MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-3 DNA

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020826	ACTTT	2	10	3776	3785	20 %	60 %	0 %	20 %	472279730
2	NC_020826	TGCTT	2	10	4133	4142	0 %	60 %	20 %	20 %	472279730
3	NC_020826	AAAAT	2	10	4334	4343	80 %	20 %	0 %	0 %	472279730
4	NC_020826	TTATT	2	10	4557	4566	20 %	80 %	0 %	0 %	472279731
5	NC_020826	TATTT	2	10	5838	5847	20 %	80 %	0 %	0 %	472279732
6	NC_020826	AAACA	2	10	6661	6670	80 %	0 %	0 %	20 %	472279734
7	NC_020826	AATTG	2	10	6871	6880	40 %	40 %	20 %	0 %	472279734
8	NC_020826	TTTCA	2	10	15668	15677	20 %	60 %	0 %	20 %	472279742
9	NC_020826	TTTTG	2	10	18275	18284	0 %	80 %	20 %	0 %	472279743
10	NC_020826	ATTAG	2	10	19060	19069	40 %	40 %	20 %	0 %	472279743
11	NC_020826	TCATT	2	10	19085	19094	20 %	60 %	0 %	20 %	472279743
12	NC_020826	TTTTC	2	10	19633	19642	0 %	80 %	0 %	20 %	472279744
13	NC_020826	TTCCA	2	10	21074	21083	20 %	40 %	0 %	40 %	472279745
14	NC_020826	TGAGG	2	10	21861	21870	20 %	20 %	60 %	0 %	472279746
15	NC_020826	TAAAT	2	10	23129	23138	60 %	40 %	0 %	0 %	472279747
16	NC_020826	ATCCG	2	10	27274	27283	20 %	20 %	20 %	40 %	472279751
17	NC_020826	TATAT	2	10	30277	30286	40 %	60 %	0 %	0 %	472279756
18	NC_020826	GTTTT	2	10	31650	31659	0 %	80 %	20 %	0 %	472279757
19	NC_020826	ATGAT	2	10	31802	31811	40 %	40 %	20 %	0 %	472279758
20	NC_020826	TGAAA	2	10	33810	33819	60 %	20 %	20 %	0 %	472279761
21	NC_020826	TTAAC	2	10	34019	34028	40 %	40 %	0 %	20 %	472279761

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.