MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-2 complete genome

Total Repeats: 648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020931	TGTGA	2	10	3878	3887	20 %	40 %	40 %	0 %	478454035
2	NC_020931	TTGAA	2	10	4234	4243	40 %	40 %	20 %	0 %	478454036
3	NC_020931	GAGAA	2	10	4528	4537	60 %	0 %	40 %	0 %	478454036
4	NC_020931	GAAAA	2	10	4965	4974	80 %	0 %	20 %	0 %	478454036
5	NC_020931	TTACA	2	10	5120	5129	40 %	40 %	0 %	20 %	478454036
6	NC_020931	GTCTT	2	10	5816	5825	0 %	60 %	20 %	20 %	478454037
7	NC_020931	TGGTA	2	10	8289	8298	20 %	40 %	40 %	0 %	478454039
8	NC_020931	CGAAA	2	10	9697	9706	60 %	0 %	20 %	20 %	478454040
9	NC_020931	GGCTG	2	10	10333	10342	0 %	20 %	60 %	20 %	478454041
10	NC_020931	CCTCT	2	10	11125	11134	0 %	40 %	0 %	60 %	478454042
11	NC_020931	AAAGG	2	10	11284	11293	60 %	0 %	40 %	0 %	478454042
12	NC_020931	AAGAA	2	10	12404	12413	80 %	0 %	20 %	0 %	478454043
13	NC_020931	AAAGA	2	10	13802	13811	80 %	0 %	20 %	0 %	478454044
14	NC_020931	GATTT	2	10	15649	15658	20 %	60 %	20 %	0 %	478454046
15	NC_020931	CGTTC	2	10	16760	16769	0 %	40 %	20 %	40 %	478454047
16	NC_020931	GCTTC	2	10	17133	17142	0 %	40 %	20 %	40 %	478454047
17	NC_020931	GAAGG	2	10	17504	17513	40 %	0 %	60 %	0 %	478454047
18	NC_020931	GTTGT	2	10	20930	20939	0 %	60 %	40 %	0 %	478454050
19	NC_020931	AAGAT	2	10	22042	22051	60 %	20 %	20 %	0 %	478454051
20	NC_020931	TTTGC	2	10	22653	22662	0 %	60 %	20 %	20 %	478454051
21	NC_020931	GGAAA	2	10	24407	24416	60 %	0 %	40 %	0 %	478454051
22	NC_020931	AGAGG	2	10	26132	26141	40 %	0 %	60 %	0 %	478454052
23	NC_020931	GGAGA	2	10	27911	27920	40 %	0 %	60 %	0 %	478454053
24	NC_020931	GGATA	2	10	27937	27946	40 %	20 %	40 %	0 %	478454053
25	NC_020931	ATCCG	2	10	28662	28671	20 %	20 %	20 %	40 %	478454055
26	NC_020931	AGGGT	2	10	29180	29189	20 %	20 %	60 %	0 %	478454055
27	NC_020931	CCTAT	2	10	30220	30229	20 %	40 %	0 %	40 %	478454056
28	NC_020931	GAAGG	2	10	31019	31028	40 %	0 %	60 %	0 %	478454057
29	NC_020931	GAGCT	2	10	32059	32068	20 %	20 %	40 %	20 %	478454058
30	NC_020931	CTATT	2	10	36733	36742	20 %	60 %	0 %	20 %	478454064
31	NC_020931	TCCTA	2	10	36780	36789	20 %	40 %	0 %	40 %	478454064
32	NC_020931	ACGAT	2	10	38695	38704	40 %	20 %	20 %	20 %	478454065
33	NC_020931	AATTT	2	10	39586	39595	40 %	60 %	0 %	0 %	478454066
34	NC_020931	AGCAA	2	10	42710	42719	60 %	0 %	20 %	20 %	478454068
35	NC_020931	CGATG	2	10	42767	42776	20 %	20 %	40 %	20 %	478454068
36	NC_020931	TTTAT	2	10	44770	44779	20 %	80 %	0 %	0 %	478454071
37	NC_020931	CTTTC	2	10	46866	46875	0 %	60 %	0 %	40 %	478454073
38	NC_020931	AGTTT	2	10	47405	47414	20 %	60 %	20 %	0 %	478454073
39	NC_020931	CTTTT	2	10	50570	50579	0 %	80 %	0 %	20 %	478454076
40	NC_020931	CCGTA	2	10	54404	54413	20 %	20 %	20 %	40 %	478454079
41	NC_020931	TTATC	2	10	55807	55816	20 %	60 %	0 %	20 %	478454080
42	NC_020931	GTTGT	2	10	56872	56881	0 %	60 %	40 %	0 %	478454081
43	NC_020931	GAGCA	2	10	60379	60388	40 %	0 %	40 %	20 %	478454083
44	NC_020931	TGTGA	2	10	62828	62837	20 %	40 %	40 %	0 %	478454085
45	NC_020931	AGTGA	2	10	64349	64358	40 %	20 %	40 %	0 %	478454086
