MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-2 complete genome

Total Repeats: 14073

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020931	AGG	2	6	18	23	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454032
2	NC_020931	TAA	3	9	93	101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454032
3	NC_020931	AGT	2	6	168	173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454032
4	NC_020931	AAG	2	6	324	329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454032
5	NC_020931	CAA	2	6	338	343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454032
6	NC_020931	AGT	2	6	364	369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454032
7	NC_020931	GTG	2	6	380	385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478454032
8	NC_020931	CAG	2	6	413	418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454032
9	NC_020931	GCT	2	6	532	537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454032
10	NC_020931	ATT	2	6	557	562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454032
11	NC_020931	GCC	2	6	601	606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478454032
12	NC_020931	TGC	2	6	660	665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454032
13	NC_020931	ATT	2	6	672	677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454032
14	NC_020931	CGA	2	6	694	699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454032
15	NC_020931	TAT	2	6	836	841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454032
16	NC_020931	GAA	2	6	883	888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454032
17	NC_020931	AGA	2	6	912	917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454032
18	NC_020931	AGA	2	6	966	971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454032
19	NC_020931	CAA	2	6	1039	1044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454032
20	NC_020931	TTG	2	6	1182	1187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454032
21	NC_020931	CTC	2	6	1211	1216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454032
22	NC_020931	GAT	2	6	1273	1278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454032
23	NC_020931	GAT	2	6	1327	1332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454032
24	NC_020931	ATG	2	6	1390	1395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454032
25	NC_020931	CTT	2	6	1610	1615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454032
26	NC_020931	CAG	2	6	1675	1680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454032
27	NC_020931	AAG	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020931	TGG	2	6	1833	1838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020931	CTT	2	6	1840	1845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020931	ATG	2	6	1933	1938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454033
31	NC_020931	GTG	2	6	1939	1944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478454033
32	NC_020931	TCC	2	6	1948	1953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454033
33	NC_020931	AGC	2	6	1962	1967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454033
34	NC_020931	AGC	2	6	1989	1994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454033
35	NC_020931	AAG	2	6	2000	2005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454033
36	NC_020931	TAC	2	6	2038	2043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454033
37	NC_020931	GCT	2	6	2048	2053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454033
38	NC_020931	AAC	2	6	2146	2151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454033
39	NC_020931	AGA	2	6	2158	2163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454033
40	NC_020931	TAA	2	6	2248	2253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020931	AGA	2	6	2414	2419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454034
42	NC_020931	ATC	2	6	2421	2426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454034
43	NC_020931	TGC	2	6	2441	2446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454034
44	NC_020931	CAT	2	6	2565	2570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454034
45	NC_020931	AGA	2	6	2594	2599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454034
46	NC_020931	AAG	2	6	2623	2628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454034
47	NC_020931	GGA	2	6	2658	2663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454034
48	NC_020931	ATC	2	6	2787	2792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454035
49	NC_020931	ATA	2	6	2937	2942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454035
50	NC_020931	AAC	2	6	2962	2967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454035
51	NC_020931	GGT	2	6	3016	3021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478454035
52	NC_020931	AAT	2	6	3122	3127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454035
53	NC_020931	TTC	2	6	3157	3162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454035
54	NC_020931	GCA	2	6	3176	3181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454035
55	NC_020931	GGA	2	6	3224	3229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454035
56	NC_020931	CAG	2	6	3243	3248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454035
57	NC_020931	GTT	2	6	3260	3265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454035
58	NC_020931	GGT	2	6	3352	3357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478454035
59	NC_020931	AAG	2	6	3510	3515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454035
60	NC_020931	ATT	2	6	3572	3577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454035
61	NC_020931	TTG	2	6	3624	3629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454035
62	NC_020931	AAG	2	6	3735	3740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454035
63	NC_020931	AAG	2	6	3750	3755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454035
64	NC_020931	CAG	2	6	3792	3797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454035
65	NC_020931	GCT	2	6	3863	3868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454035
66	NC_020931	AAG	2	6	4029	4034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454035
67	NC_020931	CAG	2	6	4079	4084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454035
68	NC_020931	GGA	2	6	4166	4171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454035
69	NC_020931	AAT	2	6	4176	4181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454035
70	NC_020931	ATT	2	6	4256	4261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454036
71	NC_020931	TGA	2	6	4286	4291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454036
72	NC_020931	GTA	2	6	4518	4523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454036
73	NC_020931	AGA	2	6	4565	4570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454036
74	NC_020931	GAA	2	6	4749	4754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454036
