MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Methanomethylophilus alvus Mx1201

Total Repeats: 993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020913	CCCCA	2	10	74	83	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
2	NC_020913	GAAAA	2	10	724	733	80 %	0 %	20 %	0 %	478482032
3	NC_020913	GAAGA	2	10	1309	1318	60 %	0 %	40 %	0 %	478482032
4	NC_020913	TCGCA	2	10	2349	2358	20 %	20 %	20 %	40 %	478482033
5	NC_020913	CGAGG	2	10	2602	2611	20 %	0 %	60 %	20 %	478482033
6	NC_020913	TCGGT	2	10	2654	2663	0 %	40 %	40 %	20 %	478482034
7	NC_020913	GATTG	2	10	4105	4114	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020913	CGACC	2	10	5561	5570	20 %	0 %	20 %	60 %	478482037
9	NC_020913	AAGGA	2	10	11691	11700	60 %	0 %	40 %	0 %	478482043
10	NC_020913	GGAAA	2	10	14262	14271	60 %	0 %	40 %	0 %	478482046
11	NC_020913	TTCCG	2	10	15466	15475	0 %	40 %	20 %	40 %	478482049
12	NC_020913	GGACA	2	10	21399	21408	40 %	0 %	40 %	20 %	478482056
13	NC_020913	GGAGA	2	10	23417	23426	40 %	0 %	60 %	0 %	478482058
14	NC_020913	TCCTT	2	10	32541	32550	0 %	60 %	0 %	40 %	478482072
15	NC_020913	TTCTT	2	10	32917	32926	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_020913	GTAAT	2	10	34859	34868	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020913	GAAAG	2	10	37204	37213	60 %	0 %	40 %	0 %	478482080
18	NC_020913	TTGCG	2	10	40371	40380	0 %	40 %	40 %	20 %	478482085
19	NC_020913	GTACC	2	10	41036	41045	20 %	20 %	20 %	40 %	478482086
20	NC_020913	GGTAC	2	10	42546	42555	20 %	20 %	40 %	20 %	478482088
21	NC_020913	ATCGC	2	10	43548	43557	20 %	20 %	20 %	40 %	478482089
22	NC_020913	GGCCC	2	10	43974	43983	0 %	0 %	40 %	60 %	478482089
23	NC_020913	ACAGG	2	10	44021	44030	40 %	0 %	40 %	20 %	478482089
24	NC_020913	TCATC	2	10	44619	44628	20 %	40 %	0 %	40 %	478482090
25	NC_020913	GAGGG	2	10	46577	46586	20 %	0 %	80 %	0 %	478482092
26	NC_020913	TCCTT	2	10	47625	47634	0 %	60 %	0 %	40 %	478482094
27	NC_020913	TGATC	2	10	47853	47862	20 %	40 %	20 %	20 %	478482094
28	NC_020913	ACGGA	2	10	48871	48880	40 %	0 %	40 %	20 %	478482095
29	NC_020913	ATATT	2	10	49250	49259	40 %	60 %	0 %	0 %	478482095
30	NC_020913	ATCCC	2	10	49523	49532	20 %	20 %	0 %	60 %	478482095
31	NC_020913	GGGCA	2	10	54662	54671	20 %	0 %	60 %	20 %	478482100
32	NC_020913	ACGGT	2	10	55635	55644	20 %	20 %	40 %	20 %	478482101
33	NC_020913	CTATT	2	10	60681	60690	20 %	60 %	0 %	20 %	478482108
34	NC_020913	AACAG	2	10	61512	61521	60 %	0 %	20 %	20 %	478482109
35	NC_020913	TTCAA	2	10	62401	62410	40 %	40 %	0 %	20 %	478482109
36	NC_020913	TATTC	2	10	64189	64198	20 %	60 %	0 %	20 %	478482110
37	NC_020913	CTCTG	2	10	67703	67712	0 %	40 %	20 %	40 %	478482113
38	NC_020913	TACCT	2	10	69962	69971	20 %	40 %	0 %	40 %	478482116
39	NC_020913	CGTGC	2	10	70061	70070	0 %	20 %	40 %	40 %	478482116
40	NC_020913	GCAGG	2	10	70082	70091	20 %	0 %	60 %	20 %	478482116
41	NC_020913	CATCG	2	10	72873	72882	20 %	20 %	20 %	40 %	478482118
42	NC_020913	CTGGG	2	10	75737	75746	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_020913	GTTCC	2	10	79158	79167	0 %	40 %	20 %	40 %	478482123
