MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis NCPPB 2581 complete genome

Total Repeats: 12233

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020891	GA	3	6	1595	1600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020891	GA	3	6	3139	3144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020891	CG	3	6	3589	3594	0 %	0 %	50 %	50 %	473832063
4	NC_020891	GC	3	6	3711	3716	0 %	0 %	50 %	50 %	473832063
5	NC_020891	CG	3	6	3935	3940	0 %	0 %	50 %	50 %	473832063
6	NC_020891	CG	3	6	4087	4092	0 %	0 %	50 %	50 %	473832064
7	NC_020891	CG	3	6	4321	4326	0 %	0 %	50 %	50 %	473832064
8	NC_020891	CG	3	6	4352	4357	0 %	0 %	50 %	50 %	473832064
9	NC_020891	CG	3	6	4631	4636	0 %	0 %	50 %	50 %	473832064
10	NC_020891	GC	4	8	4669	4676	0 %	0 %	50 %	50 %	473832064
11	NC_020891	GC	4	8	4775	4782	0 %	0 %	50 %	50 %	473832064
12	NC_020891	CG	3	6	5743	5748	0 %	0 %	50 %	50 %	473832065
13	NC_020891	CG	4	8	5897	5904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_020891	CG	3	6	6148	6153	0 %	0 %	50 %	50 %	473832066
15	NC_020891	GC	4	8	6608	6615	0 %	0 %	50 %	50 %	473832066
16	NC_020891	CG	3	6	6930	6935	0 %	0 %	50 %	50 %	473832066
17	NC_020891	CG	3	6	6962	6967	0 %	0 %	50 %	50 %	473832066
18	NC_020891	GC	3	6	7236	7241	0 %	0 %	50 %	50 %	473832066
19	NC_020891	CG	3	6	7452	7457	0 %	0 %	50 %	50 %	473832066
20	NC_020891	GC	4	8	8343	8350	0 %	0 %	50 %	50 %	473832067
21	NC_020891	GC	3	6	8828	8833	0 %	0 %	50 %	50 %	473832067
22	NC_020891	CG	3	6	9791	9796	0 %	0 %	50 %	50 %	473832067
23	NC_020891	TC	3	6	10250	10255	0 %	50 %	0 %	50 %	473832067
24	NC_020891	CG	3	6	11633	11638	0 %	0 %	50 %	50 %	473832069
25	NC_020891	GC	3	6	12053	12058	0 %	0 %	50 %	50 %	473832069
26	NC_020891	TG	3	6	13100	13105	0 %	50 %	50 %	0 %	473832071
27	NC_020891	CG	3	6	13463	13468	0 %	0 %	50 %	50 %	473832071
28	NC_020891	GC	3	6	13582	13587	0 %	0 %	50 %	50 %	473832071
29	NC_020891	GT	3	6	13839	13844	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020891	TG	3	6	13983	13988	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020891	GC	3	6	17308	17313	0 %	0 %	50 %	50 %	473832076
32	NC_020891	GC	4	8	17411	17418	0 %	0 %	50 %	50 %	473832076
33	NC_020891	CG	3	6	17500	17505	0 %	0 %	50 %	50 %	473832076
34	NC_020891	GC	3	6	17713	17718	0 %	0 %	50 %	50 %	473832076
35	NC_020891	GC	3	6	18898	18903	0 %	0 %	50 %	50 %	473832077
36	NC_020891	GC	3	6	18910	18915	0 %	0 %	50 %	50 %	473832077
37	NC_020891	GC	3	6	18973	18978	0 %	0 %	50 %	50 %	473832077
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39	NC_020891	GC	3	6	19470	19475	0 %	0 %	50 %	50 %	473832077
40	NC_020891	GC	3	6	20379	20384	0 %	0 %	50 %	50 %	473832078
41	NC_020891	CG	3	6	20771	20776	0 %	0 %	50 %	50 %	473832078
42	NC_020891	CG	3	6	20834	20839	0 %	0 %	50 %	50 %	473832078
