MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-6 DNA

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020827	CTT	2	6	48	53	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020827	AAC	2	6	114	119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020827	CTA	2	6	447	452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020827	TAG	2	6	557	562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020827	CTA	2	6	569	574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020827	CTT	2	6	781	786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279763
7	NC_020827	TCA	2	6	798	803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279763
8	NC_020827	TAA	2	6	941	946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279763
9	NC_020827	TGC	2	6	973	978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279763
10	NC_020827	TTG	2	6	1105	1110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279763
11	NC_020827	TCT	2	6	1129	1134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279763
12	NC_020827	TCA	2	6	1161	1166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279763
13	NC_020827	CTT	2	6	1171	1176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279763
14	NC_020827	AAT	2	6	1533	1538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279764
15	NC_020827	AAC	2	6	1572	1577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279764
16	NC_020827	TAT	2	6	1659	1664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279764
17	NC_020827	AAT	2	6	1697	1702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279764
18	NC_020827	ACT	2	6	1707	1712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279764
19	NC_020827	TAA	2	6	1765	1770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279765
20	NC_020827	CTA	2	6	1811	1816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279765
21	NC_020827	ATT	2	6	1885	1890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279765
22	NC_020827	CTA	2	6	1919	1924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279765
23	NC_020827	CCA	2	6	2309	2314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279765
24	NC_020827	TAA	2	6	2474	2479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279765
25	NC_020827	GTA	2	6	2482	2487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279765
26	NC_020827	TTA	2	6	2539	2544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279765
27	NC_020827	AAT	2	6	2580	2585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279765
28	NC_020827	TTC	2	6	2586	2591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279765
29	NC_020827	CAA	2	6	2613	2618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279765
30	NC_020827	CGA	2	6	2788	2793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279765
31	NC_020827	ATT	2	6	2904	2909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279765
32	NC_020827	ATG	2	6	2941	2946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279765
33	NC_020827	CAA	2	6	3017	3022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279765
34	NC_020827	AAT	2	6	3078	3083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279765
35	NC_020827	ATT	2	6	3084	3089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279765
36	NC_020827	GAA	2	6	3338	3343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279765
37	NC_020827	AAT	2	6	3399	3404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279765
38	NC_020827	ATC	2	6	3456	3461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279765
39	NC_020827	TAA	2	6	3579	3584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279765
40	NC_020827	CGT	2	6	3629	3634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279765
41	NC_020827	GCT	2	6	3853	3858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279765
42	NC_020827	TTC	2	6	4041	4046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020827	AGT	2	6	4140	4145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020827	ATT	2	6	4166	4171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020827	ATT	2	6	4244	4249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020827	TGG	2	6	4276	4281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020827	GCT	2	6	4340	4345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_020827	GTT	2	6	4404	4409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020827	CAA	2	6	4744	4749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279766
50	NC_020827	GAA	2	6	4757	4762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279766
51	NC_020827	AGT	2	6	4931	4936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279766
52	NC_020827	CAC	2	6	4991	4996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279766
53	NC_020827	TGT	2	6	5027	5032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279766
54	NC_020827	ATG	2	6	5106	5111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279766
55	NC_020827	ATT	2	6	5117	5122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279766
56	NC_020827	TCA	2	6	5154	5159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279766
57	NC_020827	TAT	2	6	5189	5194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279766
58	NC_020827	CTA	2	6	5447	5452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020827	AAC	2	6	5519	5524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_020827	TGC	2	6	5606	5611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279767
61	NC_020827	TTA	2	6	5619	5624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279767
62	NC_020827	TAA	2	6	5711	5716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279767
63	NC_020827	TTA	2	6	5930	5935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279767
64	NC_020827	GTA	2	6	6241	6246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020827	AAT	2	6	6267	6272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020827	CTT	2	6	6328	6333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020827	CTT	2	6	6340	6345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_020827	ATA	2	6	6380	6385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020827	CAA	2	6	6474	6479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_020827	AAT	2	6	6783	6788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279768
71	NC_020827	CTA	2	6	6976	6981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279768
72	NC_020827	TTG	2	6	7019	7024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279768
73	NC_020827	GTA	2	6	7084	7089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279768
74	NC_020827	TCG	2	6	7123	7128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279769
75	NC_020827	TTC	2	6	7195	7200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279769
76	NC_020827	CGT	2	6	7273	7278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279769
77	NC_020827	GCT	2	6	7335	7340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279769
78	NC_020827	GCT	2	6	7382	7387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279769
79	NC_020827	GTT	2	6	7413	7418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279769
80	NC_020827	TAA	2	6	7441	7446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279769
81	NC_020827	GAT	2	6	7569	7574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279769
82	NC_020827	ATT	2	6	7651	7656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279769
83	NC_020827	CTG	2	6	7942	7947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279769
84	NC_020827	CTT	2	6	8013	8018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279769
85	NC_020827	ATT	2	6	8213	8218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279769
86	NC_020827	TGA	2	6	8263	8268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279769
87	NC_020827	CGG	2	6	8438	8443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_020827	TGA	2	6	8612	8617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020827	GAA	2	6	8667	8672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020827	CAA	2	6	8724	8729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_020827	AAC	2	6	8737	8742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020827	GCC	2	6	8799	8804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279770
93	NC_020827	ACG	2	6	8914	8919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279770
94	NC_020827	ACC	2	6	8971	8976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279770
95	NC_020827	TTA	2	6	9060	9065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279770
96	NC_020827	GAC	2	6	9178	9183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279770
97	NC_020827	AGG	2	6	9349	9354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020827	TAT	2	6	9374	9379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020827	AAG	2	6	9685	9690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020827	CTT	2	6	9715	9720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020827	ATA	2	6	9765	9770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020827	CAC	2	6	9784	9789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_020827	CAA	2	6	9856	9861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_020827	ACC	2	6	9872	9877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_020827	ACT	2	6	9916	9921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_020827	TAA	2	6	9953	9958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020827	CAT	2	6	10024	10029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_020827	TAC	2	6	10055	10060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_020827	TAT	2	6	10362	10367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279771
110	NC_020827	ATC	2	6	10491	10496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279771
111	NC_020827	ACT	2	6	10528	10533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279771
112	NC_020827	CTC	2	6	10628	10633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472279771
113	NC_020827	TCG	2	6	10680	10685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279771
114	NC_020827	TTA	2	6	10714	10719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279771
115	NC_020827	TAA	2	6	10806	10811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279771
116	NC_020827	ATT	2	6	10830	10835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279771
117	NC_020827	ACT	2	6	10845	10850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279771
118	NC_020827	TTA	2	6	10855	10860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279771
119	NC_020827	ATG	2	6	10881	10886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279771
120	NC_020827	CTA	2	6	10989	10994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279772
121	NC_020827	TAA	2	6	11026	11031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279772
122	NC_020827	AAC	2	6	11249	11254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279772
123	NC_020827	GAA	2	6	11352	11357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279772
124	NC_020827	AGA	2	6	11390	11395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020827	TAA	2	6	11461	11466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020827	GGT	2	6	11545	11550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.