MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis NCPPB 2581 complete genome

Total Repeats: 9130

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020891	GCTC	2	8	215	222	0 %	25 %	25 %	50 %	473832061
2	NC_020891	GCCG	2	8	303	310	0 %	0 %	50 %	50 %	473832061
3	NC_020891	CACC	2	8	332	339	25 %	0 %	0 %	75 %	473832061
4	NC_020891	CCGC	2	8	1223	1230	0 %	0 %	25 %	75 %	473832061
5	NC_020891	TGCG	2	8	1512	1519	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_020891	GCCG	2	8	1603	1610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_020891	GGAC	2	8	2091	2098	25 %	0 %	50 %	25 %	473832062
8	NC_020891	CGCA	2	8	2134	2141	25 %	0 %	25 %	50 %	473832062
9	NC_020891	CGAC	2	8	2477	2484	25 %	0 %	25 %	50 %	473832062
10	NC_020891	CGCA	2	8	2568	2575	25 %	0 %	25 %	50 %	473832062
11	NC_020891	TGCG	2	8	3190	3197	0 %	25 %	50 %	25 %	473832063
12	NC_020891	CGGC	2	8	3322	3329	0 %	0 %	50 %	50 %	473832063
13	NC_020891	CGTC	2	8	4047	4054	0 %	25 %	25 %	50 %	473832064
14	NC_020891	CGAG	2	8	4500	4507	25 %	0 %	50 %	25 %	473832064
15	NC_020891	GCCA	2	8	4942	4949	25 %	0 %	25 %	50 %	473832064
16	NC_020891	CGGC	2	8	7354	7361	0 %	0 %	50 %	50 %	473832066
17	NC_020891	CACG	2	8	8259	8266	25 %	0 %	25 %	50 %	473832067
18	NC_020891	CGTT	2	8	8305	8312	0 %	50 %	25 %	25 %	473832067
19	NC_020891	CAGC	2	8	9834	9841	25 %	0 %	25 %	50 %	473832067
20	NC_020891	TCCG	2	8	10298	10305	0 %	25 %	25 %	50 %	473832067
21	NC_020891	TGCT	2	8	11850	11857	0 %	50 %	25 %	25 %	473832069
22	NC_020891	ACCC	2	8	12436	12443	25 %	0 %	0 %	75 %	473832070
23	NC_020891	CGAC	2	8	12461	12468	25 %	0 %	25 %	50 %	473832070
24	NC_020891	CGAC	2	8	12779	12786	25 %	0 %	25 %	50 %	473832070
25	NC_020891	GCGG	2	8	12925	12932	0 %	0 %	75 %	25 %	473832071
26	NC_020891	GCCG	2	8	12956	12963	0 %	0 %	50 %	50 %	473832071
27	NC_020891	TCGT	2	8	13029	13036	0 %	50 %	25 %	25 %	473832071
28	NC_020891	CTCG	2	8	13358	13365	0 %	25 %	25 %	50 %	473832071
29	NC_020891	GCTC	2	8	13645	13652	0 %	25 %	25 %	50 %	473832071
30	NC_020891	GACC	2	8	13708	13715	25 %	0 %	25 %	50 %	473832071
31	NC_020891	CACG	2	8	13720	13727	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_020891	CGGC	2	8	14557	14564	0 %	0 %	50 %	50 %	473832073
33	NC_020891	CGAC	2	8	14752	14759	25 %	0 %	25 %	50 %	473832073
34	NC_020891	CACG	2	8	15744	15751	25 %	0 %	25 %	50 %	473832075
35	NC_020891	CGTC	2	8	16126	16133	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_020891	CGGG	2	8	16614	16621	0 %	0 %	75 %	25 %	473832076
37	NC_020891	GAGC	2	8	17049	17056	25 %	0 %	50 %	25 %	473832076
38	NC_020891	CGCC	2	8	17094	17101	0 %	0 %	25 %	75 %	473832076
39	NC_020891	GCGG	2	8	17353	17360	0 %	0 %	75 %	25 %	473832076
40	NC_020891	CGAG	2	8	18068	18075	25 %	0 %	50 %	25 %	473832077
41	NC_020891	GTCG	2	8	18468	18475	0 %	25 %	50 %	25 %	473832077
42	NC_020891	GGTG	2	8	18726	18733	0 %	25 %	75 %	0 %	473832077
43	NC_020891	CGGC	2	8	19187	19194	0 %	0 %	50 %	50 %	473832077
44	NC_020891	GCTC	2	8	20275	20282	0 %	25 %	25 %	50 %	473832078
45	NC_020891	GCCG	2	8	20345	20352	0 %	0 %	50 %	50 %	473832078
46	NC_020891	CGGG	2	8	20749	20756	0 %	0 %	75 %	25 %	473832078
