MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis NCPPB 2581 complete genome

Total Repeats: 70995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020891	CGC	2	6	48	53	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832061
2	NC_020891	GAC	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832061
3	NC_020891	TCA	2	6	95	100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	473832061
4	NC_020891	TGA	2	6	122	127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832061
5	NC_020891	AGC	2	6	179	184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832061
6	NC_020891	CTC	2	6	199	204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832061
7	NC_020891	GGC	2	6	228	233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832061
8	NC_020891	AGC	2	6	314	319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832061
9	NC_020891	CGG	2	6	435	440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832061
10	NC_020891	CCT	2	6	546	551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832061
11	NC_020891	GAG	2	6	616	621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832061
12	NC_020891	TCA	2	6	635	640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	473832061
13	NC_020891	AAC	2	6	652	657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	473832061
14	NC_020891	GTC	2	6	660	665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832061
15	NC_020891	CTG	2	6	700	705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832061
16	NC_020891	CGA	2	6	708	713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832061
17	NC_020891	TCC	2	6	722	727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832061
18	NC_020891	AGG	2	6	746	751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832061
19	NC_020891	TTC	2	6	754	759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	473832061
20	NC_020891	CAA	2	6	786	791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	473832061
21	NC_020891	GGT	2	6	795	800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	473832061
22	NC_020891	TCA	2	6	875	880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	473832061
23	NC_020891	TCC	2	6	920	925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832061
24	NC_020891	AAG	2	6	928	933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	473832061
25	NC_020891	CGA	2	6	960	965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832061
26	NC_020891	CCA	2	6	983	988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	473832061
27	NC_020891	CAA	2	6	1053	1058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	473832061
28	NC_020891	CAT	2	6	1143	1148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	473832061
29	NC_020891	CGA	2	6	1182	1187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832061
30	NC_020891	ACG	2	6	1312	1317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832061
31	NC_020891	CAA	2	6	1329	1334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	473832061
32	NC_020891	ACC	2	6	1412	1417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	473832061
33	NC_020891	CCT	2	6	1438	1443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_020891	TGC	2	6	1449	1454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020891	CGG	2	6	1527	1532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020891	CCG	2	6	1665	1670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_020891	CGT	2	6	1710	1715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020891	TCG	2	6	1720	1725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020891	CCG	2	6	1731	1736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_020891	GTC	2	6	2106	2111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832062
41	NC_020891	GAG	2	6	2158	2163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832062
42	NC_020891	CTC	2	6	2191	2196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832062
43	NC_020891	CAC	2	6	2238	2243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	473832062
44	NC_020891	GCT	2	6	2289	2294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832062
45	NC_020891	GAG	2	6	2308	2313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832062
46	NC_020891	CCT	2	6	2349	2354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832062
47	NC_020891	CCG	2	6	2357	2362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832062
48	NC_020891	CGC	3	9	2370	2378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832062
49	NC_020891	CGA	2	6	2409	2414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832062
50	NC_020891	TCA	2	6	2426	2431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	473832062
51	NC_020891	CGG	2	6	2520	2525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832062
52	NC_020891	CCG	2	6	2713	2718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832062
53	NC_020891	CGG	2	6	2768	2773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832062
54	NC_020891	CGC	2	6	2791	2796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832062
55	NC_020891	GGC	2	6	2820	2825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832062
56	NC_020891	CCT	2	6	2910	2915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832062
57	NC_020891	GTG	2	6	2932	2937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	473832062
58	NC_020891	CTG	2	6	2956	2961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832062
59	NC_020891	CAA	2	6	3024	3029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	473832062
60	NC_020891	TCA	2	6	3044	3049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	473832062
61	NC_020891	TCC	2	6	3058	3063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832062
62	NC_020891	CTG	2	6	3097	3102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832062
63	NC_020891	CTG	3	9	3112	3120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832062
64	NC_020891	TCG	2	6	3160	3165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832063
65	NC_020891	CGA	2	6	3269	3274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832063
66	NC_020891	CGC	2	6	3278	3283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832063
67	NC_020891	GTG	2	6	3345	3350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	473832063
68	NC_020891	CGG	2	6	3395	3400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832063
69	NC_020891	GAC	2	6	3417	3422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832063
70	NC_020891	GCT	2	6	3437	3442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832063
71	NC_020891	TCG	2	6	3463	3468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832063
72	NC_020891	GCG	2	6	3484	3489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832063
73	NC_020891	CGG	2	6	3524	3529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832063
74	NC_020891	AGG	2	6	3595	3600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832063
75	NC_020891	ATG	2	6	3672	3677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832063
76	NC_020891	CTC	2	6	3702	3707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832063
77	NC_020891	CAT	2	6	3722	3727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	473832063
