MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum TV

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020831	GGATT	2	10	9157	9166	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020831	AAAGT	2	10	9366	9375	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020831	TATTT	2	10	11846	11855	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020831	ATTTT	2	10	17012	17021	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020831	ATTAT	2	10	45070	45079	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020831	TATTT	2	10	62185	62194	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020831	TTCTC	2	10	68615	68624	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_020831	TATAT	2	10	76926	76935	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020831	TTCAA	2	10	86945	86954	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_020831	TAATA	2	10	103195	103204	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020831	TTATT	2	10	112704	112713	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020831	CCTTT	2	10	113108	113117	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_020831	TTTTA	2	10	146995	147004	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020831	TATAA	2	10	147357	147366	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020831	TATAT	2	10	206326	206335	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020831	TATAA	2	10	227053	227062	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020831	TATTT	2	10	227104	227113	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020831	AGAAT	2	10	234720	234729	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020831	ATATT	2	10	262449	262458	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.