47	NC_020891	CGAC	2	8	20992	20999	25 %	0 %	25 %	50 %	473832078
48	NC_020891	CCGC	2	8	21485	21492	0 %	0 %	25 %	75 %	473832079
49	NC_020891	ACGA	2	8	21575	21582	50 %	0 %	25 %	25 %	473832079
50	NC_020891	ACGT	2	8	21980	21987	25 %	25 %	25 %	25 %	473832079
51	NC_020891	CGAG	2	8	22831	22838	25 %	0 %	50 %	25 %	473832080
52	NC_020891	ACGC	2	8	23028	23035	25 %	0 %	25 %	50 %	473832080
53	NC_020891	CCAG	2	8	23071	23078	25 %	0 %	25 %	50 %	473832080
54	NC_020891	CGGG	2	8	23291	23298	0 %	0 %	75 %	25 %	473832080
55	NC_020891	GGCC	2	8	23821	23828	0 %	0 %	50 %	50 %	473832080
56	NC_020891	GCCC	2	8	23926	23933	0 %	0 %	25 %	75 %	473832080
57	NC_020891	CTCG	2	8	24246	24253	0 %	25 %	25 %	50 %	473832081
58	NC_020891	GGCG	2	8	24329	24336	0 %	0 %	75 %	25 %	473832081
59	NC_020891	CGGG	2	8	24742	24749	0 %	0 %	75 %	25 %	473832082
60	NC_020891	GGGC	2	8	25718	25725	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61	NC_020891	CGCC	2	8	25798	25805	0 %	0 %	25 %	75 %	473832083
62	NC_020891	CGCC	2	8	25912	25919	0 %	0 %	25 %	75 %	473832083
63	NC_020891	GGCC	2	8	25972	25979	0 %	0 %	50 %	50 %	473832083
64	NC_020891	CCGT	2	8	26198	26205	0 %	25 %	25 %	50 %	473832083
65	NC_020891	CCGC	2	8	26391	26398	0 %	0 %	25 %	75 %	473832083
66	NC_020891	CGGT	2	8	26833	26840	0 %	25 %	50 %	25 %	473832083
67	NC_020891	CCGC	2	8	26958	26965	0 %	0 %	25 %	75 %	473832083
68	NC_020891	GCTG	2	8	27459	27466	0 %	25 %	50 %	25 %	473832083
69	NC_020891	GCGG	2	8	27877	27884	0 %	0 %	75 %	25 %	473832083
70	NC_020891	CGCC	2	8	28396	28403	0 %	0 %	25 %	75 %	473832084
71	NC_020891	CGGC	2	8	28456	28463	0 %	0 %	50 %	50 %	473832084
72	NC_020891	CGCT	2	8	28469	28476	0 %	25 %	25 %	50 %	473832084
73	NC_020891	GGGC	2	8	28733	28740	0 %	0 %	75 %	25 %	473832085
74	NC_020891	GCCG	2	8	28766	28773	0 %	0 %	50 %	50 %	473832085
75	NC_020891	CGAC	2	8	29400	29407	25 %	0 %	25 %	50 %	473832085
76	NC_020891	GATC	2	8	29408	29415	25 %	25 %	25 %	25 %	473832085
77	NC_020891	GCGG	2	8	29498	29505	0 %	0 %	75 %	25 %	473832085
78	NC_020891	CGAC	2	8	29583	29590	25 %	0 %	25 %	50 %	473832085
79	NC_020891	CGGC	2	8	29939	29946	0 %	0 %	50 %	50 %	473832086
80	NC_020891	GGCG	2	8	30054	30061	0 %	0 %	75 %	25 %	473832086
81	NC_020891	GCAC	2	8	30396	30403	25 %	0 %	25 %	50 %	473832086
82	NC_020891	GCCG	2	8	30501	30508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020891	TCGC	2	8	31501	31508	0 %	25 %	25 %	50 %	473832088
84	NC_020891	CGGC	2	8	31639	31646	0 %	0 %	50 %	50 %	473832088
85	NC_020891	GGCG	2	8	31655	31662	0 %	0 %	75 %	25 %	473832088
86	NC_020891	CGGG	2	8	31665	31672	0 %	0 %	75 %	25 %	473832088
87	NC_020891	CGCC	2	8	32253	32260	0 %	0 %	25 %	75 %	473832089
88	NC_020891	GCCG	2	8	32998	33005	0 %	0 %	50 %	50 %	473832089
89	NC_020891	CGGC	2	8	33071	33078	0 %	0 %	50 %	50 %	473832089
90	NC_020891	GGCG	2	8	33112	33119	0 %	0 %	75 %	25 %	473832089
91	NC_020891	CGGC	2	8	33134	33141	0 %	0 %	50 %	50 %	473832089
92	NC_020891	CGGC	2	8	33665	33672	0 %	0 %	50 %	50 %	473832089
93	NC_020891	CGGC	2	8	34029	34036	0 %	0 %	50 %	50 %	473832090
94	NC_020891	CGAC	2	8	34344	34351	25 %	0 %	25 %	50 %	473832090
95	NC_020891	CCGG	2	8	34413	34420	0 %	0 %	50 %	50 %	473832090
