %	25 %	0 %	478466697
92	NC_020933	GGAT	2	8	42622	42629	25 %	25 %	50 %	0 %	478466697
93	NC_020933	AAAC	2	8	43761	43768	75 %	0 %	0 %	25 %	478466699
94	NC_020933	CAAT	2	8	43965	43972	50 %	25 %	0 %	25 %	478466699
95	NC_020933	ATTT	2	8	44721	44728	25 %	75 %	0 %	0 %	478466700
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98	NC_020933	TTGA	2	8	45771	45778	25 %	50 %	25 %	0 %	478466701
99	NC_020933	TGTT	2	8	45943	45950	0 %	75 %	25 %	0 %	478466701
100	NC_020933	CTAT	2	8	45973	45980	25 %	50 %	0 %	25 %	478466701
101	NC_020933	TGTT	2	8	46002	46009	0 %	75 %	25 %	0 %	478466701
102	NC_020933	CTAT	2	8	46298	46305	25 %	50 %	0 %	25 %	478466701
103	NC_020933	AAGA	2	8	46793	46800	75 %	0 %	25 %	0 %	478466702
104	NC_020933	AAGA	2	8	46850	46857	75 %	0 %	25 %	0 %	478466702
105	NC_020933	AAAG	2	8	46890	46897	75 %	0 %	25 %	0 %	478466702
106	NC_020933	AAGA	2	8	47005	47012	75 %	0 %	25 %	0 %	478466702
107	NC_020933	ACTT	2	8	47266	47273	25 %	50 %	0 %	25 %	478466702
108	NC_020933	ATGG	2	8	47892	47899	25 %	25 %	50 %	0 %	478466702
109	NC_020933	AGGA	2	8	47923	47930	50 %	0 %	50 %	0 %	478466702
110	NC_020933	GAAC	2	8	48470	48477	50 %	0 %	25 %	25 %	478466702
111	NC_020933	AACA	2	8	48714	48721	75 %	0 %	0 %	25 %	478466703
112	NC_020933	CTTT	2	8	48910	48917	0 %	75 %	0 %	25 %	478466703
113	NC_020933	CTTT	2	8	49795	49802	0 %	75 %	0 %	25 %	478466704
114	NC_020933	GTAG	2	8	49813	49820	25 %	25 %	50 %	0 %	478466704
115	NC_020933	GAAG	2	8	51243	51250	50 %	0 %	50 %	0 %	478466705
116	NC_020933	TTCA	2	8	51665	51672	25 %	50 %	0 %	25 %	478466705
117	NC_020933	TCTA	2	8	51882	51889	25 %	50 %	0 %	25 %	478466705
118	NC_020933	GGAA	2	8	52999	53006	50 %	0 %	50 %	0 %	478466707
119	NC_020933	TTAA	2	8	53740	53747	50 %	50 %	0 %	0 %	478466707
120	NC_020933	CCTT	2	8	53947	53954	0 %	50 %	0 %	50 %	478466708
121	NC_020933	TTTA	2	8	54114	54121	25 %	75 %	0 %	0 %	478466708
122	NC_020933	AAAG	2	8	54338	54345	75 %	0 %	25 %	0 %	478466708
123	NC_020933	GATT	2	8	54475	54482	25 %	50 %	25 %	0 %	478466708
124	NC_020933	AATC	2	8	54530	54537	50 %	25 %	0 %	25 %	478466708
125	NC_020933	TATT	2	8	54591	54598	25 %	75 %	0 %	0 %	478466708
126	NC_020933	TCGA	2	8	54979	54986	25 %	25 %	25 %	25 %	478466709
127	NC_020933	CTTC	2	8	55073	55080	0 %	50 %	0 %	50 %	478466709
128	NC_020933	GAAT	2	8	55108	55115	50 %	25 %	25 %	0 %	478466709
129	NC_020933	TTGA	2	8	55178	55185	25 %	50 %	25 %	0 %	478466709
130	NC_020933	GGAA	2	8	55534	55541	50 %	0 %	50 %	0 %	478466709
131	NC_020933	AGAA	2	8	55880	55887	75 %	0 %	25 %	0 %	478466709
132	NC_020933	CTGG	3	12	56445	56456	0 %	25 %	50 %	25 %	478466710
133	NC_020933	TTGC	2	8	56579	56586	0 %	50 %	25 %	25 %	478466710
134	NC_020933	AGCG	2	8	56619	56626	25 %	0 %	50 %	25 %	478466710
135	NC_020933	AGCT	2	8	57078	57085	25 %	25 %	25 %	25 %	478466710
136	NC_020933	TTTG	2	8	57312	57319	0 %	75 %	25 %	0 %	478466710
137	NC_020933	GGTT	2	8	57772	57779	0 %	50 %	50 %	0 %	478466710
138	NC_020933	GAAA	2	8	58710	58717	75 %	0 %	25 %	0 %	478466711
139	NC_020933	AGGT	2	8	58749	58756	25 %	25 %	50 %	0 %	478466711
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