MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis TL01

Total Repeats: 9958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020895	CTTCT	2	10	3389	3398	0 %	60 %	0 %	40 %	474978536
2	NC_020895	GTGGG	2	10	6159	6168	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020895	GCTCC	2	10	6406	6415	0 %	20 %	20 %	60 %	474978539
4	NC_020895	AGGGC	2	10	6827	6836	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_020895	CGGCC	2	10	7438	7447	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6	NC_020895	TGGCG	2	10	8943	8952	0 %	20 %	60 %	20 %	474978542
7	NC_020895	CGGCG	2	10	9366	9375	0 %	0 %	60 %	40 %	474978542
8	NC_020895	CCGGG	2	10	9749	9758	0 %	0 %	60 %	40 %	474978542
9	NC_020895	AGGCG	2	10	9892	9901	20 %	0 %	60 %	20 %	474978543
10	NC_020895	AGCGC	2	10	11639	11648	20 %	0 %	40 %	40 %	474978544
11	NC_020895	GCCCG	2	10	11876	11885	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12	NC_020895	CGTGC	2	10	12512	12521	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_020895	GGCAC	2	10	12757	12766	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_020895	CCCGG	2	10	12997	13006	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15	NC_020895	CGGCC	2	10	13214	13223	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16	NC_020895	CCCCA	2	10	13664	13673	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
17	NC_020895	ACACC	2	10	13900	13909	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_020895	GCGCA	2	10	15603	15612	20 %	0 %	40 %	40 %	474978546
19	NC_020895	GGGGC	2	10	16591	16600	0 %	0 %	80 %	20 %	474978547
20	NC_020895	CGGGC	2	10	17230	17239	0 %	0 %	60 %	40 %	474978548
21	NC_020895	CGGGG	2	10	17280	17289	0 %	0 %	80 %	20 %	474978548
22	NC_020895	CCAGC	2	10	17436	17445	20 %	0 %	20 %	60 %	474978548
23	NC_020895	GTTCG	2	10	18621	18630	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_020895	TCACC	2	10	21819	21828	20 %	20 %	0 %	60 %	474978552
25	NC_020895	GCGCA	2	10	23318	23327	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_020895	CGGCG	2	10	24411	24420	0 %	0 %	60 %	40 %	474978555
27	NC_020895	CAGGT	2	10	24586	24595	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_020895	CGTTC	2	10	25139	25148	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_020895	GCGTC	2	10	25608	25617	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_020895	CCGGT	2	10	28720	28729	0 %	20 %	40 %	40 %	474978558
31	NC_020895	AGACC	2	10	32121	32130	40 %	0 %	20 %	40 %	474978562
32	NC_020895	CGCAG	2	10	34302	34311	20 %	0 %	40 %	40 %	474978564
33	NC_020895	CGGGT	2	10	34422	34431	0 %	20 %	60 %	20 %	474978564
34	NC_020895	CAGGG	2	10	35309	35318	20 %	0 %	60 %	20 %	474978565
35	NC_020895	GCGCC	2	10	35999	36008	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
36	NC_020895	GGGCG	2	10	36018	36027	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
37	NC_020895	CCGAG	2	10	36544	36553	20 %	0 %	40 %	40 %	474978568
38	NC_020895	CGCCA	2	10	37196	37205	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_020895	CTCGA	2	10	38236	38245	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_020895	CCGTC	2	10	39779	39788	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_020895	TGGTG	2	10	40305	40314	0 %	40 %	60 %	0 %	474978569
42	NC_020895	GAGAC	2	10	42462	42471	40 %	0 %	40 %	20 %	474978570
43	NC_020895	CCGGG	2	10	44203	44212	0 %	0 %	60 %	40 %	474978573
44	NC_020895	CCGCC	2	10	44399	44408	0 %	0 %	20 %	80 %	474978573
45	NC_020895	CGGCT	2	10	46436	46445	0 %	20 %	40 %	40 %	474978575
46	NC_020895	GCTGC	2	10	47015	47024	0 %	20 %	40 %	40 %	474978576
47	NC_020895	CGCGG	2	10	48162	48171	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
48	NC_020895	CACCG	2	10	49052	49061	20 %	0 %	20 %	60 %	474978578
49	NC_020895	CCTTC	2	10	49369	49378	0 %	40 %	0 %	60 %	474978579