96	NC_020891	CCGA	2	8	34576	34583	25 %	0 %	25 %	50 %	473832090
97	NC_020891	CGAG	2	8	34952	34959	25 %	0 %	50 %	25 %	473832090
98	NC_020891	ATGC	2	8	35538	35545	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_020891	TCGC	2	8	35895	35902	0 %	25 %	25 %	50 %	473832092
100	NC_020891	CGCA	2	8	35931	35938	25 %	0 %	25 %	50 %	473832092
101	NC_020891	TCCA	2	8	35967	35974	25 %	25 %	0 %	50 %	473832092
102	NC_020891	CCGG	2	8	36514	36521	0 %	0 %	50 %	50 %	473832092
103	NC_020891	CGCC	2	8	36811	36818	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
104	NC_020891	CGGC	2	8	37076	37083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_020891	CACC	2	8	37740	37747	25 %	0 %	0 %	75 %	473832093
106	NC_020891	CGGC	2	8	38386	38393	0 %	0 %	50 %	50 %	473832094
107	NC_020891	CGCC	2	8	39428	39435	0 %	0 %	25 %	75 %	473832095
108	NC_020891	ACCT	2	8	39783	39790	25 %	25 %	0 %	50 %	473832096
109	NC_020891	CACG	2	8	39959	39966	25 %	0 %	25 %	50 %	473832096
110	NC_020891	CGGC	2	8	39974	39981	0 %	0 %	50 %	50 %	473832096
111	NC_020891	CGGG	2	8	40435	40442	0 %	0 %	75 %	25 %	473832096
112	NC_020891	CAGC	2	8	40559	40566	25 %	0 %	25 %	50 %	473832096
113	NC_020891	CCGG	2	8	41051	41058	0 %	0 %	50 %	50 %	473832097
114	NC_020891	CGGC	2	8	41456	41463	0 %	0 %	50 %	50 %	473832097
115	NC_020891	CGGG	2	8	41504	41511	0 %	0 %	75 %	25 %	473832097
116	NC_020891	GTCC	2	8	42043	42050	0 %	25 %	25 %	50 %	473832098
117	NC_020891	GGTC	2	8	42302	42309	0 %	25 %	50 %	25 %	473832098
118	NC_020891	CGTC	2	8	42502	42509	0 %	25 %	25 %	50 %	473832098
119	NC_020891	GGCT	2	8	42889	42896	0 %	25 %	50 %	25 %	473832098
120	NC_020891	TCGC	2	8	43061	43068	0 %	25 %	25 %	50 %	473832099
121	NC_020891	CCCG	2	8	43773	43780	0 %	0 %	25 %	75 %	473832100
122	NC_020891	ACCG	2	8	44168	44175	25 %	0 %	25 %	50 %	473832101
123	NC_020891	GCCC	2	8	44512	44519	0 %	0 %	25 %	75 %	473832101
124	NC_020891	GGCC	2	8	44632	44639	0 %	0 %	50 %	50 %	473832101
125	NC_020891	CGAC	2	8	44707	44714	25 %	0 %	25 %	50 %	473832101
126	NC_020891	GCGT	2	8	45537	45544	0 %	25 %	50 %	25 %	473832101
127	NC_020891	CTCG	2	8	45745	45752	0 %	25 %	25 %	50 %	473832102
128	NC_020891	GGCT	2	8	46414	46421	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_020891	ACGG	2	8	46760	46767	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_020891	GCAC	2	8	46879	46886	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_020891	AGGC	2	8	47226	47233	25 %	0 %	50 %	25 %	473832103
132	NC_020891	GCGG	2	8	47275	47282	0 %	0 %	75 %	25 %	473832103
133	NC_020891	CGAG	2	8	47832	47839	25 %	0 %	50 %	25 %	473832104
134	NC_020891	GCGG	2	8	47859	47866	0 %	0 %	75 %	25 %	473832104
135	NC_020891	CGAG	2	8	48087	48094	25 %	0 %	50 %	25 %	473832104
136	NC_020891	ACGA	2	8	48242	48249	50 %	0 %	25 %	25 %	473832104
137	NC_020891	CTCG	2	8	48409	48416	0 %	25 %	25 %	50 %	473832104
138	NC_020891	CCGG	2	8	48999	49006	0 %	0 %	50 %	50 %	473832104
139	NC_020891	GCGG	2	8	49935	49942	0 %	0 %	75 %	25 %	473832104
140	NC_020891	CCGC	2	8	50143	50150	0 %	0 %	25 %	75 %	473832104
141	NC_020891	GGTC	2	8	50169	50176	0 %	25 %	50 %	25 %	473832104
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