75	NC_020931	CGT	2	6	4881	4886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454036
76	NC_020931	GTT	2	6	4932	4937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454036
77	NC_020931	TGA	2	6	5069	5074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454036
78	NC_020931	TTG	2	6	5164	5169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454036
79	NC_020931	TTC	2	6	5305	5310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454036
80	NC_020931	TCT	2	6	5397	5402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454036
81	NC_020931	AGA	2	6	5417	5422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454036
82	NC_020931	GTT	2	6	5444	5449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454036
83	NC_020931	GGT	2	6	5492	5497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478454036
84	NC_020931	CTC	2	6	5596	5601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454036
85	NC_020931	AGC	2	6	5627	5632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454036
86	NC_020931	GCA	2	6	5652	5657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020931	AGA	2	6	5679	5684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020931	ATT	2	6	5746	5751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454037
89	NC_020931	TCT	2	6	5764	5769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454037
90	NC_020931	GCT	2	6	5810	5815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454037
91	NC_020931	GAT	2	6	5845	5850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454037
92	NC_020931	ACG	2	6	5883	5888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454037
93	NC_020931	GAA	2	6	5907	5912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454037
94	NC_020931	AGA	3	9	5984	5992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454037
95	NC_020931	GCT	2	6	5993	5998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454037
96	NC_020931	AGA	2	6	6002	6007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454037
97	NC_020931	TGG	2	6	6038	6043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478454037
98	NC_020931	AGA	3	9	6056	6064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454037
99	NC_020931	GGA	2	6	6065	6070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454037
100	NC_020931	TCA	2	6	6250	6255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454037
101	NC_020931	GGA	2	6	6287	6292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454037
102	NC_020931	CTT	2	6	6347	6352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454037
103	NC_020931	CTG	2	6	6353	6358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454037
104	NC_020931	CAG	2	6	6508	6513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454037
105	NC_020931	CTT	2	6	6959	6964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_020931	AGG	2	6	7037	7042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454038
107	NC_020931	GAA	2	6	7081	7086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454038
108	NC_020931	GCA	2	6	7345	7350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454038
109	NC_020931	AAG	2	6	7386	7391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454038
110	NC_020931	TGC	2	6	7419	7424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454038
111	NC_020931	GAA	2	6	7674	7679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020931	TTA	2	6	7751	7756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020931	GAA	2	6	7800	7805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020931	ATG	2	6	7836	7841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020931	TCG	2	6	7913	7918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454039
116	NC_020931	TCC	2	6	7956	7961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454039
117	NC_020931	GTT	2	6	8064	8069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454039
118	NC_020931	TTA	2	6	8434	8439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454039
119	NC_020931	TTC	2	6	8757	8762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454039
120	NC_020931	GAA	2	6	8901	8906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454040
121	NC_020931	ACC	2	6	9029	9034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478454040
122	NC_020931	CTT	2	6	9082	9087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454040
123	NC_020931	GAG	2	6	9162	9167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454040
124	NC_020931	ATA	2	6	9179	9184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454040
125	NC_020931	AGG	2	6	9203	9208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454040
126	NC_020931	GAA	2	6	9383	9388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454040
127	NC_020931	CAG	2	6	9399	9404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454040
128	NC_020931	TGT	2	6	9470	9475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454040
129	NC_020931	GAG	2	6	9485	9490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454040
130	NC_020931	TAC	2	6	9553	9558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454040
131	NC_020931	GTT	2	6	9657	9662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454040
132	NC_020931	AAG	2	6	9681	9686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454040
133	NC_020931	GAG	2	6	9707	9712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454040
134	NC_020931	TTC	3	9	9774	9782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_020931	ATC	2	6	9790	9795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_020931	GAA	2	6	9828	9833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020931	CCT	2	6	9929	9934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_020931	TTA	2	6	9997	10002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454041
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165	NC_020931	CTT	2	6	11842	11847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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252	NC_020931	AGA	2	6	18976	18981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
253	NC_020931	AAT	3	9	19038	19046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_020931	TCT	2	6	19066	19071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_020931	TGC	2	6	19194	19199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454049
256	NC_020931	ACT	2	6	19376	19381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454049
257	NC_020931	GTA	2	6	19384	19389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454049
258	NC_020931	GCT	2	6	19390	19395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454049
259	NC_020931	TGT	2	6	19524	19529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454049
260	NC_020931	GAA	2	6	19602	19607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454049
