MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis TL01 plasmid pSHJGH1

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020894	CGCC	2	8	192	199	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2	NC_020894	CGCT	2	8	258	265	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020894	GCAC	2	8	410	417	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020894	TCCC	2	8	3234	3241	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_020894	CTGG	2	8	3257	3264	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_020894	ACCC	2	8	6349	6356	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_020894	CGTC	2	8	6754	6761	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_020894	TCAC	2	8	6982	6989	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020894	GGGC	2	8	9743	9750	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020894	TCGA	2	8	9783	9790	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020894	CCCG	2	8	11819	11826	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12	NC_020894	CCAC	2	8	11973	11980	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_020894	GCTT	2	8	14229	14236	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_020894	CGCC	2	8	14281	14288	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_020894	CCCA	2	8	14301	14308	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16	NC_020894	TCGC	2	8	16480	16487	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020894	CCGG	2	8	16611	16618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020894	GGGT	2	8	16640	16647	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020894	GCGG	2	8	16739	16746	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020894	ACCA	2	8	16913	16920	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020894	CTTC	2	8	17051	17058	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020894	GGCA	2	8	18784	18791	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_020894	CGAC	2	8	23117	23124	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_020894	CCCT	2	8	23521	23528	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_020894	GCCG	2	8	23628	23635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_020894	GCCG	2	8	32550	32557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020894	CGGA	2	8	32616	32623	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_020894	GGGC	2	8	32734	32741	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_020894	CGGG	3	12	32863	32874	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020894	GGGC	2	8	33459	33466	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_020894	GCTC	2	8	34112	34119	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_020894	CCTA	2	8	34226	34233	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020894	GTCA	2	8	34392	34399	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_020894	GGGC	2	8	34781	34788	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_020894	ACCC	2	8	38112	38119	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
36	NC_020894	GCTC	2	8	38141	38148	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020894	CGAG	2	8	38714	38721	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020894	CGAG	2	8	40334	40341	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_020894	AACC	2	8	50355	50362	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_020894	AGTG	2	8	50717	50724	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020894	ATCG	2	8	51000	51007	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_020894	GACC	2	8	51202	51209	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_020894	AGTG	2	8	51780	51787	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020894	CTGT	2	8	51898	51905	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_020894	CGGT	2	8	52137	52144	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_020894	CGAC	2	8	52266	52273	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020894	TGGC	2	8	52594	52601	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_020894	CGTG	2	8	52756	52763	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_020894	ATGC	2	8	52868	52875	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020894	AGTG	2	8	52973	52980	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020894	AGTG	2	8	55190	55197	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020894	GTGC	2	8	55473	55480	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_020894	AGTG	2	8	55963	55970	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020894	CCGG	2	8	56497	56504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020894	CCTG	2	8	56607	56614	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_020894	GAAA	2	8	56631	56638	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020894	AGTG	2	8	57040	57047	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020894	TTCC	2	8	58931	58938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_020894	CGGG	2	8	61884	61891	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_020894	CCTT	2	8	62455	62462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_020894	TCCT	2	8	66737	66744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_020894	GCCG	2	8	67465	67472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_020894	GAGG	2	8	68490	68497	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020894	CGGG	2	8	68826	68833	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_020894	GCCC	2	8	69287	69294	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_020894	CGGC	2	8	69332	69339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_020894	CCGG	2	8	73641	73648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_020894	GAAC	2	8	74105	74112	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_020894	GAAG	2	8	75586	75593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020894	CCGG	2	8	78268	78275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_020894	CGAG	2	8	79210	79217	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_020894	CGCC	2	8	80119	80126	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
73	NC_020894	TGCT	2	8	80149	80156	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_020894	CGGC	2	8	80213	80220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020894	CCCG	2	8	80221	80228	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
76	NC_020894	GCCA	2	8	84673	84680	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_020894	AGCC	2	8	93454	93461	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_020894	CCCT	2	8	93462	93469	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
79	NC_020894	CCGG	2	8	95375	95382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_020894	GGCC	2	8	95418	95425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_020894	ACCC	2	8	98761	98768	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
82	NC_020894	GCCA	2	8	102040	102047	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020894	CCCA	2	8	102073	102080	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
84	NC_020894	CCCG	2	8	102413	102420	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
85	NC_020894	AGCG	2	8	104848	104855	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_020894	CCAG	2	8	106304	106311	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020894	CTCG	2	8	106426	106433	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_020894	GATC	2	8	107810	107817	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_020894	ACCC	2	8	114357	114364	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
90	NC_020894	GGGT	2	8	115139	115146	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020894	CGCC	2	8	121713	121720	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
92	NC_020894	CCCG	2	8	121754	121761	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
93	NC_020894	CGAA	2	8	125631	125638	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_020894	CCGG	2	8	127188	127195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_020894	CCTG	2	8	127285	127292	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_020894	GCCA	2	8	127338	127345	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_020894	CGCC	2	8	127384	127391	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NC_020894	GCCG	2	8	127749	127756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_020894	CCGG	2	8	128252	128259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_020894	CATC	2	8	129105	129112	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_020894	AGGC	2	8	130983	130990	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_020894	CGTG	2	8	131006	131013	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_020894	ATGC	2	8	131085	131092	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_020894	CAGA	2	8	133728	133735	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_020894	GCCT	2	8	134004	134011	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020894	CCGT	2	8	134569	134576	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_020894	AGGG	2	8	135742	135749	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020894	CCAG	2	8	135873	135880	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_020894	GCGG	2	8	137883	137890	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
110	NC_020894	TGAT	2	8	138046	138053	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020894	TCCG	2	8	138264	138271	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_020894	CCGT	2	8	142248	142255	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_020894	CTCG	2	8	143189	143196	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_020894	CCCG	2	8	143317	143324	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
115	NC_020894	CCCG	2	8	144797	144804	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
116	NC_020894	GCCG	2	8	144844	144851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_020894	GCCA	2	8	145332	145339	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_020894	CAGC	2	8	145406	145413	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_020894	GCAT	2	8	147593	147600	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_020894	GTGG	2	8	148072	148079	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020894	GCGG	2	8	148104	148111	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
122	NC_020894	GCAC	2	8	149528	149535	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_020894	CGGC	2	8	149766	149773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_020894	CGCA	2	8	150129	150136	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_020894	CCGC	2	8	151779	151786	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
126	NC_020894	CTCG	2	8	156149	156156	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_020894	CCCG	2	8	156278	156285	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
128	NC_020894	TCGG	2	8	156684	156691	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_020894	CGGG	2	8	156896	156903	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_020894	GGCT	2	8	157169	157176	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_020894	TGCA	2	8	157309	157316	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_020894	GTCC	2	8	164081	164088	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_020894	AGCC	2	8	164261	164268	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_020894	CCGG	2	8	164353	164360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020894	CGGA	2	8	164414	164421	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.