MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L2/25667R complete genome

Total Repeats: 2380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020930	GA	3	6	212	217	50 %	0 %	50 %	0 %	478446833
2	NC_020930	AG	3	6	844	849	50 %	0 %	50 %	0 %	478446833
3	NC_020930	TC	3	6	2195	2200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020930	TC	3	6	2267	2272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020930	AG	3	6	2750	2755	50 %	0 %	50 %	0 %	478446836
6	NC_020930	TC	3	6	2831	2836	0 %	50 %	0 %	50 %	478446836
7	NC_020930	GA	3	6	3418	3423	50 %	0 %	50 %	0 %	478446836
8	NC_020930	AT	3	6	5111	5116	50 %	50 %	0 %	0 %	478446837
9	NC_020930	TC	3	6	5861	5866	0 %	50 %	0 %	50 %	478446838
10	NC_020930	GA	3	6	5872	5877	50 %	0 %	50 %	0 %	478446838
11	NC_020930	AT	3	6	5976	5981	50 %	50 %	0 %	0 %	478446838
12	NC_020930	TG	3	6	6129	6134	0 %	50 %	50 %	0 %	478446838
13	NC_020930	TA	3	6	6200	6205	50 %	50 %	0 %	0 %	478446838
14	NC_020930	AG	3	6	6537	6542	50 %	0 %	50 %	0 %	478446838
15	NC_020930	GA	3	6	7595	7600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020930	AC	3	6	8246	8251	50 %	0 %	0 %	50 %	478446840
17	NC_020930	AG	3	6	8989	8994	50 %	0 %	50 %	0 %	478446841
18	NC_020930	CT	4	8	9108	9115	0 %	50 %	0 %	50 %	478446841
19	NC_020930	GT	3	6	9190	9195	0 %	50 %	50 %	0 %	478446841
20	NC_020930	AG	3	6	9950	9955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020930	GA	3	6	10466	10471	50 %	0 %	50 %	0 %	478446843
22	NC_020930	AG	3	6	10683	10688	50 %	0 %	50 %	0 %	478446843
23	NC_020930	TA	3	6	11848	11853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020930	AG	3	6	11909	11914	50 %	0 %	50 %	0 %	478446844
25	NC_020930	TA	3	6	12469	12474	50 %	50 %	0 %	0 %	478446844
26	NC_020930	TG	3	6	13372	13377	0 %	50 %	50 %	0 %	478446845
27	NC_020930	AG	3	6	13521	13526	50 %	0 %	50 %	0 %	478446845
28	NC_020930	AG	4	8	13677	13684	50 %	0 %	50 %	0 %	478446845
29	NC_020930	TA	3	6	13939	13944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020930	TA	4	8	14163	14170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020930	AC	3	6	15006	15011	50 %	0 %	0 %	50 %	478446846
32	NC_020930	CT	3	6	15295	15300	0 %	50 %	0 %	50 %	478446846
33	NC_020930	AG	3	6	16345	16350	50 %	0 %	50 %	0 %	478446847
34	NC_020930	TC	3	6	16385	16390	0 %	50 %	0 %	50 %	478446847
35	NC_020930	GA	3	6	16914	16919	50 %	0 %	50 %	0 %	478446848
36	NC_020930	AG	3	6	16985	16990	50 %	0 %	50 %	0 %	478446848
37	NC_020930	GA	3	6	17769	17774	50 %	0 %	50 %	0 %	478446848
38	NC_020930	AG	3	6	18115	18120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020930	GA	3	6	18128	18133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020930	GA	3	6	18372	18377	50 %	0 %	50 %	0 %	478446849
41	NC_020930	TC	3	6	18822	18827	0 %	50 %	0 %	50 %	478446849
42	NC_020930	CT	3	6	19050	19055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_020930	TC	3	6	19250	19255	0 %	50 %	0 %	50 %	478446850
44	NC_020930	GA	3	6	19265	19270	50 %	0 %	50 %	0 %	478446850
45	NC_020930	GA	3	6	19364	19369	50 %	0 %	50 %	0 %	478446850
46	NC_020930	AG	3	6	19830	19835	50 %	0 %	50 %	0 %	478446850
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50	NC_020930	TG	3	6	20720	20725	0 %	50 %	50 %	0 %	478446851
51	NC_020930	AG	3	6	21116	21121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020930	GA	3	6	21274	21279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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59	NC_020930	GA	3	6	24522	24527	50 %	0 %	50 %	0 %	478446852
60	NC_020930	AG	3	6	24903	24908	50 %	0 %	50 %	0 %	478446852
61	NC_020930	GA	3	6	26319	26324	50 %	0 %	50 %	0 %	478446853
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65	NC_020930	GA	3	6	27111	27116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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70	NC_020930	AG	3	6	28569	28574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020930	TG	3	6	28992	28997	0 %	50 %	50 %	0 %	478446856
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115	NC_020930	AG	3	6	43243	43248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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