MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 3055

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020833	GT	3	6	1902	1907	0 %	50 %	50 %	0 %	472332509
2	NC_020833	GA	3	6	2190	2195	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020833	TC	3	6	2388	2393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020833	GT	3	6	3580	3585	0 %	50 %	50 %	0 %	472332511
5	NC_020833	CT	3	6	3746	3751	0 %	50 %	0 %	50 %	472332511
6	NC_020833	CT	3	6	5218	5223	0 %	50 %	0 %	50 %	472332513
7	NC_020833	GT	3	6	5654	5659	0 %	50 %	50 %	0 %	472332514
8	NC_020833	TG	3	6	5842	5847	0 %	50 %	50 %	0 %	472332514
9	NC_020833	AG	3	6	5971	5976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020833	CT	3	6	6607	6612	0 %	50 %	0 %	50 %	472332515
11	NC_020833	AG	3	6	7084	7089	50 %	0 %	50 %	0 %	472332516
12	NC_020833	CA	3	6	8026	8031	50 %	0 %	0 %	50 %	472332517
13	NC_020833	AG	3	6	8080	8085	50 %	0 %	50 %	0 %	472332517
14	NC_020833	CT	3	6	8826	8831	0 %	50 %	0 %	50 %	472332519
15	NC_020833	GA	3	6	10697	10702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020833	GT	3	6	11146	11151	0 %	50 %	50 %	0 %	472332523
17	NC_020833	TG	3	6	12329	12334	0 %	50 %	50 %	0 %	472332524
18	NC_020833	TC	3	6	14541	14546	0 %	50 %	0 %	50 %	472332526
19	NC_020833	GA	3	6	15528	15533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020833	AC	3	6	16500	16505	50 %	0 %	0 %	50 %	472332529
21	NC_020833	CA	3	6	17245	17250	50 %	0 %	0 %	50 %	472332530
22	NC_020833	TC	3	6	18096	18101	0 %	50 %	0 %	50 %	472332532
23	NC_020833	TA	3	6	20229	20234	50 %	50 %	0 %	0 %	472332534
24	NC_020833	AT	3	6	24538	24543	50 %	50 %	0 %	0 %	472332539
25	NC_020833	CA	3	6	24996	25001	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_020833	GT	4	8	25195	25202	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020833	AT	3	6	25280	25285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020833	TA	3	6	25942	25947	50 %	50 %	0 %	0 %	472332541
29	NC_020833	TG	3	6	26582	26587	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020833	AG	3	6	26661	26666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020833	AC	3	6	27398	27403	50 %	0 %	0 %	50 %	472332542
32	NC_020833	AC	3	6	27661	27666	50 %	0 %	0 %	50 %	472332542
33	NC_020833	AG	3	6	27848	27853	50 %	0 %	50 %	0 %	472332542
34	NC_020833	GA	3	6	30695	30700	50 %	0 %	50 %	0 %	472332543
35	NC_020833	CT	3	6	31665	31670	0 %	50 %	0 %	50 %	472332544
36	NC_020833	TC	3	6	33198	33203	0 %	50 %	0 %	50 %	472332547
37	NC_020833	GA	3	6	35412	35417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020833	GA	3	6	35784	35789	50 %	0 %	50 %	0 %	472332549
39	NC_020833	CT	3	6	36915	36920	0 %	50 %	0 %	50 %	472332550
40	NC_020833	AG	3	6	37238	37243	50 %	0 %	50 %	0 %	472332550
41	NC_020833	GA	4	8	38040	38047	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020833	AG	4	8	38079	38086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020833	TG	3	6	38327	38332	0 %	50 %	50 %	0 %	472332551
44	NC_020833	AG	3	6	40470	40475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020833	AC	3	6	41467	41472	50 %	0 %	0 %	50 %	472332554
46	NC_020833	CA	3	6	44685	44690	50 %	0 %	0 %	50 %	472332558
47	NC_020833	TC	3	6	45649	45654	0 %	50 %	0 %	50 %	472332558
