MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 6674

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020834	TAAC	2	8	376	383	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020834	TTAC	2	8	1036	1043	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_020834	TTTA	2	8	1912	1919	25 %	75 %	0 %	0 %	472335240
4	NC_020834	TCAA	2	8	2189	2196	50 %	25 %	0 %	25 %	472335240
5	NC_020834	ATGT	2	8	2212	2219	25 %	50 %	25 %	0 %	472335241
6	NC_020834	ATCA	2	8	2342	2349	50 %	25 %	0 %	25 %	472335241
7	NC_020834	AGCA	2	8	2652	2659	50 %	0 %	25 %	25 %	472335241
8	NC_020834	ATTG	2	8	2728	2735	25 %	50 %	25 %	0 %	472335241
9	NC_020834	AAAT	2	8	2764	2771	75 %	25 %	0 %	0 %	472335241
10	NC_020834	TTGC	2	8	3189	3196	0 %	50 %	25 %	25 %	472335241
11	NC_020834	ATTA	2	8	3477	3484	50 %	50 %	0 %	0 %	472335241
12	NC_020834	TTAA	2	8	4182	4189	50 %	50 %	0 %	0 %	472335242
13	NC_020834	ACAA	2	8	4376	4383	75 %	0 %	0 %	25 %	472335242
14	NC_020834	AAAG	2	8	4406	4413	75 %	0 %	25 %	0 %	472335242
15	NC_020834	ATTC	2	8	4473	4480	25 %	50 %	0 %	25 %	472335242
16	NC_020834	TAAA	2	8	4717	4724	75 %	25 %	0 %	0 %	472335242
17	NC_020834	AATG	2	8	5517	5524	50 %	25 %	25 %	0 %	472335242
18	NC_020834	TAGA	2	8	5683	5690	50 %	25 %	25 %	0 %	472335242
19	NC_020834	ATGT	2	8	6192	6199	25 %	50 %	25 %	0 %	472335242
20	NC_020834	TACC	2	8	6985	6992	25 %	25 %	0 %	50 %	472335243
21	NC_020834	AAGC	2	8	7026	7033	50 %	0 %	25 %	25 %	472335243
22	NC_020834	TAGA	2	8	7132	7139	50 %	25 %	25 %	0 %	472335243
23	NC_020834	TTTC	2	8	7276	7283	0 %	75 %	0 %	25 %	472335244
24	NC_020834	TTAT	2	8	7334	7341	25 %	75 %	0 %	0 %	472335244
25	NC_020834	ATTA	2	8	7512	7519	50 %	50 %	0 %	0 %	472335244
26	NC_020834	ATAA	2	8	7729	7736	75 %	25 %	0 %	0 %	472335244
27	NC_020834	AAAT	2	8	8025	8032	75 %	25 %	0 %	0 %	472335244
28	NC_020834	TTTA	2	8	8213	8220	25 %	75 %	0 %	0 %	472335244
29	NC_020834	TGTA	2	8	8303	8310	25 %	50 %	25 %	0 %	472335244
30	NC_020834	ATTA	2	8	9589	9596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020834	CAAT	2	8	10637	10644	50 %	25 %	0 %	25 %	472335246
32	NC_020834	GTTC	2	8	10996	11003	0 %	50 %	25 %	25 %	472335247
33	NC_020834	ATTA	2	8	11358	11365	50 %	50 %	0 %	0 %	472335247
34	NC_020834	AATT	2	8	11549	11556	50 %	50 %	0 %	0 %	472335247
35	NC_020834	TTTA	2	8	11816	11823	25 %	75 %	0 %	0 %	472335247
36	NC_020834	AATT	2	8	12046	12053	50 %	50 %	0 %	0 %	472335248
37	NC_020834	TTGG	2	8	12379	12386	0 %	50 %	50 %	0 %	472335248
38	NC_020834	GTAA	2	8	12779	12786	50 %	25 %	25 %	0 %	472335249
39	NC_020834	TAAT	2	8	14051	14058	50 %	50 %	0 %	0 %	472335250
40	NC_020834	GTAA	2	8	14135	14142	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020834	TAAA	2	8	14712	14719	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020834	AAAT	2	8	14723	14730	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020834	ATTT	2	8	15091	15098	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020834	GTGC	2	8	15389	15396	0 %	25 %	50 %	25 %	472335252
45	NC_020834	AACC	2	8	16176	16183	50 %	0 %	0 %	50 %	472335252
46	NC_020834	AAGA	2	8	16539	16546	75 %	0 %	25 %	0 %	472335252
47	NC_020834	AAGC	2	8	16632	16639	50 %	0 %	25 %	25 %	472335252
48	NC_020834	CAAG	2	8	16720	16727	50 %	0 %	25 %	25 %	472335252
