MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Clostridium stercorarium subsp. stercorarium DSM 8532

Total Repeats: 1038

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020887	TAAAAA	2	12	3413	3424	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	472465463
2	NC_020887	GAGATA	2	12	5115	5126	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	472465465
3	NC_020887	TGATAT	2	12	6406	6417	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020887	ACCATA	2	12	6843	6854	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	472465466
5	NC_020887	ATTGAT	2	12	9351	9362	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	472465468
6	NC_020887	ATGAAA	2	12	10007	10018	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	472465468
7	NC_020887	TTTTAA	2	12	11949	11960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472465471
8	NC_020887	CGTATA	2	12	15713	15724	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	472465473
9	NC_020887	ACAAAT	2	12	23464	23475	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	537432304
10	NC_020887	AGGGAA	2	12	26511	26522	50 %	0 %	50 %	0 %	472465483
11	NC_020887	GGAAAA	2	12	28509	28520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465485
12	NC_020887	TCAAAA	2	12	30985	30996	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_020887	AACATA	2	12	31290	31301	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	472465487
14	NC_020887	AATATA	2	12	31897	31908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020887	TTACAT	2	12	31917	31928	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_020887	CTGTTT	2	12	33305	33316	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	472465489
17	NC_020887	GCCAAA	2	12	38524	38535	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	472465494
18	NC_020887	GATTTT	2	12	39466	39477	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	472465494
19	NC_020887	GATTTT	2	12	39820	39831	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	472465494
20	NC_020887	TACGGA	2	12	41978	41989	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	472465495
21	NC_020887	TCGGTT	2	12	42993	43004	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	472465496
22	NC_020887	CCCATG	2	12	43729	43740	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	472465496
23	NC_020887	TTTATG	2	12	44799	44810	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	472465497
24	NC_020887	TGGGAA	2	12	48355	48366	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	472465500
25	NC_020887	TTGATT	2	12	52102	52113	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	472465503
26	NC_020887	AAACCG	2	12	55771	55782	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	472465507
27	NC_020887	GGATTA	2	12	58487	58498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472465508
28	NC_020887	GTTATT	2	12	58678	58689	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	472465509
29	NC_020887	TCCCGA	2	12	59898	59909	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	472465510
30	NC_020887	AACGGA	2	12	60259	60270	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	472465510
31	NC_020887	CGGCAA	2	12	69355	69366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472465518
32	NC_020887	GCTTCA	2	12	70804	70815	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	472465519
33	NC_020887	TCAATA	2	12	70939	70950	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	472465519
34	NC_020887	ATTTCA	2	12	70981	70992	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	472465519
35	NC_020887	TTTTAT	2	12	74020	74031	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	472465522
36	NC_020887	GGTTTT	2	12	74258	74269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472465522
37	NC_020887	GTTGAG	2	12	86615	86626	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	472465533
38	NC_020887	AATGAA	2	12	86940	86951	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	472465534
39	NC_020887	GTGAAA	2	12	88118	88129	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020887	ACACCC	2	12	91889	91900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472465540
41	NC_020887	ATCCTT	2	12	92289	92300	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	472465540
42	NC_020887	TCAACA	2	12	93055	93066	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	472465541
43	NC_020887	GTTAAA	2	12	95090	95101	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020887	GTTGGT	2	12	96235	96246	0 %	50 %	50 %	0 %	472465543
45	NC_020887	ATTGGC	2	12	96379	96390	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	472465543
46	NC_020887	GGATTT	2	12	98178	98189	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	472465545
47	NC_020887	TTTGGA	2	12	98484	98495	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	472465545
48	NC_020887	GCCTGT	2	12	98517	98528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472465545
49	NC_020887	TGCCAG	2	12	104806	104817	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	472465549
50	NC_020887	AAAGAC	2	12	106835	106846	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_020887	GTCCGT	2	12	108428	108439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472465552
52	NC_020887	GGATCG	2	12	108709	108720	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	472465552
53	NC_020887	GAGGAA	2	12	113232	113243	50 %	0 %	50 %	0 %	472465554
54	NC_020887	CTGAAC	2	12	114856	114867	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	472465556
55	NC_020887	ATCGGT	2	12	117214	117225	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	472465559
56	NC_020887	AAATTA	2	12	119477	119488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020887	AGTGAG	2	12	119849	119860	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020887	TTATTC	2	12	121994	122005	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	472465563
59	NC_020887	TCGCCG	2	12	127168	127179	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	472465567
60	NC_020887	CCGTCG	2	12	127231	127242	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	472465567
61	NC_020887	ATTAAA	2	12	128106	128117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465567
62	NC_020887	CTTCCA	2	12	129079	129090	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	472465568
63	NC_020887	GGAAAA	2	12	137085	137096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465575
64	NC_020887	TAAAAA	2	12	141639	141650	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020887	GACAAG	2	12	142335	142346	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	472465580
66	NC_020887	ATATGT	2	12	143246	143257	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	472465580
67	NC_020887	AAATAC	2	12	146657	146668	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	472465583
68	NC_020887	AACGAA	2	12	147047	147058	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	472465583
69	NC_020887	ATTGCG	2	12	148359	148370	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	537432305
70	NC_020887	GACTTT	2	12	149175	149186	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	537432305
71	NC_020887	ATTAGA	2	12	152087	152098	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	472465586
72	NC_020887	ACAGCA	2	12	153848	153859	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	472465587
73	NC_020887	GAAGAT	2	12	153866	153877	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	472465587
74	NC_020887	GATGTA	2	12	160481	160492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472465594
75	NC_020887	AAAATA	2	12	161593	161604	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	472465595
