MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L2/25667R complete genome

Total Repeats: 14070

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020930	AGG	2	6	18	23	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478446833
2	NC_020930	TAA	3	9	93	101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478446833
3	NC_020930	AGT	2	6	168	173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446833
4	NC_020930	AAG	2	6	324	329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446833
5	NC_020930	CAA	2	6	338	343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478446833
6	NC_020930	AGT	2	6	364	369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446833
7	NC_020930	GTG	2	6	380	385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478446833
8	NC_020930	CAG	2	6	413	418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478446833
9	NC_020930	GCT	2	6	532	537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478446833
10	NC_020930	ATT	2	6	557	562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478446833
11	NC_020930	GCC	2	6	601	606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478446833
12	NC_020930	TGC	2	6	660	665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478446833
13	NC_020930	ATT	2	6	672	677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478446833
14	NC_020930	CGA	2	6	694	699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478446833
15	NC_020930	TAT	2	6	836	841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478446833
16	NC_020930	GAA	2	6	883	888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446833
17	NC_020930	AGA	2	6	912	917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446833
18	NC_020930	AGA	2	6	966	971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446833
19	NC_020930	CAA	2	6	1039	1044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478446833
20	NC_020930	TTG	2	6	1182	1187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478446833
21	NC_020930	CTC	2	6	1211	1216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478446833
22	NC_020930	GAT	2	6	1273	1278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446833
23	NC_020930	GAT	2	6	1327	1332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446833
24	NC_020930	ATG	2	6	1390	1395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446833
25	NC_020930	CTT	2	6	1610	1615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446833
26	NC_020930	CAG	2	6	1675	1680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478446833
27	NC_020930	AAG	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020930	TGG	2	6	1833	1838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020930	CTT	2	6	1840	1845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020930	ATG	2	6	1933	1938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446834
31	NC_020930	GTG	2	6	1939	1944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478446834
32	NC_020930	TCC	2	6	1948	1953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478446834
33	NC_020930	AGC	2	6	1962	1967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478446834
34	NC_020930	AGC	2	6	1989	1994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478446834
35	NC_020930	AAG	2	6	2000	2005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446834
36	NC_020930	TAC	2	6	2038	2043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478446834
37	NC_020930	GCT	2	6	2048	2053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478446834
38	NC_020930	AAC	2	6	2146	2151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478446834
39	NC_020930	AGA	2	6	2158	2163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446834
40	NC_020930	TAA	2	6	2248	2253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020930	AGA	2	6	2414	2419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446835
42	NC_020930	ATC	2	6	2421	2426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478446835
43	NC_020930	TGC	2	6	2441	2446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478446835
44	NC_020930	CAT	2	6	2565	2570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478446835
45	NC_020930	AGA	2	6	2594	2599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446835
46	NC_020930	AAG	2	6	2623	2628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446835
47	NC_020930	GGA	2	6	2658	2663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478446835
48	NC_020930	ATC	2	6	2787	2792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478446836
49	NC_020930	ATA	2	6	2937	2942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478446836
50	NC_020930	AAC	2	6	2962	2967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478446836
51	NC_020930	GGT	2	6	3016	3021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478446836
52	NC_020930	AAT	2	6	3122	3127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478446836
53	NC_020930	TTC	2	6	3157	3162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446836
54	NC_020930	GCA	2	6	3176	3181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478446836
55	NC_020930	GGA	2	6	3224	3229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478446836
56	NC_020930	CAG	2	6	3243	3248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478446836
57	NC_020930	GTT	2	6	3260	3265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478446836
58	NC_020930	GGT	2	6	3352	3357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478446836
59	NC_020930	AAG	2	6	3510	3515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446836
60	NC_020930	ATT	2	6	3572	3577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478446836
61	NC_020930	TTG	2	6	3624	3629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478446836
62	NC_020930	AAG	2	6	3735	3740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446836
63	NC_020930	AAG	2	6	3750	3755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446836
64	NC_020930	CAG	2	6	3792	3797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478446836
65	NC_020930	GCT	2	6	3863	3868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478446836
66	NC_020930	AAG	2	6	4029	4034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446836
67	NC_020930	CAG	2	6	4079	4084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478446836
68	NC_020930	GGA	2	6	4166	4171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478446836
69	NC_020930	AAT	2	6	4176	4181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478446836
70	NC_020930	ATT	2	6	4256	4261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478446837
71	NC_020930	TGA	2	6	4286	4291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446837
72	NC_020930	GTA	2	6	4518	4523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446837
73	NC_020930	AGA	2	6	4565	4570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446837
74	NC_020930	GAA	2	6	4749	4754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446837