44	NC_020913	TAAGG	2	10	79176	79185	40 %	20 %	40 %	0 %	478482123
45	NC_020913	TGATG	2	10	79642	79651	20 %	40 %	40 %	0 %	478482124
46	NC_020913	GATTG	2	10	79679	79688	20 %	40 %	40 %	0 %	478482124
47	NC_020913	AGCAT	2	10	79991	80000	40 %	20 %	20 %	20 %	478482124
48	NC_020913	ATTTT	2	10	81911	81920	20 %	80 %	0 %	0 %	478482127
49	NC_020913	GATAT	2	10	82555	82564	40 %	40 %	20 %	0 %	478482127
50	NC_020913	AGTTT	2	10	82763	82772	20 %	60 %	20 %	0 %	478482127
51	NC_020913	TGATT	2	10	85389	85398	20 %	60 %	20 %	0 %	478482129
52	NC_020913	ATGCA	2	10	85433	85442	40 %	20 %	20 %	20 %	478482129
53	NC_020913	TGAAT	2	10	85584	85593	40 %	40 %	20 %	0 %	478482129
54	NC_020913	TTATC	2	10	86095	86104	20 %	60 %	0 %	20 %	478482130
55	NC_020913	ATTTT	2	10	88731	88740	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020913	TTTAT	2	10	88978	88987	20 %	80 %	0 %	0 %	478482133
57	NC_020913	TCCTC	2	10	89894	89903	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
58	NC_020913	TTGGA	2	10	95439	95448	20 %	40 %	40 %	0 %	478482140
59	NC_020913	GGAAA	2	10	100517	100526	60 %	0 %	40 %	0 %	478482147
60	NC_020913	ACGGT	2	10	109001	109010	20 %	20 %	40 %	20 %	478482155
61	NC_020913	GACCT	2	10	109279	109288	20 %	20 %	20 %	40 %	478482155
62	NC_020913	TGGTA	2	10	112522	112531	20 %	40 %	40 %	0 %	478482158
63	NC_020913	TCGAT	2	10	112548	112557	20 %	40 %	20 %	20 %	478482158
64	NC_020913	TTTTC	2	10	113461	113470	0 %	80 %	0 %	20 %	478482158
65	NC_020913	CGATG	2	10	119970	119979	20 %	20 %	40 %	20 %	478482168
66	NC_020913	GACGG	2	10	121538	121547	20 %	0 %	60 %	20 %	478482169
67	NC_020913	AAGGG	2	10	122697	122706	40 %	0 %	60 %	0 %	478482171
68	NC_020913	TTCGG	2	10	125725	125734	0 %	40 %	40 %	20 %	478482173
69	NC_020913	TCCGC	2	10	133031	133040	0 %	20 %	20 %	60 %	478482182
70	NC_020913	CGGTC	2	10	133108	133117	0 %	20 %	40 %	40 %	478482182
71	NC_020913	GTCCT	2	10	141122	141131	0 %	40 %	20 %	40 %	478482191
72	NC_020913	CCGTG	2	10	141633	141642	0 %	20 %	40 %	40 %	478482192
73	NC_020913	TTCCC	2	10	142404	142413	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
74	NC_020913	TCCTG	2	10	149099	149108	0 %	40 %	20 %	40 %	478482198
75	NC_020913	TGCGA	2	10	149427	149436	20 %	20 %	40 %	20 %	478482199
76	NC_020913	GAAGG	2	10	150119	150128	40 %	0 %	60 %	0 %	478482201
77	NC_020913	CTTCT	2	10	150649	150658	0 %	60 %	0 %	40 %	478482202
78	NC_020913	ACGAT	2	10	152144	152153	40 %	20 %	20 %	20 %	478482203
79	NC_020913	CCGCA	2	10	153373	153382	20 %	0 %	20 %	60 %	478482205
80	NC_020913	CATGT	2	10	155504	155513	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_020913	AAGGG	2	10	156030	156039	40 %	0 %	60 %	0 %	478482207
82	NC_020913	CTGGA	2	10	157750	157759	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_020913	AAGGC	2	10	158455	158464	40 %	0 %	40 %	20 %	478482209
84	NC_020913	AAGGG	2	10	159239	159248	40 %	0 %	60 %	0 %	478482210
85	NC_020913	CAGGA	2	10	161491	161500	40 %	0 %	40 %	20 %	478482213
86	NC_020913	GTGAA	2	10	163075	163084	40 %	20 %	40 %	0 %	478482214