48	NC_020833	AG	3	6	46038	46043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020833	CA	3	6	49728	49733	50 %	0 %	0 %	50 %	472332561
50	NC_020833	CT	3	6	49734	49739	0 %	50 %	0 %	50 %	472332561
51	NC_020833	AT	3	6	49760	49765	50 %	50 %	0 %	0 %	472332561
52	NC_020833	GT	3	6	50011	50016	0 %	50 %	50 %	0 %	472332561
53	NC_020833	GT	3	6	51976	51981	0 %	50 %	50 %	0 %	472332563
54	NC_020833	AG	3	6	51989	51994	50 %	0 %	50 %	0 %	472332563
55	NC_020833	AG	3	6	53890	53895	50 %	0 %	50 %	0 %	472332565
56	NC_020833	TA	3	6	54592	54597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020833	AT	3	6	55687	55692	50 %	50 %	0 %	0 %	472332567
58	NC_020833	AC	3	6	56398	56403	50 %	0 %	0 %	50 %	472332568
59	NC_020833	AG	3	6	57767	57772	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020833	TA	3	6	57811	57816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020833	CT	3	6	58475	58480	0 %	50 %	0 %	50 %	472332569
62	NC_020833	CA	3	6	60060	60065	50 %	0 %	0 %	50 %	472332572
63	NC_020833	TA	3	6	60645	60650	50 %	50 %	0 %	0 %	472332572
64	NC_020833	CA	3	6	60783	60788	50 %	0 %	0 %	50 %	472332572
65	NC_020833	CT	3	6	60836	60841	0 %	50 %	0 %	50 %	472332573
66	NC_020833	AT	3	6	61689	61694	50 %	50 %	0 %	0 %	472332573
67	NC_020833	AC	3	6	62277	62282	50 %	0 %	0 %	50 %	472332574
68	NC_020833	AT	3	6	62907	62912	50 %	50 %	0 %	0 %	472332574
69	NC_020833	AG	3	6	63275	63280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020833	TA	3	6	63307	63312	50 %	50 %	0 %	0 %	472332575
71	NC_020833	AT	3	6	63481	63486	50 %	50 %	0 %	0 %	472332575
72	NC_020833	TC	3	6	64417	64422	0 %	50 %	0 %	50 %	472332576
73	NC_020833	AT	3	6	64903	64908	50 %	50 %	0 %	0 %	472332576
74	NC_020833	AT	3	6	65026	65031	50 %	50 %	0 %	0 %	472332576
75	NC_020833	GC	3	6	65154	65159	0 %	0 %	50 %	50 %	472332577
76	NC_020833	TC	3	6	65375	65380	0 %	50 %	0 %	50 %	472332577
77	NC_020833	TA	3	6	65737	65742	50 %	50 %	0 %	0 %	472332577
78	NC_020833	TA	3	6	65887	65892	50 %	50 %	0 %	0 %	472332577
79	NC_020833	TA	3	6	65939	65944	50 %	50 %	0 %	0 %	472332577
80	NC_020833	TA	4	8	66264	66271	50 %	50 %	0 %	0 %	472332578
81	NC_020833	TA	3	6	66741	66746	50 %	50 %	0 %	0 %	472332578
82	NC_020833	AC	3	6	67055	67060	50 %	0 %	0 %	50 %	472332578
83	NC_020833	CA	3	6	68337	68342	50 %	0 %	0 %	50 %	472332579
84	NC_020833	GA	3	6	69618	69623	50 %	0 %	50 %	0 %	472332580
85	NC_020833	TC	3	6	69792	69797	0 %	50 %	0 %	50 %	472332580
86	NC_020833	CT	3	6	69872	69877	0 %	50 %	0 %	50 %	472332580
87	NC_020833	GA	3	6	69894	69899	50 %	0 %	50 %	0 %	472332580
88	NC_020833	TA	3	6	70112	70117	50 %	50 %	0 %	0 %	472332580
89	NC_020833	AG	4	8	71321	71328	50 %	0 %	50 %	0 %	472332581
90	NC_020833	TG	3	6	71656	71661	0 %	50 %	50 %	0 %	472332581
91	NC_020833	TA	3	6	71923	71928	50 %	50 %	0 %	0 %	472332581
92	NC_020833	AT	3	6	72846	72851	50 %	50 %	0 %	0 %	472332581
93	NC_020833	AT	3	6	72910	72915	50 %	50 %	0 %	0 %	472332581
94	NC_020833	AT	3	6	73419	73424	50 %	50 %	0 %	0 %	472332582
95	NC_020833	CA	3	6	74279	74284	50 %	0 %	0 %	50 %	472332582
96	NC_020833	AT	3	6	74594	74599	50 %	50 %	0 %	0 %	472332583
97	NC_020833	AT	3	6	75166	75171	50 %	50 %	0 %	0 %	472332583
98	NC_020833	GA	3	6	75266	75271	50 %	0 %	50 %	0 %	472332583
99	NC_020833	AT	3	6	76704	76709	50 %	50 %	0 %	0 %	472332584
100	NC_020833	TG	3	6	79629	79634	0 %	50 %	50 %	0 %	472332587