50	NC_020895	CTGGC	2	10	50289	50298	0 %	20 %	40 %	40 %	474978580
51	NC_020895	CCGCG	2	10	50366	50375	0 %	0 %	40 %	60 %	474978580
52	NC_020895	CGGAT	2	10	51092	51101	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_020895	CGCCT	2	10	52580	52589	0 %	20 %	20 %	60 %	474978582
54	NC_020895	CTGCC	2	10	53833	53842	0 %	20 %	20 %	60 %	474978583
55	NC_020895	GGCCC	2	10	54837	54846	0 %	0 %	40 %	60 %	474978584
56	NC_020895	CGCAC	2	10	55062	55071	20 %	0 %	20 %	60 %	474978585
57	NC_020895	CGGTC	2	10	55129	55138	0 %	20 %	40 %	40 %	474978585
58	NC_020895	CGCGG	2	10	56778	56787	0 %	0 %	60 %	40 %	474978585
59	NC_020895	TGGAC	2	10	58322	58331	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_020895	GTTGC	2	10	58697	58706	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_020895	TGCGT	2	10	62013	62022	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_020895	GCAAC	2	10	62110	62119	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_020895	CACTG	2	10	62326	62335	20 %	20 %	20 %	40 %	474978587
64	NC_020895	GCACC	2	10	62395	62404	20 %	0 %	20 %	60 %	474978587
65	NC_020895	TGCGC	2	10	63215	63224	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_020895	CGGCC	2	10	63468	63477	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
67	NC_020895	GGGGA	2	10	63961	63970	20 %	0 %	80 %	0 %	474978588
68	NC_020895	GCCCG	2	10	64641	64650	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
69	NC_020895	CCGCA	2	10	65903	65912	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
70	NC_020895	TCCGG	2	10	66743	66752	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_020895	CGCCT	2	10	67687	67696	0 %	20 %	20 %	60 %	474978590
72	NC_020895	GCCGA	2	10	68205	68214	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_020895	CGGTC	2	10	68222	68231	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_020895	CCGAC	2	10	68236	68245	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_020895	CCACA	2	10	68683	68692	40 %	0 %	0 %	60 %	474978591
76	NC_020895	GCCTG	2	10	68865	68874	0 %	20 %	40 %	40 %	474978591
77	NC_020895	GCTTG	2	10	69137	69146	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_020895	GTGAC	2	10	69793	69802	20 %	20 %	40 %	20 %	474978592
79	NC_020895	CCCAT	2	10	72604	72613	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
80	NC_020895	GCCTG	2	10	74653	74662	0 %	20 %	40 %	40 %	474978593
81	NC_020895	TCTGT	2	10	74664	74673	0 %	60 %	20 %	20 %	474978593
82	NC_020895	CGGGC	2	10	76916	76925	0 %	0 %	60 %	40 %	474978596
83	NC_020895	TGTGG	2	10	79821	79830	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020895	CGTTG	2	10	80104	80113	0 %	40 %	40 %	20 %	474978600
85	NC_020895	GATCC	2	10	81544	81553	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_020895	TCGGC	2	10	81771	81780	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_020895	TTTGG	2	10	89508	89517	0 %	60 %	40 %	0 %	474978607
88	NC_020895	TGCTC	2	10	90360	90369	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_020895	CGGGC	2	10	90670	90679	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
90	NC_020895	GGGCA	2	10	91052	91061	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
91	NC_020895	CCAGG	2	10	91657	91666	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
92	NC_020895	GACAC	2	10	94146	94155	40 %	0 %	20 %	40 %	474978611
93	NC_020895	CCGCT	2	10	95971	95980	0 %	20 %	20 %	60 %	474978612
94	NC_020895	CAACG	2	10	98146	98155	40 %	0 %	20 %	40 %	474978614
95	NC_020895	GCGTC	2	10	99105	99114	0 %	20 %	40 %	40 %	474978615
96	NC_020895	AGGCG	2	10	99397	99406	20 %	0 %	60 %	20 %	474978615
97	NC_020895	GCCGG	2	10	99548	99557	0 %	0 %	60 %	40 %	474978615
98	NC_020895	GCGCG	2	10	99744	99753	0 %	0 %	60 %	40 %	474978615
99	NC_020895	GTCCG	2	10	101991	102000	0 %	20 %	40 %	40 %	474978617