87	NC_020913	AGAGG	2	10	165505	165514	40 %	0 %	60 %	0 %	478482216
88	NC_020913	AGAGG	2	10	166283	166292	40 %	0 %	60 %	0 %	478482217
89	NC_020913	GGGGC	2	10	166831	166840	0 %	0 %	80 %	20 %	478482217
90	NC_020913	CCCAG	2	10	168450	168459	20 %	0 %	20 %	60 %	478482218
91	NC_020913	ACCGC	2	10	168564	168573	20 %	0 %	20 %	60 %	478482219
92	NC_020913	TATAA	2	10	169288	169297	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020913	TCCTA	2	10	173995	174004	20 %	40 %	0 %	40 %	478482224
94	NC_020913	ACTAC	2	10	176534	176543	40 %	20 %	0 %	40 %	478482227
95	NC_020913	GACTG	2	10	178518	178527	20 %	20 %	40 %	20 %	478482229
96	NC_020913	GTTCC	2	10	185107	185116	0 %	40 %	20 %	40 %	478482236
97	NC_020913	GTATG	2	10	188912	188921	20 %	40 %	40 %	0 %	478482240
98	NC_020913	CCGTC	2	10	192772	192781	0 %	20 %	20 %	60 %	478482246
99	NC_020913	AAGAC	2	10	197665	197674	60 %	0 %	20 %	20 %	478482249
100	NC_020913	GTCTC	2	10	198025	198034	0 %	40 %	20 %	40 %	478482249
101	NC_020913	GGTAC	2	10	201912	201921	20 %	20 %	40 %	20 %	478482253
102	NC_020913	GACGG	2	10	203368	203377	20 %	0 %	60 %	20 %	478482255
103	NC_020913	GGAGG	2	10	203992	204001	20 %	0 %	80 %	0 %	478482255
104	NC_020913	TGGAT	2	10	206664	206673	20 %	40 %	40 %	0 %	478482259
105	NC_020913	TCATC	2	10	207203	207212	20 %	40 %	0 %	40 %	478482260
106	NC_020913	CGGAT	2	10	209294	209303	20 %	20 %	40 %	20 %	478482263
107	NC_020913	CAAGG	2	10	210015	210024	40 %	0 %	40 %	20 %	478482264
108	NC_020913	TTTAT	2	10	210577	210586	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020913	CTTTT	2	10	210805	210814	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_020913	GTTCT	2	10	214455	214464	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_020913	CGGGT	2	10	218743	218752	0 %	20 %	60 %	20 %	478482273
112	NC_020913	TCCCC	2	10	219572	219581	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
113	NC_020913	TCCGC	2	10	225758	225767	0 %	20 %	20 %	60 %	478482282
114	NC_020913	CATCC	2	10	226018	226027	20 %	20 %	0 %	60 %	478482282
115	NC_020913	GGAAG	2	10	226054	226063	40 %	0 %	60 %	0 %	478482282
116	NC_020913	CAATA	2	10	226432	226441	60 %	20 %	0 %	20 %	478482283
117	NC_020913	GCCTT	2	10	227259	227268	0 %	40 %	20 %	40 %	478482284
118	NC_020913	AGCCC	2	10	227886	227895	20 %	0 %	20 %	60 %	478482284
119	NC_020913	TCTGA	2	10	228464	228473	20 %	40 %	20 %	20 %	478482285
120	NC_020913	AGTCC	2	10	228693	228702	20 %	20 %	20 %	40 %	478482285
121	NC_020913	ATCGA	2	10	229911	229920	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_020913	TCCCT	2	10	231141	231150	0 %	40 %	0 %	60 %	478482287
123	NC_020913	GCATT	2	10	235331	235340	20 %	40 %	20 %	20 %	478482292
124	NC_020913	GGATG	2	10	239263	239272	20 %	20 %	60 %	0 %	478482295
125	NC_020913	GGCGG	2	10	243043	243052	0 %	0 %	80 %	20 %	478482299
126	NC_020913	TCCGA	2	10	244206	244215	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_020913	TCTGC	2	10	246202	246211	0 %	40 %	20 %	40 %	478482303
128	NC_020913	TCCCT	2	10	246362	246371	0 %	40 %	0 %	60 %	478482304