78	NC_020891	GCT	2	6	3785	3790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832063
79	NC_020891	CTC	2	6	3795	3800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832063
80	NC_020891	AGG	2	6	3814	3819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832063
81	NC_020891	GAG	2	6	3882	3887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832063
82	NC_020891	TCC	2	6	3945	3950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832063
83	NC_020891	AGG	2	6	3955	3960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832063
84	NC_020891	CGG	2	6	4004	4009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832063
85	NC_020891	AGA	2	6	4021	4026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	473832063
86	NC_020891	ACC	2	6	4034	4039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	473832063
87	NC_020891	GAT	2	6	4041	4046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832064
88	NC_020891	TGG	2	6	4157	4162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	473832064
89	NC_020891	GCA	2	6	4263	4268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832064
90	NC_020891	TCG	2	6	4309	4314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832064
91	NC_020891	GTT	2	6	4383	4388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	473832064
92	NC_020891	GGA	2	6	4395	4400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832064
93	NC_020891	GCG	2	6	4415	4420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832064
94	NC_020891	TGC	2	6	4460	4465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832064
95	NC_020891	CGC	2	6	4469	4474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832064
96	NC_020891	AGC	2	6	4514	4519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832064
97	NC_020891	TCG	2	6	4601	4606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832064
98	NC_020891	ATC	2	6	4621	4626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	473832064
99	NC_020891	GCG	2	6	4627	4632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832064
100	NC_020891	TCG	2	6	4643	4648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832064
101	NC_020891	CGT	2	6	4709	4714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832064
102	NC_020891	GAC	2	6	4741	4746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832064
103	NC_020891	GAC	3	9	4753	4761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832064
104	NC_020891	GAC	2	6	4765	4770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832064
105	NC_020891	CGT	2	6	4812	4817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832064
106	NC_020891	CGC	2	6	4827	4832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832064
107	NC_020891	CGA	2	6	4896	4901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832064
108	NC_020891	GCG	2	6	5004	5009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832064
109	NC_020891	CGA	2	6	5043	5048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832064
110	NC_020891	TCA	2	6	5120	5125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	473832064
111	NC_020891	GCG	2	6	5245	5250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832064
112	NC_020891	CGC	2	6	5261	5266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832065
113	NC_020891	CGG	2	6	5270	5275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832065
114	NC_020891	CCG	2	6	5309	5314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832065
115	NC_020891	GGC	2	6	5495	5500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832065
116	NC_020891	GAC	2	6	5504	5509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832065
117	NC_020891	GAG	2	6	5520	5525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832065
118	NC_020891	CCG	2	6	5527	5532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832065
119	NC_020891	CTC	2	6	5537	5542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832065
120	NC_020891	CCT	2	6	5564	5569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832065
121	NC_020891	ACG	2	6	5631	5636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832065
122	NC_020891	GAC	2	6	5868	5873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_020891	CCG	2	6	5906	5911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_020891	CCA	2	6	5942	5947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_020891	CGA	2	6	5981	5986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832066
126	NC_020891	CGA	2	6	5996	6001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832066
127	NC_020891	GAG	2	6	6012	6017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832066
128	NC_020891	CAG	2	6	6048	6053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832066
129	NC_020891	CAC	2	6	6159	6164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	473832066
130	NC_020891	TCG	2	6	6178	6183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832066
131	NC_020891	CGA	2	6	6194	6199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832066
132	NC_020891	CGG	2	6	6248	6253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832066
133	NC_020891	CGT	2	6	6260	6265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832066
134	NC_020891	CGA	2	6	6266	6271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832066
135	NC_020891	CGG	4	12	6362	6373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832066
136	NC_020891	CGG	2	6	6386	6391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832066
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141	NC_020891	CAA	2	6	6638	6643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	473832066
142	NC_020891	ACG	2	6	6664	6669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832066
143	NC_020891	TCG	2	6	6727	6732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832066
144	NC_020891	GAA	2	6	6758	6763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	473832066
145	NC_020891	GTC	2	6	6771	6776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832066
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162	NC_020891	GAT	2	6	7481	7486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832066
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172	NC_020891	CGC	2	6	7944	7949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832066
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174	NC_020891	CCG	2	6	8029	8034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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252	NC_020891	TGA	2	6	10758	10763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832067
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257	NC_020891	CAT	2	6	10894	10899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	473832068
258	NC_020891	CGT	2	6	10903	10908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832068
259	NC_020891	CGT	2	6	10927	10932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832068
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376	NC_020891	GGA	2	6	16154	16159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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