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44	NC_020891	CG	3	6	22098	22103	0 %	0 %	50 %	50 %	473832079
45	NC_020891	CG	4	8	22149	22156	0 %	0 %	50 %	50 %	473832079
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47	NC_020891	CG	3	6	22788	22793	0 %	0 %	50 %	50 %	473832079
48	NC_020891	GC	4	8	23095	23102	0 %	0 %	50 %	50 %	473832080
49	NC_020891	CG	4	8	23164	23171	0 %	0 %	50 %	50 %	473832080
50	NC_020891	GC	3	6	23181	23186	0 %	0 %	50 %	50 %	473832080
51	NC_020891	GC	3	6	23220	23225	0 %	0 %	50 %	50 %	473832080
52	NC_020891	GC	3	6	23740	23745	0 %	0 %	50 %	50 %	473832080
53	NC_020891	GC	3	6	24198	24203	0 %	0 %	50 %	50 %	473832081
54	NC_020891	CG	3	6	24354	24359	0 %	0 %	50 %	50 %	473832081
55	NC_020891	GC	3	6	24769	24774	0 %	0 %	50 %	50 %	473832082
56	NC_020891	GC	3	6	25308	25313	0 %	0 %	50 %	50 %	473832082
57	NC_020891	CG	3	6	25363	25368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_020891	GT	3	6	25565	25570	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020891	CG	3	6	25864	25869	0 %	0 %	50 %	50 %	473832083
60	NC_020891	CG	3	6	26270	26275	0 %	0 %	50 %	50 %	473832083
61	NC_020891	CG	3	6	26334	26339	0 %	0 %	50 %	50 %	473832083
62	NC_020891	CG	3	6	26819	26824	0 %	0 %	50 %	50 %	473832083
63	NC_020891	GC	3	6	27077	27082	0 %	0 %	50 %	50 %	473832083
64	NC_020891	CG	3	6	27308	27313	0 %	0 %	50 %	50 %	473832083
65	NC_020891	GC	3	6	27318	27323	0 %	0 %	50 %	50 %	473832083
66	NC_020891	CG	5	10	27568	27577	0 %	0 %	50 %	50 %	473832083
67	NC_020891	GC	3	6	27674	27679	0 %	0 %	50 %	50 %	473832083
68	NC_020891	GC	4	8	27817	27824	0 %	0 %	50 %	50 %	473832083
69	NC_020891	GC	3	6	27870	27875	0 %	0 %	50 %	50 %	473832083
70	NC_020891	GC	3	6	27931	27936	0 %	0 %	50 %	50 %	473832083
71	NC_020891	CG	3	6	28154	28159	0 %	0 %	50 %	50 %	473832084
72	NC_020891	GC	3	6	28496	28501	0 %	0 %	50 %	50 %	473832084
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74	NC_020891	CG	3	6	29058	29063	0 %	0 %	50 %	50 %	473832085
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76	NC_020891	CG	3	6	29425	29430	0 %	0 %	50 %	50 %	473832085
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78	NC_020891	CG	3	6	29576	29581	0 %	0 %	50 %	50 %	473832085
79	NC_020891	GC	3	6	29626	29631	0 %	0 %	50 %	50 %	473832085
80	NC_020891	CG	3	6	29665	29670	0 %	0 %	50 %	50 %	473832085
81	NC_020891	GC	3	6	29812	29817	0 %	0 %	50 %	50 %	473832085
82	NC_020891	CG	3	6	29927	29932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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90	NC_020891	CG	3	6	31220	31225	0 %	0 %	50 %	50 %	473832088
91	NC_020891	CG	3	6	31239	31244	0 %	0 %	50 %	50 %	473832088
92	NC_020891	CG	3	6	31465	31470	0 %	0 %	50 %	50 %	473832088
93	NC_020891	GC	3	6	31595	31600	0 %	0 %	50 %	50 %	473832088