129	NC_020913	TATCA	2	10	247948	247957	40 %	40 %	0 %	20 %	478482306
130	NC_020913	CAGGG	2	10	248557	248566	20 %	0 %	60 %	20 %	478482307
131	NC_020913	TTTCT	2	10	250187	250196	0 %	80 %	0 %	20 %	478482307
132	NC_020913	CCCTT	2	10	253635	253644	0 %	40 %	0 %	60 %	478482309
133	NC_020913	ACGGT	2	10	254541	254550	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_020913	GTCGG	2	10	254573	254582	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
135	NC_020913	AGGAG	2	10	257155	257164	40 %	0 %	60 %	0 %	478482312
136	NC_020913	TCCAT	2	10	261865	261874	20 %	40 %	0 %	40 %	478482316
137	NC_020913	CGCCT	2	10	262011	262020	0 %	20 %	20 %	60 %	478482316
138	NC_020913	AGGGC	2	10	262894	262903	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
139	NC_020913	AGGGT	2	10	266008	266017	20 %	20 %	60 %	0 %	478482324
140	NC_020913	CGAGG	2	10	267169	267178	20 %	0 %	60 %	20 %	478482326
141	NC_020913	CCTGG	2	10	267487	267496	0 %	20 %	40 %	40 %	478482326
142	NC_020913	TCATC	2	10	268165	268174	20 %	40 %	0 %	40 %	478482327
143	NC_020913	TGTCC	2	10	268228	268237	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_020913	GATTG	2	10	268383	268392	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020913	AATTT	2	10	268617	268626	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020913	GGAGA	2	10	270845	270854	40 %	0 %	60 %	0 %	478482328
147	NC_020913	CGACC	2	10	271099	271108	20 %	0 %	20 %	60 %	478482328
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149	NC_020913	TCGAG	2	10	277449	277458	20 %	20 %	40 %	20 %	478482333
150	NC_020913	GGCCG	2	10	278383	278392	0 %	0 %	60 %	40 %	478482336
151	NC_020913	GATAC	2	10	279525	279534	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
152	NC_020913	TCTCT	2	10	279675	279684	0 %	60 %	0 %	40 %	478482338
153	NC_020913	TAATA	2	10	281149	281158	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_020913	CACTA	2	10	286293	286302	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
155	NC_020913	CTGTG	2	10	287044	287053	0 %	40 %	40 %	20 %	478482343
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157	NC_020913	CTTCC	2	10	288097	288106	0 %	40 %	0 %	60 %	478482344
158	NC_020913	ATCGC	2	10	290250	290259	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
159	NC_020913	ACGAC	2	10	290837	290846	40 %	0 %	20 %	40 %	478482347
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162	NC_020913	ATACG	2	10	298136	298145	40 %	20 %	20 %	20 %	478482353
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164	NC_020913	TGTGA	2	10	300303	300312	20 %	40 %	40 %	0 %	478482356
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167	NC_020913	GACCT	2	10	303254	303263	20 %	20 %	20 %	40 %	478482358
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169	NC_020913	TAATA	2	10	305162	305171	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_020913	CTCGA	2	10	305365	305374	20 %	20 %	20 %	40 %	478482362
171	NC_020913	TTAAG	2	10	307005	307014	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
