MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis NCPPB 2581 complete genome

Total Repeats: 1276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020891	TGCG	2	8	1512	1519	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020891	GCCG	2	8	1603	1610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020891	CACG	2	8	13720	13727	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020891	CGTC	2	8	16126	16133	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020891	GGGC	2	8	25718	25725	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6	NC_020891	GCCG	2	8	30501	30508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_020891	ATGC	2	8	35538	35545	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_020891	CGCC	2	8	36811	36818	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_020891	CGGC	2	8	37076	37083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020891	GGCT	2	8	46414	46421	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020891	ACGG	2	8	46760	46767	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020891	GCAC	2	8	46879	46886	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_020891	TTCC	2	8	54733	54740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_020891	ATGA	2	8	55903	55910	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020891	AGTG	2	8	56062	56069	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020891	CGCA	2	8	56199	56206	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020891	CACG	2	8	56385	56392	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020891	GTCG	2	8	56635	56642	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_020891	GCCC	2	8	58113	58120	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_020891	CCCA	2	8	60290	60297	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_020891	GTGC	3	12	62313	62324	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020891	CCGC	3	12	63418	63429	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_020891	CGGG	2	8	63523	63530	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_020891	GGGT	2	8	63643	63650	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020891	GGTC	2	8	66490	66497	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020891	GACG	2	8	67380	67387	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020891	GTCG	2	8	67389	67396	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_020891	CGAG	2	8	71176	71183	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_020891	CACC	2	8	73828	73835	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
30	NC_020891	GCGT	2	8	77145	77152	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_020891	CGGG	2	8	78647	78654	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_020891	CGGG	2	8	79748	79755	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_020891	CACC	2	8	83714	83721	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_020891	CCCG	2	8	84536	84543	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_020891	CCGC	2	8	91879	91886	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36	NC_020891	CACG	2	8	91889	91896	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020891	TCCT	2	8	92789	92796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_020891	ATTG	2	8	97485	97492	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020891	GCTC	2	8	97893	97900	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_020891	GTCT	2	8	98046	98053	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_020891	GGCC	2	8	104273	104280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_020891	GCCG	2	8	104310	104317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_020891	CGCC	2	8	104350	104357	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_020891	CGTC	2	8	104394	104401	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_020891	GAGG	2	8	105832	105839	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020891	CCCG	2	8	106334	106341	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
47	NC_020891	CGTG	2	8	109464	109471	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_020891	GCCG	2	8	113885	113892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_020891	GGTC	2	8	114217	114224	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020891	TCCG	2	8	114227	114234	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_020891	TGAT	2	8	116988	116995	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020891	TGCC	2	8	117370	117377	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_020891	CGAC	2	8	117417	117424	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_020891	GCGG	2	8	123561	123568	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_020891	GCCC	2	8	123599	123606	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
56	NC_020891	CTTC	2	8	126374	126381	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_020891	CTCC	2	8	131928	131935	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
58	NC_020891	CGGG	2	8	131945	131952	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_020891	GCCG	2	8	136299	136306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_020891	CGGC	2	8	137309	137316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_020891	CGGG	2	8	137332	137339	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_020891	GTGG	2	8	140242	140249	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020891	GCTG	2	8	141702	141709	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_020891	ATCG	2	8	141966	141973	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_020891	AGGC	2	8	142077	142084	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_020891	CCGG	2	8	142370	142377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_020891	TCGC	2	8	143485	143492	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_020891	TCTT	2	8	144902	144909	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_020891	GGCC	2	8	148300	148307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_020891	CGCC	2	8	148735	148742	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_020891	CTTC	2	8	149231	149238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_020891	CCCG	2	8	156182	156189	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
73	NC_020891	CGGG	2	8	172571	172578	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
74	NC_020891	CGAC	2	8	174165	174172	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020891	TGGG	2	8	177095	177102	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020891	CGCC	2	8	178704	178711	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
77	NC_020891	GCCC	2	8	180958	180965	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
78	NC_020891	CCCG	2	8	180974	180981	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_020891	CGCT	2	8	181577	181584	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_020891	CCGG	2	8	181651	181658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_020891	TCGA	2	8	181787	181794	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_020891	GCCG	2	8	181828	181835	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020891	CGGG	2	8	190583	190590	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020891	CGGC	2	8	194991	194998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_020891	CCGC	2	8	195007	195014	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
86	NC_020891	CCGC	2	8	198203	198210	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
87	NC_020891	AGCG	2	8	200192	200199	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_020891	GGGC	2	8	201729	201736	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
89	NC_020891	GCAC	2	8	205079	205086	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_020891	GCCC	2	8	217250	217257	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
91	NC_020891	GGCC	2	8	218324	218331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_020891	CGAC	2	8	218388	218395	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_020891	CGGC	2	8	219734	219741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_020891	GACG	2	8	219784	219791	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_020891	GCCA	2	8	223202	223209	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_020891	CGGC	2	8	223430	223437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_020891	GCCC	2	8	223686	223693	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NC_020891	TCGC	2	8	223748	223755	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_020891	CCGC	2	8	223972	223979	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