76	NC_020887	AGAATT	2	12	162210	162221	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	472465595
77	NC_020887	TTGCGG	2	12	183613	183624	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	472465614
78	NC_020887	GCAATG	2	12	183771	183782	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	472465614
79	NC_020887	GTTGCT	2	12	185525	185536	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	472465616
80	NC_020887	GTCAAG	2	12	186248	186259	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	472465616
81	NC_020887	TTCCTT	2	12	187541	187552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472465616
82	NC_020887	ATGGAA	2	12	191282	191293	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020887	GGAAAA	2	12	191636	191647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465619
84	NC_020887	AAAAGG	2	12	193237	193248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465621
85	NC_020887	CTTACC	2	12	201414	201425	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	472465627
86	NC_020887	AGAAAA	2	12	201580	201591	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	472465627
87	NC_020887	GGAAGC	2	12	202025	202036	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	472465628
88	NC_020887	CACCGT	2	12	202373	202384	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	472465628
89	NC_020887	ATTTTT	2	12	205022	205033	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020887	GTTTGA	2	12	206185	206196	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020887	AATCCG	2	12	212023	212034	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	472465634
92	NC_020887	CTCTCA	2	12	212093	212104	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	472465634
93	NC_020887	CAAAAG	2	12	214720	214731	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	472465636
94	NC_020887	GTAAAG	2	12	215054	215065	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	472465636
95	NC_020887	AAATTT	2	12	217382	217393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020887	GTTTTT	2	12	218959	218970	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020887	TTTTTC	2	12	219036	219047	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_020887	CAAAAC	2	12	219711	219722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472465639
99	NC_020887	ATTTTT	2	12	223269	223280	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	472465642
100	NC_020887	CGGAAA	2	12	233987	233998	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	472465651
101	NC_020887	CCTGCA	2	12	234969	234980	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	472465651
102	NC_020887	TCCGTT	2	12	235002	235013	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	472465651
103	NC_020887	ATGCCG	2	12	237358	237369	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	472465653
104	NC_020887	CTGTTA	2	12	238201	238212	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	472465653
105	NC_020887	CGGCAG	2	12	239578	239589	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	472465654
106	NC_020887	TTCAAT	2	12	243157	243168	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	472465658
107	NC_020887	GGATGC	2	12	244538	244549	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	472465658
108	NC_020887	TTTTAT	2	12	244586	244597	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	472465658
109	NC_020887	TCAGGA	2	12	244981	244992	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	472465658
110	NC_020887	AAAATG	2	12	248119	248130	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020887	TCTTAC	2	12	249469	249480	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	472465661
112	NC_020887	CACATT	2	12	249787	249798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472465661
113	NC_020887	AATAAA	2	12	250108	250119	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020887	TGCCAA	2	12	252163	252174	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	472465663
115	NC_020887	ACAGGA	2	12	252874	252885	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	472465663
116	NC_020887	AGTTTA	2	12	253356	253367	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	472465663
117	NC_020887	AGACGA	2	12	253381	253392	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	472465663
118	NC_020887	AATGCA	2	12	255831	255842	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	472465664
119	NC_020887	GAAAAG	2	12	258783	258794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465667
120	NC_020887	TAAAAA	2	12	266175	266186	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	472465676
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233	NC_020887	GCCAAT	2	12	591703	591714	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	472465970
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236	NC_020887	ATAATT	2	12	609384	609395	50 %	50 %	0 %	0 %	472465992
237	NC_020887	AGCGCC	2	12	609776	609787	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	472465992
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355	NC_020887	GTAATT	2	12	995815	995826	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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440	NC_020887	GACGAT	2	12	1236897	1236908	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	472466495
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443	NC_020887	CCTGAG	2	12	1249091	1249102	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	472466504
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450	NC_020887	CCGGTT	2	12	1264857	1264868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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457	NC_020887	TGAGCA	2	12	1284355	1284366	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	472466537
458	NC_020887	CATTGA	2	12	1290522	1290533	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	472466544
459	NC_020887	GAGGCA	2	12	1291895	1291906	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	472466546
460	NC_020887	ATGTCA	2	12	1292948	1292959	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	472466546
461	NC_020887	ATACCC	2	12	1293991	1294002	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	472466547
462	NC_020887	AAAAGA	2	12	1296316	1296327	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
463	NC_020887	GGCAAG	2	12	1297612	1297623	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	472466550
464	NC_020887	TCATTT	2	12	1299376	1299387	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	472466552
465	NC_020887	AAACAG	2	12	1299896	1299907	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	472466552
466	NC_020887	TTCATG	2	12	1304361	1304372	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	472466558
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480	NC_020887	TAAATA	2	12	1351831	1351842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
481	NC_020887	TATATT	2	12	1356524	1356535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_020887	CGGGAA	2	12	1357447	1357458	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	472466611
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484	NC_020887	ATGGCA	2	12	1358778	1358789	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	472466611
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487	NC_020887	TTTGTT	2	12	1362654	1362665	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_020887	GCCATA	2	12	1369720	1369731	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	472466618
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500	NC_020887	CGGGAA	2	12	1384283	1384294	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

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