MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium stercorarium subsp. stercorarium DSM 8532

Total Repeats: 1744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020887	GAACA	2	10	701	710	60 %	0 %	20 %	20 %	472465461
2	NC_020887	AAAAT	2	10	2269	2278	80 %	20 %	0 %	0 %	472465462
3	NC_020887	AAATA	2	10	3190	3199	80 %	20 %	0 %	0 %	472465463
4	NC_020887	CCTTT	2	10	7350	7359	0 %	60 %	0 %	40 %	472465467
5	NC_020887	TTTTA	2	10	7774	7783	20 %	80 %	0 %	0 %	472465467
6	NC_020887	AGAGC	2	10	10458	10467	40 %	0 %	40 %	20 %	472465469
7	NC_020887	ATAAA	2	10	10506	10515	80 %	20 %	0 %	0 %	472465469
8	NC_020887	AGAAA	2	10	10680	10689	80 %	0 %	20 %	0 %	472465469
9	NC_020887	GAAAT	2	10	11779	11788	60 %	20 %	20 %	0 %	472465471
10	NC_020887	GAAAA	2	10	11836	11845	80 %	0 %	20 %	0 %	472465471
11	NC_020887	GGAAA	2	10	11902	11911	60 %	0 %	40 %	0 %	472465471
12	NC_020887	GAAAA	2	10	12841	12850	80 %	0 %	20 %	0 %	472465471
13	NC_020887	AGGAA	2	10	14052	14061	60 %	0 %	40 %	0 %	472465472
14	NC_020887	ATGAA	2	10	18963	18972	60 %	20 %	20 %	0 %	472465477
15	NC_020887	AGCCA	2	10	19844	19853	40 %	0 %	20 %	40 %	472465478
16	NC_020887	AAGTT	2	10	20329	20338	40 %	40 %	20 %	0 %	472465478
17	NC_020887	TTTTC	2	10	20732	20741	0 %	80 %	0 %	20 %	472465478
18	NC_020887	GAAGA	2	10	22476	22485	60 %	0 %	40 %	0 %	537432304
19	NC_020887	ATTGG	2	10	22672	22681	20 %	40 %	40 %	0 %	537432304
20	NC_020887	GGGAA	2	10	23711	23720	40 %	0 %	60 %	0 %	537432304
21	NC_020887	TTCCC	2	10	28200	28209	0 %	40 %	0 %	60 %	472465484
22	NC_020887	ATTTC	2	10	28340	28349	20 %	60 %	0 %	20 %	472465484
23	NC_020887	ATTTC	2	10	30120	30129	20 %	60 %	0 %	20 %	472465486
24	NC_020887	GAGAA	2	10	31376	31385	60 %	0 %	40 %	0 %	472465487
25	NC_020887	TGACT	2	10	31536	31545	20 %	40 %	20 %	20 %	472465487
26	NC_020887	ATTTC	2	10	33077	33086	20 %	60 %	0 %	20 %	472465489
27	NC_020887	GAACA	2	10	34287	34296	60 %	0 %	20 %	20 %	472465490
28	NC_020887	GCAGG	2	10	37958	37967	20 %	0 %	60 %	20 %	472465493
29	NC_020887	AAGTG	2	10	38040	38049	40 %	20 %	40 %	0 %	472465493
30	NC_020887	GGAAT	2	10	40788	40797	40 %	20 %	40 %	0 %	472465494
31	NC_020887	CCGTT	2	10	40901	40910	0 %	40 %	20 %	40 %	472465494
32	NC_020887	GTGAC	2	10	41018	41027	20 %	20 %	40 %	20 %	472465494
33	NC_020887	ATATT	2	10	41168	41177	40 %	60 %	0 %	0 %	472465494
34	NC_020887	GGAAA	2	10	44154	44163	60 %	0 %	40 %	0 %	472465496
35	NC_020887	CCGGC	2	10	46369	46378	0 %	0 %	40 %	60 %	472465498
36	NC_020887	AAGCC	2	10	48751	48760	40 %	0 %	20 %	40 %	472465500
37	NC_020887	GATGA	2	10	51190	51199	40 %	20 %	40 %	0 %	472465502
38	NC_020887	GAAGG	2	10	52280	52289	40 %	0 %	60 %	0 %	472465503
39	NC_020887	GGGAA	2	10	52388	52397	40 %	0 %	60 %	0 %	472465503
40	NC_020887	CCGTT	2	10	52712	52721	0 %	40 %	20 %	40 %	472465503
41	NC_020887	CTTAA	2	10	54129	54138	40 %	40 %	0 %	20 %	472465505
42	NC_020887	ATTGT	2	10	55053	55062	20 %	60 %	20 %	0 %	472465506
43	NC_020887	ATGAT	2	10	55864	55873	40 %	40 %	20 %	0 %	472465507
44	NC_020887	GCTGT	2	10	56634	56643	0 %	40 %	40 %	20 %	472465507
