MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-3 DNA

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020826	GATT	2	8	432	439	25 %	50 %	25 %	0 %	472279728
2	NC_020826	CGAG	2	8	909	916	25 %	0 %	50 %	25 %	472279728
3	NC_020826	CCAT	2	8	1092	1099	25 %	25 %	0 %	50 %	472279728
4	NC_020826	GAAA	2	8	1346	1353	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020826	TTAA	2	8	2118	2125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020826	AAAT	2	8	2205	2212	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020826	TGCT	2	8	3124	3131	0 %	50 %	25 %	25 %	472279730
8	NC_020826	GCGA	2	8	3284	3291	25 %	0 %	50 %	25 %	472279730
9	NC_020826	TAAA	2	8	3384	3391	75 %	25 %	0 %	0 %	472279730
10	NC_020826	TATG	2	8	4083	4090	25 %	50 %	25 %	0 %	472279730
11	NC_020826	TTTC	2	8	4152	4159	0 %	75 %	0 %	25 %	472279730
12	NC_020826	GTTC	2	8	4173	4180	0 %	50 %	25 %	25 %	472279730
13	NC_020826	TTCA	2	8	4426	4433	25 %	50 %	0 %	25 %	472279730
14	NC_020826	TATC	2	8	4583	4590	25 %	50 %	0 %	25 %	472279731
15	NC_020826	TAGC	2	8	5492	5499	25 %	25 %	25 %	25 %	472279732
16	NC_020826	TAAA	2	8	5664	5671	75 %	25 %	0 %	0 %	472279732
17	NC_020826	TATC	2	8	5885	5892	25 %	50 %	0 %	25 %	472279732
18	NC_020826	ATTA	2	8	5919	5926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020826	ATTG	2	8	6225	6232	25 %	50 %	25 %	0 %	472279733
20	NC_020826	GATT	2	8	6730	6737	25 %	50 %	25 %	0 %	472279734
21	NC_020826	AACA	2	8	6886	6893	75 %	0 %	0 %	25 %	472279734
22	NC_020826	CTTT	2	8	7023	7030	0 %	75 %	0 %	25 %	472279734
23	NC_020826	GTTT	2	8	7092	7099	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020826	ACCA	2	8	7258	7265	50 %	0 %	0 %	50 %	472279735
25	NC_020826	ATTA	2	8	7624	7631	50 %	50 %	0 %	0 %	472279735
26	NC_020826	AAAT	2	8	8116	8123	75 %	25 %	0 %	0 %	472279735
27	NC_020826	TTGG	2	8	8387	8394	0 %	50 %	50 %	0 %	472279735
28	NC_020826	CTAA	2	8	8711	8718	50 %	25 %	0 %	25 %	472279735
29	NC_020826	GTTT	2	8	10801	10808	0 %	75 %	25 %	0 %	472279738
30	NC_020826	AAAC	2	8	10993	11000	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_020826	AAAG	2	8	11104	11111	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020826	CATT	2	8	11281	11288	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_020826	GACC	2	8	11780	11787	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_020826	TTTA	2	8	11807	11814	25 %	75 %	0 %	0 %	472279739
35	NC_020826	AATT	2	8	11892	11899	50 %	50 %	0 %	0 %	472279739
36	NC_020826	AAGC	2	8	11919	11926	50 %	0 %	25 %	25 %	472279739
37	NC_020826	TAAT	2	8	11953	11960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020826	GCCA	2	8	12198	12205	25 %	0 %	25 %	50 %	472279740
39	NC_020826	AAGA	2	8	12326	12333	75 %	0 %	25 %	0 %	472279740
40	NC_020826	TGTT	2	8	12665	12672	0 %	75 %	25 %	0 %	472279740
41	NC_020826	AGAA	2	8	12869	12876	75 %	0 %	25 %	0 %	472279740
42	NC_020826	CAGT	2	8	13215	13222	25 %	25 %	25 %	25 %	472279740
43	NC_020826	TAAA	2	8	13713	13720	75 %	25 %	0 %	0 %	472279741
44	NC_020826	AGCC	2	8	13875	13882	25 %	0 %	25 %	50 %	472279741
45	NC_020826	TCGA	2	8	14044	14051	25 %	25 %	25 %	25 %	472279741
46	NC_020826	ATTA	2	8	14176	14183	50 %	50 %	0 %	0 %	472279741
