MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-6 DNA

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020827	CTAT	2	8	927	934	25 %	50 %	0 %	25 %	472279763
2	NC_020827	CTTT	2	8	1490	1497	0 %	75 %	0 %	25 %	472279764
3	NC_020827	TCCC	2	8	1749	1756	0 %	25 %	0 %	75 %	472279765
4	NC_020827	TGCC	2	8	2102	2109	0 %	25 %	25 %	50 %	472279765
5	NC_020827	CTGT	2	8	2555	2562	0 %	50 %	25 %	25 %	472279765
6	NC_020827	CAAA	2	8	3155	3162	75 %	0 %	0 %	25 %	472279765
7	NC_020827	GTAA	2	8	3234	3241	50 %	25 %	25 %	0 %	472279765
8	NC_020827	TCTA	2	8	3636	3643	25 %	50 %	0 %	25 %	472279765
9	NC_020827	CTGA	2	8	3818	3825	25 %	25 %	25 %	25 %	472279765
10	NC_020827	TAAA	2	8	5094	5101	75 %	25 %	0 %	0 %	472279766
11	NC_020827	ATGA	2	8	5592	5599	50 %	25 %	25 %	0 %	472279767
12	NC_020827	GTTT	2	8	7205	7212	0 %	75 %	25 %	0 %	472279769
13	NC_020827	CAAC	2	8	7374	7381	50 %	0 %	0 %	50 %	472279769
14	NC_020827	TATT	2	8	7598	7605	25 %	75 %	0 %	0 %	472279769
15	NC_020827	CCGA	2	8	8163	8170	25 %	0 %	25 %	50 %	472279769
16	NC_020827	CAAC	2	8	9079	9086	50 %	0 %	0 %	50 %	472279770
17	NC_020827	TCTA	2	8	10542	10549	25 %	50 %	0 %	25 %	472279771
18	NC_020827	TTAT	2	8	10564	10571	25 %	75 %	0 %	0 %	472279771
19	NC_020827	ATTA	2	8	10794	10801	50 %	50 %	0 %	0 %	472279771
20	NC_020827	TACA	2	8	10960	10967	50 %	25 %	0 %	25 %	472279771
21	NC_020827	AGAA	2	8	11100	11107	75 %	0 %	25 %	0 %	472279772
22	NC_020827	TCAA	2	8	11137	11144	50 %	25 %	0 %	25 %	472279772
23	NC_020827	AATT	2	8	11201	11208	50 %	50 %	0 %	0 %	472279772
24	NC_020827	ATAA	2	8	11316	11323	75 %	25 %	0 %	0 %	472279772

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.