MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis TL01 plasmid pSHJGH1

Total Repeats: 204

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020894	CG	3	6	698	703	0 %	0 %	50 %	50 %	474987155
2	NC_020894	CG	3	6	713	718	0 %	0 %	50 %	50 %	474987155
3	NC_020894	GT	3	6	1099	1104	0 %	50 %	50 %	0 %	474987155
4	NC_020894	GT	3	6	1236	1241	0 %	50 %	50 %	0 %	474987155
5	NC_020894	GC	3	6	2528	2533	0 %	0 %	50 %	50 %	474987155
6	NC_020894	GC	3	6	2567	2572	0 %	0 %	50 %	50 %	474987155
7	NC_020894	AG	3	6	2612	2617	50 %	0 %	50 %	0 %	474987155
8	NC_020894	GC	3	6	2924	2929	0 %	0 %	50 %	50 %	474987155
9	NC_020894	GC	4	8	3433	3440	0 %	0 %	50 %	50 %	474987156
10	NC_020894	GC	3	6	3778	3783	0 %	0 %	50 %	50 %	474987157
11	NC_020894	GT	3	6	4239	4244	0 %	50 %	50 %	0 %	474987159
12	NC_020894	GC	3	6	4912	4917	0 %	0 %	50 %	50 %	474987159
13	NC_020894	TG	3	6	6165	6170	0 %	50 %	50 %	0 %	474987160
14	NC_020894	GC	3	6	6263	6268	0 %	0 %	50 %	50 %	474987160
15	NC_020894	TC	3	6	8030	8035	0 %	50 %	0 %	50 %	474987162
16	NC_020894	GC	3	6	9222	9227	0 %	0 %	50 %	50 %	474987164
17	NC_020894	GC	3	6	9513	9518	0 %	0 %	50 %	50 %	474987164
18	NC_020894	CT	3	6	10341	10346	0 %	50 %	0 %	50 %	474987165
19	NC_020894	GC	3	6	10762	10767	0 %	0 %	50 %	50 %	474987165
20	NC_020894	CG	3	6	13026	13031	0 %	0 %	50 %	50 %	474987169
21	NC_020894	GC	3	6	13041	13046	0 %	0 %	50 %	50 %	474987169
22	NC_020894	CG	3	6	15127	15132	0 %	0 %	50 %	50 %	474987170
23	NC_020894	CG	3	6	17989	17994	0 %	0 %	50 %	50 %	474987175
24	NC_020894	GA	3	6	18484	18489	50 %	0 %	50 %	0 %	474987176
25	NC_020894	GC	3	6	19462	19467	0 %	0 %	50 %	50 %	474987178
26	NC_020894	CG	3	6	20598	20603	0 %	0 %	50 %	50 %	474987180
27	NC_020894	CG	3	6	20638	20643	0 %	0 %	50 %	50 %	474987180
28	NC_020894	CG	3	6	21857	21862	0 %	0 %	50 %	50 %	474987183
29	NC_020894	GC	3	6	21937	21942	0 %	0 %	50 %	50 %	474987183
30	NC_020894	CG	3	6	22930	22935	0 %	0 %	50 %	50 %	474987184
31	NC_020894	CG	3	6	24379	24384	0 %	0 %	50 %	50 %	474987186
32	NC_020894	CG	3	6	26851	26856	0 %	0 %	50 %	50 %	474987190
33	NC_020894	GC	3	6	26861	26866	0 %	0 %	50 %	50 %	474987190
34	NC_020894	CG	3	6	28347	28352	0 %	0 %	50 %	50 %	474987192
35	NC_020894	GT	3	6	28634	28639	0 %	50 %	50 %	0 %	474987192
36	NC_020894	GC	3	6	28688	28693	0 %	0 %	50 %	50 %	474987192
37	NC_020894	GC	3	6	29062	29067	0 %	0 %	50 %	50 %	474987193
38	NC_020894	CG	3	6	30912	30917	0 %	0 %	50 %	50 %	474987195
39	NC_020894	CG	4	8	32219	32226	0 %	0 %	50 %	50 %	474987196
40	NC_020894	TC	3	6	33075	33080	0 %	50 %	0 %	50 %	474987198
41	NC_020894	GC	3	6	33169	33174	0 %	0 %	50 %	50 %	474987198
42	NC_020894	CG	3	6	33187	33192	0 %	0 %	50 %	50 %	474987198
43	NC_020894	CG	3	6	34473	34478	0 %	0 %	50 %	50 %	474987200
44	NC_020894	CG	3	6	34949	34954	0 %	0 %	50 %	50 %	474987201
45	NC_020894	CG	3	6	37282	37287	0 %	0 %	50 %	50 %	474987205
46	NC_020894	CG	3	6	39092	39097	0 %	0 %	50 %	50 %	474987206
47	NC_020894	GC	3	6	39504	39509	0 %	0 %	50 %	50 %	474987206