261	NC_020931	GAA	2	6	19614	19619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454049
262	NC_020931	AAG	2	6	19649	19654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454049
263	NC_020931	GAA	2	6	19780	19785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454049
264	NC_020931	AAG	2	6	19841	19846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454049
265	NC_020931	AGA	2	6	19968	19973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454049
266	NC_020931	TGT	2	6	20010	20015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454049
267	NC_020931	TAT	2	6	20057	20062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454049
268	NC_020931	AGA	3	9	20216	20224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454049
269	NC_020931	AAT	2	6	20272	20277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454049
270	NC_020931	CTA	2	6	20330	20335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454049
271	NC_020931	AAT	2	6	20395	20400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454049
272	NC_020931	AAG	2	6	20438	20443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454049
273	NC_020931	CTT	3	9	20492	20500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_020931	GAG	2	6	20563	20568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454050
275	NC_020931	CTT	2	6	20704	20709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454050
276	NC_020931	TCC	2	6	20804	20809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454050
277	NC_020931	TCG	2	6	20813	20818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454050
278	NC_020931	ACG	2	6	20918	20923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454050
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280	NC_020931	GAA	2	6	21017	21022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_020931	GGA	2	6	21211	21216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
282	NC_020931	AGA	3	9	21251	21259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
283	NC_020931	TGG	2	6	21470	21475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
284	NC_020931	AAC	2	6	21509	21514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_020931	AGC	2	6	21526	21531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_020931	TGA	2	6	21727	21732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_020931	TCC	2	6	21844	21849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
288	NC_020931	AAT	2	6	22020	22025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_020931	TGT	2	6	22223	22228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454051
290	NC_020931	GAA	2	6	22377	22382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454051
291	NC_020931	GGA	2	6	22468	22473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454051
292	NC_020931	TGG	2	6	22503	22508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478454051
293	NC_020931	GAC	2	6	22629	22634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454051
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295	NC_020931	TTG	2	6	22873	22878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454051
296	NC_020931	TTC	2	6	22942	22947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454051
297	NC_020931	CTG	2	6	23122	23127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454051
298	NC_020931	TCG	2	6	23141	23146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454051
299	NC_020931	GAA	2	6	23150	23155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454051
300	NC_020931	TTG	2	6	23204	23209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454051
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302	NC_020931	TGA	2	6	23513	23518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454051
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320	NC_020931	AAG	2	6	25075	25080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454051
321	NC_020931	TTA	2	6	25173	25178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
322	NC_020931	AGA	2	6	25347	25352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454052
323	NC_020931	TAA	2	6	25479	25484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454052
324	NC_020931	GGA	3	9	25511	25519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454052
325	NC_020931	GAT	2	6	25556	25561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454052
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327	NC_020931	TTA	2	6	25979	25984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454052
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332	NC_020931	TGT	2	6	26698	26703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454052
333	NC_020931	TAG	2	6	26736	26741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454052
334	NC_020931	GCA	2	6	26810	26815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454052
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337	NC_020931	GAA	2	6	27030	27035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454052
338	NC_020931	CGA	2	6	27038	27043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454052
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343	NC_020931	TTC	2	6	27724	27729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454053
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354	NC_020931	TAA	2	6	28480	28485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
355	NC_020931	AGA	2	6	28592	28597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
356	NC_020931	GAA	2	6	28642	28647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454055
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369	NC_020931	GAA	2	6	29671	29676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454055
370	NC_020931	TGT	2	6	29703	29708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454056
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372	NC_020931	ACA	2	6	29999	30004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454056
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374	NC_020931	ATC	2	6	30315	30320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454056
375	NC_020931	ATG	2	6	30495	30500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454056
376	NC_020931	AGG	2	6	30608	30613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454057
377	NC_020931	GTT	2	6	30712	30717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454057
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379	NC_020931	TCT	2	6	30787	30792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454057
380	NC_020931	CTG	2	6	30809	30814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454057
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382	NC_020931	TTC	2	6	30905	30910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454057
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