75	NC_020930	CGT	2	6	4881	4886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478446837
76	NC_020930	GTT	2	6	4932	4937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478446837
77	NC_020930	TGA	2	6	5069	5074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446837
78	NC_020930	TTG	2	6	5164	5169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478446837
79	NC_020930	TTC	2	6	5305	5310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446837
80	NC_020930	TCT	2	6	5397	5402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446837
81	NC_020930	AGA	2	6	5417	5422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446837
82	NC_020930	GTT	2	6	5444	5449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478446837
83	NC_020930	GGT	2	6	5492	5497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478446837
84	NC_020930	CTC	2	6	5596	5601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478446837
85	NC_020930	AGC	2	6	5627	5632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478446837
86	NC_020930	GCA	2	6	5652	5657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020930	AGA	2	6	5679	5684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020930	ATT	2	6	5746	5751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478446838
89	NC_020930	TCT	2	6	5764	5769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446838
90	NC_020930	GCT	2	6	5810	5815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478446838
91	NC_020930	GAT	2	6	5845	5850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446838
92	NC_020930	ACG	2	6	5883	5888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478446838
93	NC_020930	GAA	2	6	5907	5912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446838
94	NC_020930	AGA	3	9	5984	5992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446838
95	NC_020930	GCT	2	6	5993	5998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478446838
96	NC_020930	AGA	2	6	6002	6007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446838
97	NC_020930	TGG	2	6	6038	6043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478446838
98	NC_020930	AGA	3	9	6056	6064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446838
99	NC_020930	GGA	2	6	6065	6070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478446838
100	NC_020930	TCA	2	6	6250	6255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478446838
101	NC_020930	GGA	2	6	6287	6292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478446838
102	NC_020930	CTT	2	6	6347	6352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446838
103	NC_020930	CTG	2	6	6353	6358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478446838
104	NC_020930	CAG	2	6	6508	6513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478446838
105	NC_020930	CTT	2	6	6959	6964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_020930	AGG	2	6	7037	7042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478446839
107	NC_020930	GAA	2	6	7081	7086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446839
108	NC_020930	GCA	2	6	7345	7350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478446839
109	NC_020930	AAG	2	6	7386	7391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446839
110	NC_020930	TGC	2	6	7419	7424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478446839
111	NC_020930	GAA	2	6	7674	7679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020930	TTA	2	6	7751	7756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020930	GAA	2	6	7800	7805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020930	ATG	2	6	7836	7841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020930	TCG	2	6	7913	7918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478446840
116	NC_020930	TCC	2	6	7956	7961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478446840
117	NC_020930	GTT	2	6	8064	8069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478446840
118	NC_020930	TTA	2	6	8434	8439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478446840
119	NC_020930	TTC	2	6	8757	8762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446840
120	NC_020930	GAA	2	6	8901	8906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446841
121	NC_020930	ACC	2	6	9029	9034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478446841
122	NC_020930	CTT	2	6	9082	9087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446841
123	NC_020930	GAG	2	6	9162	9167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478446841
124	NC_020930	ATA	2	6	9179	9184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478446841
125	NC_020930	AGG	2	6	9203	9208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478446841
126	NC_020930	GAA	2	6	9383	9388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446841
127	NC_020930	CAG	2	6	9399	9404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478446841
128	NC_020930	TGT	2	6	9470	9475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478446841
129	NC_020930	GAG	2	6	9485	9490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478446841
130	NC_020930	TAC	2	6	9553	9558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478446841
131	NC_020930	GTT	2	6	9657	9662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478446841
132	NC_020930	AAG	2	6	9681	9686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446841
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253	NC_020930	AAT	3	9	19038	19046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_020930	TCT	2	6	19066	19071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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258	NC_020930	GCT	2	6	19390	19395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478446850
259	NC_020930	TGT	2	6	19524	19529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478446850
260	NC_020930	GAA	2	6	19602	19607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446850
261	NC_020930	GAA	2	6	19614	19619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446850
262	NC_020930	AAG	2	6	19649	19654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446850
263	NC_020930	GAA	2	6	19780	19785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446850
264	NC_020930	AAG	2	6	19841	19846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446850
265	NC_020930	AGA	2	6	19968	19973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446850
266	NC_020930	TGT	2	6	20010	20015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478446850
267	NC_020930	TAT	2	6	20057	20062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478446850
268	NC_020930	AGA	3	9	20216	20224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446850
269	NC_020930	AAT	2	6	20272	20277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478446850
270	NC_020930	CTA	2	6	20330	20335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478446850
271	NC_020930	AAT	2	6	20395	20400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478446850
