MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 2909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020834	CA	3	6	139	144	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020834	CT	4	8	472	479	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020834	TC	3	6	1901	1906	0 %	50 %	0 %	50 %	472335240
4	NC_020834	GA	3	6	1922	1927	50 %	0 %	50 %	0 %	472335240
5	NC_020834	GA	3	6	2003	2008	50 %	0 %	50 %	0 %	472335240
6	NC_020834	TC	3	6	2177	2182	0 %	50 %	0 %	50 %	472335240
7	NC_020834	TA	3	6	4255	4260	50 %	50 %	0 %	0 %	472335242
8	NC_020834	GA	3	6	6761	6766	50 %	0 %	50 %	0 %	472335243
9	NC_020834	TA	4	8	7443	7450	50 %	50 %	0 %	0 %	472335244
10	NC_020834	AT	3	6	7470	7475	50 %	50 %	0 %	0 %	472335244
11	NC_020834	AT	3	6	7493	7498	50 %	50 %	0 %	0 %	472335244
12	NC_020834	TA	3	6	7556	7561	50 %	50 %	0 %	0 %	472335244
13	NC_020834	AT	3	6	8249	8254	50 %	50 %	0 %	0 %	472335244
14	NC_020834	TA	3	6	8371	8376	50 %	50 %	0 %	0 %	472335244
15	NC_020834	AT	3	6	8842	8847	50 %	50 %	0 %	0 %	472335245
16	NC_020834	AG	3	6	8880	8885	50 %	0 %	50 %	0 %	472335245
17	NC_020834	AT	3	6	9319	9324	50 %	50 %	0 %	0 %	472335245
18	NC_020834	TA	3	6	9493	9498	50 %	50 %	0 %	0 %	472335245
19	NC_020834	CT	3	6	9525	9530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_020834	AT	3	6	9879	9884	50 %	50 %	0 %	0 %	472335246
21	NC_020834	AT	3	6	11097	11102	50 %	50 %	0 %	0 %	472335247
22	NC_020834	AG	3	6	11950	11955	50 %	0 %	50 %	0 %	472335247
23	NC_020834	TG	3	6	12003	12008	0 %	50 %	50 %	0 %	472335248
24	NC_020834	AT	3	6	12140	12145	50 %	50 %	0 %	0 %	472335248
25	NC_020834	TG	3	6	12726	12731	0 %	50 %	50 %	0 %	472335248
26	NC_020834	TC	4	8	13166	13173	0 %	50 %	0 %	50 %	472335249
27	NC_020834	AG	3	6	14316	14321	50 %	0 %	50 %	0 %	472335251
28	NC_020834	TA	3	6	14981	14986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020834	AT	3	6	15112	15117	50 %	50 %	0 %	0 %	472335252
30	NC_020834	GT	3	6	16395	16400	0 %	50 %	50 %	0 %	472335252
31	NC_020834	AT	3	6	17106	17111	50 %	50 %	0 %	0 %	472335253
32	NC_020834	TA	3	6	18201	18206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020834	CT	3	6	20278	20283	0 %	50 %	0 %	50 %	472335258
34	NC_020834	AC	3	6	20291	20296	50 %	0 %	0 %	50 %	472335258
35	NC_020834	AT	3	6	22279	22284	50 %	50 %	0 %	0 %	472335260
36	NC_020834	AG	3	6	22305	22310	50 %	0 %	50 %	0 %	472335260
37	NC_020834	TG	3	6	22311	22316	0 %	50 %	50 %	0 %	472335260
38	NC_020834	CT	3	6	26001	26006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020834	GA	3	6	26390	26395	50 %	0 %	50 %	0 %	472335263
40	NC_020834	TG	3	6	27354	27359	0 %	50 %	50 %	0 %	472335263
41	NC_020834	GT	3	6	30572	30577	0 %	50 %	50 %	0 %	472335267
42	NC_020834	CT	3	6	31569	31574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_020834	AC	3	6	33711	33716	50 %	0 %	0 %	50 %	472335270
44	NC_020834	CT	4	8	33958	33965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_020834	TC	4	8	33997	34004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_020834	CT	3	6	34801	34806	0 %	50 %	0 %	50 %	472335271
47	NC_020834	AG	3	6	35124	35129	50 %	0 %	50 %	0 %	472335271
48	NC_020834	TC	3	6	36255	36260	0 %	50 %	0 %	50 %	472335272