48	NC_020894	CG	3	6	39579	39584	0 %	0 %	50 %	50 %	474987206
49	NC_020894	TC	3	6	41452	41457	0 %	50 %	0 %	50 %	474987208
50	NC_020894	CG	3	6	41856	41861	0 %	0 %	50 %	50 %	474987208
51	NC_020894	GT	3	6	42408	42413	0 %	50 %	50 %	0 %	474987209
52	NC_020894	CG	3	6	44125	44130	0 %	0 %	50 %	50 %	474987211
53	NC_020894	GC	3	6	44822	44827	0 %	0 %	50 %	50 %	474987211
54	NC_020894	CA	3	6	45822	45827	50 %	0 %	0 %	50 %	474987213
55	NC_020894	CG	3	6	46068	46073	0 %	0 %	50 %	50 %	474987213
56	NC_020894	CG	3	6	46273	46278	0 %	0 %	50 %	50 %	474987213
57	NC_020894	AC	3	6	46789	46794	50 %	0 %	0 %	50 %	474987213
58	NC_020894	CG	3	6	47028	47033	0 %	0 %	50 %	50 %	474987213
59	NC_020894	GC	3	6	48744	48749	0 %	0 %	50 %	50 %	474987214
60	NC_020894	AC	3	6	48791	48796	50 %	0 %	0 %	50 %	474987214
61	NC_020894	GC	3	6	49105	49110	0 %	0 %	50 %	50 %	474987214
62	NC_020894	CA	3	6	50295	50300	50 %	0 %	0 %	50 %	474987214
63	NC_020894	AC	4	8	53541	53548	50 %	0 %	0 %	50 %	474987216
64	NC_020894	CT	3	6	53725	53730	0 %	50 %	0 %	50 %	474987216
65	NC_020894	CG	3	6	54174	54179	0 %	0 %	50 %	50 %	474987216
66	NC_020894	CG	3	6	58055	58060	0 %	0 %	50 %	50 %	474987220
67	NC_020894	CG	3	6	58682	58687	0 %	0 %	50 %	50 %	474987220
68	NC_020894	CG	3	6	58743	58748	0 %	0 %	50 %	50 %	474987220
69	NC_020894	GC	3	6	58836	58841	0 %	0 %	50 %	50 %	474987220
70	NC_020894	GC	3	6	59419	59424	0 %	0 %	50 %	50 %	474987221
71	NC_020894	CG	3	6	59750	59755	0 %	0 %	50 %	50 %	474987221
72	NC_020894	CG	4	8	60448	60455	0 %	0 %	50 %	50 %	474987221
73	NC_020894	GC	3	6	62342	62347	0 %	0 %	50 %	50 %	474987222
74	NC_020894	GT	3	6	62413	62418	0 %	50 %	50 %	0 %	474987222
75	NC_020894	CG	3	6	62832	62837	0 %	0 %	50 %	50 %	474987223
76	NC_020894	GC	3	6	62975	62980	0 %	0 %	50 %	50 %	474987223
77	NC_020894	GC	3	6	63029	63034	0 %	0 %	50 %	50 %	474987223
78	NC_020894	GC	3	6	63471	63476	0 %	0 %	50 %	50 %	474987224
79	NC_020894	GC	3	6	64089	64094	0 %	0 %	50 %	50 %	474987224
80	NC_020894	GC	3	6	64343	64348	0 %	0 %	50 %	50 %	474987225
81	NC_020894	CG	3	6	64396	64401	0 %	0 %	50 %	50 %	474987225
82	NC_020894	CG	3	6	64653	64658	0 %	0 %	50 %	50 %	474987225
83	NC_020894	GC	3	6	65454	65459	0 %	0 %	50 %	50 %	474987226
84	NC_020894	AG	3	6	65616	65621	50 %	0 %	50 %	0 %	474987226
85	NC_020894	GC	3	6	68638	68643	0 %	0 %	50 %	50 %	474987231
86	NC_020894	GC	3	6	69241	69246	0 %	0 %	50 %	50 %	474987232
87	NC_020894	AC	3	6	69901	69906	50 %	0 %	0 %	50 %	474987234
88	NC_020894	GT	5	10	70001	70010	0 %	50 %	50 %	0 %	474987234
89	NC_020894	CG	4	8	70435	70442	0 %	0 %	50 %	50 %	474987236
90	NC_020894	CG	3	6	70544	70549	0 %	0 %	50 %	50 %	474987236
91	NC_020894	CG	3	6	70733	70738	0 %	0 %	50 %	50 %	474987236
92	NC_020894	CG	3	6	70847	70852	0 %	0 %	50 %	50 %	474987236
93	NC_020894	AC	3	6	72067	72072	50 %	0 %	0 %	50 %	474987236
94	NC_020894	CG	3	6	72336	72341	0 %	0 %	50 %	50 %	474987236
95	NC_020894	CG	3	6	72401	72406	0 %	0 %	50 %	50 %	474987236