46	NC_020931	CCTTC	2	10	64623	64632	0 %	40 %	0 %	60 %	478454086
47	NC_020931	AGGAG	2	10	66851	66860	40 %	0 %	60 %	0 %	478454088
48	NC_020931	GTTAA	2	10	66981	66990	40 %	40 %	20 %	0 %	478454088
49	NC_020931	CAAGC	2	10	69347	69356	40 %	0 %	20 %	40 %	478454090
50	NC_020931	GGAGC	2	10	70217	70226	20 %	0 %	60 %	20 %	478454091
51	NC_020931	GCGAT	2	10	70407	70416	20 %	20 %	40 %	20 %	478454091
52	NC_020931	CTCTT	2	10	70761	70770	0 %	60 %	0 %	40 %	478454091
53	NC_020931	AGGGG	2	10	71407	71416	20 %	0 %	80 %	0 %	478454091
54	NC_020931	AAGAA	2	10	71449	71458	80 %	0 %	20 %	0 %	478454091
55	NC_020931	ATTGG	2	10	72739	72748	20 %	40 %	40 %	0 %	478454093
56	NC_020931	GAAAA	2	10	73811	73820	80 %	0 %	20 %	0 %	478454093
57	NC_020931	TGGGA	2	10	74228	74237	20 %	20 %	60 %	0 %	478454094
58	NC_020931	TATTT	2	10	76755	76764	20 %	80 %	0 %	0 %	478454095
59	NC_020931	TGTCT	2	10	80550	80559	0 %	60 %	20 %	20 %	478454098
60	NC_020931	TTACT	2	10	81057	81066	20 %	60 %	0 %	20 %	478454098
61	NC_020931	AGAAA	2	10	82447	82456	80 %	0 %	20 %	0 %	478454100
62	NC_020931	GGAAG	2	10	82960	82969	40 %	0 %	60 %	0 %	478454100
63	NC_020931	AGCGA	2	10	85426	85435	40 %	0 %	40 %	20 %	478454102
64	NC_020931	GATCC	2	10	86511	86520	20 %	20 %	20 %	40 %	478454103
65	NC_020931	AGAGC	2	10	87846	87855	40 %	0 %	40 %	20 %	478454104
66	NC_020931	TTTTC	2	10	91578	91587	0 %	80 %	0 %	20 %	478454107
67	NC_020931	GGATG	2	10	91838	91847	20 %	20 %	60 %	0 %	478454108
68	NC_020931	CAACA	2	10	93377	93386	60 %	0 %	0 %	40 %	478454109
69	NC_020931	ACAGC	2	10	94422	94431	40 %	0 %	20 %	40 %	478454110
70	NC_020931	GGAAC	2	10	95134	95143	40 %	0 %	40 %	20 %	478454111
71	NC_020931	GGATT	2	10	96034	96043	20 %	40 %	40 %	0 %	478454111
72	NC_020931	CAATC	2	10	97136	97145	40 %	20 %	0 %	40 %	478454113
73	NC_020931	TTTGC	2	10	97270	97279	0 %	60 %	20 %	20 %	478454113
74	NC_020931	ATTCA	2	10	97534	97543	40 %	40 %	0 %	20 %	478454113
75	NC_020931	GATCC	2	10	97793	97802	20 %	20 %	20 %	40 %	478454113
76	NC_020931	GTTTT	2	10	98214	98223	0 %	80 %	20 %	0 %	478454113
77	NC_020931	AAGCT	2	10	99419	99428	40 %	20 %	20 %	20 %	478454114
78	NC_020931	AGGGG	2	10	99778	99787	20 %	0 %	80 %	0 %	478454114
79	NC_020931	ATAGC	2	10	100471	100480	40 %	20 %	20 %	20 %	478454115
80	NC_020931	TTCCC	2	10	101075	101084	0 %	40 %	0 %	60 %	478454116
81	NC_020931	AGCGA	2	10	103399	103408	40 %	0 %	40 %	20 %	478454118
82	NC_020931	TTTCT	2	10	103757	103766	0 %	80 %	0 %	20 %	478454118
83	NC_020931	CTTCT	2	10	103811	103820	0 %	60 %	0 %	40 %	478454118
84	NC_020931	ATCAT	2	10	104963	104972	40 %	40 %	0 %	20 %	478454119
85	NC_020931	GGCAT	2	10	105671	105680	20 %	20 %	40 %	20 %	478454119
86	NC_020931	AAAGC	2	10	109397	109406	60 %	0 %	20 %	20 %	478454122
87	NC_020931	GCATT	2	10	110557	110566	20 %	40 %	20 %	20 %	478454124
88	NC_020931	TGTTT	2	10	115246	115255	0 %	80 %	20 %	0 %	478454127
89	NC_020931	CATGT	2	10	115624	115633	20 %	40 %	20 %	20 %	478454127
90	NC_020931	TATCG	2	10	116328	116337	20 %	40 %	20 %	20 %	478454127
91	NC_020931	TTTCT	2	10	116844	116853	0 %	80 %	0 %	20 %	478454128
92	NC_020931	GGAGA	2	10	117040	117049	40 %	0 %	60 %	0 %	478454128