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102	NC_020833	AT	3	6	83137	83142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020833	AG	3	6	83969	83974	50 %	0 %	50 %	0 %	472332592
104	NC_020833	AG	3	6	85142	85147	50 %	0 %	50 %	0 %	472332592
105	NC_020833	AC	17	34	85308	85341	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020833	AC	4	8	85343	85350	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_020833	AC	5	10	85362	85371	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_020833	AC	4	8	85374	85381	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_020833	CA	5	10	85382	85391	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_020833	GA	3	6	85555	85560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020833	TA	3	6	86044	86049	50 %	50 %	0 %	0 %	472332593
112	NC_020833	TA	3	6	87165	87170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020833	TG	3	6	87518	87523	0 %	50 %	50 %	0 %	472332595
114	NC_020833	CT	3	6	87891	87896	0 %	50 %	0 %	50 %	472332595
115	NC_020833	AG	3	6	90194	90199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020833	CA	3	6	91146	91151	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_020833	TG	3	6	91233	91238	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020833	AC	3	6	92620	92625	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_020833	AC	3	6	92789	92794	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_020833	CA	3	6	92965	92970	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_020833	GA	3	6	93357	93362	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020833	TG	3	6	93708	93713	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020833	AC	3	6	94482	94487	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_020833	GA	3	6	95187	95192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020833	GT	3	6	96336	96341	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020833	GT	3	6	96377	96382	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020833	TC	3	6	97247	97252	0 %	50 %	0 %	50 %	472332600
128	NC_020833	TC	3	6	98971	98976	0 %	50 %	0 %	50 %	472332601
129	NC_020833	AG	3	6	99546	99551	50 %	0 %	50 %	0 %	472332602
130	NC_020833	CA	3	6	101388	101393	50 %	0 %	0 %	50 %	472332603
131	NC_020833	GA	3	6	102760	102765	50 %	0 %	50 %	0 %	472332606
132	NC_020833	TG	3	6	106388	106393	0 %	50 %	50 %	0 %	472332610
133	NC_020833	CA	3	6	106944	106949	50 %	0 %	0 %	50 %	472332610
134	NC_020833	CG	3	6	107743	107748	0 %	0 %	50 %	50 %	472332610
135	NC_020833	AT	3	6	109697	109702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020833	AG	3	6	110805	110810	50 %	0 %	50 %	0 %	472332613
137	NC_020833	AT	3	6	111875	111880	50 %	50 %	0 %	0 %	472332614
138	NC_020833	AG	4	8	113579	113586	50 %	0 %	50 %	0 %	472332615
139	NC_020833	GT	3	6	113784	113789	0 %	50 %	50 %	0 %	472332616
140	NC_020833	AT	3	6	114500	114505	50 %	50 %	0 %	0 %	472332617
141	NC_020833	AT	3	6	114542	114547	50 %	50 %	0 %	0 %	472332617
142	NC_020833	TG	4	8	115589	115596	0 %	50 %	50 %	0 %	472332618
143	NC_020833	GA	4	8	116484	116491	50 %	0 %	50 %	0 %	472332619
144	NC_020833	TA	3	6	117591	117596	50 %	50 %	0 %	0 %	472332620
145	NC_020833	CT	3	6	118738	118743	0 %	50 %	0 %	50 %	472332621
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