MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium stercorarium subsp. stercorarium DSM 8532

Total Repeats: 7017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020887	ACAA	2	8	425	432	75 %	0 %	0 %	25 %	472465461
2	NC_020887	TGTA	2	8	726	733	25 %	50 %	25 %	0 %	472465461
3	NC_020887	GAAA	2	8	1320	1327	75 %	0 %	25 %	0 %	472465461
4	NC_020887	TCTT	2	8	1390	1397	0 %	75 %	0 %	25 %	472465461
5	NC_020887	AGAA	2	8	1477	1484	75 %	0 %	25 %	0 %	472465461
6	NC_020887	GGAA	2	8	1913	1920	50 %	0 %	50 %	0 %	472465462
7	NC_020887	TTTG	2	8	2483	2490	0 %	75 %	25 %	0 %	472465462
8	NC_020887	ATTT	2	8	2826	2833	25 %	75 %	0 %	0 %	472465462
9	NC_020887	AGAT	2	8	3457	3464	50 %	25 %	25 %	0 %	472465463
10	NC_020887	CGTA	2	8	3982	3989	25 %	25 %	25 %	25 %	472465463
11	NC_020887	GTAT	2	8	4435	4442	25 %	50 %	25 %	0 %	472465465
12	NC_020887	TTCA	2	8	4654	4661	25 %	50 %	0 %	25 %	472465465
13	NC_020887	ATGG	2	8	4745	4752	25 %	25 %	50 %	0 %	472465465
14	NC_020887	ACAG	2	8	4783	4790	50 %	0 %	25 %	25 %	472465465
15	NC_020887	TAAT	2	8	5239	5246	50 %	50 %	0 %	0 %	472465465
16	NC_020887	GGAA	2	8	5312	5319	50 %	0 %	50 %	0 %	472465465
17	NC_020887	AAGG	2	8	5519	5526	50 %	0 %	50 %	0 %	472465465
18	NC_020887	GGAG	2	8	5633	5640	25 %	0 %	75 %	0 %	472465465
19	NC_020887	TTGA	2	8	5922	5929	25 %	50 %	25 %	0 %	472465465
20	NC_020887	GAAG	2	8	6054	6061	50 %	0 %	50 %	0 %	472465465
21	NC_020887	ACAA	2	8	6391	6398	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020887	AGTA	2	8	6587	6594	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020887	GATA	2	8	7129	7136	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020887	GTTT	2	8	7755	7762	0 %	75 %	25 %	0 %	472465467
25	NC_020887	TACA	2	8	7866	7873	50 %	25 %	0 %	25 %	472465467
26	NC_020887	CTGC	2	8	8034	8041	0 %	25 %	25 %	50 %	472465467
27	NC_020887	GCGA	2	8	8133	8140	25 %	0 %	50 %	25 %	472465467
28	NC_020887	TAAT	2	8	8602	8609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020887	ATTT	2	8	8744	8751	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020887	ATTA	2	8	8895	8902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020887	TGAA	2	8	10653	10660	50 %	25 %	25 %	0 %	472465469
32	NC_020887	GGTT	2	8	11030	11037	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020887	TAAA	2	8	11264	11271	75 %	25 %	0 %	0 %	472465470
34	NC_020887	AAAG	2	8	11805	11812	75 %	0 %	25 %	0 %	472465471
35	NC_020887	TTTC	2	8	11854	11861	0 %	75 %	0 %	25 %	472465471
36	NC_020887	GGAT	2	8	12114	12121	25 %	25 %	50 %	0 %	472465471
37	NC_020887	ATGA	2	8	12595	12602	50 %	25 %	25 %	0 %	472465471
38	NC_020887	TGGA	2	8	13028	13035	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020887	ATTT	2	8	13298	13305	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020887	TTAT	2	8	13451	13458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020887	GAAG	2	8	14554	14561	50 %	0 %	50 %	0 %	472465472
42	NC_020887	GACA	2	8	14573	14580	50 %	0 %	25 %	25 %	472465472
43	NC_020887	TTCT	2	8	15153	15160	0 %	75 %	0 %	25 %	472465472
44	NC_020887	AAGA	2	8	16155	16162	75 %	0 %	25 %	0 %	472465473
45	NC_020887	CGGC	2	8	18811	18818	0 %	0 %	50 %	50 %	472465477
46	NC_020887	ACCG	2	8	18848	18855	25 %	0 %	25 %	50 %	472465477