172	NC_020913	TTCAT	2	10	308920	308929	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
173	NC_020913	CGTAA	2	10	311373	311382	40 %	20 %	20 %	20 %	478482364
174	NC_020913	ATTTT	2	10	313269	313278	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_020913	GTCCC	2	10	317944	317953	0 %	20 %	20 %	60 %	478482373
176	NC_020913	CCTTA	2	10	318603	318612	20 %	40 %	0 %	40 %	478482373
177	NC_020913	CCCCT	2	10	319481	319490	0 %	20 %	0 %	80 %	478482373
178	NC_020913	GGGGA	2	10	321288	321297	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
179	NC_020913	TCCGT	2	10	324617	324626	0 %	40 %	20 %	40 %	478482375
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181	NC_020913	TTTTA	2	10	328474	328483	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_020913	CAAGG	2	10	329440	329449	40 %	0 %	40 %	20 %	478482379
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199	NC_020913	TGCGG	2	10	355554	355563	0 %	20 %	60 %	20 %	478482410
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203	NC_020913	CCGAG	2	10	358975	358984	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
204	NC_020913	GACTC	2	10	364071	364080	20 %	20 %	20 %	40 %	478482418
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220	NC_020913	ATCAT	2	10	393469	393478	40 %	40 %	0 %	20 %	478482445
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223	NC_020913	GTCGG	2	10	396007	396016	0 %	20 %	60 %	20 %	478482449
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234	NC_020913	TTGGA	2	10	425158	425167	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_020913	CCCGT	2	10	465477	465486	0 %	20 %	20 %	60 %	478482524
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255	NC_020913	GCCAT	2	10	466870	466879	20 %	20 %	20 %	40 %	478482525
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260	NC_020913	TATCC	2	10	473138	473147	20 %	40 %	0 %	40 %	478482530
261	NC_020913	TCCGA	2	10	473346	473355	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
262	NC_020913	CCTTC	2	10	473690	473699	0 %	40 %	0 %	60 %	478482531
263	NC_020913	TCCAG	2	10	475398	475407	20 %	20 %	20 %	40 %	478482532
264	NC_020913	GGGGA	2	10	476029	476038	20 %	0 %	80 %	0 %	478482533
265	NC_020913	GGGGA	2	10	477718	477727	20 %	0 %	80 %	0 %	478482535
266	NC_020913	GTGGA	2	10	477931	477940	20 %	20 %	60 %	0 %	478482535
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268	NC_020913	CGATG	2	10	479635	479644	20 %	20 %	40 %	20 %	478482537
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270	NC_020913	ATCCC	2	10	480896	480905	20 %	20 %	0 %	60 %	478482538
271	NC_020913	GGATG	2	10	482717	482726	20 %	20 %	60 %	0 %	478482541
272	NC_020913	CCATT	2	10	482819	482828	20 %	40 %	0 %	40 %	478482541
273	NC_020913	AATGG	2	10	484883	484892	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_020913	TTATT	2	10	498020	498029	20 %	80 %	0 %	0 %	478482553
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287	NC_020913	AATTT	2	10	502107	502116	40 %	60 %	0 %	0 %	478482554
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