100	NC_020895	CTGAT	2	10	104026	104035	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_020895	GGACA	2	10	104054	104063	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_020895	CGTCC	2	10	104198	104207	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
103	NC_020895	CCTTC	2	10	104773	104782	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
104	NC_020895	ATGCG	2	10	104900	104909	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_020895	CCGAG	2	10	105927	105936	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_020895	GATCA	2	10	107685	107694	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_020895	CCCGA	2	10	108287	108296	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
108	NC_020895	CTTTT	2	10	108474	108483	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_020895	GGCCT	2	10	109184	109193	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_020895	CGGAC	2	10	109711	109720	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_020895	GCCCC	2	10	109772	109781	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
112	NC_020895	AGCGG	2	10	111230	111239	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
113	NC_020895	CGTGG	2	10	112400	112409	0 %	20 %	60 %	20 %	474978618
114	NC_020895	GCCCA	2	10	112623	112632	20 %	0 %	20 %	60 %	474978618
115	NC_020895	CATCC	2	10	112780	112789	20 %	20 %	0 %	60 %	474978618
116	NC_020895	CGGGC	2	10	115303	115312	0 %	0 %	60 %	40 %	474978619
117	NC_020895	GGCGG	2	10	116797	116806	0 %	0 %	80 %	20 %	474978621
118	NC_020895	TGGTC	2	10	120313	120322	0 %	40 %	40 %	20 %	474978625
119	NC_020895	ACCGC	2	10	120552	120561	20 %	0 %	20 %	60 %	474978625
120	NC_020895	GCATG	2	10	123251	123260	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_020895	GGCGA	2	10	124130	124139	20 %	0 %	60 %	20 %	474978627
122	NC_020895	GCTTC	2	10	124407	124416	0 %	40 %	20 %	40 %	474978627
123	NC_020895	CAGGG	2	10	126448	126457	20 %	0 %	60 %	20 %	474978627
124	NC_020895	CGGGC	2	10	127029	127038	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
125	NC_020895	GCCGT	2	10	127143	127152	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
126	NC_020895	CGTGA	2	10	127550	127559	20 %	20 %	40 %	20 %	474978628
127	NC_020895	CTGAG	2	10	127784	127793	20 %	20 %	40 %	20 %	474978628
128	NC_020895	CCGAC	2	10	131225	131234	20 %	0 %	20 %	60 %	474978634
129	NC_020895	CGCGA	2	10	132905	132914	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_020895	GCGTC	2	10	136374	136383	0 %	20 %	40 %	40 %	474978640
131	NC_020895	GGTGC	2	10	136668	136677	0 %	20 %	60 %	20 %	474978640
132	NC_020895	TCGGC	2	10	137014	137023	0 %	20 %	40 %	40 %	474978640
133	NC_020895	GGCCG	2	10	137042	137051	0 %	0 %	60 %	40 %	474978640
134	NC_020895	CGGTG	2	10	138705	138714	0 %	20 %	60 %	20 %	474978642
135	NC_020895	CGGCC	2	10	138849	138858	0 %	0 %	40 %	60 %	474978642
136	NC_020895	AGTTG	2	10	139029	139038	20 %	40 %	40 %	0 %	474978642
137	NC_020895	ATGCC	2	10	141333	141342	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_020895	TGGCG	2	10	142126	142135	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
139	NC_020895	GGCCG	2	10	145454	145463	0 %	0 %	60 %	40 %	474978646
140	NC_020895	ACGCG	2	10	145714	145723	20 %	0 %	40 %	40 %	474978646
141	NC_020895	CATGC	2	10	148051	148060	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_020895	AGCTG	2	10	148560	148569	20 %	20 %	40 %	20 %	474978648
143	NC_020895	CACCG	2	10	148753	148762	20 %	0 %	20 %	60 %	474978648
144	NC_020895	CGCAG	2	10	149965	149974	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
145	NC_020895	TCCGC	2	10	150117	150126	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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147	NC_020895	GCCGG	2	10	152173	152182	0 %	0 %	60 %	40 %	474978650
