MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 333

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020932	TC	3	6	2195	2200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020932	TC	3	6	2267	2272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020932	GA	3	6	7595	7600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020932	AG	3	6	9950	9955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020932	TA	3	6	11848	11853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020932	TA	3	6	13939	13944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020932	TA	4	8	14163	14170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020932	AG	3	6	18115	18120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020932	GA	3	6	18128	18133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020932	CT	3	6	19050	19055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_020932	AG	3	6	21116	21121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020932	GA	3	6	21274	21279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020932	AG	3	6	21791	21796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020932	CT	3	6	21860	21865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020932	GA	3	6	27112	27117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020932	CT	3	6	27119	27124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020932	TC	3	6	28487	28492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020932	AG	3	6	28570	28575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020932	GA	3	6	36984	36989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020932	AT	3	6	37085	37090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020932	CT	3	6	39352	39357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020932	CT	3	6	40722	40727	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020932	AG	3	6	42848	42853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020932	CT	3	6	42914	42919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_020932	AG	3	6	43244	43249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020932	TC	3	6	44336	44341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020932	TA	3	6	44488	44493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020932	AG	3	6	48570	48575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020932	TG	4	8	51919	51926	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020932	GA	3	6	56189	56194	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020932	GA	3	6	61249	61254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020932	AG	4	8	65268	65275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020932	TA	3	6	69587	69592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020932	CT	3	6	72323	72328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020932	TA	3	6	85687	85692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020932	TC	3	6	90908	90913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020932	GA	3	6	91040	91045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020932	CT	3	6	93390	93395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020932	TA	3	6	93556	93561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020932	AG	3	6	93599	93604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020932	AG	3	6	93696	93701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020932	GA	3	6	93918	93923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020932	TA	3	6	94535	94540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020932	TC	3	6	100412	100417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_020932	AT	3	6	100463	100468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020932	GC	3	6	102569	102574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020932	TA	3	6	107139	107144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020932	TG	3	6	116393	116398	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020932	AG	4	8	118981	118988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020932	GA	3	6	120803	120808	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020932	TA	3	6	123111	123116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020932	GT	3	6	124101	124106	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020932	CT	3	6	128637	128642	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_020932	TC	3	6	130959	130964	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020932	AG	3	6	131036	131041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020932	AG	3	6	131061	131066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020932	TG	3	6	137474	137479	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020932	AG	3	6	138719	138724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020932	AT	3	6	143014	143019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020932	GA	3	6	152254	152259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020932	AG	3	6	157821	157826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020932	TC	3	6	172293	172298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_020932	AG	3	6	172425	172430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020932	CT	3	6	172443	172448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020932	TG	3	6	178932	178937	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020932	TA	3	6	184127	184132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020932	GA	3	6	184240	184245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020932	GA	3	6	184343	184348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020932	GA	3	6	184984	184989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020932	GA	3	6	185016	185021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020932	AG	3	6	189070	189075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020932	AT	3	6	189572	189577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020932	AG	3	6	193350	193355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020932	TC	3	6	196342	196347	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020932	CT	3	6	200100	200105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_020932	GA	4	8	203159	203166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020932	CT	4	8	203207	203214	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_020932	TA	3	6	204788	204793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020932	AG	3	6	214479	214484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020932	TA	3	6	216033	216038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020932	CT	3	6	217676	217681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_020932	TC	3	6	220677	220682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020932	AG	3	6	220708	220713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020932	TC	3	6	234907	234912	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_020932	AG	3	6	234933	234938	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020932	AC	3	6	239856	239861	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020932	GA	3	6	246942	246947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020932	TG	3	6	247052	247057	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020932	AG	3	6	247852	247857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020932	GA	3	6	248731	248736	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020932	AG	3	6	248856	248861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020932	TA	3	6	250677	250682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020932	AG	3	6	252968	252973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020932	TC	3	6	252994	252999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_020932	TA	3	6	260835	260840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020932	AG	3	6	260915	260920	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020932	CA	3	6	262642	262647	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_020932	TC	3	6	264541	264546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_020932	CA	3	6	269890	269895	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_020932	TA	3	6	270092	270097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020932	AT	4	8	280652	280659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020932	CT	3	6	281504	281509	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020932	TC	4	8	281595	281602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_020932	TC	3	6	283286	283291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_020932	TC	3	6	283343	283348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020932	CT	3	6	283816	283821	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_020932	AT	3	6	295830	295835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020932	CA	3	6	298159	298164	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_020932	GA	3	6	302890	302895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020932	AG	3	6	312108	312113	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020932	CT	3	6	344066	344071	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_020932	CT	3	6	347137	347142	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_020932	TC	3	6	351363	351368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_020932	CT	3	6	355279	355284	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_020932	AC	3	6	358612	358617	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_020932	GA	3	6	360521	360526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020932	TC	3	6	360599	360604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_020932	TA	3	6	360800	360805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020932	GC	3	6	362329	362334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_020932	TC	3	6	362632	362637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_020932	CT	4	8	377935	377942	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_020932	CG	3	6	387774	387779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_020932	CA	3	6	388824	388829	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_020932	TC	3	6	391371	391376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_020932	CT	3	6	391861	391866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_020932	GA	3	6	391991	391996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020932	GA	3	6	392115	392120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020932	CT	3	6	406223	406228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_020932	CT	3	6	407208	407213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_020932	CT	3	6	425943	425948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_020932	CT	3	6	426966	426971	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_020932	AG	3	6	427312	427317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020932	GA	3	6	429007	429012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020932	AC	3	6	433005	433010	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020932	CT	3	6	437276	437281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_020932	AC	3	6	437314	437319	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_020932	CA	3	6	439783	439788	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_020932	CT	3	6	441187	441192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_020932	CT	3	6	450469	450474	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_020932	AG	3	6	456610	456615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020932	TC	3	6	463148	463153	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_020932	AT	3	6	463217	463222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020932	GA	4	8	464591	464598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020932	TA	3	6	464634	464639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020932	TC	3	6	476459	476464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_020932	AC	3	6	482001	482006	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_020932	GA	4	8	482046	482053	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020932	CA	3	6	482083	482088	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_020932	TC	3	6	482124	482129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_020932	AC	3	6	486559	486564	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_020932	AG	3	6	486721	486726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020932	CT	3	6	486740	486745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_020932	AG	3	6	487033	487038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_020932	CT	3	6	490020	490025	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.