49	NC_020834	TC	3	6	36627	36632	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_020834	GA	3	6	38841	38846	50 %	0 %	50 %	0 %	472335274
51	NC_020834	AG	3	6	40415	40420	50 %	0 %	50 %	0 %	472335278
52	NC_020834	TC	3	6	41385	41390	0 %	50 %	0 %	50 %	472335279
53	NC_020834	CT	3	6	44232	44237	0 %	50 %	0 %	50 %	472335280
54	NC_020834	GT	3	6	44419	44424	0 %	50 %	50 %	0 %	472335280
55	NC_020834	GT	3	6	44682	44687	0 %	50 %	50 %	0 %	472335280
56	NC_020834	CT	3	6	45419	45424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_020834	AC	3	6	45497	45502	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_020834	TA	3	6	46138	46143	50 %	50 %	0 %	0 %	472335281
59	NC_020834	AT	3	6	46800	46805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020834	AC	4	8	46883	46890	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_020834	TG	3	6	47084	47089	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020834	AT	3	6	47542	47547	50 %	50 %	0 %	0 %	472335283
63	NC_020834	TA	3	6	51851	51856	50 %	50 %	0 %	0 %	472335288
64	NC_020834	GA	3	6	53984	53989	50 %	0 %	50 %	0 %	472335290
65	NC_020834	GT	3	6	54834	54839	0 %	50 %	50 %	0 %	472335291
66	NC_020834	GT	3	6	55580	55585	0 %	50 %	50 %	0 %	472335292
67	NC_020834	TC	3	6	56552	56557	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_020834	AG	3	6	57538	57543	50 %	0 %	50 %	0 %	472335295
69	NC_020834	CA	3	6	59787	59792	50 %	0 %	0 %	50 %	472335297
70	NC_020834	CA	3	6	60969	60974	50 %	0 %	0 %	50 %	472335298
71	NC_020834	CT	3	6	61418	61423	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_020834	GA	3	6	63289	63294	50 %	0 %	50 %	0 %	472335302
73	NC_020834	CT	3	6	64036	64041	0 %	50 %	0 %	50 %	472335304
74	NC_020834	TG	3	6	64090	64095	0 %	50 %	50 %	0 %	472335304
75	NC_020834	TC	3	6	65031	65036	0 %	50 %	0 %	50 %	472335305
76	NC_020834	AG	3	6	65509	65514	50 %	0 %	50 %	0 %	472335306
77	NC_020834	TC	3	6	66144	66149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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79	NC_020834	AC	3	6	66468	66473	50 %	0 %	0 %	50 %	472335307
80	NC_020834	AG	3	6	66904	66909	50 %	0 %	50 %	0 %	472335308
81	NC_020834	AG	3	6	68376	68381	50 %	0 %	50 %	0 %	472335310
82	NC_020834	CA	3	6	68541	68546	50 %	0 %	0 %	50 %	472335310
83	NC_020834	AG	3	6	69733	69738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020834	TC	3	6	69932	69937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_020834	AC	3	6	70220	70225	50 %	0 %	0 %	50 %	472335312
86	NC_020834	TA	3	6	72334	72339	50 %	50 %	0 %	0 %	472335315
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88	NC_020834	TG	3	6	75146	75151	0 %	50 %	50 %	0 %	472335317
89	NC_020834	TA	3	6	75317	75322	50 %	50 %	0 %	0 %	472335317
90	NC_020834	AG	3	6	77271	77276	50 %	0 %	50 %	0 %	472335318
91	NC_020834	AT	3	6	77886	77891	50 %	50 %	0 %	0 %	472335318
92	NC_020834	GT	3	6	78399	78404	0 %	50 %	50 %	0 %	472335318
93	NC_020834	GA	3	6	79644	79649	50 %	0 %	50 %	0 %	472335320
94	NC_020834	AG	3	6	79847	79852	50 %	0 %	50 %	0 %	472335320
95	NC_020834	GA	3	6	80629	80634	50 %	0 %	50 %	0 %	472335321
96	NC_020834	GT	3	6	83150	83155	0 %	50 %	50 %	0 %	472335324
97	NC_020834	TC	3	6	84485	84490	0 %	50 %	0 %	50 %	472335325
