MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis NCPPB 2581 complete genome

Total Repeats: 160

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020891	C	6	6	25595	25600	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2	NC_020891	C	7	7	46933	46939	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3	NC_020891	C	6	6	54795	54800	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4	NC_020891	C	6	6	54811	54816	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5	NC_020891	C	6	6	56436	56441	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6	NC_020891	G	6	6	66516	66521	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020891	G	6	6	67432	67437	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020891	C	6	6	70904	70909	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_020891	C	6	6	71007	71012	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10	NC_020891	G	6	6	78763	78768	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020891	G	6	6	78813	78818	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020891	G	6	6	92742	92747	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020891	C	6	6	104407	104412	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14	NC_020891	G	6	6	141044	141049	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020891	G	6	6	142036	142041	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020891	G	8	8	148696	148703	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020891	C	6	6	151968	151973	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18	NC_020891	G	7	7	196966	196972	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020891	G	6	6	237009	237014	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020891	G	7	7	265792	265798	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020891	G	6	6	272264	272269	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020891	G	6	6	317133	317138	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020891	G	8	8	318252	318259	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020891	C	6	6	326175	326180	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25	NC_020891	C	6	6	334168	334173	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26	NC_020891	G	6	6	334205	334210	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020891	C	6	6	335683	335688	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
28	NC_020891	G	8	8	352617	352624	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020891	C	6	6	383652	383657	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30	NC_020891	G	6	6	383813	383818	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020891	G	6	6	421987	421992	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020891	C	6	6	425666	425671	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
33	NC_020891	G	6	6	463470	463475	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020891	C	6	6	472539	472544	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35	NC_020891	G	7	7	475778	475784	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020891	C	7	7	475971	475977	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37	NC_020891	G	6	6	493026	493031	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020891	G	6	6	493745	493750	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020891	G	6	6	499891	499896	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020891	C	6	6	535683	535688	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41	NC_020891	G	6	6	582902	582907	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020891	C	6	6	595064	595069	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43	NC_020891	G	6	6	630855	630860	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020891	G	6	6	631543	631548	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020891	C	7	7	636987	636993	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
46	NC_020891	C	6	6	638487	638492	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47	NC_020891	A	7	7	651913	651919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020891	G	6	6	766699	766704	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020891	C	8	8	769746	769753	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50	NC_020891	C	6	6	772511	772516	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51	NC_020891	G	6	6	828110	828115	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020891	C	6	6	836947	836952	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53	NC_020891	G	6	6	885051	885056	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020891	G	6	6	903149	903154	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020891	C	6	6	921137	921142	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56	NC_020891	G	6	6	937309	937314	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020891	C	6	6	959890	959895	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
58	NC_020891	G	6	6	962283	962288	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020891	C	6	6	962305	962310	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
60	NC_020891	G	6	6	981234	981239	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020891	C	6	6	1052240	1052245	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
62	NC_020891	G	6	6	1052250	1052255	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020891	G	8	8	1057263	1057270	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020891	C	9	9	1059861	1059869	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
65	NC_020891	G	6	6	1103722	1103727	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020891	C	7	7	1113263	1113269	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
67	NC_020891	C	6	6	1156290	1156295	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
68	NC_020891	G	6	6	1179303	1179308	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020891	G	7	7	1211103	1211109	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020891	T	7	7	1212272	1212278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020891	A	7	7	1225146	1225152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020891	C	6	6	1226978	1226983	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
73	NC_020891	C	6	6	1235569	1235574	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
74	NC_020891	G	6	6	1261695	1261700	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020891	C	6	6	1284626	1284631	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76	NC_020891	C	6	6	1284637	1284642	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
77	NC_020891	C	6	6	1298255	1298260	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
78	NC_020891	C	6	6	1309356	1309361	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
79	NC_020891	C	6	6	1338375	1338380	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
80	NC_020891	G	6	6	1419058	1419063	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020891	C	8	8	1453864	1453871	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
82	NC_020891	G	6	6	1453949	1453954	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020891	C	6	6	1469759	1469764	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
84	NC_020891	G	6	6	1471806	1471811	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020891	G	6	6	1482149	1482154	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020891	C	8	8	1493257	1493264	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
87	NC_020891	C	6	6	1516001	1516006	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
88	NC_020891	G	7	7	1576912	1576918	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020891	G	6	6	1600192	1600197	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020891	G	6	6	1614603	1614608	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020891	G	6	6	1641283	1641288	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020891	C	6	6	1649168	1649173	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
93	NC_020891	C	7	7	1658937	1658943	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
94	NC_020891	G	6	6	1659881	1659886	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020891	C	6	6	1688898	1688903	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
96	NC_020891	C	6	6	1726472	1726477	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
97	NC_020891	G	6	6	1729769	1729774	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020891	C	6	6	1730591	1730596	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
99	NC_020891	C	6	6	1731981	1731986	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
100	NC_020891	G	6	6	1753431	1753436	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020891	C	6	6	1792643	1792648	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
102	NC_020891	C	6	6	1858317	1858322	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
103	NC_020891	C	6	6	1874398	1874403	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
104	NC_020891	G	6	6	1882100	1882105	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020891	G	7	7	1885864	1885870	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020891	C	6	6	1890706	1890711	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
107	NC_020891	G	6	6	1891904	1891909	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020891	C	7	7	1907800	1907806	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
109	NC_020891	G	6	6	1963610	1963615	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020891	G	8	8	1985944	1985951	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020891	C	6	6	2016982	2016987	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
112	NC_020891	C	6	6	2055812	2055817	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
113	NC_020891	C	6	6	2057214	2057219	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
114	NC_020891	G	6	6	2133294	2133299	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020891	G	6	6	2135213	2135218	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020891	C	6	6	2161038	2161043	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
117	NC_020891	G	6	6	2164442	2164447	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020891	C	7	7	2200632	2200638	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
119	NC_020891	C	6	6	2205921	2205926	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
120	NC_020891	C	7	7	2212918	2212924	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
121	NC_020891	G	6	6	2267478	2267483	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020891	C	6	6	2301613	2301618	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
123	NC_020891	C	6	6	2359298	2359303	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
124	NC_020891	G	8	8	2368716	2368723	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020891	G	6	6	2386862	2386867	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020891	G	6	6	2394621	2394626	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020891	C	6	6	2471908	2471913	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
128	NC_020891	C	6	6	2472694	2472699	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
129	NC_020891	C	6	6	2549900	2549905	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
130	NC_020891	C	6	6	2552773	2552778	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
131	NC_020891	G	6	6	2570542	2570547	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020891	G	7	7	2589509	2589515	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020891	G	6	6	2600555	2600560	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020891	C	6	6	2636999	2637004	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
135	NC_020891	G	7	7	2641177	2641183	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020891	C	6	6	2642949	2642954	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
137	NC_020891	C	6	6	2644350	2644355	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
138	NC_020891	G	11	11	2675987	2675997	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020891	C	6	6	2680390	2680395	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
140	NC_020891	G	6	6	2680950	2680955	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020891	C	6	6	2695782	2695787	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
142	NC_020891	C	6	6	2747341	2747346	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
143	NC_020891	G	7	7	2756538	2756544	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020891	G	6	6	2763232	2763237	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020891	G	8	8	2782594	2782601	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020891	G	6	6	2785470	2785475	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020891	G	6	6	2802013	2802018	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020891	C	6	6	2821333	2821338	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
149	NC_020891	C	6	6	2823734	2823739	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
150	NC_020891	C	6	6	2841316	2841321	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
151	NC_020891	C	6	6	2851287	2851292	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.