47	NC_020887	CCTG	2	8	18894	18901	0 %	25 %	25 %	50 %	472465477
48	NC_020887	AATC	2	8	19033	19040	50 %	25 %	0 %	25 %	472465477
49	NC_020887	AATC	2	8	19048	19055	50 %	25 %	0 %	25 %	472465477
50	NC_020887	TTGC	2	8	19259	19266	0 %	50 %	25 %	25 %	472465477
51	NC_020887	CATC	2	8	19401	19408	25 %	25 %	0 %	50 %	472465477
52	NC_020887	ATAC	2	8	20054	20061	50 %	25 %	0 %	25 %	472465478
53	NC_020887	TTGA	2	8	20134	20141	25 %	50 %	25 %	0 %	472465478
54	NC_020887	TCCG	2	8	20763	20770	0 %	25 %	25 %	50 %	472465478
55	NC_020887	TATT	2	8	20994	21001	25 %	75 %	0 %	0 %	472465478
56	NC_020887	CATA	2	8	21248	21255	50 %	25 %	0 %	25 %	472465478
57	NC_020887	ATGG	2	8	22571	22578	25 %	25 %	50 %	0 %	537432304
58	NC_020887	GAAA	2	8	22642	22649	75 %	0 %	25 %	0 %	537432304
59	NC_020887	AAGG	2	8	22854	22861	50 %	0 %	50 %	0 %	537432304
60	NC_020887	CCAA	2	8	22869	22876	50 %	0 %	0 %	50 %	537432304
61	NC_020887	CATG	2	8	23126	23133	25 %	25 %	25 %	25 %	537432304
62	NC_020887	ACGC	2	8	23447	23454	25 %	0 %	25 %	50 %	537432304
63	NC_020887	ATAA	2	8	23799	23806	75 %	25 %	0 %	0 %	537432304
64	NC_020887	CCGA	2	8	24140	24147	25 %	0 %	25 %	50 %	472465480
65	NC_020887	AAAC	2	8	24709	24716	75 %	0 %	0 %	25 %	472465480
66	NC_020887	ATTA	2	8	25311	25318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020887	GATG	2	8	26087	26094	25 %	25 %	50 %	0 %	472465482
68	NC_020887	GAAA	2	8	26148	26155	75 %	0 %	25 %	0 %	472465482
69	NC_020887	GTGA	2	8	26191	26198	25 %	25 %	50 %	0 %	472465482
70	NC_020887	GGAA	2	8	27024	27031	50 %	0 %	50 %	0 %	472465483
71	NC_020887	GAAA	2	8	27270	27277	75 %	0 %	25 %	0 %	472465483
72	NC_020887	AGGA	2	8	27766	27773	50 %	0 %	50 %	0 %	472465483
73	NC_020887	GAAT	2	8	27917	27924	50 %	25 %	25 %	0 %	472465484
74	NC_020887	CTTC	2	8	28597	28604	0 %	50 %	0 %	50 %	472465485
75	NC_020887	CAGG	2	8	29064	29071	25 %	0 %	50 %	25 %	472465485
76	NC_020887	ACAG	2	8	30214	30221	50 %	0 %	25 %	25 %	472465486
77	NC_020887	AAAG	2	8	31042	31049	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020887	TAAA	2	8	31057	31064	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020887	TCTT	2	8	31410	31417	0 %	75 %	0 %	25 %	472465487
80	NC_020887	TAAA	2	8	31771	31778	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020887	ACAG	2	8	32276	32283	50 %	0 %	25 %	25 %	472465488
82	NC_020887	TGGA	2	8	33019	33026	25 %	25 %	50 %	0 %	472465489
83	NC_020887	AGGA	2	8	33129	33136	50 %	0 %	50 %	0 %	472465489
84	NC_020887	CTTC	2	8	33192	33199	0 %	50 %	0 %	50 %	472465489
85	NC_020887	GTAT	2	8	33423	33430	25 %	50 %	25 %	0 %	472465489
86	NC_020887	TGGT	2	8	33841	33848	0 %	50 %	50 %	0 %	472465490
87	NC_020887	GGAA	2	8	33952	33959	50 %	0 %	50 %	0 %	472465490
88	NC_020887	TCCC	2	8	34024	34031	0 %	25 %	0 %	75 %	472465490
89	NC_020887	GGCG	2	8	34931	34938	0 %	0 %	75 %	25 %	472465491
90	NC_020887	GGTA	2	8	35393	35400	25 %	25 %	50 %	0 %	472465491
91	NC_020887	TTGA	2	8	36153	36160	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020887	TAAA	2	8	36404	36411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020887	CAAA	2	8	37785	37792	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_020887	CCTG	2	8	39018	39025	0 %	25 %	25 %	50 %	472465494
