MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-8 DNA

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020828	ATT	2	6	1983	1988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279774
2	NC_020828	AAC	2	6	2035	2040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279774
3	NC_020828	AAT	2	6	2073	2078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279774
4	NC_020828	GAT	2	6	2088	2093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279774
5	NC_020828	GTA	2	6	2140	2145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279774
6	NC_020828	TTG	2	6	2194	2199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279774
7	NC_020828	CTT	2	6	2253	2258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279774
8	NC_020828	AAT	2	6	2259	2264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279774
9	NC_020828	AAC	2	6	2357	2362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279774
10	NC_020828	AGA	2	6	2384	2389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279774
11	NC_020828	AGA	2	6	2471	2476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279774
12	NC_020828	AAG	2	6	2782	2787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279774
13	NC_020828	TGA	2	6	2847	2852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279775
14	NC_020828	CAA	2	6	3004	3009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279775
15	NC_020828	CAA	2	6	3036	3041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279775
16	NC_020828	AAT	2	6	3046	3051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279775
17	NC_020828	AAG	2	6	3069	3074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279775
18	NC_020828	TAC	2	6	3114	3119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279775
19	NC_020828	CAA	2	6	3127	3132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279775
20	NC_020828	CAA	3	9	3163	3171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279775
21	NC_020828	AAC	2	6	3180	3185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279775
22	NC_020828	AGA	2	6	3189	3194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279775
23	NC_020828	AGA	2	6	3282	3287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279775
24	NC_020828	TGG	2	6	3319	3324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279775
25	NC_020828	GAT	2	6	3685	3690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279776
26	NC_020828	TGA	2	6	3709	3714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279776
27	NC_020828	TAT	2	6	3943	3948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279776
28	NC_020828	ATT	3	9	4021	4029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279776
29	NC_020828	TAC	2	6	4967	4972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279777
30	NC_020828	GTG	2	6	5076	5081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279777
31	NC_020828	CAA	2	6	5232	5237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279777
32	NC_020828	TAG	2	6	5280	5285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279777
33	NC_020828	TGC	2	6	5734	5739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279778
34	NC_020828	TCA	2	6	5767	5772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279778
35	NC_020828	AGC	2	6	5789	5794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279778
36	NC_020828	AGT	2	6	5816	5821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279778
37	NC_020828	CTT	2	6	5847	5852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279778
38	NC_020828	AGT	2	6	5861	5866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279778
39	NC_020828	CTA	2	6	5886	5891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279778
40	NC_020828	CTA	2	6	5895	5900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279778
41	NC_020828	CAA	2	6	5903	5908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279778
42	NC_020828	TTC	2	6	5914	5919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279778
43	NC_020828	AGT	2	6	5930	5935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279778
44	NC_020828	CAG	2	6	5946	5951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279778
45	NC_020828	TAC	2	6	5962	5967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279778
46	NC_020828	TCT	2	6	6376	6381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279779
47	NC_020828	ATC	2	6	6657	6662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279779
48	NC_020828	ATA	2	6	6663	6668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279779
49	NC_020828	TTC	2	6	6766	6771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279779
50	NC_020828	TTA	2	6	6856	6861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279779
51	NC_020828	TCT	2	6	7003	7008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279779
52	NC_020828	TGT	2	6	7041	7046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279779
53	NC_020828	ATC	2	6	7065	7070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279779
54	NC_020828	ATC	2	6	7074	7079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279779
55	NC_020828	ACT	2	6	7098	7103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279779
56	NC_020828	ATA	2	6	7171	7176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279779
57	NC_020828	ATC	2	6	7260	7265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279779

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.