MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 1018

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020833	GGGT	2	8	2308	2315	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020833	CAAA	2	8	2493	2500	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_020833	TTAT	2	8	6938	6945	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020833	GCCA	2	8	13276	13283	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020833	GTTT	2	8	13630	13637	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020833	AAAT	2	8	13700	13707	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020833	TTTA	2	8	25128	25135	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020833	CTCC	2	8	35369	35376	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_020833	CTCC	2	8	38130	38137	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_020833	AAAT	2	8	40394	40401	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020833	ACAA	2	8	41437	41444	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020833	TTTA	2	8	42984	42991	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020833	TTAA	2	8	43002	43009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020833	TTAA	2	8	43104	43111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020833	GCTT	2	8	44270	44277	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020833	TTCT	2	8	46018	46025	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_020833	AGGA	2	8	47701	47708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020833	AAAT	2	8	54700	54707	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020833	GCAG	2	8	54782	54789	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020833	AACC	2	8	55771	55778	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020833	ATTT	2	8	58067	58074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020833	TTTA	2	8	58078	58085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020833	TTAC	2	8	58654	58661	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_020833	TAAT	2	8	63195	63202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020833	TAAT	2	8	63239	63246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020833	GTAA	2	8	70757	70764	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020833	TAAA	2	8	75524	75531	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020833	AATT	2	8	81106	81113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020833	CAAC	2	8	85299	85306	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_020833	ACCA	3	12	85392	85403	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_020833	CAAC	3	12	85404	85415	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_020833	AACC	8	32	85416	85447	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020833	ACTT	2	8	90238	90245	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_020833	TTGA	2	8	91256	91263	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020833	CTTT	2	8	91317	91324	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_020833	TGAA	2	8	91802	91809	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020833	AGGG	2	8	92060	92067	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020833	GCCT	2	8	93172	93179	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020833	GCGA	2	8	93786	93793	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_020833	GGTG	2	8	94488	94495	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020833	AAAG	2	8	94623	94630	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020833	GCTG	2	8	95300	95307	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_020833	TGCC	2	8	95367	95374	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_020833	AAGC	2	8	95872	95879	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_020833	GACA	2	8	95890	95897	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_020833	AATC	2	8	96500	96507	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_020833	ATTT	2	8	96719	96726	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020833	TGAT	2	8	96785	96792	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020833	CCTG	2	8	96940	96947	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_020833	CCGT	2	8	96975	96982	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_020833	GATT	2	8	100744	100751	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020833	TTTA	2	8	100783	100790	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020833	GAAA	2	8	103875	103882	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020833	GGTA	2	8	104738	104745	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020833	AATA	2	8	105490	105497	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020833	TAGA	2	8	114066	114073	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020833	TCTA	2	8	114100	114107	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_020833	TTAT	2	8	118366	118373	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020833	AGTA	2	8	119335	119342	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020833	CTTT	3	12	119384	119395	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_020833	ACAA	2	8	123455	123462	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_020833	ATTT	2	8	128864	128871	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020833	CAAT	2	8	128920	128927	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_020833	ATTT	2	8	137849	137856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020833	TGAA	2	8	137931	137938	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020833	TTTC	2	8	146574	146581	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_020833	TTGA	2	8	150397	150404	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020833	CTTT	2	8	150458	150465	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_020833	TGAA	2	8	150943	150950	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020833	AGGG	2	8	151201	151208	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020833	ATGA	2	8	152125	152132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020833	GCGA	2	8	152811	152818	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_020833	GGTG	2	8	153513	153520	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020833	AAAG	2	8	153648	153655	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020833	GCTG	2	8	154325	154332	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_020833	TGCC	2	8	154392	154399	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_020833	AAGC	2	8	154897	154904	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_020833	GACA	2	8	154915	154922	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_020833	AATC	2	8	155525	155532	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_020833	ATTT	2	8	155744	155751	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020833	TGAT	2	8	155810	155817	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020833	CCTG	2	8	155965	155972	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020833	CCGT	2	8	156000	156007	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_020833	TTAA	2	8	156238	156245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020833	GAAA	2	8	160711	160718	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020833	ATCC	2	8	163097	163104	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020833	ATTG	2	8	163194	163201	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020833	ATTT	2	8	163338	163345	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020833	TAAA	2	8	168638	168645	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020833	AATT	2	8	170593	170600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020833	GTAA	2	8	170644	170651	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020833	ACAA	2	8	174669	174676	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_020833	AATA	2	8	174726	174733	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020833	ATAG	2	8	180298	180305	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020833	TAAA	2	8	182341	182348	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020833	AAAT	2	8	182371	182378	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020833	TATT	2	8	186287	186294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020833	TCAT	2	8	190530	190537	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_020833	GTAG	2	8	190666	190673	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020833	AAAT	2	8	194006	194013	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020833	AAAG	2	8	196373	196380	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020833	CAGA	2	8	197183	197190	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_020833	GATT	2	8	200513	200520	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020833	ATTT	2	8	200724	200731	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020833	GCAG	2	8	207690	207697	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_020833	TGAA	2	8	209370	209377	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020833	TTCT	2	8	209519	209526	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_020833	AATT	2	8	211699	211706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020833	AATA	2	8	213609	213616	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020833	CCCG	2	8	217537	217544	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
111	NC_020833	ACAG	2	8	221203	221210	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_020833	ATTT	2	8	222263	222270	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020833	AAGT	2	8	227062	227069	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020833	TTGA	2	8	244360	244367	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020833	CTTT	2	8	247365	247372	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_020833	ATTT	2	8	257584	257591	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020833	TTGA	2	8	257644	257651	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020833	CTTT	2	8	257705	257712	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_020833	TGAA	2	8	258190	258197	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020833	AGGG	2	8	258448	258455	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020833	GCCT	2	8	259560	259567	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_020833	GCGA	2	8	260174	260181	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_020833	GGTG	2	8	260876	260883	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020833	AAAG	2	8	261011	261018	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020833	GCTG	2	8	261688	261695	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_020833	TGCC	2	8	261755	261762	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_020833	AAGC	2	8	262260	262267	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_020833	GACA	2	8	262278	262285	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_020833	AATC	2	8	262888	262895	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_020833	AAGA	2	8	263200	263207	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020833	GACA	2	8	264542	264549	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_020833	GACA	2	8	269666	269673	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_020833	AGCG	2	8	271535	271542	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_020833	ATTT	2	8	275795	275802	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020833	ATTT	2	8	278590	278597	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020833	ATTT	2	8	281242	281249	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020833	ATTT	2	8	281272	281279	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020833	TCGC	2	8	285857	285864	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_020833	ATAC	2	8	285968	285975	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_020833	AACA	2	8	288551	288558	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_020833	CTTT	2	8	289065	289072	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_020833	ATTA	2	8	289354	289361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020833	AAAT	2	8	290366	290373	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020833	TGAG	2	8	292063	292070	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020833	TTGA	2	8	293790	293797	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020833	CTTT	2	8	293851	293858	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_020833	TGAA	2	8	294336	294343	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020833	AGGG	2	8	294594	294601	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020833	ATGA	2	8	295518	295525	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020833	GCGA	2	8	296204	296211	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_020833	GGTG	2	8	296906	296913	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020833	AAAG	2	8	297041	297048	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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