96	NC_020894	GC	3	6	72786	72791	0 %	0 %	50 %	50 %	474987237
97	NC_020894	GC	3	6	73094	73099	0 %	0 %	50 %	50 %	474987238
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99	NC_020894	GC	3	6	76663	76668	0 %	0 %	50 %	50 %	474987241
100	NC_020894	CG	3	6	76983	76988	0 %	0 %	50 %	50 %	474987241
101	NC_020894	GC	3	6	77385	77390	0 %	0 %	50 %	50 %	474987241
102	NC_020894	GC	3	6	78161	78166	0 %	0 %	50 %	50 %	474987241
103	NC_020894	CG	3	6	78682	78687	0 %	0 %	50 %	50 %	474987243
104	NC_020894	GC	3	6	78838	78843	0 %	0 %	50 %	50 %	474987243
105	NC_020894	GC	3	6	79366	79371	0 %	0 %	50 %	50 %	474987244
106	NC_020894	GC	3	6	79760	79765	0 %	0 %	50 %	50 %	474987244
107	NC_020894	CG	3	6	80435	80440	0 %	0 %	50 %	50 %	474987245
108	NC_020894	TG	3	6	81222	81227	0 %	50 %	50 %	0 %	474987246
109	NC_020894	CG	3	6	81318	81323	0 %	0 %	50 %	50 %	474987246
110	NC_020894	TG	3	6	81929	81934	0 %	50 %	50 %	0 %	474987247
111	NC_020894	CG	3	6	82064	82069	0 %	0 %	50 %	50 %	474987247
112	NC_020894	CG	3	6	82362	82367	0 %	0 %	50 %	50 %	474987248
113	NC_020894	GC	3	6	82909	82914	0 %	0 %	50 %	50 %	474987248
114	NC_020894	CG	3	6	83010	83015	0 %	0 %	50 %	50 %	474987248
115	NC_020894	TC	3	6	83139	83144	0 %	50 %	0 %	50 %	474987248
116	NC_020894	CG	3	6	83287	83292	0 %	0 %	50 %	50 %	474987248
117	NC_020894	GC	3	6	83368	83373	0 %	0 %	50 %	50 %	474987248
118	NC_020894	GC	3	6	83527	83532	0 %	0 %	50 %	50 %	474987248
119	NC_020894	GC	3	6	83604	83609	0 %	0 %	50 %	50 %	474987248
120	NC_020894	CA	3	6	84145	84150	50 %	0 %	0 %	50 %	474987248
121	NC_020894	CT	3	6	86494	86499	0 %	50 %	0 %	50 %	474987249
122	NC_020894	CG	3	6	87617	87622	0 %	0 %	50 %	50 %	474987250
123	NC_020894	CG	3	6	89075	89080	0 %	0 %	50 %	50 %	474987254
124	NC_020894	GC	3	6	89940	89945	0 %	0 %	50 %	50 %	474987254
125	NC_020894	CG	3	6	90776	90781	0 %	0 %	50 %	50 %	474987256
126	NC_020894	GC	4	8	91253	91260	0 %	0 %	50 %	50 %	474987256
127	NC_020894	GC	4	8	91316	91323	0 %	0 %	50 %	50 %	474987256
128	NC_020894	GC	3	6	91395	91400	0 %	0 %	50 %	50 %	474987256
129	NC_020894	CG	3	6	91835	91840	0 %	0 %	50 %	50 %	474987256
130	NC_020894	CA	3	6	91989	91994	50 %	0 %	0 %	50 %	474987256
131	NC_020894	CA	3	6	92076	92081	50 %	0 %	0 %	50 %	474987256
132	NC_020894	CA	3	6	92736	92741	50 %	0 %	0 %	50 %	474987256
133	NC_020894	CG	3	6	93073	93078	0 %	0 %	50 %	50 %	474987257
134	NC_020894	CA	3	6	93419	93424	50 %	0 %	0 %	50 %	474987257
135	NC_020894	CG	3	6	94334	94339	0 %	0 %	50 %	50 %	474987259
136	NC_020894	GC	3	6	95075	95080	0 %	0 %	50 %	50 %	474987261
137	NC_020894	CG	3	6	95717	95722	0 %	0 %	50 %	50 %	474987262
138	NC_020894	CG	3	6	97293	97298	0 %	0 %	50 %	50 %	474987264
139	NC_020894	AG	3	6	98386	98391	50 %	0 %	50 %	0 %	474987268
140	NC_020894	GC	3	6	98602	98607	0 %	0 %	50 %	50 %	474987267
141	NC_020894	GC	3	6	98835	98840	0 %	0 %	50 %	50 %	474987269
142	NC_020894	CG	3	6	99125	99130	0 %	0 %	50 %	50 %	474987269
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.