93	NC_020931	AAAGA	2	10	119091	119100	80 %	0 %	20 %	0 %	478454131
94	NC_020931	CCAAT	2	10	122054	122063	40 %	20 %	0 %	40 %	478454134
95	NC_020931	GCTTC	2	10	123155	123164	0 %	40 %	20 %	40 %	478454134
96	NC_020931	TACAA	2	10	126944	126953	60 %	20 %	0 %	20 %	478454138
97	NC_020931	ATCCA	2	10	129351	129360	40 %	20 %	0 %	40 %	478454142
98	NC_020931	GAAGA	2	10	130901	130910	60 %	0 %	40 %	0 %	478454142
99	NC_020931	AAAAG	2	10	132813	132822	80 %	0 %	20 %	0 %	478454143
100	NC_020931	GATTC	2	10	133144	133153	20 %	40 %	20 %	20 %	478454143
101	NC_020931	GGATA	2	10	135762	135771	40 %	20 %	40 %	0 %	478454145
102	NC_020931	ATTGT	2	10	136459	136468	20 %	60 %	20 %	0 %	478454146
103	NC_020931	TCCAG	2	10	140631	140640	20 %	20 %	20 %	40 %	478454153
104	NC_020931	GTACA	2	10	141362	141371	40 %	20 %	20 %	20 %	478454154
105	NC_020931	TAGAT	2	10	141735	141744	40 %	40 %	20 %	0 %	478454154
106	NC_020931	AAAAC	2	10	142627	142636	80 %	0 %	0 %	20 %	478454155
107	NC_020931	TGCTA	2	10	143713	143722	20 %	40 %	20 %	20 %	478454157
108	NC_020931	GGAGC	2	10	143760	143769	20 %	0 %	60 %	20 %	478454157
109	NC_020931	CTGGG	2	10	145175	145184	0 %	20 %	60 %	20 %	478454159
110	NC_020931	GTTTT	2	10	145922	145931	0 %	80 %	20 %	0 %	478454160
111	NC_020931	GAACC	2	10	149656	149665	40 %	0 %	20 %	40 %	478454161
112	NC_020931	ATTCT	2	10	153153	153162	20 %	60 %	0 %	20 %	478454165
113	NC_020931	CTGTG	2	10	153357	153366	0 %	40 %	40 %	20 %	478454165
114	NC_020931	TTCTT	2	10	155830	155839	0 %	80 %	0 %	20 %	478454168
115	NC_020931	AGGAA	2	10	160389	160398	60 %	0 %	40 %	0 %	478454172
116	NC_020931	AGAGA	2	10	163629	163638	60 %	0 %	40 %	0 %	478454175
117	NC_020931	AGCAA	2	10	164064	164073	60 %	0 %	20 %	20 %	478454175
118	NC_020931	TATGA	2	10	164488	164497	40 %	40 %	20 %	0 %	478454176
119	NC_020931	CAAAA	2	10	167567	167576	80 %	0 %	0 %	20 %	478454177
120	NC_020931	AAGAG	2	10	168400	168409	60 %	0 %	40 %	0 %	478454177
121	NC_020931	GATTG	2	10	168745	168754	20 %	40 %	40 %	0 %	478454177
122	NC_020931	GTTTT	2	10	175224	175233	0 %	80 %	20 %	0 %	478454181
123	NC_020931	TATTG	2	10	175247	175256	20 %	60 %	20 %	0 %	478454181
124	NC_020931	CAGCA	2	10	175606	175615	40 %	0 %	20 %	40 %	478454181
125	NC_020931	TAGGA	2	10	175911	175920	40 %	20 %	40 %	0 %	478454182
126	NC_020931	TGATT	2	10	177838	177847	20 %	60 %	20 %	0 %	478454183
127	NC_020931	TCAAT	2	10	178479	178488	40 %	40 %	0 %	20 %	478454183
128	NC_020931	TTTTC	2	10	178518	178527	0 %	80 %	0 %	20 %	478454183
129	NC_020931	GGAAT	2	10	180077	180086	40 %	20 %	40 %	0 %	478454185
130	NC_020931	AGAGT	2	10	181464	181473	40 %	20 %	40 %	0 %	478454186
131	NC_020931	TTGAA	2	10	182154	182163	40 %	40 %	20 %	0 %	478454187
132	NC_020931	TGAGT	2	10	182968	182977	20 %	40 %	40 %	0 %	478454187
133	NC_020931	AGGGG	2	10	183165	183174	20 %	0 %	80 %	0 %	478454187
134	NC_020931	TTGAG	2	10	183715	183724	20 %	40 %	40 %	0 %	478454188
135	NC_020931	ATAGA	2	10	183737	183746	60 %	20 %	20 %	0 %	478454188
136	NC_020931	AGAGA	2	10	185820	185829	60 %	0 %	40 %	0 %	478454191
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