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102	NC_020891	GC	3	6	33154	33159	0 %	0 %	50 %	50 %	473832089
103	NC_020891	GC	3	6	33170	33175	0 %	0 %	50 %	50 %	473832089
104	NC_020891	GA	3	6	33410	33415	50 %	0 %	50 %	0 %	473832089
105	NC_020891	CG	3	6	34391	34396	0 %	0 %	50 %	50 %	473832090
106	NC_020891	GC	3	6	34817	34822	0 %	0 %	50 %	50 %	473832090
107	NC_020891	CG	3	6	34842	34847	0 %	0 %	50 %	50 %	473832090
108	NC_020891	CG	3	6	34865	34870	0 %	0 %	50 %	50 %	473832090
109	NC_020891	GC	3	6	34887	34892	0 %	0 %	50 %	50 %	473832090
110	NC_020891	CG	3	6	35005	35010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_020891	GC	3	6	35044	35049	0 %	0 %	50 %	50 %	473832091
112	NC_020891	CG	3	6	35106	35111	0 %	0 %	50 %	50 %	473832091
113	NC_020891	GC	3	6	35260	35265	0 %	0 %	50 %	50 %	473832091
114	NC_020891	GC	3	6	35953	35958	0 %	0 %	50 %	50 %	473832092
115	NC_020891	CG	3	6	36350	36355	0 %	0 %	50 %	50 %	473832092
116	NC_020891	CG	4	8	36464	36471	0 %	0 %	50 %	50 %	473832092
117	NC_020891	CG	3	6	37061	37066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_020891	GC	4	8	37097	37104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_020891	GC	4	8	37146	37153	0 %	0 %	50 %	50 %	473832093
120	NC_020891	CG	4	8	37527	37534	0 %	0 %	50 %	50 %	473832093
121	NC_020891	GC	3	6	37593	37598	0 %	0 %	50 %	50 %	473832093
122	NC_020891	CG	3	6	37733	37738	0 %	0 %	50 %	50 %	473832093
123	NC_020891	GC	3	6	37922	37927	0 %	0 %	50 %	50 %	473832093
124	NC_020891	TC	3	6	38691	38696	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_020891	GC	3	6	39042	39047	0 %	0 %	50 %	50 %	473832095
126	NC_020891	CG	4	8	39273	39280	0 %	0 %	50 %	50 %	473832095
127	NC_020891	CG	5	10	39858	39867	0 %	0 %	50 %	50 %	473832096
128	NC_020891	GC	4	8	40065	40072	0 %	0 %	50 %	50 %	473832096
129	NC_020891	GC	3	6	40093	40098	0 %	0 %	50 %	50 %	473832096
130	NC_020891	GC	3	6	40136	40141	0 %	0 %	50 %	50 %	473832096
131	NC_020891	CG	3	6	40374	40379	0 %	0 %	50 %	50 %	473832096
132	NC_020891	CG	3	6	40649	40654	0 %	0 %	50 %	50 %	473832096
133	NC_020891	GC	3	6	40679	40684	0 %	0 %	50 %	50 %	473832096
134	NC_020891	CG	3	6	40917	40922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020891	CG	3	6	41001	41006	0 %	0 %	50 %	50 %	473832097
136	NC_020891	GC	3	6	41208	41213	0 %	0 %	50 %	50 %	473832097
137	NC_020891	GC	3	6	41252	41257	0 %	0 %	50 %	50 %	473832097
138	NC_020891	CG	3	6	41306	41311	0 %	0 %	50 %	50 %	473832097
139	NC_020891	CG	4	8	41437	41444	0 %	0 %	50 %	50 %	473832097
140	NC_020891	CG	3	6	41585	41590	0 %	0 %	50 %	50 %	473832097
141	NC_020891	CA	3	6	41722	41727	50 %	0 %	0 %	50 %	473832098
142	NC_020891	GC	3	6	41771	41776	0 %	0 %	50 %	50 %	473832098
143	NC_020891	TC	3	6	42214	42219	0 %	50 %	0 %	50 %	473832098
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