49	NC_020834	GGCA	2	8	16911	16918	25 %	0 %	50 %	25 %	472335252
50	NC_020834	GGTT	2	8	17020	17027	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020834	GCTT	2	8	17359	17366	0 %	50 %	25 %	25 %	472335254
52	NC_020834	AAAT	2	8	17377	17384	75 %	25 %	0 %	0 %	472335254
53	NC_020834	AGTT	2	8	17407	17414	25 %	50 %	25 %	0 %	472335254
54	NC_020834	CTGC	2	8	18009	18016	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020834	ATTT	2	8	18091	18098	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020834	ACTT	2	8	18345	18352	25 %	50 %	0 %	25 %	472335255
57	NC_020834	AAGC	2	8	18458	18465	50 %	0 %	25 %	25 %	472335255
58	NC_020834	TCTA	2	8	18678	18685	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_020834	TACT	2	8	19232	19239	25 %	50 %	0 %	25 %	472335257
60	NC_020834	TCTT	2	8	19394	19401	0 %	75 %	0 %	25 %	472335257
61	NC_020834	TGGT	2	8	19419	19426	0 %	50 %	50 %	0 %	472335257
62	NC_020834	ACTA	2	8	19470	19477	50 %	25 %	0 %	25 %	472335257
63	NC_020834	TGGT	2	8	20012	20019	0 %	50 %	50 %	0 %	472335257
64	NC_020834	ATTG	2	8	20263	20270	25 %	50 %	25 %	0 %	472335258
65	NC_020834	TAAC	2	8	20394	20401	50 %	25 %	0 %	25 %	472335258
66	NC_020834	TCAC	2	8	20410	20417	25 %	25 %	0 %	50 %	472335258
67	NC_020834	GAAA	2	8	20584	20591	75 %	0 %	25 %	0 %	472335258
68	NC_020834	ATTC	2	8	20607	20614	25 %	50 %	0 %	25 %	472335258
69	NC_020834	GCTG	2	8	20722	20729	0 %	25 %	50 %	25 %	472335258
70	NC_020834	CACT	2	8	21774	21781	25 %	25 %	0 %	50 %	472335259
71	NC_020834	AACT	2	8	23592	23599	50 %	25 %	0 %	25 %	472335261
72	NC_020834	TCCT	2	8	24336	24343	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_020834	TTAT	2	8	24353	24360	25 %	75 %	0 %	0 %	472335262
74	NC_020834	GTTT	2	8	25007	25014	0 %	75 %	25 %	0 %	472335262
75	NC_020834	CATA	2	8	25482	25489	50 %	25 %	0 %	25 %	472335262
76	NC_020834	CGGT	2	8	25508	25515	0 %	25 %	50 %	25 %	472335262
77	NC_020834	TCAA	2	8	25636	25643	50 %	25 %	0 %	25 %	472335262
78	NC_020834	GCAC	2	8	25669	25676	25 %	0 %	25 %	50 %	472335262
79	NC_020834	AGAA	2	8	26019	26026	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020834	AGCT	2	8	26179	26186	25 %	25 %	25 %	25 %	472335263
81	NC_020834	ATTT	2	8	26437	26444	25 %	75 %	0 %	0 %	472335263
82	NC_020834	TCAA	2	8	26785	26792	50 %	25 %	0 %	25 %	472335263
83	NC_020834	ATGA	2	8	26844	26851	50 %	25 %	25 %	0 %	472335263
84	NC_020834	GACG	2	8	26973	26980	25 %	0 %	50 %	25 %	472335263
85	NC_020834	TATT	2	8	27723	27730	25 %	75 %	0 %	0 %	472335263
86	NC_020834	AAGC	2	8	27767	27774	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_020834	TGTT	2	8	27998	28005	0 %	75 %	25 %	0 %	472335264
88	NC_020834	GTTT	2	8	28697	28704	0 %	75 %	25 %	0 %	472335266
89	NC_020834	TTAA	2	8	28933	28940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020834	GCTT	2	8	29685	29692	0 %	50 %	25 %	25 %	472335267
91	NC_020834	CCTG	2	8	30463	30470	0 %	25 %	25 %	50 %	472335267
92	NC_020834	CAAT	2	8	30559	30566	50 %	25 %	0 %	25 %	472335267
93	NC_020834	GACC	2	8	31228	31235	25 %	0 %	25 %	50 %	472335268
94	NC_020834	ATTT	2	8	31643	31650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020834	GTTG	2	8	32454	32461	0 %	50 %	50 %	0 %	472335269
96	NC_020834	GTCC	2	8	32619	32626	0 %	25 %	25 %	50 %	472335269
