MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams1 complete genome

Total Repeats: 2381

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020933	GA	3	6	212	217	50 %	0 %	50 %	0 %	478466661
2	NC_020933	AG	3	6	844	849	50 %	0 %	50 %	0 %	478466661
3	NC_020933	TC	3	6	2195	2200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020933	TC	3	6	2267	2272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020933	AG	3	6	2750	2755	50 %	0 %	50 %	0 %	478466664
6	NC_020933	TC	3	6	2831	2836	0 %	50 %	0 %	50 %	478466664
7	NC_020933	GA	3	6	3418	3423	50 %	0 %	50 %	0 %	478466664
8	NC_020933	AT	3	6	5111	5116	50 %	50 %	0 %	0 %	478466665
9	NC_020933	TC	3	6	5861	5866	0 %	50 %	0 %	50 %	478466666
10	NC_020933	GA	3	6	5872	5877	50 %	0 %	50 %	0 %	478466666
11	NC_020933	AT	3	6	5976	5981	50 %	50 %	0 %	0 %	478466666
12	NC_020933	TG	3	6	6129	6134	0 %	50 %	50 %	0 %	478466666
13	NC_020933	AG	3	6	6537	6542	50 %	0 %	50 %	0 %	478466666
14	NC_020933	GA	3	6	7595	7600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020933	AC	3	6	8246	8251	50 %	0 %	0 %	50 %	478466668
16	NC_020933	AG	3	6	8989	8994	50 %	0 %	50 %	0 %	478466669
17	NC_020933	CT	4	8	9108	9115	0 %	50 %	0 %	50 %	478466669
18	NC_020933	GT	3	6	9190	9195	0 %	50 %	50 %	0 %	478466669
19	NC_020933	AG	3	6	9950	9955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020933	GA	3	6	10466	10471	50 %	0 %	50 %	0 %	478466671
21	NC_020933	AG	3	6	10683	10688	50 %	0 %	50 %	0 %	478466671
22	NC_020933	TA	3	6	11848	11853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020933	AG	3	6	11909	11914	50 %	0 %	50 %	0 %	478466672
24	NC_020933	TA	3	6	12469	12474	50 %	50 %	0 %	0 %	478466672
25	NC_020933	TG	3	6	13372	13377	0 %	50 %	50 %	0 %	478466673
26	NC_020933	AG	3	6	13521	13526	50 %	0 %	50 %	0 %	478466673
27	NC_020933	AG	4	8	13677	13684	50 %	0 %	50 %	0 %	478466673
28	NC_020933	TA	3	6	13939	13944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020933	TA	4	8	14163	14170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020933	AC	3	6	15006	15011	50 %	0 %	0 %	50 %	478466674
31	NC_020933	CT	3	6	15295	15300	0 %	50 %	0 %	50 %	478466674
32	NC_020933	AG	3	6	16345	16350	50 %	0 %	50 %	0 %	478466675
33	NC_020933	TC	3	6	16385	16390	0 %	50 %	0 %	50 %	478466675
34	NC_020933	GA	3	6	16914	16919	50 %	0 %	50 %	0 %	478466676
35	NC_020933	AG	3	6	16985	16990	50 %	0 %	50 %	0 %	478466676
36	NC_020933	GA	3	6	17769	17774	50 %	0 %	50 %	0 %	478466676
37	NC_020933	AG	3	6	18115	18120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020933	GA	3	6	18128	18133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020933	GA	3	6	18372	18377	50 %	0 %	50 %	0 %	478466677
40	NC_020933	TC	3	6	18822	18827	0 %	50 %	0 %	50 %	478466677
41	NC_020933	CT	3	6	19050	19055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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43	NC_020933	GA	3	6	19265	19270	50 %	0 %	50 %	0 %	478466678
44	NC_020933	GA	3	6	19364	19369	50 %	0 %	50 %	0 %	478466678
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50	NC_020933	AG	3	6	21116	21121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020933	GA	3	6	21274	21279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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65	NC_020933	CT	3	6	27119	27124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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70	NC_020933	TG	3	6	28993	28998	0 %	50 %	50 %	0 %	478466684
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111	NC_020933	GA	4	8	42612	42619	50 %	0 %	50 %	0 %	478466697
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114	NC_020933	AG	3	6	43244	43249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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