98	NC_020834	CA	3	6	85100	85105	50 %	0 %	0 %	50 %	472335325
99	NC_020834	CA	3	6	85195	85200	50 %	0 %	0 %	50 %	472335325
100	NC_020834	GA	4	8	87036	87043	50 %	0 %	50 %	0 %	472335328
101	NC_020834	AG	3	6	87291	87296	50 %	0 %	50 %	0 %	472335328
102	NC_020834	AG	4	8	87411	87418	50 %	0 %	50 %	0 %	472335328
103	NC_020834	CA	3	6	87822	87827	50 %	0 %	0 %	50 %	472335328
104	NC_020834	TA	3	6	89326	89331	50 %	50 %	0 %	0 %	472335329
105	NC_020834	CT	4	8	90747	90754	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020834	AG	4	8	90784	90791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020834	CA	3	6	91021	91026	50 %	0 %	0 %	50 %	472335332
108	NC_020834	AT	3	6	91097	91102	50 %	50 %	0 %	0 %	472335332
109	NC_020834	TG	3	6	92129	92134	0 %	50 %	50 %	0 %	472335332
110	NC_020834	AG	3	6	92272	92277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020834	AG	4	8	92308	92315	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020834	GA	3	6	92331	92336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020834	TA	3	6	92434	92439	50 %	50 %	0 %	0 %	472335333
114	NC_020834	CA	3	6	92612	92617	50 %	0 %	0 %	50 %	472335333
115	NC_020834	CA	3	6	94022	94027	50 %	0 %	0 %	50 %	472335333
116	NC_020834	TG	3	6	94750	94755	0 %	50 %	50 %	0 %	472335335
117	NC_020834	AT	3	6	95103	95108	50 %	50 %	0 %	0 %	472335335
118	NC_020834	AT	3	6	95278	95283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020834	GA	3	6	96019	96024	50 %	0 %	50 %	0 %	472335336
120	NC_020834	CA	3	6	96540	96545	50 %	0 %	0 %	50 %	472335336
121	NC_020834	CA	3	6	97083	97088	50 %	0 %	0 %	50 %	472335336
122	NC_020834	GT	3	6	102162	102167	0 %	50 %	50 %	0 %	472335339
123	NC_020834	TA	3	6	102336	102341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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125	NC_020834	AT	3	6	104258	104263	50 %	50 %	0 %	0 %	472335343
126	NC_020834	GT	3	6	105811	105816	0 %	50 %	50 %	0 %	472335345
127	NC_020834	GA	4	8	105821	105828	50 %	0 %	50 %	0 %	472335345
128	NC_020834	GT	3	6	107123	107128	0 %	50 %	50 %	0 %	472335347
129	NC_020834	TA	3	6	108181	108186	50 %	50 %	0 %	0 %	472335348
130	NC_020834	AT	3	6	109314	109319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020834	TC	4	8	109792	109799	0 %	50 %	0 %	50 %	472335350
132	NC_020834	AG	3	6	109867	109872	50 %	0 %	50 %	0 %	472335350
133	NC_020834	AC	3	6	111326	111331	50 %	0 %	0 %	50 %	472335352
134	NC_020834	TC	3	6	111557	111562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020834	AC	3	6	113779	113784	50 %	0 %	0 %	50 %	472335356
136	NC_020834	GA	3	6	115414	115419	50 %	0 %	50 %	0 %	472335358
137	NC_020834	CT	3	6	118315	118320	0 %	50 %	0 %	50 %	472335362
138	NC_020834	TA	3	6	118532	118537	50 %	50 %	0 %	0 %	472335362
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141	NC_020834	GA	3	6	118683	118688	50 %	0 %	50 %	0 %	472335362
142	NC_020834	AT	3	6	119726	119731	50 %	50 %	0 %	0 %	472335364
143	NC_020834	GA	3	6	120481	120486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020834	TC	3	6	120548	120553	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_020834	GT	3	6	121153	121158	0 %	50 %	50 %	0 %	472335366
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