45	NC_020887	ATGCC	2	10	61385	61394	20 %	20 %	20 %	40 %	472465511
46	NC_020887	ACGGA	2	10	61642	61651	40 %	0 %	40 %	20 %	472465512
47	NC_020887	CAGTT	2	10	63710	63719	20 %	40 %	20 %	20 %	472465514
48	NC_020887	CTTTG	2	10	67335	67344	0 %	60 %	20 %	20 %	472465516
49	NC_020887	TGATG	2	10	70432	70441	20 %	40 %	40 %	0 %	472465518
50	NC_020887	CTGAA	2	10	71239	71248	40 %	20 %	20 %	20 %	472465519
51	NC_020887	GGAAG	2	10	77641	77650	40 %	0 %	60 %	0 %	472465523
52	NC_020887	AGTGG	2	10	79242	79251	20 %	20 %	60 %	0 %	472465525
53	NC_020887	GACAG	2	10	81152	81161	40 %	0 %	40 %	20 %	472465527
54	NC_020887	TTTAC	2	10	81446	81455	20 %	60 %	0 %	20 %	472465528
55	NC_020887	GACAG	2	10	82159	82168	40 %	0 %	40 %	20 %	472465528
56	NC_020887	GAAAG	2	10	86569	86578	60 %	0 %	40 %	0 %	472465533
57	NC_020887	GTGAT	2	10	87580	87589	20 %	40 %	40 %	0 %	472465534
58	NC_020887	AAAAC	2	10	87864	87873	80 %	0 %	0 %	20 %	472465535
59	NC_020887	TGATA	2	10	90410	90419	40 %	40 %	20 %	0 %	472465537
60	NC_020887	AAAGG	2	10	90658	90667	60 %	0 %	40 %	0 %	472465538
61	NC_020887	ACGGT	2	10	90756	90765	20 %	20 %	40 %	20 %	472465538
62	NC_020887	GTTTT	2	10	93024	93033	0 %	80 %	20 %	0 %	472465541
63	NC_020887	GTATT	2	10	94676	94685	20 %	60 %	20 %	0 %	472465541
64	NC_020887	CCTGC	2	10	101228	101237	0 %	20 %	20 %	60 %	472465546
65	NC_020887	ATGGA	2	10	101300	101309	40 %	20 %	40 %	0 %	472465546
66	NC_020887	TAAAA	2	10	102785	102794	80 %	20 %	0 %	0 %	472465547
67	NC_020887	ATGTA	2	10	103706	103715	40 %	40 %	20 %	0 %	472465548
68	NC_020887	CTCCC	2	10	107757	107766	0 %	20 %	0 %	80 %	472465552
69	NC_020887	GGGCA	2	10	109963	109972	20 %	0 %	60 %	20 %	472465553
70	NC_020887	CGTAA	2	10	110971	110980	40 %	20 %	20 %	20 %	472465553
71	NC_020887	CAGTG	2	10	112992	113001	20 %	20 %	40 %	20 %	472465554
72	NC_020887	TCAAA	2	10	116847	116856	60 %	20 %	0 %	20 %	472465559
73	NC_020887	GGGTT	2	10	116877	116886	0 %	40 %	60 %	0 %	472465559
74	NC_020887	TAATG	2	10	122759	122768	40 %	40 %	20 %	0 %	472465564
75	NC_020887	TCCTG	2	10	123107	123116	0 %	40 %	20 %	40 %	472465564
76	NC_020887	ACGGA	2	10	124295	124304	40 %	0 %	40 %	20 %	472465566
77	NC_020887	GTTTA	2	10	129125	129134	20 %	60 %	20 %	0 %	472465568
78	NC_020887	TAAAA	2	10	129958	129967	80 %	20 %	0 %	0 %	472465568
79	NC_020887	TAATA	2	10	129988	129997	60 %	40 %	0 %	0 %	472465568
80	NC_020887	TGTAC	2	10	131411	131420	20 %	40 %	20 %	20 %	472465569
81	NC_020887	AAAGA	2	10	132564	132573	80 %	0 %	20 %	0 %	472465570
82	NC_020887	TAAAA	2	10	133177	133186	80 %	20 %	0 %	0 %	472465570
83	NC_020887	GCAAA	2	10	134109	134118	60 %	0 %	20 %	20 %	472465572
84	NC_020887	GGAAA	2	10	139799	139808	60 %	0 %	40 %	0 %	472465578
85	NC_020887	GAAAA	2	10	143461	143470	80 %	0 %	20 %	0 %	472465580
86	NC_020887	AAAGC	2	10	146536	146545	60 %	0 %	20 %	20 %	472465583
87	NC_020887	TTTAT	2	10	147961	147970	20 %	80 %	0 %	0 %	537432305
88	NC_020887	TTTTA	2	10	149739	149748	20 %	80 %	0 %	0 %	537432305
89	NC_020887	GAAAT	2	10	150459	150468	60 %	20 %	20 %	0 %	537432305
90	NC_020887	CATTT	2	10	152117	152126	20 %	60 %	0 %	20 %	472465586
