MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis TL01 plasmid pSHJGH1

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020894	GACGC	2	10	20	29	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_020894	ACCCC	2	10	3196	3205	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
3	NC_020894	GCGGG	2	10	9752	9761	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4	NC_020894	CACGG	2	10	10956	10965	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_020894	CGGGC	2	10	11323	11332	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6	NC_020894	CGGCC	2	10	11906	11915	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7	NC_020894	CACCG	2	10	11953	11962	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_020894	GAGCT	2	10	16702	16711	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_020894	TAAGC	2	10	18186	18195	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_020894	GTGGG	2	10	18292	18301	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020894	GCCGG	2	10	26602	26611	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12	NC_020894	CCGTG	2	10	29449	29458	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_020894	TCGTG	2	10	31860	31869	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_020894	CGGGG	2	10	33413	33422	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
15	NC_020894	GCGCG	2	10	34762	34771	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16	NC_020894	CCTCG	2	10	37941	37950	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_020894	CTGGC	2	10	38361	38370	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_020894	CACCC	2	10	51364	51373	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
19	NC_020894	GTCCA	2	10	52063	52072	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_020894	GGTGC	2	10	52741	52750	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_020894	GATGG	2	10	52838	52847	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020894	CCCCG	2	10	70198	70207	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
23	NC_020894	CGCGG	2	10	73965	73974	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
24	NC_020894	GCCAG	2	10	84556	84565	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_020894	CCCGG	2	10	88192	88201	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
26	NC_020894	CGACC	2	10	95356	95365	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
27	NC_020894	ACGAG	2	10	98772	98781	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_020894	GCGCC	2	10	102264	102273	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
29	NC_020894	GGCGC	2	10	102289	102298	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
30	NC_020894	ATCCG	2	10	102349	102358	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_020894	CCAGT	2	10	114911	114920	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_020894	CTGGG	2	10	125548	125557	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_020894	CCGGC	2	10	130708	130717	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
34	NC_020894	CGGGC	2	10	135482	135491	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35	NC_020894	AGGCC	2	10	135697	135706	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_020894	CAGCG	2	10	135902	135911	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_020894	ACTCC	2	10	137611	137620	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
38	NC_020894	CGGTG	2	10	137628	137637	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_020894	GGTGC	2	10	137672	137681	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_020894	TCCCG	2	10	137891	137900	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_020894	GGTGG	2	10	137955	137964	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020894	GGCTG	2	10	138185	138194	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_020894	CGCGG	2	10	138960	138969	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44	NC_020894	CGGGG	2	10	145626	145635	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
45	NC_020894	CTCGT	2	10	145716	145725	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_020894	GGCGC	2	10	145742	145751	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
47	NC_020894	CGGAA	2	10	156171	156180	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_020894	CCGGG	2	10	156997	157006	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.