95	NC_020887	GAGG	2	8	39142	39149	25 %	0 %	75 %	0 %	472465494
96	NC_020887	CAAA	2	8	39365	39372	75 %	0 %	0 %	25 %	472465494
97	NC_020887	ATCC	2	8	39700	39707	25 %	25 %	0 %	50 %	472465494
98	NC_020887	CAGA	2	8	40034	40041	50 %	0 %	25 %	25 %	472465494
99	NC_020887	CAGA	2	8	40119	40126	50 %	0 %	25 %	25 %	472465494
100	NC_020887	ACGA	2	8	40420	40427	50 %	0 %	25 %	25 %	472465494
101	NC_020887	TCCT	2	8	42081	42088	0 %	50 %	0 %	50 %	472465495
102	NC_020887	TCCT	2	8	42486	42493	0 %	50 %	0 %	50 %	472465495
103	NC_020887	GCAT	2	8	43119	43126	25 %	25 %	25 %	25 %	472465496
104	NC_020887	CGGC	2	8	43427	43434	0 %	0 %	50 %	50 %	472465496
105	NC_020887	GGCA	2	8	43496	43503	25 %	0 %	50 %	25 %	472465496
106	NC_020887	ATTC	2	8	44179	44186	25 %	50 %	0 %	25 %	472465496
107	NC_020887	CCGG	2	8	44815	44822	0 %	0 %	50 %	50 %	472465497
108	NC_020887	AGGA	2	8	44880	44887	50 %	0 %	50 %	0 %	472465497
109	NC_020887	TTTG	2	8	45316	45323	0 %	75 %	25 %	0 %	472465498
110	NC_020887	TGAA	2	8	46548	46555	50 %	25 %	25 %	0 %	472465498
111	NC_020887	TGAG	2	8	46581	46588	25 %	25 %	50 %	0 %	472465498
112	NC_020887	ATGA	2	8	47263	47270	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020887	GAAT	2	8	47532	47539	50 %	25 %	25 %	0 %	472465499
114	NC_020887	AGGA	2	8	47555	47562	50 %	0 %	50 %	0 %	472465499
115	NC_020887	CGGG	2	8	47760	47767	0 %	0 %	75 %	25 %	472465499
116	NC_020887	TAAA	2	8	48484	48491	75 %	25 %	0 %	0 %	472465500
117	NC_020887	TAAA	2	8	48996	49003	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020887	AGGA	2	8	49717	49724	50 %	0 %	50 %	0 %	472465501
119	NC_020887	ATAA	2	8	49791	49798	75 %	25 %	0 %	0 %	472465501
120	NC_020887	TTAG	2	8	50094	50101	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020887	TCCC	2	8	51134	51141	0 %	25 %	0 %	75 %	472465502
122	NC_020887	GGGA	2	8	51488	51495	25 %	0 %	75 %	0 %	472465502
123	NC_020887	GAAA	2	8	52002	52009	75 %	0 %	25 %	0 %	472465503
124	NC_020887	CCGG	2	8	52572	52579	0 %	0 %	50 %	50 %	472465503
125	NC_020887	AATA	2	8	52643	52650	75 %	25 %	0 %	0 %	472465503
126	NC_020887	TATT	2	8	53619	53626	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020887	AAAG	2	8	53649	53656	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020887	TGAA	2	8	53896	53903	50 %	25 %	25 %	0 %	472465505
129	NC_020887	TTAA	2	8	53934	53941	50 %	50 %	0 %	0 %	472465505
130	NC_020887	GAGG	2	8	53969	53976	25 %	0 %	75 %	0 %	472465505
131	NC_020887	AAAT	2	8	54074	54081	75 %	25 %	0 %	0 %	472465505
132	NC_020887	CGTG	2	8	54507	54514	0 %	25 %	50 %	25 %	472465506
133	NC_020887	TTCC	2	8	54648	54655	0 %	50 %	0 %	50 %	472465506
134	NC_020887	GTTG	2	8	54964	54971	0 %	50 %	50 %	0 %	472465506
135	NC_020887	AGGG	2	8	55226	55233	25 %	0 %	75 %	0 %	472465506
136	NC_020887	AAGG	2	8	56625	56632	50 %	0 %	50 %	0 %	472465507
137	NC_020887	TGAT	2	8	56740	56747	25 %	50 %	25 %	0 %	472465507
138	NC_020887	AAAT	2	8	56896	56903	75 %	25 %	0 %	0 %	472465507
139	NC_020887	ACGC	2	8	58628	58635	25 %	0 %	25 %	50 %	472465509
140	NC_020887	TGGG	2	8	58831	58838	0 %	25 %	75 %	0 %	472465509
141	NC_020887	AGGA	2	8	59816	59823	50 %	0 %	50 %	0 %	472465510
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