272	NC_020930	AAG	2	6	20438	20443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446850
273	NC_020930	CTT	3	9	20492	20500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_020930	GAG	2	6	20563	20568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478446851
275	NC_020930	CTT	2	6	20704	20709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446851
276	NC_020930	TCC	2	6	20804	20809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478446851
277	NC_020930	TCG	2	6	20813	20818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478446851
278	NC_020930	ACG	2	6	20918	20923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478446851
279	NC_020930	TGC	2	6	20979	20984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478446851
280	NC_020930	GAA	2	6	21017	21022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_020930	GGA	2	6	21211	21216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
282	NC_020930	AGA	3	9	21251	21259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
283	NC_020930	TGG	2	6	21470	21475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
284	NC_020930	AAC	2	6	21509	21514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_020930	AGC	2	6	21526	21531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_020930	TGA	2	6	21727	21732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_020930	TCC	2	6	21844	21849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
288	NC_020930	AAT	2	6	22020	22025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_020930	TGT	2	6	22223	22228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478446852
290	NC_020930	GAA	2	6	22377	22382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446852
291	NC_020930	GGA	2	6	22468	22473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478446852
292	NC_020930	TGG	2	6	22503	22508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478446852
293	NC_020930	GAC	2	6	22629	22634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478446852
294	NC_020930	TCT	2	6	22679	22684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446852
295	NC_020930	TTG	2	6	22873	22878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478446852
296	NC_020930	TTC	2	6	22942	22947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446852
297	NC_020930	CTG	2	6	23122	23127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478446852
298	NC_020930	TCG	2	6	23141	23146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478446852
299	NC_020930	GAA	2	6	23150	23155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446852
300	NC_020930	TTG	2	6	23204	23209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478446852
301	NC_020930	AGA	2	6	23482	23487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446852
302	NC_020930	TGA	2	6	23513	23518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446852
303	NC_020930	GAA	2	6	23551	23556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446852
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308	NC_020930	AAT	2	6	23814	23819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478446852
309	NC_020930	TTG	2	6	23877	23882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478446852
310	NC_020930	TGC	2	6	24128	24133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478446852
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319	NC_020930	GAA	2	6	24934	24939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446852
320	NC_020930	AAG	2	6	25075	25080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446852
321	NC_020930	TTA	2	6	25173	25178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
322	NC_020930	AGA	2	6	25346	25351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446853
323	NC_020930	TAA	2	6	25478	25483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478446853
324	NC_020930	GGA	3	9	25510	25518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478446853
325	NC_020930	GAT	2	6	25555	25560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446853
326	NC_020930	TGT	2	6	25968	25973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478446853
327	NC_020930	TTA	2	6	25978	25983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478446853
328	NC_020930	TAG	2	6	26039	26044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446853
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331	NC_020930	GAT	2	6	26562	26567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446853
332	NC_020930	TGT	2	6	26697	26702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478446853
333	NC_020930	TAG	2	6	26735	26740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446853
334	NC_020930	GCA	2	6	26809	26814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478446853
335	NC_020930	CTT	2	6	26957	26962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446853
336	NC_020930	GAA	2	6	27022	27027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446853
337	NC_020930	GAA	2	6	27029	27034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446853
338	NC_020930	CGA	2	6	27037	27042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478446853
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342	NC_020930	GAA	2	6	27435	27440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446854
343	NC_020930	TTC	2	6	27723	27728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446854
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347	NC_020930	AAG	2	6	27977	27982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446854
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352	NC_020930	AAG	2	6	28385	28390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446855
353	NC_020930	AAG	2	6	28403	28408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446855
354	NC_020930	TAA	2	6	28479	28484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
355	NC_020930	AGA	2	6	28591	28596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
356	NC_020930	GAA	2	6	28641	28646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446856
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369	NC_020930	GAA	2	6	29670	29675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446856
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372	NC_020930	ACA	2	6	29998	30003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478446857
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374	NC_020930	ATC	2	6	30314	30319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478446857
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379	NC_020930	TCT	2	6	30786	30791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446858
380	NC_020930	CTG	2	6	30808	30813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478446858
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382	NC_020930	TTC	2	6	30904	30909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446858
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