97	NC_020834	CCAA	2	8	33020	33027	50 %	0 %	0 %	50 %	472335270
98	NC_020834	AGTA	2	8	33035	33042	50 %	25 %	25 %	0 %	472335270
99	NC_020834	CATA	2	8	33198	33205	50 %	25 %	0 %	25 %	472335270
100	NC_020834	ACCA	2	8	33233	33240	50 %	0 %	0 %	50 %	472335270
101	NC_020834	GATA	2	8	33781	33788	50 %	25 %	25 %	0 %	472335270
102	NC_020834	GTTT	2	8	33817	33824	0 %	75 %	25 %	0 %	472335270
103	NC_020834	GAGG	2	8	33880	33887	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020834	GGAG	2	8	33907	33914	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020834	GACT	2	8	34039	34046	25 %	25 %	25 %	25 %	472335271
106	NC_020834	TCAA	2	8	35185	35192	50 %	25 %	0 %	25 %	472335271
107	NC_020834	ATCA	2	8	36310	36317	50 %	25 %	0 %	25 %	472335272
108	NC_020834	GGAG	2	8	36668	36675	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020834	TGGT	2	8	36990	36997	0 %	50 %	50 %	0 %	472335273
110	NC_020834	TGGT	2	8	37167	37174	0 %	50 %	50 %	0 %	472335273
111	NC_020834	ATCA	2	8	37367	37374	50 %	25 %	0 %	25 %	472335273
112	NC_020834	CACG	2	8	37441	37448	25 %	0 %	25 %	50 %	472335273
113	NC_020834	TGCC	2	8	38011	38018	0 %	25 %	25 %	50 %	472335274
114	NC_020834	CAGC	2	8	38192	38199	25 %	0 %	25 %	50 %	472335274
115	NC_020834	AAAC	2	8	38299	38306	75 %	0 %	0 %	25 %	472335274
116	NC_020834	TGCC	2	8	38486	38493	0 %	25 %	25 %	50 %	472335274
117	NC_020834	CAAG	2	8	39031	39038	50 %	0 %	25 %	25 %	472335274
118	NC_020834	GAAA	2	8	39042	39049	75 %	0 %	25 %	0 %	472335274
119	NC_020834	CCAA	2	8	39379	39386	50 %	0 %	0 %	50 %	472335275
120	NC_020834	TTAG	2	8	42206	42213	25 %	50 %	25 %	0 %	472335280
121	NC_020834	GGCT	2	8	42889	42896	0 %	25 %	50 %	25 %	472335280
122	NC_020834	GTTT	2	8	42993	43000	0 %	75 %	25 %	0 %	472335280
123	NC_020834	GCCC	2	8	45136	45143	0 %	0 %	25 %	75 %	472335280
124	NC_020834	GGTC	2	8	45241	45248	0 %	25 %	50 %	25 %	472335280
125	NC_020834	AAAT	2	8	45551	45558	75 %	25 %	0 %	0 %	472335281
126	NC_020834	GGCT	2	8	45580	45587	0 %	25 %	50 %	25 %	472335281
127	NC_020834	TTTC	2	8	46756	46763	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_020834	TAAA	2	8	46950	46957	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020834	TGGT	2	8	47359	47366	0 %	50 %	50 %	0 %	472335282
130	NC_020834	CATT	2	8	48030	48037	25 %	50 %	0 %	25 %	472335283
131	NC_020834	ATAG	2	8	49653	49660	50 %	25 %	25 %	0 %	472335286
132	NC_020834	TGAT	2	8	49702	49709	25 %	50 %	25 %	0 %	472335286
133	NC_020834	GTGA	2	8	49836	49843	25 %	25 %	50 %	0 %	472335287
134	NC_020834	AAGC	2	8	50565	50572	50 %	0 %	25 %	25 %	472335287
135	NC_020834	TCTA	2	8	50644	50651	25 %	50 %	0 %	25 %	472335287
136	NC_020834	GCGT	2	8	50669	50676	0 %	25 %	50 %	25 %	472335287
137	NC_020834	ATTT	2	8	51620	51627	25 %	75 %	0 %	0 %	472335288
138	NC_020834	GAAA	2	8	51648	51655	75 %	0 %	25 %	0 %	472335288
139	NC_020834	CAAG	2	8	52150	52157	50 %	0 %	25 %	25 %	472335288
140	NC_020834	GAAT	2	8	52164	52171	50 %	25 %	25 %	0 %	472335288
141	NC_020834	GAAC	2	8	52847	52854	50 %	0 %	25 %	25 %	472335289
142	NC_020834	TGGT	2	8	53263	53270	0 %	50 %	50 %	0 %	472335289
143	NC_020834	AGTG	2	8	53654	53661	25 %	25 %	50 %	0 %	472335290
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