MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum TV

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020831	TTTA	2	8	1894	1901	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020831	CAAC	2	8	9256	9263	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020831	TAAA	2	8	17691	17698	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020831	TAAT	2	8	22050	22057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020831	ATTT	2	8	34709	34716	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020831	TAGG	2	8	36617	36624	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020831	ATTA	2	8	44981	44988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020831	ATAA	2	8	48318	48325	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020831	ATAA	2	8	48330	48337	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020831	AATT	2	8	49465	49472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020831	AATG	2	8	54017	54024	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020831	TTTA	2	8	61830	61837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020831	TTTA	2	8	61962	61969	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020831	TGTA	2	8	62237	62244	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020831	ATTT	2	8	79211	79218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020831	TTGT	2	8	86474	86481	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020831	CTTT	2	8	87734	87741	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_020831	GTCA	2	8	88381	88388	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_020831	TCGC	2	8	88563	88570	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_020831	ATTC	2	8	88675	88682	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_020831	TCAT	2	8	90017	90024	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020831	ATTA	2	8	92805	92812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020831	AACT	2	8	99732	99739	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_020831	CTTT	2	8	103206	103213	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_020831	ATTA	2	8	103236	103243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020831	TTTA	2	8	103268	103275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020831	TTTC	2	8	103282	103289	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_020831	ATTT	2	8	114727	114734	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020831	TCTT	2	8	115138	115145	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020831	AATT	2	8	145212	145219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020831	CTTC	2	8	147079	147086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_020831	CTTT	2	8	166754	166761	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_020831	GATA	2	8	178117	178124	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020831	AATA	2	8	180811	180818	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020831	AAAC	2	8	184918	184925	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_020831	CTAT	2	8	187824	187831	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_020831	GTAT	2	8	192693	192700	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020831	ATAA	2	8	199418	199425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020831	ATTA	2	8	199475	199482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020831	ATTT	2	8	201787	201794	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020831	GTTT	2	8	204658	204665	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020831	TTTA	2	8	211032	211039	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020831	CAAA	2	8	211041	211048	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_020831	ATTT	2	8	211072	211079	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020831	ATTT	2	8	215058	215065	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020831	AAAT	2	8	220526	220533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020831	TAAT	2	8	221391	221398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020831	AAAT	2	8	221491	221498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020831	TTTA	2	8	223427	223434	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020831	ATTT	2	8	241229	241236	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020831	ATTT	2	8	252696	252703	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020831	TAAA	2	8	255555	255562	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020831	GTAG	2	8	278914	278921	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020831	TTAA	2	8	279410	279417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020831	TTTA	2	8	279455	279462	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020831	AACT	2	8	280031	280038	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.