47	NC_020826	TTGT	2	8	14478	14485	0 %	75 %	25 %	0 %	472279741
48	NC_020826	AATC	2	8	14569	14576	50 %	25 %	0 %	25 %	472279741
49	NC_020826	CTAT	2	8	14609	14616	25 %	50 %	0 %	25 %	472279741
50	NC_020826	CTTA	2	8	14761	14768	25 %	50 %	0 %	25 %	472279741
51	NC_020826	AAGC	2	8	14840	14847	50 %	0 %	25 %	25 %	472279741
52	NC_020826	ATAC	2	8	15004	15011	50 %	25 %	0 %	25 %	472279741
53	NC_020826	AATT	2	8	15864	15871	50 %	50 %	0 %	0 %	472279743
54	NC_020826	AATT	2	8	16605	16612	50 %	50 %	0 %	0 %	472279743
55	NC_020826	AATA	2	8	16986	16993	75 %	25 %	0 %	0 %	472279743
56	NC_020826	ATTT	2	8	17157	17164	25 %	75 %	0 %	0 %	472279743
57	NC_020826	TACT	2	8	17360	17367	25 %	50 %	0 %	25 %	472279743
58	NC_020826	AATT	2	8	18053	18060	50 %	50 %	0 %	0 %	472279743
59	NC_020826	CAAA	2	8	18395	18402	75 %	0 %	0 %	25 %	472279743
60	NC_020826	ATTT	2	8	18951	18958	25 %	75 %	0 %	0 %	472279743
61	NC_020826	AAAT	2	8	20060	20067	75 %	25 %	0 %	0 %	472279744
62	NC_020826	ACAA	2	8	20112	20119	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020826	TAAC	2	8	20132	20139	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_020826	CCCA	2	8	20169	20176	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
65	NC_020826	GCTT	2	8	20239	20246	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_020826	TCAT	2	8	20934	20941	25 %	50 %	0 %	25 %	472279745
67	NC_020826	ATTC	2	8	20989	20996	25 %	50 %	0 %	25 %	472279745
68	NC_020826	TTGC	2	8	21346	21353	0 %	50 %	25 %	25 %	472279745
69	NC_020826	AATT	2	8	21451	21458	50 %	50 %	0 %	0 %	472279745
70	NC_020826	GCTT	2	8	22319	22326	0 %	50 %	25 %	25 %	472279747
71	NC_020826	TTTA	2	8	23837	23844	25 %	75 %	0 %	0 %	472279749
72	NC_020826	CAAT	2	8	23959	23966	50 %	25 %	0 %	25 %	472279749
73	NC_020826	TGGC	2	8	24840	24847	0 %	25 %	50 %	25 %	472279749
74	NC_020826	CATT	2	8	25225	25232	25 %	50 %	0 %	25 %	472279750
75	NC_020826	GTTC	2	8	25763	25770	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_020826	TAAC	2	8	26651	26658	50 %	25 %	0 %	25 %	472279751
77	NC_020826	TTTA	2	8	26868	26875	25 %	75 %	0 %	0 %	472279751
78	NC_020826	CAAC	2	8	27368	27375	50 %	0 %	0 %	50 %	472279751
79	NC_020826	TTGC	2	8	27417	27424	0 %	50 %	25 %	25 %	472279751
80	NC_020826	TTCT	2	8	27603	27610	0 %	75 %	0 %	25 %	472279751
81	NC_020826	TCTT	2	8	27682	27689	0 %	75 %	0 %	25 %	472279751
82	NC_020826	ATTC	2	8	28003	28010	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_020826	TCAA	2	8	28751	28758	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020826	AATT	2	8	28828	28835	50 %	50 %	0 %	0 %	472279754
85	NC_020826	CTTT	2	8	30642	30649	0 %	75 %	0 %	25 %	472279756
86	NC_020826	CATT	2	8	31003	31010	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_020826	ATTA	2	8	32081	32088	50 %	50 %	0 %	0 %	472279758
88	NC_020826	ATCA	2	8	32486	32493	50 %	25 %	0 %	25 %	472279758
89	NC_020826	CCCT	2	8	32561	32568	0 %	25 %	0 %	75 %	472279758
90	NC_020826	TCAT	2	8	33090	33097	25 %	50 %	0 %	25 %	472279760
91	NC_020826	TAAT	2	8	33261	33268	50 %	50 %	0 %	0 %	472279760
92	NC_020826	TGAT	2	8	34213	34220	25 %	50 %	25 %	0 %	472279761
93	NC_020826	AGCC	2	8	35149	35156	25 %	0 %	25 %	50 %	472279761

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.