148	NC_020895	ACTCC	2	10	152244	152253	20 %	20 %	0 %	60 %	474978650
149	NC_020895	GCTTC	2	10	152694	152703	0 %	40 %	20 %	40 %	474978650
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151	NC_020895	CCTCC	2	10	154410	154419	0 %	20 %	0 %	80 %	474978651
152	NC_020895	GCACG	2	10	154525	154534	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
153	NC_020895	GAAGC	2	10	154738	154747	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
154	NC_020895	CACCG	2	10	158317	158326	20 %	0 %	20 %	60 %	474978653
155	NC_020895	GCGGG	2	10	159416	159425	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
156	NC_020895	CGCGC	2	10	160714	160723	0 %	0 %	40 %	60 %	474978654
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159	NC_020895	CTGGG	2	10	166961	166970	0 %	20 %	60 %	20 %	474978658
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162	NC_020895	GCCCC	2	10	170249	170258	0 %	0 %	20 %	80 %	474978660
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164	NC_020895	CCGGC	2	10	170625	170634	0 %	0 %	40 %	60 %	474978660
165	NC_020895	CGGCG	2	10	170793	170802	0 %	0 %	60 %	40 %	474978660
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168	NC_020895	GCGCG	2	10	173620	173629	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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184	NC_020895	GGTCC	2	10	197887	197896	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
185	NC_020895	CGGGA	2	10	198188	198197	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
186	NC_020895	CGAGG	2	10	198879	198888	20 %	0 %	60 %	20 %	474978690
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194	NC_020895	CGCCT	2	10	206246	206255	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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249	NC_020895	GCCCG	2	10	263029	263038	0 %	0 %	40 %	60 %	474978731
250	NC_020895	CCGGA	2	10	264213	264222	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
251	NC_020895	ACCCC	2	10	267028	267037	20 %	0 %	0 %	80 %	474978734
252	NC_020895	CCCGT	2	10	267175	267184	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
253	NC_020895	CGACA	2	10	268218	268227	40 %	0 %	20 %	40 %	474978735
254	NC_020895	CCGGC	2	10	269354	269363	0 %	0 %	40 %	60 %	474978737
255	NC_020895	CGCCT	2	10	269505	269514	0 %	20 %	20 %	60 %	474978737
256	NC_020895	GTGTC	2	10	270035	270044	0 %	40 %	40 %	20 %	474978738
257	NC_020895	CCGGC	2	10	270224	270233	0 %	0 %	40 %	60 %	474978738
258	NC_020895	GATCC	2	10	270929	270938	20 %	20 %	20 %	40 %	474978739
259	NC_020895	GCCCG	2	10	271077	271086	0 %	0 %	40 %	60 %	474978739
260	NC_020895	CGGCT	2	10	272363	272372	0 %	20 %	40 %	40 %	474978740
261	NC_020895	GGGCG	2	10	272636	272645	0 %	0 %	80 %	20 %	474978740
262	NC_020895	CCAGC	2	10	273277	273286	20 %	0 %	20 %	60 %	474978741
263	NC_020895	GCCGC	2	10	273478	273487	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
264	NC_020895	CAGTC	2	10	273654	273663	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
265	NC_020895	CGCGG	2	10	274262	274271	0 %	0 %	60 %	40 %	474978743
266	NC_020895	GCGCG	2	10	274828	274837	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
267	NC_020895	CCGTC	2	10	275204	275213	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
268	NC_020895	GACCA	2	10	275899	275908	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
269	NC_020895	TCCCC	2	10	278264	278273	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
270	NC_020895	CCGGT	2	10	278413	278422	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
271	NC_020895	CAGCC	2	10	279484	279493	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
272	NC_020895	GGGGA	2	10	279514	279523	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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