MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-6 DNA

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020827	CTT	2	6	781	786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279763
2	NC_020827	TCA	2	6	798	803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279763
3	NC_020827	TAA	2	6	941	946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279763
4	NC_020827	TGC	2	6	973	978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279763
5	NC_020827	TTG	2	6	1105	1110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279763
6	NC_020827	TCT	2	6	1129	1134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279763
7	NC_020827	TCA	2	6	1161	1166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279763
8	NC_020827	CTT	2	6	1171	1176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279763
9	NC_020827	AAT	2	6	1533	1538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279764
10	NC_020827	AAC	2	6	1572	1577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279764
11	NC_020827	TAT	2	6	1659	1664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279764
12	NC_020827	AAT	2	6	1697	1702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279764
13	NC_020827	ACT	2	6	1707	1712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279764
14	NC_020827	TAA	2	6	1765	1770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279765
15	NC_020827	CTA	2	6	1811	1816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279765
16	NC_020827	ATT	2	6	1885	1890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279765
17	NC_020827	CTA	2	6	1919	1924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279765
18	NC_020827	CCA	2	6	2309	2314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279765
19	NC_020827	TAA	2	6	2474	2479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279765
20	NC_020827	GTA	2	6	2482	2487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279765
21	NC_020827	TTA	2	6	2539	2544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279765
22	NC_020827	AAT	2	6	2580	2585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279765
23	NC_020827	TTC	2	6	2586	2591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279765
24	NC_020827	CAA	2	6	2613	2618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279765
25	NC_020827	CGA	2	6	2788	2793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279765
26	NC_020827	ATT	2	6	2904	2909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279765
27	NC_020827	ATG	2	6	2941	2946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279765
28	NC_020827	CAA	2	6	3017	3022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279765
29	NC_020827	AAT	2	6	3078	3083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279765
30	NC_020827	ATT	2	6	3084	3089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279765
31	NC_020827	GAA	2	6	3338	3343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279765
32	NC_020827	AAT	2	6	3399	3404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279765
33	NC_020827	ATC	2	6	3456	3461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279765
34	NC_020827	TAA	2	6	3579	3584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279765
35	NC_020827	CGT	2	6	3629	3634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279765
36	NC_020827	GCT	2	6	3853	3858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279765
37	NC_020827	CAA	2	6	4744	4749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279766
38	NC_020827	GAA	2	6	4757	4762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279766
39	NC_020827	AGT	2	6	4931	4936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279766
40	NC_020827	CAC	2	6	4991	4996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279766
41	NC_020827	TGT	2	6	5027	5032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279766
42	NC_020827	ATG	2	6	5106	5111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279766
43	NC_020827	ATT	2	6	5117	5122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279766
44	NC_020827	TCA	2	6	5154	5159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279766
45	NC_020827	TAT	2	6	5189	5194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279766
46	NC_020827	TGC	2	6	5606	5611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279767
47	NC_020827	TTA	2	6	5619	5624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279767
48	NC_020827	TAA	2	6	5711	5716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279767
49	NC_020827	TTA	2	6	5930	5935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279767
50	NC_020827	AAT	2	6	6783	6788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279768
51	NC_020827	CTA	2	6	6976	6981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279768
52	NC_020827	TTG	2	6	7019	7024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279768
53	NC_020827	GTA	2	6	7084	7089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279768
54	NC_020827	TCG	2	6	7123	7128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279769
55	NC_020827	TTC	2	6	7195	7200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279769
56	NC_020827	CGT	2	6	7273	7278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279769
57	NC_020827	GCT	2	6	7335	7340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279769
58	NC_020827	GCT	2	6	7382	7387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279769
59	NC_020827	GTT	2	6	7413	7418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279769
60	NC_020827	TAA	2	6	7441	7446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279769
61	NC_020827	GAT	2	6	7569	7574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279769
62	NC_020827	ATT	2	6	7651	7656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279769
63	NC_020827	CTG	2	6	7942	7947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279769
64	NC_020827	CTT	2	6	8013	8018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279769
65	NC_020827	ATT	2	6	8213	8218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279769
66	NC_020827	TGA	2	6	8263	8268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279769
67	NC_020827	GCC	2	6	8799	8804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279770
68	NC_020827	ACG	2	6	8914	8919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279770
69	NC_020827	ACC	2	6	8971	8976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279770
70	NC_020827	TTA	2	6	9060	9065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279770
71	NC_020827	GAC	2	6	9178	9183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279770
72	NC_020827	TAT	2	6	10362	10367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279771
73	NC_020827	ATC	2	6	10491	10496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279771
74	NC_020827	ACT	2	6	10528	10533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279771
75	NC_020827	CTC	2	6	10628	10633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472279771
76	NC_020827	TCG	2	6	10680	10685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279771
77	NC_020827	TTA	2	6	10714	10719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279771
78	NC_020827	TAA	2	6	10806	10811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279771
79	NC_020827	ATT	2	6	10830	10835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279771
80	NC_020827	ACT	2	6	10845	10850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279771
81	NC_020827	TTA	2	6	10855	10860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279771
82	NC_020827	ATG	2	6	10881	10886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279771
83	NC_020827	CTA	2	6	10989	10994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279772
84	NC_020827	TAA	2	6	11026	11031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279772
85	NC_020827	AAC	2	6	11249	11254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279772
86	NC_020827	GAA	2	6	11352	11357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279772

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.