100	NC_020891	GACG	2	8	223980	223987	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_020891	GCCC	2	8	224012	224019	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
102	NC_020891	GCCA	2	8	224095	224102	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020891	GCCG	2	8	224144	224151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_020891	GGTC	2	8	224159	224166	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_020891	CGGC	2	8	224462	224469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020891	CCGC	2	8	228660	228667	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
107	NC_020891	CGTG	2	8	228695	228702	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_020891	CGTC	2	8	228794	228801	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_020891	GCGG	2	8	228806	228813	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
110	NC_020891	GCTC	2	8	237022	237029	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_020891	GGAG	2	8	237091	237098	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020891	GCCG	2	8	248447	248454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_020891	GGAC	2	8	251547	251554	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_020891	GCGA	2	8	251600	251607	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_020891	TGGC	2	8	251629	251636	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_020891	CGGC	2	8	263635	263642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_020891	ATCG	2	8	264669	264676	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_020891	CGGG	2	8	266543	266550	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_020891	GGCC	2	8	266569	266576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_020891	TCCA	2	8	266603	266610	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_020891	TCGC	2	8	266659	266666	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_020891	CGGG	2	8	272196	272203	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_020891	CCGG	2	8	275046	275053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_020891	GCGG	3	12	285918	285929	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_020891	CCGA	2	8	286013	286020	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_020891	AGGG	2	8	314606	314613	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020891	CCGG	2	8	315974	315981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_020891	CCCG	2	8	316003	316010	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
129	NC_020891	CCGC	2	8	318894	318901	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
130	NC_020891	CTGT	2	8	318912	318919	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_020891	GACG	2	8	319092	319099	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_020891	GCAG	2	8	322796	322803	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_020891	TCAG	2	8	324948	324955	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_020891	TCCC	2	8	326155	326162	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
135	NC_020891	CCCG	2	8	326166	326173	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
136	NC_020891	GGAA	2	8	333279	333286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020891	GTCG	2	8	333356	333363	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_020891	GCGT	2	8	333367	333374	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_020891	TCCT	2	8	333448	333455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_020891	GAGG	2	8	333949	333956	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020891	GGCG	2	8	334290	334297	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
142	NC_020891	TCGC	2	8	334445	334452	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_020891	GGCC	2	8	334474	334481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_020891	GGCT	2	8	334889	334896	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_020891	GTCC	2	8	335009	335016	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_020891	GCCG	2	8	335479	335486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_020891	GTCC	2	8	338722	338729	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_020891	CGCA	2	8	341185	341192	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_020891	CGGC	2	8	345304	345311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_020891	CGGC	2	8	348042	348049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_020891	GGTG	2	8	348285	348292	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020891	CGTC	2	8	348568	348575	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
153	NC_020891	CCGC	2	8	350655	350662	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
154	NC_020891	GGGC	2	8	352133	352140	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
155	NC_020891	GGCG	2	8	352649	352656	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
156	NC_020891	CAGG	2	8	357434	357441	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
157	NC_020891	GCCG	2	8	361743	361750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
158	NC_020891	CCGC	2	8	369566	369573	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
159	NC_020891	GATC	2	8	371625	371632	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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163	NC_020891	CCCG	2	8	382508	382515	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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165	NC_020891	GGCC	2	8	388629	388636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
166	NC_020891	CGGC	2	8	388648	388655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
167	NC_020891	GAGG	2	8	398979	398986	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_020891	CCGG	2	8	458287	458294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
188	NC_020891	GCCG	2	8	458770	458777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
189	NC_020891	GCGG	2	8	458851	458858	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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191	NC_020891	GTGC	2	8	459647	459654	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
192	NC_020891	GAGC	2	8	459847	459854	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
193	NC_020891	GCTC	2	8	459939	459946	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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272	NC_020891	CGGG	2	8	610600	610607	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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281	NC_020891	GGCG	2	8	631303	631310	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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442	NC_020891	GGTA	2	8	1036529	1036536	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
443	NC_020891	CGGG	2	8	1042690	1042697	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
444	NC_020891	CGTG	2	8	1048543	1048550	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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475	NC_020891	CGAG	2	8	1111724	1111731	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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482	NC_020891	CCGG	2	8	1127185	1127192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
483	NC_020891	CGTC	2	8	1132175	1132182	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
484	NC_020891	TCGG	2	8	1132200	1132207	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
485	NC_020891	GGGC	2	8	1134024	1134031	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
486	NC_020891	TCCA	2	8	1137702	1137709	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
487	NC_020891	GTGC	2	8	1137724	1137731	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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490	NC_020891	CGGT	3	12	1143858	1143869	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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500	NC_020891	TCCC	2	8	1176852	1176859	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding

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