MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum TV

Total Repeats: 234

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020831	ATA	2	6	9127	9132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020831	CAC	2	6	9306	9311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_020831	CTG	2	6	9314	9319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020831	CAA	2	6	9335	9340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020831	TAA	3	9	9397	9405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020831	ATT	2	6	9418	9423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020831	ATA	2	6	9482	9487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020831	TTA	2	6	9492	9497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020831	TAA	2	6	9498	9503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020831	TAT	2	6	11343	11348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020831	ATT	2	6	11353	11358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020831	TAT	2	6	11364	11369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020831	GAT	2	6	11856	11861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020831	AAT	2	6	17655	17660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020831	ATA	2	6	21164	21169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020831	ATT	2	6	21962	21967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020831	TTA	2	6	22002	22007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020831	AAT	2	6	22034	22039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020831	ATT	2	6	28171	28176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020831	TTA	2	6	29460	29465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020831	ATT	2	6	34731	34736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020831	AAT	2	6	34737	34742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020831	TAT	2	6	34754	34759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020831	AAT	2	6	39940	39945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020831	CTT	2	6	44725	44730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020831	ATG	2	6	45114	45119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020831	TAT	2	6	45122	45127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020831	TAA	2	6	45164	45169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020831	AAT	2	6	49453	49458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020831	TTA	2	6	52068	52073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020831	ATA	2	6	52077	52082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020831	ATT	2	6	61206	61211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020831	ATT	2	6	61788	61793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020831	TTC	2	6	61821	61826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020831	CTT	2	6	61874	61879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020831	TTA	2	6	61897	61902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020831	ATT	2	6	61956	61961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020831	ATT	2	6	62009	62014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020831	TAA	2	6	62037	62042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020831	TAA	2	6	62096	62101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020831	TTC	2	6	62259	62264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020831	AAC	2	6	62273	62278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020831	TGA	2	6	62306	62311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020831	TAC	2	6	62334	62339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_020831	AGT	2	6	62354	62359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020831	TAA	2	6	62362	62367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020831	AAT	2	6	62402	62407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020831	ATA	2	6	68658	68663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020831	TCA	2	6	68701	68706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_020831	TAT	2	6	68717	68722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020831	ATA	2	6	71493	71498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020831	TAT	2	6	73737	73742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020831	ATT	2	6	73750	73755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020831	TTA	2	6	73768	73773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020831	TTA	2	6	76880	76885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020831	ATA	2	6	76906	76911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020831	CAA	2	6	80253	80258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_020831	TTA	2	6	80382	80387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020831	TTA	2	6	85771	85776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020831	TAC	2	6	85825	85830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020831	CCA	2	6	85883	85888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_020831	CAG	2	6	86087	86092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020831	AGC	2	6	86184	86189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_020831	TCT	2	6	86190	86195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020831	ACG	2	6	86238	86243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020831	TGA	2	6	86318	86323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020831	CCG	2	6	86346	86351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_020831	ACC	2	6	86434	86439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_020831	CTC	2	6	86553	86558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_020831	AGG	2	6	86570	86575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020831	CAC	2	6	86598	86603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_020831	ATA	2	6	86647	86652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020831	ATA	2	6	86728	86733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020831	CAT	2	6	86852	86857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020831	GCC	2	6	86927	86932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_020831	TAA	2	6	87043	87048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020831	ACC	2	6	87202	87207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_020831	TTA	2	6	87308	87313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020831	CGG	2	6	87520	87525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_020831	CTC	2	6	87624	87629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_020831	GCT	2	6	87750	87755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_020831	CCT	2	6	87766	87771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_020831	TGC	2	6	87889	87894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_020831	GAG	2	6	88006	88011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020831	GGA	2	6	88404	88409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020831	TTC	2	6	88420	88425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020831	TAA	2	6	88467	88472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020831	ACT	2	6	88572	88577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_020831	CCA	2	6	88789	88794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_020831	CTT	2	6	88929	88934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_020831	TCA	2	6	88935	88940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020831	AGG	2	6	88958	88963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020831	GTA	2	6	89029	89034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020831	ATG	2	6	89293	89298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020831	CGT	2	6	89305	89310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_020831	TCC	2	6	89319	89324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_020831	CAG	2	6	89335	89340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020831	GAC	2	6	89433	89438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_020831	GCA	2	6	89445	89450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_020831	TTC	2	6	89521	89526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020831	TCC	2	6	89784	89789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_020831	ACC	2	6	89910	89915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_020831	GCT	2	6	89974	89979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_020831	CTT	2	6	89999	90004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_020831	TTC	2	6	90049	90054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_020831	CTT	2	6	90085	90090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_020831	CTG	2	6	90144	90149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_020831	ATC	2	6	90194	90199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_020831	ATC	2	6	90269	90274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_020831	CGC	2	6	90406	90411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_020831	ATG	2	6	90426	90431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020831	GCC	2	6	90458	90463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_020831	GAA	2	6	90523	90528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020831	TTA	3	9	92810	92818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020831	TTA	2	6	95738	95743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020831	TCA	2	6	95777	95782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_020831	AAT	2	6	95785	95790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020831	TAT	2	6	95837	95842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020831	ATC	2	6	95849	95854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_020831	ATA	2	6	95855	95860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020831	AAC	2	6	97304	97309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_020831	ACT	2	6	98966	98971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_020831	TAT	2	6	114109	114114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020831	CTA	2	6	117305	117310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_020831	CTA	2	6	118815	118820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_020831	AAG	2	6	119532	119537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020831	CTT	2	6	120349	120354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_020831	AAC	2	6	134014	134019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_020831	CTC	2	6	138112	138117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_020831	AGG	2	6	140399	140404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020831	GCT	2	6	140438	140443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_020831	AAC	2	6	140555	140560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_020831	ATC	2	6	140576	140581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_020831	TAA	2	6	147016	147021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020831	TAA	2	6	147057	147062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020831	CTT	2	6	147112	147117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_020831	TAA	2	6	151500	151505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020831	ATC	2	6	156061	156066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_020831	ATA	2	6	158975	158980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020831	TTC	2	6	159080	159085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.