91	NC_020887	GAAAG	2	10	153458	153467	60 %	0 %	40 %	0 %	472465587
92	NC_020887	ATTGC	2	10	155695	155704	20 %	40 %	20 %	20 %	472465589
93	NC_020887	TAGGT	2	10	156752	156761	20 %	40 %	40 %	0 %	472465590
94	NC_020887	TTTTA	2	10	157157	157166	20 %	80 %	0 %	0 %	472465590
95	NC_020887	TAATA	2	10	158475	158484	60 %	40 %	0 %	0 %	472465592
96	NC_020887	TTCTT	2	10	159349	159358	0 %	80 %	0 %	20 %	472465593
97	NC_020887	TTGGT	2	10	160264	160273	0 %	60 %	40 %	0 %	472465594
98	NC_020887	GGAAT	2	10	160348	160357	40 %	20 %	40 %	0 %	472465594
99	NC_020887	TTATA	2	10	160913	160922	40 %	60 %	0 %	0 %	472465594
100	NC_020887	ATGAA	2	10	161611	161620	60 %	20 %	20 %	0 %	472465595
101	NC_020887	ATATT	2	10	162097	162106	40 %	60 %	0 %	0 %	472465595
102	NC_020887	GAAAT	2	10	162343	162352	60 %	20 %	20 %	0 %	472465595
103	NC_020887	TTCTT	2	10	163223	163232	0 %	80 %	0 %	20 %	472465596
104	NC_020887	TATGA	2	10	163239	163248	40 %	40 %	20 %	0 %	472465596
105	NC_020887	GGTAA	2	10	165446	165455	40 %	20 %	40 %	0 %	472465598
106	NC_020887	ATTAA	2	10	166496	166505	60 %	40 %	0 %	0 %	472465599
107	NC_020887	ATTAT	2	10	166883	166892	40 %	60 %	0 %	0 %	472465600
108	NC_020887	TGGGA	2	10	167561	167570	20 %	20 %	60 %	0 %	472465600
109	NC_020887	CAATA	2	10	167843	167852	60 %	20 %	0 %	20 %	472465601
110	NC_020887	AGGGA	2	10	176961	176970	40 %	0 %	60 %	0 %	472465607
111	NC_020887	ATTTG	2	10	177434	177443	20 %	60 %	20 %	0 %	472465607
112	NC_020887	TGTCT	2	10	181369	181378	0 %	60 %	20 %	20 %	472465612
113	NC_020887	TTTTA	2	10	185241	185250	20 %	80 %	0 %	0 %	472465616
114	NC_020887	CACCG	2	10	185546	185555	20 %	0 %	20 %	60 %	472465616
115	NC_020887	AATTT	2	10	188319	188328	40 %	60 %	0 %	0 %	472465616
116	NC_020887	AGAAA	2	10	189667	189676	80 %	0 %	20 %	0 %	472465617
117	NC_020887	TGTTC	2	10	189937	189946	0 %	60 %	20 %	20 %	472465618
118	NC_020887	AAAGC	2	10	192427	192436	60 %	0 %	20 %	20 %	472465620
119	NC_020887	GTTCC	2	10	193796	193805	0 %	40 %	20 %	40 %	472465622
120	NC_020887	TGGAC	2	10	194256	194265	20 %	20 %	40 %	20 %	472465622
121	NC_020887	AAGGG	2	10	195170	195179	40 %	0 %	60 %	0 %	472465623
122	NC_020887	TTTGA	2	10	195780	195789	20 %	60 %	20 %	0 %	472465623
123	NC_020887	GCGCT	2	10	195976	195985	0 %	20 %	40 %	40 %	472465623
124	NC_020887	AAAGC	2	10	196004	196013	60 %	0 %	20 %	20 %	472465623
125	NC_020887	GTTAT	2	10	197165	197174	20 %	60 %	20 %	0 %	472465625
126	NC_020887	TCGGT	2	10	197955	197964	0 %	40 %	40 %	20 %	472465626
127	NC_020887	CCTTT	2	10	209680	209689	0 %	60 %	0 %	40 %	472465632
128	NC_020887	TTTTA	2	10	210104	210113	20 %	80 %	0 %	0 %	472465632
129	NC_020887	CATTC	2	10	211245	211254	20 %	40 %	0 %	40 %	472465633
130	NC_020887	AATCC	2	10	213654	213663	40 %	20 %	0 %	40 %	472465635
131	NC_020887	TGAAA	2	10	220318	220327	60 %	20 %	20 %	0 %	472465639
132	NC_020887	ATGAA	2	10	220689	220698	60 %	20 %	20 %	0 %	472465639
133	NC_020887	CTGTG	2	10	223497	223506	0 %	40 %	40 %	20 %	472465642
134	NC_020887	AATAA	2	10	224111	224120	80 %	20 %	0 %	0 %	472465642
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